给esri中国的客服打电话被告知，是一直存在这个bug，arcgis10.2对应的oracle数据库版本要用11.2.0.3及以上的:

1、数据库升级可以用打补丁的当方式.

2、直接重装，我这里是直接重装的oracle，装完之后，有一个图层还有这个问题，刚开始以为是这个图层中有一条异常数据，结果找了半天没有找到，最后替换了ST_Geometry的类库（部署ArcSDE10.2.1版本地理数据库和对应版本ST_Geometry）。

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