Bonferroni校正:如果在同一数据集上同时检验n个独立的假设,那么用于每一假设的统计显著水平,应为仅检验一个假设时的显著水平的1/n

http://baike.baidu.com/view/1217813.htm?fr=aladdin

Bonferroni校正法:

此方法是在进行两两比较时对检验水准进行调整的办法,但是该方法在比较的次数较多时,就不太适合,因为校正后的检验水准会过小。此时可采用sidark法进行多重比较(仍然是对检验水准进行调整)。

统计学中一般以小概率作为判断差异是否显著的标准,通常都以0.05或0.01作为判断标准。在多重比较中, bonferroni是以t分布作为检验分布的,但多重比较时若均以0.05作为小概率的话,每次比较就会有5%犯一型错误的可能。但如果有n次比较,如有4个组要做6次比较,则有C6(2)*5%一型错误发生的概率,不符合小概率判断的原则。因此,bonferroni中,将小概率0.05或0.01除以要比较的次数n,作为判断显著性的小概率,这样,多重比较总的一型错误发生的概率不会超过0.05或0.01。

控制累积Ⅰ类错误概率增大的方法
采用Bonferroni法,SNK法和Tukey法等方法
累积Ⅰ类错误的概率为α'
当有k个均数需作两两比较时,比较的次数共有c= = k!/(2!(k-2)!)=k(k-1)/2
设每次检验所用Ⅰ类错误的概率水准为α,累积Ⅰ类错误的概率为α',则在对同一实验资料进行c次检验时,在样本彼此独立的条件下,根据概率乘法原理,其累积Ⅰ类错误概率α'与c有下列关系:
α'=1-(1-α)c (8.6)
例如,设α=0.05,c=3(即k=3),其累积Ⅰ类错误的概率为α'=1-(1-0.05)3 =1-(0.95)3 = 0.143
一,Bonferroni法
方法:采用α=α'/c作为下结论时所采用的检验水准.c为两两比较次数, α'为累积I类错误的概率.
例8-1四个均值的Bonferroni法比较
设α=α'/c=0.05/6=0.0083,由此t的临界值为t(0.0083/2,20)=2.9271
Bonferroni法的适用性
当比较次数不多时,Bonferroni法的效果较好.
但当比较次数较多(例如在10次以上)时,则由于其检验水准选择得过低,结论偏于保守.

Bonferroni校正法的更多相关文章

  1. GWAS

    GWAS的数据形式:SNP数据,即各个SNP位点的aa,Aa,AA基因型与疾病状态(0正常,1患病)的样例-对照数据. 在遗传流行病学上,全基因组关联研究(Genome Wide Associatio ...

  2. p值还是 FDR ?

    p值还是 FDR ? 差异分析 如何筛选显著性差异基因,p value, FDR 如何选 经常有同学询问如何筛选差异的基因(蛋白).已经计算了表达量和p value值,差异的基因(蛋白)太多了,如何筛 ...

  3. FDR错误发现率-P值校正学习[转载]

    转自:https://baike.baidu.com/item/FDR/16312044?fr=aladdin  https://blog.csdn.net/taojiea1014/article/d ...

  4. 学习笔记50—多重假设检验与Bonferroni校正、FDR校正

    总结起来就三句话: (1)当同一个数据集有n次(n>=2)假设检验时,要做多重假设检验校正 (2)对于Bonferroni校正,是将p-value的cutoff除以n做校正,这样差异基因筛选的p ...

  5. Holm–Bonferroni method

    sklearn实战-乳腺癌细胞数据挖掘(博主亲自录视频) https://study.163.com/course/introduction.htm?courseId=1005269003&u ...

  6. SAGE|DNA微阵列|RNA-seq|lncRNA|scripture|tophat|cufflinks|NONCODE|MA|LOWESS|qualitile归一化|permutation test|SAM|FDR|The Bonferroni|Tukey's|BH|FWER|Holm's step-down|q-value|

    生物信息学-基因表达分析 为了丰富中心法则,研究人员使用不断更新的技术研究lncRNA的方方面面,其中技术主要是生物学上的微阵列芯片技术和表达数据分析方法,方方面面是指lncRNA的位置特征. Bac ...

  7. C语言-预估校正法求常微分方程

    #include<stdio.h> #include<math.h> #define n 14 int main(){ double a = 0.0, b = 1.4,h,m= ...

  8. (转)基因芯片数据GO和KEGG功能分析

    随着人类基因组计划(Human Genome Project)即全部核苷酸测序的即将完成,人类基因组研究的重心逐渐进入后基因组时代(Postgenome Era),向基因的功能及基因的多样性倾斜.通过 ...

  9. SAS学习笔记27 卡方检验

    卡方检验(chi-square test)是英国统计学家Pearson提出的一种主要用于分析分类变量数据的假设检验方法,该方法主要目的是推断两个或多个总体率或构成比之间有无差别. 卡方分布界值表的依据 ...

随机推荐

  1. ural1037 Memory Management

    Memory Management Time limit: 2.0 secondMemory limit: 64 MB Background Don't you know that at school ...

  2. 1209:Catch That Cow(bfs)

    题意: 从一个坐标到另一个坐标的移动方式有三种,即:st-1,st+1,2*st.每移动一步时间是一秒. 给出两个坐标,求得从第一坐标到第二座标的最短时间. #include<iostream& ...

  3. Delphi xe7并行编程快速入门(转)

    源:http://blog.csdn.net/henreash/article/details/41315183 现在多数设备.计算机都有多个CPU单元,即使是手机也是多核的.但要在开发中使用多核的优 ...

  4. JavaScript(三)---- 控制流程语句

    常用的控制流程语句有判断语句.分支语句.循环语句.基本用法都和java中的一致,switch有几点特殊. 1.判断语句 格式:        if(判断条件){            符合条件执行的代 ...

  5. [zoj解题] 1203

    #include <stdio.h> #include <stdlib.h> #include <math.h> #define MAXN 100 #define ...

  6. CSS的三种手段让元素脱离标准本文档流——浮动、绝对定位、固定定位

    1.浮动 浮动是CSS中用到的最多的一个选项,他有三个性质.关于浮动我们要强调一点,永远不是一个东西单独浮动,浮动都是一起浮动,要浮动,大家都浮动. 1.1 浮动元素脱离标准文档流 1.1.1 大概描 ...

  7. C# 开发系列(二)

    1. 参考文档:http://www.yiibai.com/csharp/csharp_environment_setup.html 2. C# ,ASP.NET HTTP Authorization ...

  8. ubuntu 系统 opencv3.1.0 安装

    opencv编译安装 编译环境安装: sudo apt-get install build-essential 必需包安装: sudo apt-get install cmake git libgtk ...

  9. Cocos2dx 3.1.1 学习笔记整理(4):事件监听与Action的初步使用

    项目忙,趁着刚才有点空,看了下触摸事件在新版本中怎么实现,遇到问题都是去:cocos2d-x-3.1.1\tests\cpp-tests\Classes下面找的,里面都是一些小例子. 首先新的CCNo ...

  10. (简单) POJ 1562 Oil Deposits,BFS。

    Description The GeoSurvComp geologic survey company is responsible for detecting underground oil dep ...