http://www.webgestalt.org/

通路富集分析

参考 http://www.sci666.com.cn/9596.html

webgestalt 通路富集分析的更多相关文章

  1. GO富集分析 信号通路

    基因富集分析是分析基因表达信息的一种方法,富集是指将基因按照先验知识,也就是基因组注释信息进行分类. 信号通路是指能将细胞外的分子信号经细胞膜传入细胞内发挥效应的一系列酶促反应通路.这些细胞外的分子信 ...

  2. GO 和 KEGG 的区别 | GO KEGG数据库用法 | 基因集功能注释 | 代谢通路富集

    一直都搞不清楚这两者的具体区别. 其实初学者搞不清楚很正常,因为它们的本质是相通的,都是对基因进行归类注释的数据库. 建议初学者自己使用一下这两个数据库,应该很快就能明白其中的区别. (抱歉之前没讲清 ...

  3. 基因探针富集分析(GSEA)& GO & pathway

    http://blog.sina.com.cn/s/blog_4c1f21000100utyx.html GO是Gene Ontology的简称,是生物学家为了衡量基因的功能而而发起的一个项目,从分子 ...

  4. DAVID 进行 GO/KEGG 功能富集分析

    何为功能富集分析? 功能富集分析是将基因或者蛋白列表分成多个部分,即将一堆基因进行分类,而这里的分类标准往往是按照基因的功能来限定的.换句话说,就是把一个基因列表中,具有相似功能的基因放到一起,并和生 ...

  5. GSEA 基因集富集分析

    http://software.broadinstitute.org/gsea/index.jsp GSEA(Gene Set Enrichment Analysis)是一种生物信息学的计算方法,用于 ...

  6. python scipy包进行GO富集分析p值计算

    最近总是有需要单独对某一个类型的通路进行超几何分布的p值计算,这里记录一下python包的计算方法 使用scipy的stat里面的hypergeom.sf方法进行富集分析的p值计算 hsaxxxxx ...

  7. 富集分析DAVID、Metascape、Enrichr、ClueGO

    前言 一般我们挑出一堆感兴趣的基因想临时看看它们的功能,需要做个富集分析.虽然公司买了最新版的数据库,如KEGG,但在集群跑下来嫌麻烦.这时网页在线或者本地化工具派上用场了. DAVID DAVID地 ...

  8. 【R】clusterProfiler的GO/KEGG富集分析用法小结

    前言 关于clusterProfiler这个R包就不介绍了,网红教授宣传得很成功,功能也比较强大,主要是做GO和KEGG的功能富集及其可视化.简单总结下用法,以后用时可直接找来用. 首先考虑一个问题: ...

  9. 利用GSEA对基因表达数据做富集分析

      image Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) is a computational method that determines whether an a p ...

随机推荐

  1. pytest之mark功能

    pytest系列(一)中给大家介绍了pytest的特性,以及它的编写用例的简单至极. 那么在实际工作当中呢,我们要写的自动化用例会比较多,不会都放在一个py文件里. 如下图所示,我们编写的用例存放在不 ...

  2. Object中defineProperty数据描述

    Object.defineProperty是对对象中的属性进行数据描述的 使用语法: Object.defineProperty(obj,prop,descriptor) 使用示例: var data ...

  3. Vue学习之路由vue-router小结(九)

    一.路由: 1.后端路由: 对于普通网站,所有的超链接都是URL地址,所有的URL地址都对应服务器上对应的资源: 2.前端路由: 对于单页面应用程序来说,主要通过URL中的hash(#号)来实现不同页 ...

  4. Python 的稀疏矩阵

    什么是稀疏矩阵 简单的说,如果一个矩阵中大部分元素为0,就被称为稀疏矩阵. 对于稀疏矩阵而言,实际存储的数据项很少.如果在计算机中采用传统的二维数组(Python中用二维列表)来存储稀疏矩阵,就会浪费 ...

  5. nano命令

    1. 禁止自动换行 # nano -w xxx 2. 保存 Ctrl+O 3. 退出 Ctrl+X 4. 撤销 在请求确认文件名时按Ctrl+C来取消 5. 剪切 Ctrl+K 移动多行,只需多按几次 ...

  6. iOS静态库转Framework动态库

    参考文章: iOS静态库(.a 和framework)  XCode6制作动态及静态Framework  说说iOS中静态库的开发  dyld: Library not loaded: @rpath/ ...

  7. PHP在无限分类时注意的一些问题(不保证代码完全正确哦)

    转自:PHP在无限分类时注意的一些问题(http://lxiaoke.cn) (注意:代码使用的是原生PHP,旨在提供解决思路)1 无限分类的查找(获取所有节点) 代码: /** * 无限分类查询,默 ...

  8. 分析一个UBOOT的方法

    1. 编译完成后可以看到在主目录下生成了uboot.bin文件,为了方便分析,使用如下命令将其反汇编:arm-linux-objdump -D -m arm u-boot > u-boot.as ...

  9. 第三篇 -- XML Schema

    验证XML文档是否符合议定的XML结构有两种方法,分别是DTD模式与XML Schema.本文主要介绍XML Schema. 一.XML Schema的优点 XML Schema基于XML,没有专门的 ...

  10. 王天悦 201671030121 实验十四 团队项目评审&课程学习总结

    项目 内容 课程名称 2016级计算机科学与工程学院软件工程(西北师范大学) 作业要求 实验十四 团队项目评审&课程学习总结 课程学习目标 (1)掌握软件项目评审会流程,(2)反思总结课程学习 ...