https://www.cnblogs.com/johnsonzzz/p/15151634.html

https://github.com/YangJianshun/LINKVIEW

可以绘制两个基因组、三个基因组的染色体水平的共线性关系。

按染色体配置比对文件参数，配置-k参数可以调整染色体的位置。

Nucmer+LINKVIEW实现序列水平的共线性分析的更多相关文章

  1. 基因组共线性分析工具MCScanX

    软件简介 MCScanX工具集对MCScan算法进行了调整,用于检测共线性和同线性区域,还增加了可视化和下游分析..MCscanX有三个核心工具,以及12个下游分析工具. 软件安装 进入官网http: ...

  2. 共线性分析-MCscan - python （jcvi）

    本来是不会再写这个文档的,但是由于长时间没有用这个模块,这个模块不知道是我自己弄掉了,还是别的同学误删了,于是我重新安装一下. 首先下载conda,并下载好python which pip 直接安装 ...

  3. R语言实战（五）方差分析与功效分析

    本文对应<R语言实战>第9章:方差分析:第10章:功效分析 ================================================================ ...

  4. 搜索引擎case︱从搜索序列文本看高端商务车︱统计之都

    朱雪宁(北京大学光华管理学院)               王汉生(北京大学光华管理学院) 摘要:本文对100万搜索引擎用户的13亿搜索序列文本进行探索分析,对高端车用户以及商学院人群做了描述对比,并 ...

  5. R in action读书笔记（13）第十章 功效分析

    功效分析 功效分析可以帮助在给定置信度的情况下,判断检测到给定效应值时所需的样本量.反过来,它也可以帮助你在给定置信度水平情况下,计算在某样本量内能检测到给定效应值的概率.如果概率低得难以接受,修改或 ...

  6. 生物信息-McScan（Python-jcvi）共线性画图

    比较基因组学中,共线性的分析的图无疑是最漂亮的. 共线性分析可以很好地解释进化关系和多倍化事件. 本文主要介绍的是唐老师的Python版McScan(jcvi工具包),这个包很强大,但是其功能在官网的 ...

  7. 剑指Offer面试题：20.栈的压入、弹出序列

    一.题目:栈的压入.弹出序列 题目:输入两个整数序列,第一个序列表示栈的压入顺序,请判断第二个序列是否为该栈的弹出顺序.假设压入栈的所有数字均不相等.例如序列1.2.3.4.5是某栈的压栈序列,序列4 ...

  8. SPSS数据分析—生存分析

    生存分析是对生存时间进行统计分析的一种技术,所谓生存时间,就是指从某一时间点起到所关心的事件发生的这段时间.这里的时间不一定就是钟表日历上的时间,也有可能是其他的度量单位,比如长度单位等. 生存时间有 ...

  9. LR12.53—第7课：分析场景

    第7课:分析场景 在前面的课程中,您学习如何设计,控制和执行方案运行.一旦您已加载您的服务器,你要分析的运行,并确定需要被淘汰,以提高系统性能的问题. 在图表和报告中有关方案的性能您的分析会议上提出的 ...

  10. 《UNIX/Linux网络日志分析与流量监控》新书发布

    本书从UNIX/Linux系统的原始日志(Raw Log)采集与分析讲起,逐步深入到日志审计与计算机取证环节.书中提供了多个案例,每个案例都以一种生动的记事手法讲述了网络遭到入侵之后,管理人员开展系统 ...

随机推荐

  1. 【10】java之final关键字

    1.使用final 定义的变量就变成了常量,常量必须在定义的时候就设置好内容且不能修改. public static final 声明的就是全局常量. public static final Stri ...

  2. 「JOI Open 2022」Giraffes 题解

    设我们将要给出的观感好的排列为 \(q\),我们希望求出 \(\sum[p_i=q_i]\) 的最大值(这里指不移动的长颈鹿个数). 结论一:当且仅当左右端点有当前区间最大值或者最小值时条件才能成立. ...

  3. CLIP改进工作串讲(上)学习笔记

    看了跟李沐学AI系列朱毅老师讲的CLIP改进工作串讲,这里记录一下. 1.分割 分割的任务其实跟分类很像,其实就是把图片上的分类变成像素级别上的分类,但是往往图片上能用的技术都能用到像素级别上来.所以 ...

  4. elements-plus 自动导入

    elements-plus 自动导入(官网推荐导入方式) 根据官网安装依赖 npm install -D unplugin-vue-components unplugin-auto-import 配置 ...

  5. switch和if

    #include<stdio.h> int main() { char ch1='A'; char ch2='B'; switch(ch1) { case'A': switch(ch2) ...

  6. Voletile-多线程小例子

    public class Test{ public static volatile int t = 0; //如果没有下面的全局锁标识,则结果不一定为10*1000 public static Str ...

  7. 了解ASP (一)

    1. ASP是什么? ASP 指 Active Server Pages (动态服务器页面), 是在 IIS 中运行的程序.ASP 文件的扩展名是 ".asp" 2. ASP与HT ...

  8. React Navite环境搭建

    俗话说"工欲善其事,必先利其器."所以,我们第一步就是搭建React Native开发坏境. 一.安装Node.js.npm.yarn 1.1 React native需要借助no ...

  9. vue table刷新单行数据

    1.给el-table加上标记方法 <el-table v-loading="loading" :data="tagList1" @selection-c ...

  10. # HUAWEI--IPv6 over IPv4隧道配置（简单案例）

    HUAWEI--IPv6 over IPv4隧道配置(简单案例) 拓扑图 项目要求: PC3和PC4使用的IPv6的地址,路由和路由器之间的连接使用IPv4的地址并使用静态路由连接,路由器和PC机的连 ...