转录本(transcript)长度范围  到

--3216021----

3UTR                       stop_codon                      CDS3         |      |           CDS2       |      |           CDS1                       start_codon                     5UTR

|      |                           |      |

3214482------------------------------------------------------------3216968----3421702--3421901----3670552-----------------------------------------------------------3671498

exon3(3UTR,stop_codon, CDS3)                                    exon3(CDS2)                                      exon1(5UTR,stop_codon, CDS1)

解释 transcript、UTR、stop_codon、exon、CDS、start_codon关系

CDS,是编码一段蛋白产物的序列。cds必定是一个orf。但也可能包括很多orf。反之,每个orf不一定都是cds。
开放阅读框(ORF)是基因序列的一部分,有内含子的,且包含一段可以编码蛋白的碱基序列。由于拥有特殊的起始密码子和直到可以从该段碱基序列产生合适大小蛋白才出现的终止密码子,该段碱基序列编码一个蛋白。OEF排除内含子就是CDS

25、转录本(transcript)组成(gtf文件的第三列)的更多相关文章

  1. 【转】C语言文件操作解析(三)

    原文网址:http://www.cnblogs.com/dolphin0520/archive/2011/10/07/2200454.html C语言文件操作解析(三) 在前面已经讨论了文件打开操作, ...

  2. Django文件上传三种方式以及简单预览功能

    主要内容: 一.文件长传的三种方式 二.简单预览功能实现 一.form表单上传 1.页面代码 <!DOCTYPE html> <html lang="en"> ...

  3. matlab之导入txt文件并取其中一列数据

    1.我想导入下面这个文件的内容,并且获取这个文件中的两列数据. 2.首先确保Matlab当前所在文件夹为txt文件所在文件夹,然后命令行执行: X = load('2019_03_21_08_59_0 ...

  4. linux清空文件内容的三种方法

    linux系统中清空文件内容的三种方法 1.使用vi/vim命令打开文件后,输入"%d"清空,后保存即可.但当文件内容较大时,处理较慢,命令如下:vim file_name:%d: ...

  5. Ajax文件上传三式

    文件上传(三式) 1.urls.py文件 url(r'^upload.html$', views.upload), 2.views.py文件 import os def upload(request) ...

  6. 文件上传三:base64编码上传

    介绍三种上传方式: 文件上传一:伪刷新上传 文件上传二:FormData上传 文件上传三:base64编码上传 Flash的方式也玩过,现在不推荐用了. 优点: 1.浏览器可以马上展示图像,不需要先上 ...

  7. GTF文件

    一.GTF文件格式 Fields must be tab-separated. Also, all but the final field in each feature line must cont ...

  8. 第18月第25天 github下载单个文件夹 git命令

    1. 用 SVN 即可. 举例说明: 譬如这个项目: Mooophy/Cpp-Primer · GitHub, 我只想看 ch03 文件夹的代码怎么办? 先打开 ch03, 其 URL 为: &quo ...

  9. Shell系列(25)- 条件判断之文件权限

    按照文件权限进行判断 读.写.执行等选项权限,只要有,就返回真 不会按照所属者,所属用户组,其他用户进行区分 先判断文件是否存在,再去判断选项权限 测试选项 作用(标红熟记) -r 文件 判断该文件是 ...

随机推荐

  1. Example 1 - XY plots

    http://www.ncl.ucar.edu/Document/Manuals/Getting_Started/Examples/gsun01n.shtml Frame 1 Frame 2 Fram ...

  2. python 3 模块

    python3 模块 一 .模块 1 什么是模块? 常见的场景:一个模块就是一个包含了python定义和声明的文件,文件名就是模块名字加上.py的后缀. import加载的模块分为四个通用类别: 1 ...

  3. HTTP1.1与HTTP1.0

    本文转载自: http://www.cnblogs.com/shijingxiang/articles/4434643.html 1.可扩展性 a.在消息中增添版本号,用于兼容判断,版本号只能判断逐段 ...

  4. Ansible Ad-Hoc命令集

    Ad-Hoc Ad-Hoc就是 “临时命令”, 从功能上讲 Ad-Hoc跟Ansible-playbook都差不多,Ansible提供了两种完成任务的方式: Ad-Hoc命令集与Ansible-pla ...

  5. Docker-使用Dockerfile创建镜像

    Dockerfile是一个文本格式的配置文件,用户可以使用Docker来快速创建自定义的镜像 基本结构 Dockerfile由一行行命令语句组成,并且支持以#开头的注释行 一般而言,Dockerfil ...

  6. MSSQL遇到以零作除数错误的处理方法

    在sql server中做除法处理的时候,我们经常需要处理除数为零的情况,因为如果遇到这种情况的时候,sqlserver会抛出遇到以零作除数错误的异常,我们总不希望把这个异常显示给用户吧. 做个会报这 ...

  7. Codeforces Round #335 (Div. 2) C. Sorting Railway Cars

    C. Sorting Railway Cars time limit per test 2 seconds memory limit per test 256 megabytes input stan ...

  8. 针对firefox ie6 ie7 ie8的css样式中的line-height属性

    针对firefox ie6 ie7 ie8的css样式中的line-height属性 以前我们大部分都是用!important来hack,对于ie6和firefox测试可以正常显示,但是ie7以上对! ...

  9. Delphi 实现检测线程类TThread是否结束

    unit Unit1; interface uses Windows, Messages, SysUtils, Variants, Classes, Graphics, Controls, Forms ...

  10. java String final + equal == 区别

    java String 是不可改变的类型. String a = "hello2"; String d = "hello"; final String b = ...