假设中性突变的频率分别为P和1-P,则其突变年龄为:-4Ne[p*( logep)+(1-p)* loge (1-p)]

The average age of a neutral two-allele polymorphism with frequencies p and is 1-p:-4Ne[p*( logep)+(1-p)* loge (1-p)];

这里,Ne为有效群体大小,假定一个群体的有效群体大小是5000,某个SNP突变频率分别为0.1和0.9,则其突变年龄为:

-4*5000*(0.1*log(0.1)+0.9*log(0.9))= 6501.659

这里的6501单位为generation,一个generation是25年。所以突变年龄是:6501.659*25

公式出处:

1、The age of a neutral mutant persisting in a finite population. Genetics 75:199–212

2、Dating the Origin of the CCR5-D32 AIDS-Resistance Allele by the Coalescence of Haplotypes

中性SNP的突变年龄评估(estimate the average age of a neutral two-allele polymorphism)的更多相关文章

  1. Linq to 泛型集合查询集合包括大写M和年龄小于等于18

    #region Linq to 泛型集合查询集合包括大写M和年龄小于等于18            //List<Student> list = new List<Student&g ...

  2. python工具 - alert弹框输出姓名年龄、求和

    使用python自带的tkinter库进行GUI编程,完成两个功能: (1)要求用户输入姓名和年龄然后打印出来 (2)要求用户输入一个数字,然后计算1到该数字之间的和 代码部分: # 导入tkinte ...

  3. 基于虹软 2.0 人脸识别猜年龄 java版 demo

    首先感谢虹软,是你们提供这么好的SDK支撑了我们的想象力! 这是一个用javav编写的可视化应用,用户通过自己的脸和计算机进行交互,计算机则通过萌萌女孩的语音和用户对话.核心程序就是利用ArcFace ...

  4. 用sql语句实现年龄分段统计

    SELECT CASE WHEN (age >= 10 AND age <= 20) THEN '10-20' WHEN (age >= 21 AND age <= 30) T ...

  5. 用python写了一个猜年龄小游戏

    写一个猜年龄游戏: 需要实现用户登录的功能 初始用户登录信息为 {'hades': '13579','nick': '123','ruixing': 'a1','fanping': 'b2'} 登录时 ...

  6. [spark程序]统计人口平均年龄(本地文件)(详细过程)

    一.题目描述 (1)编写Spark应用程序,该程序可以在本地文件系统中生成一个数据文件peopleage.txt,数据文件包含若干行(比如1000行,或者100万行等等)记录,每行记录只包含两列数据, ...

  7. day_10猜年龄游戏函数版

    ''' 1. 在猜年龄的基础上编写登录.注册方法,并且把猜年龄游戏分函数处理,如 2. 登录函数 3. 注册函数 4. 猜年龄函数 5. 选择奖品函数 ''' import json real_age ...

  8. spark 应用场景1-求年龄平均值

    原文引自:http://blog.csdn.net/fengzhimohan/article/details/78535143 该案例中,我们将假设我们需要统计一个 10 万人口的所有人的平均年龄,当 ...

  9. CFA一级知识点总结

    更多来自:   www.vipcoursea.com   Ethics 部分 Objective of codes and standard:永远是为了maintain public trust in ...

随机推荐

  1. shell中的>,2>&1,&>file 解析记录

    0  表示标准输入1  表示标准输出2  表示标准错误输出>  默认为标准输出重定向,与 1> 相同2>&1  意思是把 标准错误输出 重定向到 标准输出.&> ...

  2. vue 思維導圖

    vue概念:vue是一個輕量級的javascript庫:是一種漸進式的框架:vue可以實現數據視圖雙向綁定. vue基礎語法:實例化.條件.循環 vue重頭戲:動畫.組件.過濾.ajax.自定義組件. ...

  3. fastjson与各类型的转换

    参考:https://www.cnblogs.com/ceshi2016/p/7381478.html http://www.cnblogs.com/goody9807/p/4244862.html ...

  4. hdu-1251(字典树)

    字典树模板题. ps:数组要开大,40w左右才行,不然疯狂re 代码: #include<iostream> #include<algorithm> #include<c ...

  5. hdu1839(最小生成树)

    题意:字面意思: 思路:就是多了一个前提,有些点之间可能有边,有两个处理方法,一个是有边的,这条边权值归零,另一个是,先一次循环用并查集过一遍: 代码:(用的是第一种方法) #include<i ...

  6. Linux成为云计算平台的主流操作系统

    导读 这是一个人人谈"云"."大数据"的时代,作为一个IT民工,如果与同行间聊天时,不谈及这方面的内容,有人可能会觉得你落伍了,跟不上这个时代了. 这是一个人人 ...

  7. 把当前ubuntu系统做成镜像

    把当前ubuntu系统做成镜像 2018年06月19日 15:24:51 还需要再学习一个 阅读数:9720 原文地址: http://community.bwbot.org/topic/167/%E ...

  8. BZOJ3676[Apio2014]回文串——回文自动机

    题目描述 考虑一个只包含小写拉丁字母的字符串s.我们定义s的一个子串t的“出 现值”为t在s中的出现次数乘以t的长度.请你求出s的所有回文子串中的最 大出现值. 输入 输入只有一行,为一个只包含小写字 ...

  9. vue——script内容详解

    <script> export default { name: "Home", data() { return {}; }, methods: { // 组件的方法 } ...

  10. Python内建GUI模块Tkinter(二)

    Python核心组件 1.Button 按钮组件:一个简单的按钮,用来执行一个命令或别的操作. 参数解析: text:指定按钮上显示的文本: anchor: 指定按钮上文本的位置(N, NE, E, ...