编写CUDA内核

介绍

与用于CPU编程的传统顺序模型不同,CUDA具有执行模型。在CUDA中,编写的代码将同时由多个线程(通常成百上千个)执行。解决方案将通过定义网格和线程层次结构进行建模。

Numba的CUDA支持提供了用于声明和管理此线程层次结构的工具。这些功能与NVidia的CUDA C语言开放的功能非常相似。

Numba还开放了三种GPU内存:全局设备内存(连接到GPU本身的大型,相对较慢的片外内存),片上 共享内存本地内存。对于除最简单算法以外的所有算法,务必仔细考虑如何使用和访问内存,以最大程度地减少带宽需求和争用,这一点很重要。

内核声明

一个核心功能是指从CPU代码(*)称为GPU功能。它具有两个基本特征:

  • 内核无法显式返回值;所有结果数据都必须写入传递给函数的数组中(如果计算标量,则可能传递一个单元素数组);
  • 内核在调用时显式声明其线程层次结构:即线程块数和每个块的线程数(请注意,虽然内核仅编译一次,但可以使用不同的块大小或网格大小多次调用)。

用Numba编写CUDA内核看起来非常像为CPU编写JIT函数

@cuda.jit

def increment_by_one(an_array):

"""

    Increment all array elements by one.

    """

# code elided here; read further for different implementations

(*)注意:较新的CUDA支持设备端内核启动;此功能称为动态并行性,但Numba当前不支持它)

内核调用

通常以以下方式启动内核:

threadsperblock = 32

blockspergrid = (an_array.size + (threadsperblock - 1)) // threadsperblock

increment_by_one[blockspergrid, threadsperblock](an_array)

注意到两个步骤:

  • 通过指定多个块(或“每个网格的块”)和每个块的线程数来实例化内核。两者的乘积将给出启动的线程总数。内核实例化是通过采用已编译的内核函数(在此处increment_by_one)并用整数元组对其进行索引来完成的。
  • 通过将输入数组(如果需要,以及任何单独的输出数组)传递给内核来运行内核。内核异步运行:启动将其在设备上的执行排队,然后立即返回。可以 cuda.synchronize()用来等待所有先前的内核启动完成执行。

注意

传递驻留在主机内存中的数组,将隐式地导致将副本复制回主机,这将是同步的。在这种情况下,直到将数据复制回内核启动才会返回,因此似乎是同步执行的。

选择块大小

在声明内核所需的线程数时,具有两级层次结构似乎很奇怪。块大小(即每个块的线程数)通常很关键:

  • 在软件方面,块大小确定多少线程共享内存的给定区域。
  • 在硬件方面,块的大小必须足够大以完全占用执行单元。建议可在 CUDA C编程指南中找到

多维块和网格

为了帮助处理多维数组,CUDA允许指定多维块和网格。在上面的示例中,可以使blockspergridandthreadsperblock元组为一个,两个或三个整数。与等效大小的一维声明相比,这不会改变所生成代码的效率或行为,但可以帮助以更自然的方式编写算法。

Thread线程定位

运行内核时,内核函数的代码由每个线程执行一次。因此,它必须知道它在哪个线程中,以便知道它负责哪个数组元素(复杂算法可以定义更复杂的职责,但是基本原理是相同的)。

一种方法是让线程确定其在网格和块中的位置,然后手动计算相应的数组位置:

@cuda.jit

def increment_by_one(an_array):

# Thread id in a 1D block

tx = cuda.threadIdx.x

# Block id in a 1D grid

ty = cuda.blockIdx.x

# Block width, i.e. number of threads per block

bw = cuda.blockDim.x

# Compute flattened index inside the array

pos = tx + ty * bw

if pos < an_array.size:  # Check array boundaries

an_array[pos] += 1

注意

除非确定块大小和网格大小是阵列大小的除数,否则必须如上所述检查边界。

threadIdxblockIdxblockDimgridDim 是由CUDA后端为知道Thread线程层次结构的几何形状和当前线程的该几何形状内的位置,唯一目的提供特殊对象。

这些对象可以是1D,2D或3D,具体取决于调用内核的方式 。在每个维度访问该值,可使用x,y并z分别这些对象的属性。

numba.cuda.threadIdx

当前线程块中的线程索引。对于1D块,索引(由x属性赋予)是一个整数,范围从0(包括)到numba.cuda.blockDim排除(exclusive)。当使用多个维度时,每个维度都存在类似的规则。

numba.cuda.blockDim

实例化内核时声明的线程块的形状。对于给定内核中的所有线程,即使属于不同的块(即,每个块“已满”),该值也相同。

numba.cuda.blockIdx

线程网格中的块索引启动了内核。对于一维网格,索引(由x属性赋予)是一个整数,范围从0(含)到numba.cuda.gridDim不包含(exclusive)。当使用多个维度时,每个维度都存在类似的规则。

numba.cuda.gridDim

实例化内核时,声明的块网格形状,即此内核调用启动的块总数。

绝对位置

简单的算法将倾向于总是以与上例相同的方式使用线程索引。Numba提供了其它工具来自动执行此类计算:

numba.cuda.gridndim 

返回当前线程在整个块网格中的绝对位置。 ndim应该与实例化内核时声明的维数相对应。如果ndim为1,则返回一个整数。如果ndim为2或3,则返回给定整数的元组。

numba.cuda.gridsizendim 

返回整个块网格中Thread线程的绝对尺寸(或形状)。 ndimgrid()上述含义相同。

使用这些功能,递增示例可以变成:

@cuda.jit

def increment_by_one(an_array):

pos = cuda.grid(1)

if pos < an_array.size:

an_array[pos] += 1

二维数组和线程网格的相同示例为:

@cuda.jit

def increment_a_2D_array(an_array):

x, y = cuda.grid(2)

if x < an_array.shape[0] and y < an_array.shape[1]:

an_array[x, y] += 1

注意,实例化内核时,网格计算仍必须手动完成,例如:

threadsperblock = (16, 16)

blockspergrid_x = math.ceil(an_array.shape[0] / threadsperblock[0])

blockspergrid_y = math.ceil(an_array.shape[1] / threadsperblock[1])

blockspergrid = (blockspergrid_x, blockspergrid_y)

increment_a_2D_array[blockspergrid, threadsperblock](an_array)

进一步阅读

请参阅《CUDA C编程指南》,以详细了解CUDA编程。

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