R包customLayout比例拼图
一个简单的需求:
拼接两个图,一行两列,但不要一样大,让主图占的比例大些(如2/3),另一个图小一些(如1/3)
如上,我想突出曼哈顿图。
R相关的拼图函数及包:
- 基础函数如par(mar =c(3, 2, 2, 1)), par(mfrow=c(1,2)),layout(matrix(c(2,1),1,2))之类的设置
- gridExtra包
- cowplot包
- grid包
- patchwork包
尝试了下,本来很简单,这些包及其函数应该部分能实现,但没太多精力去学,一下子也没找到这个功能。新找了包customLayout,很快实现了需求。
res = read.csv('GWAS.Results.csv', header = T)
colnames(res)[1:4] = c('SNP','CHR','BP','P')
## 按2:1分布
lay <-lay_new(mat =matrix(1:2, ncol =2),widths = c(2,1))
lay_show(lay)
lay_set(lay)
manhattan(res[,1:4],col = c("blue","orange"),
main="Manhattan plot",
suggestiveline = -log10(1e-05),
genomewideline = -log10(5e-08)
)
qq(res$P, main="Q-Q plot of GWAS p-value", col = "blue4")
R包customLayout比例拼图的更多相关文章
- 用R包中heatmap画热图
一:导入R包及需要画热图的数据 library(pheatmap) data<- read.table("F:/R练习/R测试数据/heatmapdata.txt",head ...
- R包对植物进行GO,KEGG注释
1.安装,加载所用到到R包 用BiocManager安装,可同时加载依赖包 source("https://bioconductor.org/biocLite.R") BiocMa ...
- 普通用户安装 R 包
转自 http://bnuzhutao.cn/archives/901 一般 R 语言的书籍上,介绍安装 R 包的方法都是这样的: install.packages("packagename ...
- R包介绍
R语言的使用,很大程度上是借助各种各样的R包的辅助,从某种程度上讲,R包就是针对于R的插件,不同的插件满足不同的需求,截至2013年3月6日,CRAN已经收录了各类包4338个. 一. R语言包的安装 ...
- R(三): R包原理及安装
包(package)是多个函数的集合,常作为分享代码的基本单元,代码封装成包可以方便其他用户使用.越来越多的R包正在由世界上不同的人所创建并分发,这些分发的R包,可以从CRAN 或 github 上获 ...
- 高质量、处于持续更新的R包
本文在Creative Commons许可证下发布 自由软件的问题是开发人员没有稳定的资金来源支持,可能更新上做不到持续.经过考证和圈内朋友的帮助,现在把R包中高质量.持续更新的跟大数据事业相关的R包 ...
- 如何将R包安装到自定义路径
参考 设置环境变量R_LIBS将R包安装到自定义路径 实际上是可以解决问题的, #环境变量完成以后,启动(重启)R,运行 .libPaths() 加载R包时,发现路径仍然未变成自定义的. 那么参 ...
- 工业级GBDT算法︱微软开源 的LightGBM(R包正在开发....)
看完一篇介绍文章后,第一个直觉就是这算法已经配得上工业级属性.日前看到微软已经公开了这一算法,而且已经发开python版本,本人觉得等hadoop+Spark这些平台配齐之后,就可以大规模宣传啦~如果 ...
- 安装 R 包报错 clang: error: unsupported option '-fopenmp' 的解决方法
MacOS 上安装 R 包 install.packages("data.table") 后面提示是否安装需要编译的版本: Do you want to install from ...
随机推荐
- 【二食堂】Beta - 设计和计划
Beta设计和计划 需求再分析 根据助教.老师.用户以及各个团队PM的反馈意见,我们的项目目前有以下问题: 功能不完整 实用价值不高 两方面的缺陷,所以在Beta阶段,我们工作的中心还是完成项目规划中 ...
- UltraSoft - Alpha - 发布声明
DDL_Killer Alpha版本发布声明 1. Alpha 阶段功能描述与版本实现 功能描述 设计原型 Alpha实现 登陆界面 注册界面 首页 日历视图 事项详情页 新建事项 列表视图 课程视图 ...
- 2020BUAA软工热身作业
2020BUAA软工热身作业 17373010 杜博玮 项目 内容 这个作业属于哪个课程 2020春季计算机学院软件工程(罗杰 任健) 这个作业的要求在哪里 热身作业 我在这个课程的目标是 学习软件工 ...
- 力扣 - 剑指 Offer 57 - II. 和为s的连续正数序列
题目 剑指 Offer 57 - II. 和为s的连续正数序列 思路1(双指针/滑动窗口) 所谓滑动窗口,就是需要我们从一个序列中找到某些连续的子序列,我们可以使用两个for循环来遍历查找,但是未免效 ...
- 写一段java程序来执行linux命令
摘要 在日常开发中,程序员需要经常查询服务器日志来排查问题和调试程序.如果是本地调试还好,但项目一旦发布到服务器上,每次查日志就很麻烦,而且日志量巨大,有时我们无法找到我们需要的信息.经常需要借助第三 ...
- sort命令的学习与实践
一.用man sort 查看sort的帮助文档 *sort将文件的每一行作为一个单位,相互比较,比较原则是从首字符向后,依次按ASCII码值进行比较,最后将他们按升序输出. [rocrocket@ro ...
- Forest v1.5.12 发布,声明式 HTTP 框架,已超过 1.6k star
Forest介绍 Forest 是一个开源的 Java HTTP 客户端框架,它能够将 HTTP 的所有请求信息(包括 URL.Header 以及 Body 等信息)绑定到您自定义的 Interfac ...
- mysql数据库导入导出文件sql文件
window下 1.导出整个数据库 mysqldump -u 用户名 -p 数据库名 > 导出的文件名 mysqldump -u dbuser -p dbname > dbname.sql ...
- vim 脚本,自动添加文件头部信息
相信很多人编写脚本的时候都会在脚本头部写一些信息,记录文件生成时候,生成人姓名等 建议在自己的家目录下的 .vimrc 文件 下添加以下内容 [ autocmd BufNewFile *.sh exe ...
- 'pybot' 不是内部或外部命令,也不是可运行的程序 或批处理文件
在dos下运行pybot --version提示不是内部命令 这是pip list 打印信息: 解决方法: 在python/Scripts目录下加一个pybot.bat 文件 内容为: @Echo o ...