基因表达分析包括3个层次[68], 首先是单基因水平, 即比较对照组与实验组的每个基因是否存在表达差异, 这主要指差异基因表达分析; 其次是多基因水平, 如按照基因的共同功能、相互作用、共同表达等进行的聚类分析; 最后是系统水平, 即以基因网络形式解释和理解生命现象. 在生物体系中, 基因从来不是单独起作用的, 它们相互作用呈网络状, 因此从网络的观点分析基因表达谱数据必然会导致对生物系统的更高层次的理解, 目前研究者们已经开始了这方面的研究. 正如前述的各种聚类方法, 假如几个基因被聚类在同一组, 它们有可能是共同表达的基因或者是有同样的信号通径, 深入分析这些基因的增强子可能发现它们共同的调节元件, 从而揭示生物系统更高层次的网络[69]. 另外应用目前已知全序列的模式生物(如酵母、结核分枝杆菌), 人们已研制出加载有他们全基因的芯片, 通过比较不同条件下(突变、基因撬出或设计时间系列)表达谱的变化, 再使用贝叶斯网络法等进行系统分析, 可揭示基因功能和调控网络[70]. 此外还可从代谢等角度研究, 比如从新陈代谢分析基因表达的网络关系等.

gene network analysis的更多相关文章

  1. Call for Papers IEEE/ACM International Conference on Advances in Social Network Analysis and Mining (ASONAM)

    IEEE/ACM International Conference on Advances in Social Network Analysis and Mining (ASONAM) 2014 In ...

  2. Social Network Analysis的Centrality总结，以及networkx实现EigenCentrality，PageRank和KatzCentrality的对比

    本文主要总结近期学习的Social Network Analysis(SNA)中的各种Centrality度量,我暂且翻译为中心度.本文主要是实战,理论方面几乎没有,因为对于庞大的SNA,我可能连门都 ...

  3. IEEE/ACM International Conference on Advances in Social Network Analysis and Mining (ASONAM) 2014 Industry Track Call for Papers

    IEEE/ACM International Conference on Advances in Social Network Analysis and Mining (ASONAM) 2014 In ...

  4. Windows学习"Network Analysis in Python"

    原代码仓库的地址为 Network Analysis in Python. 主要按照里面的README.md 进行操作,全部仓库有100MB以上.考虑到数据比较大,再加上我对原笔记文件有修改,建议从我 ...

  5. WGCNA | weighted correlation network analysis

    早就接触过这个包了,只是一直畏惧,以为很复杂,也没有应用场景,所以认识很肤浅. 现在有应用场景了,我自己开发了一个幼稚的版本,发现了很多需求,后来想起了WGCNA似乎部分解决了我的问题,今天认真打开了 ...

  6. 社会网络分析——Social Network Analysis

    什么是社会网络分析,英文social network analysis.现在这个分析越来越时髦,也越来越显现其在社会科学的研究价值.我在2000年的时候受祝建华老师的邀请到香港城市大学作研究,接触到 ...

  7. [Network Analysis] 复杂网络分析总结

    在我们的现实生活中,许多复杂系统都可以建模成一种复杂网络进行分析,比如常见的电力网络.航空网络.交通网络.计算机网络以及社交网络等等.复杂网络不仅是一种数据的表现形式,它同样也是一种科学研究的手段.复 ...

  8. Gene co-expression analysis for functional classification and gene–disease predictions

  9. Applied Social Network Analysis in Python 相关笔记3

    如果是option2的话,答案选A. 这里节点s,从左边的选择,节点t从右边选择. 这里计算还是用以前的值,不用更新过的值.

随机推荐

  1. centos 6.5 解压 tar

    只查看 tar 文件内容而不解压 tar -tvf filename.tar 解压到指定目录(没有指定则为当前目录) tar xvf filename.tar -C /usr/file 压缩为 tar ...

  2. 理解Java构造器中的"this"

    Calling Another Constructor if the first statement of a constructor has the form this(...), then the ...

  3. Vue $ref 的用法

    <div id="app"> <cpn $ref="item"></cpn> <cpn></cpn> ...

  4. app、web其他测试点

  5. jumpserver安装和使用

    jumpserver安装 #centos6 centos7都可用yum -y install git python-pip mysql-devel gcc automake autoconf pyth ...

  6. 【已转移】【Java架构：基础技术】一篇文章搞掂：SVN

    一个例子: 公司的SVN代码中,含有target等文件夹,每次生成运行后,有很多文件打扰签入 处理方案: 1.CheckOut时,点击ChooseItems选项,不要选择这些target文件夹(有点麻 ...

  7. jenkins clone代码时间太长怎么办？

    在Jenkins的默认配置中,clone代码时会拉取所有历史版本的代码,而且默认的超时时限只有10分钟.这就造成在某些项目中,由于代码量本身就比较大,历史版本也比较多,再加上网络环境不是特别好,Jen ...

  8. Zlib not installed

    若提示:zlib not installed   wget http://zlib.net/zlib-1.2.8.tar.gz   tar zxf zlib-1.2.8.tar.gz cd zlib- ...

  9. Asp.Net Core 第01局：项目创建和部署 转载https://www.jianshu.com/p/9c9750e23b3e

    总目录 一.前言 本文通过从项目创建到部署,简单介绍Asp.Net Core. 二.环境 1.Visual Studio 2017 2.Asp.Net Core 2.2 三.开局 第一手:创建项目   ...

  10. css缓存问题

    频繁更换样式,会导致样式缓存, 在实际项目开发过过程中,页面是上传到服务器上的.而为了减少服务器的压力,让用户少加载,浏览器会将图片.css.js缓存到本地中,以便下次访问网站时使用.这样做不仅减少了 ...