hihocoder #1052 : 基因工程(字符串处理 + 找规律 )

#1052 : 基因工程

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描述

小Hi和小Ho正在进行一项基因工程实验。他们要修改一段长度为N的DNA序列，使得这段DNA上最前面的K个碱基组成的序列与最后面的K个碱基组成的序列完全一致。

例如对于序列"ATCGATAC"和K=2,可以通过将第二个碱基修改为"C"使得最前面2个碱基与最后面两个碱基都为"AC"。当然还存在其他修改方法，例如将最后一个碱基改为"T"，或者直接将最前面两个和最后面两个碱基都修改为"GG"。

小Hi和小Ho希望知道在所有方法中，修改碱基最少的方法需要修改多少个碱基。

输入

第一行包含一个整数T(1 <= T <= 10)，代表测试数据的数量。

每组测试数据包含2行，第一行是一个由"ATCG"4个大写字母组成的长度为N(1 <= N <= 1000)的字符串。第二行是一个整数K(1 <= K <= N)。

输出

对于每组数据输出最少需要修改的碱基数量。

样例输入

2
ATCGATAC
2
ATACGTCT
6 

样例输出

1
3

参考博客：http://beeder.me/2014/11/02/hihocoder-problem-1052-genetic-engineering/

#include <stdio.h>
#include <string.h>
#include <math.h>
#include <algorithm>

using namespace std;

int main()
{
	int t;
	int i, j;
	char s[1100];
	scanf("%d", &t);
	int k; int ans;

	while(t--)
	{
		scanf("%s", s);
		int len=strlen(s);
		scanf("%d", &k);
		ans=0;
		if(2*k <=len)
		{
			int dd=len-k;
			for(i=0; i<k; i++)
			{
				if(s[i]!=s[dd+i])
					ans++;
			}
		}
		else //有重合部分
		{
			int dd=len-k;
			for(i=0; i<dd; i++ )
			{
				int A=0, G=0, C=0, T=0; int num=0;
				for(j=i; j<len; j+=dd )
				{
					num++;
					if(s[j]=='A') A++;
					else if(s[j]=='G') G++;
					else if(s[j]=='C') C++;
					else T++;
				}
				int maxchar = max(A, G);
				maxchar = max(maxchar, C);
				maxchar = max(maxchar, T);
				ans=ans+(num-maxchar);
			}
		}
		printf("%d\n", ans );
	}
	return 0;
}