在使用nn-Unet做BraTS2019数据集预测时,预测文件分别生成了三类文件:.pkl  .npz  .nii.gz,我们需要的是.nii.gz文件。所以需要进行文件移动。

# coding:utf-8
import os,shutil
import time
src_path=f"C:\\Users\\wpx\\Desktop\\result\\nnunet\BraTS2019\OUTPUT_FOLDER\\" # 当前文件所在目录
target_path=f'C:\\Users\\wpx\\Desktop\\result\\nnunet\\BraTS2019\\submit\\' #移动的指定目录
while True:
time.sleep(3)
file_list=os.listdir(src_path) # 获取到当前目录下所有文件
if len(file_list)>0: # 如果目录不为空,那么进行移动
for file in file_list:
file_end_name = file.split(".")[-1]
if file_end_name == "gz": # 判断我们需要移动的文件,这里我需要移动的是.gz文件,其他文件不需要移动
shutil.move(src_path+file,target_path+file) # 利用这个方法进行移动
exit(0) # 移动完毕,进行退出

如何使用nn-Unet,可以看这篇博客

python:将文件从一个目录移动到另一个目录。附:nnUnet使用的更多相关文章

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