中性SNP的突变年龄评估（estimate the average age of a neutral two-allele polymorphism）
假设中性突变的频率分别为P和1-P，则其突变年龄为：-4Ne[p*( logep)+(1-p)* loge (1-p)]
The average age of a neutral two-allele polymorphism with frequencies p and is 1-p：-4Ne[p*( logep)+(1-p)* loge (1-p)];
这里，Ne为有效群体大小，假定一个群体的有效群体大小是5000，某个SNP突变频率分别为0.1和0.9,则其突变年龄为：
-4*5000*(0.1*log(0.1)+0.9*log(0.9))= 6501.659
这里的6501单位为generation，一个generation是25年。所以突变年龄是：6501.659*25
公式出处：
1、The age of a neutral mutant persisting in a finite population. Genetics 75:199–212
2、Dating the Origin of the CCR5-D32 AIDS-Resistance Allele by the Coalescence of Haplotypes
中性SNP的突变年龄评估（estimate the average age of a neutral two-allele polymorphism）的更多相关文章
- Linq to 泛型集合查询集合包括大写M和年龄小于等于18
#region Linq to 泛型集合查询集合包括大写M和年龄小于等于18 //List<Student> list = new List<Student&g ...
- python工具 - alert弹框输出姓名年龄、求和
使用python自带的tkinter库进行GUI编程,完成两个功能: (1)要求用户输入姓名和年龄然后打印出来 (2)要求用户输入一个数字,然后计算1到该数字之间的和 代码部分: # 导入tkinte ...
- 基于虹软 2.0 人脸识别猜年龄 java版 demo
首先感谢虹软,是你们提供这么好的SDK支撑了我们的想象力! 这是一个用javav编写的可视化应用,用户通过自己的脸和计算机进行交互,计算机则通过萌萌女孩的语音和用户对话.核心程序就是利用ArcFace ...
- 用sql语句实现年龄分段统计
SELECT CASE WHEN (age >= 10 AND age <= 20) THEN '10-20' WHEN (age >= 21 AND age <= 30) T ...
- 用python写了一个猜年龄小游戏
写一个猜年龄游戏: 需要实现用户登录的功能 初始用户登录信息为 {'hades': '13579','nick': '123','ruixing': 'a1','fanping': 'b2'} 登录时 ...
- [spark程序]统计人口平均年龄（本地文件）（详细过程）
一.题目描述 (1)编写Spark应用程序,该程序可以在本地文件系统中生成一个数据文件peopleage.txt,数据文件包含若干行(比如1000行,或者100万行等等)记录,每行记录只包含两列数据, ...
- day_10猜年龄游戏函数版
''' 1. 在猜年龄的基础上编写登录.注册方法,并且把猜年龄游戏分函数处理,如 2. 登录函数 3. 注册函数 4. 猜年龄函数 5. 选择奖品函数 ''' import json real_age ...
- spark 应用场景1-求年龄平均值
原文引自:http://blog.csdn.net/fengzhimohan/article/details/78535143 该案例中,我们将假设我们需要统计一个 10 万人口的所有人的平均年龄,当 ...
- CFA一级知识点总结
更多来自: www.vipcoursea.com Ethics 部分 Objective of codes and standard:永远是为了maintain public trust in ...
随机推荐
- NIO和经典IO
NIO未必更快,在Linux上使用Java6完成的测试中,多线程经典I/O设计胜出NIO30%左右 异步I/O强于经典I/O:服务器需要支持超大量的长期连接,比如10000个连接以上,不过各个客户端并 ...
- Selenium简单回顾
一.Selenium介绍 1.Selenium(浏览器自动化测试框架): Selenium 是一个用于Web应用程序测试的工具.Selenium测试直接运行在浏览器中,就像真正的用户在操作一样.支持的 ...
- 简单比较init-method，afterPropertiesSet和BeanPostProcessor
一.简单介绍 1.init-method方法,初始化bean的时候执行,可以针对某个具体的bean进行配置.init-method需要在applicationContext.xml配置文档中bean的 ...
- linux 挂载windows下目录，其它linux机器nfs的目录，自己dd的文件
如有转载,不胜荣幸.http://www.cnblogs.com/aaron-agu/ 挂载window下共享的目录 //192.168.0.11/share /mnt 挂载其它linux机器下目录 ...
- SpringBoot之修改单个文件后立刻生效
问题: 在使用SpringBoot进行开发时,如果修改了某个文件比如前端页面html,不能立刻起效. 解决: 在idea中打开修改后的文件,使用快捷键Ctrl+Shift+F9 进行重新编译,然后刷新 ...
- VS2017设置背景主题
一.VS2017设置背景主题 1.下载并安装Color Theme Editor for Visual Studio 2017和MoeIDE (图中红圈中的两个插件,工具-扩展和更新-联机-右上角搜索 ...
- react使用setstate注意的两点
1.this.state里的属性不修改,或是只修改一个,那么不修改的剩下的属性不会被变动. this.state={ name:"Aliece", age:19, msg:&quo ...
- 学习 Spring (十六) AOP API
Spring入门篇 学习笔记 Spring AOP API 是 Spring 1.2 历史用法,现在仍然支持 这是 Spring AOP 基础,现在的用法也是基于历史的,只是更简便了 Pointcut ...
- CentOS 安装git
git安装 yum install git 初始化git “git init --bare 文件夹” 添加所有 “git add . ” 提交 “git commit -m "提交信息&qu ...
- [Codeforces757G]Can Bash Save the Day?——动态点分治(可持久化点分树)
题目链接: Codeforces757G 题目大意:给出一棵n个点的树及一个1~n的排列pi,边有边权,有q次操作: 1 l r x 求 $\sum\limits_{i=l}^{r}dis(p_{i} ...