bcftools合并vcf文件
见命令:
bcftools merge A.vcf.gz B.vcf.gz C.vcf.gz -Oz -o ABC.vcf.gz
参考链接:http://vcftools.sourceforge.net/htslib.html#merge
bcftools合并vcf文件的更多相关文章
- 【Bcftools】合并不同sample的vcf文件,通过bcftools
通过GATK calling出来的SNP如果使用UnifiedGenotype获得的SNP文件是分sample的,但是如果使用vcftools或者ANGSD则需要Vcf文件是multi-sample的 ...
- bcftools或vcftools提取指定区段的vcf文件(extract specified position )
下载安装bcftools 见如下命令: bcftools filter 1000Genomes.vcf.gz --regions 9:4700000-4800000 > 4700000-4800 ...
- bcftools 提取vcf(snp/indel)文件子集
做群体变异检测后,通常会有提取子集的操作,之前没有发现bcftools有这个功能,都是自己写脚本操作,数据量一上来,速度真的是让人无语凝噎.这里记录下提取子vcf文件的用法,软件版本:bcftools ...
- 如何从vcf文件中批量提取一系列基因的SNP位点?
目录 需求 示例文件 代码实现 补充说明 需求 客户的一个简单需求: 我有一批功能基因位点,想从重测序的群体材料中找到这些位点,如何批量快速获得? 示例文件 gene.txt test.vcf 代码实 ...
- [Linux] vimdiff 快速比较和合并少量文件
纯文本文件比较和合并工具一直是软件开发过程中比较重要的组成部分,vimdiff 能够在比较出来的多处差异之间快速定位,很容易的进行文件合并操作.在需要快速比较和合并少量文件的时候,vimdiff是很好 ...
- 获取google翻译的音频文件_合并音频文件的方法
1. 把引文输入google 翻译,然后点击"朗读"
- Hadoop HDFS编程 API入门系列之合并小文件到HDFS(三)
不多说,直接上代码. 代码 package zhouls.bigdata.myWholeHadoop.HDFS.hdfs7; import java.io.IOException;import ja ...
- matlab批量合并txt文件
1: %% merge.m 2: %%%%Main程序%%%%%% 3: %%%%%% 4: %%%%%%本程序合并完各个子文件夹中的txt到主文件目录下,并且合并的文件以子文件夹名字命名 5: %% ...
- 合并Excel文件
//合并Excel文件 private void MargeExcelFile(string destFile, string dirPath) { DirectoryInfo dir = new D ...
随机推荐
- laravel 守护进程Supervisor的配置
安装Supervisor Supervisor是Linux系统中常用的进程守护程序.如果队列进程queue:work意外关闭,它会自动重启启动队列进程.在Ubuntu安装Supervisor 非常简单 ...
- kprobe原理解析
参考 http://www.cnblogs.com/honpey/p/4575928.html kprobe是linux内核的一个重要特性,是一个轻量级的内核调试工具,同时它又是其他一些更高级的内核 ...
- Android SDK Tools 24.3.2 Build脚本Bug
如下图版本: 在%Android_home%\tools\ant\build.xml中, 在483行附近, 少了aidl,aapt,dx, zipalign四个变量的声明. 加上就OK了. <p ...
- OSError: mysql_config not found
使用Python3开发一个管理平台,用MySQL数据库存放元数据.使用pip安装mysqlclient模块时出现“OSError: mysql_config not found”错误. 解决: # a ...
- Apache ab 单测 分布式
使用synchronized 处理并发 缺点:无法做到细粒度控制 只适合单点的情况 使用Redis作为分布式锁 setnx命令 设计模式 :使用 !setnx 加锁 getset命令
- 小米Note3 MIUI9可以用的XPosed框架
资源来自论坛里的:http://www.miui.com/thread-6449305-1-1.html 首先需要刷入TWRP,资源在这个帖子里:http://www.miui.com/thread- ...
- jQuery插件开发的基本形式
(function ($, window, document, undefined) { "use strict"; var defaults = { pageIndex: 0, ...
- sql中的begin catch 。。。end catch 的用法
begin catch ...end catch 是用来处理异常的 begintry--SQLendtry begincatch--sql (处理出错动作)endcatch 我们将可能会出错的sql ...
- eclipse 等号左边代码补全
1: 2. 3.完成 “ctrl + shift + l” 代码补全成功
- Nintex History in Form Table
一.设置参数 二.调用WebService 三.For Each 调用 四.拼写HTML Table 结果: 特别提示:过滤人只要根据人来循环即可