见命令:

bcftools merge A.vcf.gz B.vcf.gz C.vcf.gz -Oz -o ABC.vcf.gz

  参考链接:http://vcftools.sourceforge.net/htslib.html#merge

bcftools合并vcf文件的更多相关文章

  1. 【Bcftools】合并不同sample的vcf文件,通过bcftools

    通过GATK calling出来的SNP如果使用UnifiedGenotype获得的SNP文件是分sample的,但是如果使用vcftools或者ANGSD则需要Vcf文件是multi-sample的 ...

  2. bcftools或vcftools提取指定区段的vcf文件(extract specified position )

    下载安装bcftools 见如下命令: bcftools filter 1000Genomes.vcf.gz --regions 9:4700000-4800000 > 4700000-4800 ...

  3. bcftools 提取vcf(snp/indel)文件子集

    做群体变异检测后,通常会有提取子集的操作,之前没有发现bcftools有这个功能,都是自己写脚本操作,数据量一上来,速度真的是让人无语凝噎.这里记录下提取子vcf文件的用法,软件版本:bcftools ...

  4. 如何从vcf文件中批量提取一系列基因的SNP位点?

    目录 需求 示例文件 代码实现 补充说明 需求 客户的一个简单需求: 我有一批功能基因位点,想从重测序的群体材料中找到这些位点,如何批量快速获得? 示例文件 gene.txt test.vcf 代码实 ...

  5. [Linux] vimdiff 快速比较和合并少量文件

    纯文本文件比较和合并工具一直是软件开发过程中比较重要的组成部分,vimdiff 能够在比较出来的多处差异之间快速定位,很容易的进行文件合并操作.在需要快速比较和合并少量文件的时候,vimdiff是很好 ...

  6. 获取google翻译的音频文件_合并音频文件的方法

    1. 把引文输入google 翻译,然后点击"朗读"

  7. Hadoop HDFS编程 API入门系列之合并小文件到HDFS(三)

    不多说,直接上代码.  代码 package zhouls.bigdata.myWholeHadoop.HDFS.hdfs7; import java.io.IOException;import ja ...

  8. matlab批量合并txt文件

    1: %% merge.m 2: %%%%Main程序%%%%%% 3: %%%%%% 4: %%%%%%本程序合并完各个子文件夹中的txt到主文件目录下,并且合并的文件以子文件夹名字命名 5: %% ...

  9. 合并Excel文件

    //合并Excel文件 private void MargeExcelFile(string destFile, string dirPath) { DirectoryInfo dir = new D ...

随机推荐

  1. 在eclipse中spring的xml配置文件标签中class路径全限定名自动提示设置

    这个自动提示其实很简单,没有网上说的那些要在help下的Install中输入网址来下载更新一堆东西那么复杂. 只需要打开Help — — >Eclipse Marketplace... 然后在该 ...

  2. QTP自动化测试-点滴-步骤

    1 添加 test 2 设置 整个测试项目的 setting -数据表位置 3 添加 引用 方法文件 4 添加 action 5 添加 action 对应的 repository 控件库 6 录制.整 ...

  3. flask 保存文件到 七牛云

    上篇文章队长讲述了如何把前端上传的文件保存到本地项目目录 本篇 讲述一下把前端上传的文件保存到 第三方存储(七牛云) 七牛云相关步骤思路: 首先 进去七牛云官网,注册并实名认证来获取一个七牛云账号和存 ...

  4. jdbc工具类2..0

    一.创建外部文件 url=jdbc:mysql:///qy66 use=root password=root driver=com.mysql.jdbc.Driver 二.创建工具类 package ...

  5. easyui 自动动态合并单元格

    .......onLoadSuccess : function(data) { if (data.rows.length > 0) { //调用mergeCellsByField()合并单元格 ...

  6. Redux学习(3) ----- 结合React使用

    Redux 和React 进行结合, 就是用React 做UI, 因为Redux中定义了state,并且定义了改变或获取state的方法,完全可以用来进行状态管理,React中就不用保存状态了,它只要 ...

  7. CentOS 安装git

    git安装 yum install git 初始化git “git init --bare 文件夹” 添加所有 “git add . ” 提交 “git commit -m "提交信息&qu ...

  8. linux-shell系列1-ip

    #!/bin/sh # Ping网段所有IP ip1=192.168.30.ip2=192.168.31.ip3=192.168.232.for i in `seq 1 255`do ping -c ...

  9. springboot 学习

    参考:http://www.cnblogs.com/sam-uncle/p/8796212.html spring boot 系列之一:spring boot 入门 注意:main启动类和contro ...

  10. spi slaver接口的fpga实现

    前言 spi从机接口程序,数据位8bit,sck空闲时低电平,工作时第一个沿数据传输.只有一个从机,cs低电平片选,slaver开始工作. 流程: 接口定义: 编码实现:(版权所有,请勿用于商业用途, ...