转录本(transcript)长度范围  到

--3216021----

3UTR                       stop_codon                      CDS3         |      |           CDS2       |      |           CDS1                       start_codon                     5UTR

|      |                           |      |

3214482------------------------------------------------------------3216968----3421702--3421901----3670552-----------------------------------------------------------3671498

exon3(3UTR,stop_codon, CDS3)                                    exon3(CDS2)                                      exon1(5UTR,stop_codon, CDS1)

解释 transcript、UTR、stop_codon、exon、CDS、start_codon关系

CDS,是编码一段蛋白产物的序列。cds必定是一个orf。但也可能包括很多orf。反之,每个orf不一定都是cds。
开放阅读框(ORF)是基因序列的一部分,有内含子的,且包含一段可以编码蛋白的碱基序列。由于拥有特殊的起始密码子和直到可以从该段碱基序列产生合适大小蛋白才出现的终止密码子,该段碱基序列编码一个蛋白。OEF排除内含子就是CDS

25、转录本(transcript)组成(gtf文件的第三列)的更多相关文章

  1. 【转】C语言文件操作解析(三)

    原文网址:http://www.cnblogs.com/dolphin0520/archive/2011/10/07/2200454.html C语言文件操作解析(三) 在前面已经讨论了文件打开操作, ...

  2. Django文件上传三种方式以及简单预览功能

    主要内容: 一.文件长传的三种方式 二.简单预览功能实现 一.form表单上传 1.页面代码 <!DOCTYPE html> <html lang="en"> ...

  3. matlab之导入txt文件并取其中一列数据

    1.我想导入下面这个文件的内容,并且获取这个文件中的两列数据. 2.首先确保Matlab当前所在文件夹为txt文件所在文件夹,然后命令行执行: X = load('2019_03_21_08_59_0 ...

  4. linux清空文件内容的三种方法

    linux系统中清空文件内容的三种方法 1.使用vi/vim命令打开文件后,输入"%d"清空,后保存即可.但当文件内容较大时,处理较慢,命令如下:vim file_name:%d: ...

  5. Ajax文件上传三式

    文件上传(三式) 1.urls.py文件 url(r'^upload.html$', views.upload), 2.views.py文件 import os def upload(request) ...

  6. 文件上传三:base64编码上传

    介绍三种上传方式: 文件上传一:伪刷新上传 文件上传二:FormData上传 文件上传三:base64编码上传 Flash的方式也玩过,现在不推荐用了. 优点: 1.浏览器可以马上展示图像,不需要先上 ...

  7. GTF文件

    一.GTF文件格式 Fields must be tab-separated. Also, all but the final field in each feature line must cont ...

  8. 第18月第25天 github下载单个文件夹 git命令

    1. 用 SVN 即可. 举例说明: 譬如这个项目: Mooophy/Cpp-Primer · GitHub, 我只想看 ch03 文件夹的代码怎么办? 先打开 ch03, 其 URL 为: &quo ...

  9. Shell系列(25)- 条件判断之文件权限

    按照文件权限进行判断 读.写.执行等选项权限,只要有,就返回真 不会按照所属者,所属用户组,其他用户进行区分 先判断文件是否存在,再去判断选项权限 测试选项 作用(标红熟记) -r 文件 判断该文件是 ...

随机推荐

  1. LINQ 学习路程 -- 查询操作 Skip SkipWhile Take TakeWhile

    Method Description Skip 跳过序列中指定数量元素,然后返回剩余序列 SkipWhile 只要满足条件,就跳过序列中的元素,然后返回剩余函数 Take 从序列的开头返回指定数量的连 ...

  2. LINQ 学习路程 -- 查询操作 Quantifier Operators All Any Contain

    Operator Description All 判断所有的元素是否满足条件 Any 判断存在一个元素满足条件 Contain 判断是否包含元素 IList<Student> studen ...

  3. castle windsor学习----ComponentModel construction contributors

    public class RequireLoggerProperties : IContributeComponentModelConstruction { public void ProcessMo ...

  4. 希尔排序(Shell Sort)

    一.思路 希尔排序是基于插入排序算法,通过允许不相邻的元素进行交换这一简单的改进,使数组变为局部有序,最终再用插入排序. 希尔排序的思想是使数组中任意间隔h的元素都是有序的.这样的数组被称为h有序数组 ...

  5. 现有exe转为服务_方式01

    1.安装X.exe服务: ...>路径\X.exe /install 2.卸载X.exe服务: ...>路径\X.exe /uninstall 3.开始运行XX(程序是X.exe,服务名是 ...

  6. Sobel导数

    Sobel 导数 目标 本文档尝试解答如下问题: 如何使用OpenCV函数 Sobel 对图像求导. 如何使用OpenCV函数 Scharr 更准确地计算  核的导数. 原理 Note 以下内容来自于 ...

  7. BZOJ 1597 [Usaco2008 Mar]土地购买:斜率优化dp

    题目链接:http://www.lydsy.com/JudgeOnline/problem.php?id=1597 题意: 有n块矩形土地,长为a[i],宽为b[i]. FJ想要将这n块土地全部买下来 ...

  8. html基础学习(注意点)

    浏览器会自动地在块级元素(<p><h1>)的前后添加空行 当显示页面时,浏览器会移除源代码中多余的空格和空行.所有连续的空格或空行都会被算作一个空格.需要注意的是,HTML 代 ...

  9. 仿联想商城laravel实战---7、lavarel中如何给用户发送邮件

    仿联想商城laravel实战---7.lavarel中如何给用户发送邮件 一.总结 一句话总结: 设置邮件服务器,比如163邮箱 lavarel中配置邮件服务,在.env中 控制器中使用Mail对象发 ...

  10. 数据结构C语言版干货------->线性表之顺序表

    一:头文件定义 /*************************************************************************** *项目 数据结构 *概要 逻辑 ...