假设存在路径C:/coverage/Homo_sapiens.sort.add_exon1_coverage.txt,欲提取Homo_sapiens.sort.add_exon1_coverage.txt文件名,则用到basename函数和start、stop参数,命令行如下所示:

filename<-'C:/coverage/Homo_sapiens.sort.add_exon1_coverage.txt'
substr(basename(filename), start = 1, stop = 4) #表示提取文件名的第一个字符至第四个字符,即Homo
substr(basename(filename), start = 23, stop = 27)#表示提取文件名的第23个字符至第27个字符,即exon1
paste(substr(basename(path), start = 1, stop = 4),substr(basename(path), start = 23, stop = 27)) #将两个字符黏贴起来  

效果如下图所示:

R语言:提取路径中的文件名字符串(basename函数)的更多相关文章

  1. python和C语言从路径中获取文件名

    1.Python import os file_name = os.path.basename(filepath)#带后缀的文件名(不含路径) file_name_NoExtension = os.p ...

  2. R语言使用过程中出现的问题--attach()函数的使用

    使用attach(file)时,一定要配合使用detach(file),否则再此运行程序时极易出现问题,The following objects are masked ... 此外工作空间中不能有与 ...

  3. 用R语言提取数据框中日期对应年份(列表转矩阵)

    用R语言提取数据框中日期对应年份(列表转矩阵) 在数据处理中常会遇到要对数据框中的时间做聚类处理,如从"%m/%d/%Y"中提取年份. 对应操作为:拆分成列表——列表转矩阵——利用 ...

  4. R语言作为BI中ETL的工具

    R语言作为BI中ETL的工具,增删改 R语言提供了强大的R_package与各种数据库进行数据交互. 外加其强大数据变换清洗函数,为ETL提供一条方便快捷的道路. RODBC ROracal RMys ...

  5. 概率图模型 基于R语言 这本书中的第一个R语言程序

    概率图模型 基于R语言 这本书中的第一个R语言程序 prior <- c(working =0.99,broken =0.01) likelihood <- rbind(working = ...

  6. Java获取路径中的文件名(正则表达式)

    Java获取路径中的文件名(正则表达式) 目标 在这个路径中我想得到model2 /E:/2017-02-21--SoftWare/github/test/Java/poiDemo_word2exce ...

  7. No.2 R语言在生物信息中的应用—模式匹配

    目的: 1. 计算自定义模序在所有蛋白质的匹配位点和次数 2. 输出超过阈值的蛋白质序列到Hit_sequences.fasta 3. Hit_sequences.fasta中序列用小写字母,匹配用大 ...

  8. JavaScript中常见的字符串操作函数及用法

    JavaScript中常见的字符串操作函数及用法 最近几次参加前端实习生招聘的笔试,发现很多笔试题都会考到字符串的处理,比方说去哪儿网笔试题.淘宝的笔试题等.如果你经常参加笔试或者也是一个过来人,相信 ...

  9. LoadRunner中常用的字符串操作函数

    LoadRunner中常用的字符串操作函数有:                strcpy(destination_string, source_string);               strc ...

随机推荐

  1. Yii2总结

    1. Web访问流程(即在浏览器中输入一个网址至浏览器展现页面结果的过程) a. 将输入的网址提取出域名,在本地hosts文件中查找对应的IP地址(windows为C:/windows/system3 ...

  2. solr安装配置(一)

    本文使用的solr版本是solr-5.5.5. 步骤: 1.解压solr压缩包. 2.将solr-5.5.5\server\solr-webapp目录下面的文件拷贝到Tomcat的webapps目录下 ...

  3. How to RAMDISK on macOS

    diskutil erasevolume HFS+ 'RAM Disk' `hdiutil attach -nomount ram://8388608`

  4. js中的异常处理

    js中的异常处理语句有两个,一个是try……catch……,一个是throw. try……catch用于语法错误,错误有name和message两个属性.throw用于逻辑错误. 对于逻辑错误,js是 ...

  5. Java线程的创建方式三:Callable(四)

    一.Java实现多线程的三种方式 方式一:继承Thread类: public class Test extends Thread { public static void main(String[] ...

  6. 配置 BizTalk Server

    使用“基本配置”或“自定义配置”配置 BizTalk Server. 基本配置与自定义配置       如果配置使用域组,则进行“自定义配置”. 如果配置使用自定义组名称而不是默认组名称,则进行“自定 ...

  7. CentOS安装、配置Nginx反向代理

    添加Nginx存储库 sudo yum install epel-release 安装Nginx sudo yum install nginx 启动Nginx sudo systemctl start ...

  8. js弹框的3种方法

    js的三种弹框的方法 1.第一种 :  alert("1"); 2.第二种 :  window.open("Tests2.html"); var r = con ...

  9. BZOJ2480Spoj3105 Mod&BZOJ1467Pku3243 clever Y——EXBSGS

    题目描述 已知数a,p,b,求满足a^x≡b(mod p)的最小自然数x. 输入     每个测试文件中最多包含100组测试数据.     每组数据中,每行包含3个正整数a,p,b.     当a=p ...

  10. BZOJ3133[ballmachine]——倍增+优先队列

    题目描述 有一个装球机器,构造可以看作是一棵树.有下面两种操作: 从根放入一个球,只要下方有空位,球会沿着树滚下.如果同时有多个点可以走,那么会选择编号最小的节点所在路径的方向.比如依次在树根4放2个 ...