癌症蛋白质基因组学主要研究driver性质的突变，该突变有可能是转化为癌基因的突变、抑癌基因突变、药物位点突变和蛋白突变，可以使用mutation assessor 预测突变

突变导致疾病，修饰仅影响生物学功能

将序列库、图谱库、公共突变数据库和RNAseq组合起来构成组合数据库找突变。比如：

dbSNP：数据库收录的基因组变异数据

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/

n SwissVar：基于UniProt的突变和疾病数据库

http://swissvar.expasy.org/

n CanProVar：人类癌特异性突变数据库

http://bioinfo.vanderbilt.edu/canprovar/

CHPP 人类染色体蛋白质组计划是整合所有已知蛋白质信息，分析染色体上蛋白编码情况

Eg：1号染色体中未鉴定出的蛋白质：

大规模蛋白质组学具有未饱和性特点

蛋白质组与其他组学的关系图：

 

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