癌症蛋白质基因组学主要研究driver性质的突变，该突变有可能是转化为癌基因的突变、抑癌基因突变、药物位点突变和蛋白突变，可以使用mutation assessor 预测突变

突变导致疾病，修饰仅影响生物学功能

将序列库、图谱库、公共突变数据库和RNAseq组合起来构成组合数据库找突变。比如：

dbSNP：数据库收录的基因组变异数据

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/

n SwissVar：基于UniProt的突变和疾病数据库

http://swissvar.expasy.org/

n CanProVar：人类癌特异性突变数据库

http://bioinfo.vanderbilt.edu/canprovar/

CHPP 人类染色体蛋白质组计划是整合所有已知蛋白质信息，分析染色体上蛋白编码情况

Eg：1号染色体中未鉴定出的蛋白质：

大规模蛋白质组学具有未饱和性特点

蛋白质组与其他组学的关系图：

 

dbSNP|n SwissVar|n CanProVar|CHPP|mutation assessor|的更多相关文章

  1. Detailed Information for Outputted Files from Somatic Mutation Annotators（annovar 注释文件条目详细解释）

    CONTENTS *_annoTable.txt (ANNOVAR) *_annoTable.txt (SnpEff) *_genelist.txt (ANNOVAR & SnpEff) db ...

  2. somatic mutation体细胞变异检测文献分享--转载

    转载 :http://blog.sina.com.cn/s/blog_83f77c940102xuro.html Kalatskaya I, Trinh Q M, Spears M, et al. I ...

  3. HTML5新特性之Mutation Observer

    Mutation Observer(变动观察器)是监视DOM变动的接口.当DOM对象树发生任何变动时,Mutation Observer会得到通知. 要概念上,它很接近事件.可以理解为,当DOM发生变 ...

  4. 使用HTML5新特性Mutation Observer实现编辑器的撤销和撤销回退操作

     MutationObserver介绍 MutationObserver给开发者们提供了一种能在某个范围内的DOM树发生变化时作出适当反应的能力.该API设计用来替换掉在DOM3事件规范中引入的Mut ...

  5. Leetcode: Minimum Genetic Mutation

    A gene string can be represented by an 8-character long string, with choices from "A", &qu ...

  6. 转: HTML5新特性之Mutation Observer

    转: HTML5新特性之Mutation Observer Mutation Observer是什么 Mutation Observer(变动观察器)是监视DOM变动的接口.当DOM对象树发生任何变动 ...

  7. [LeetCode] Minimum Genetic Mutation 最小基因变化

    A gene string can be represented by an 8-character long string, with choices from "A", &qu ...

  8. ASP.NET Core中使用GraphQL - 第七章 Mutation

    ASP.NET Core中使用GraphQL - 目录 ASP.NET Core中使用GraphQL - 第一章 Hello World ASP.NET Core中使用GraphQL - 第二章 中间 ...

  9. [Swift]LeetCode433. 最小基因变化 | Minimum Genetic Mutation

    A gene string can be represented by an 8-character long string, with choices from "A", &qu ...

随机推荐

  1. 吴裕雄--天生自然 JAVASCRIPT开发学习： JSON

    <!DOCTYPE html> <html> <head> <meta charset="utf-8"> <title> ...

  2. [题解] 洛谷P3950 部落冲突

    传送门 拿到题目,一看 裸LCT (其实是我懒得打,splay又臭又长) 首先,这道题的意思就是删掉一些边 所以常规操作 点权转边权 之后对于战争操作,在对应的边上+1 对于和平操作,在对应的边上-1 ...

  3. javaweb04 ServletRequest&ServletResponse

    WEB浏览器与WEB服务器之间的一问一答的交互过程必须遵循一定的规则,这个歌规则就是 HTTP协议HTTP协议是超文本传输协议,它是TCP/IP协议集中的一个应用层协议,用于定义WEB浏览器与WEB服 ...

  4. AXURE方便的功能

    (1)建立一个公共的页面,可以把一些常用的组建放进去,就和代码要封装方法一样,这样省区了用到一次画一次的麻烦. 其中可以包括:弹出框.图标.搜索框之类的. 当然还可以把经常用到的 登陆.注册.忘记密码 ...

  5. 学习Unet的一些过程

    毕业设计的项目,需要用到手机作为控制端,这就需要用到Unity的网络模块. 因为只会设计到几个简单的按钮命令,所以不打算做多么复杂的功能,一开始打算用C#的Socket编程,但是考虑到多线程的关系觉得 ...

  6. winform程序常用图标网站及资源

    1.easyicon网站,免费下载 https://www.easyicon.net/ 2.findicons https://findicons.com/ 3.iconarchive http:// ...

  7. Python笔记_第四篇_高阶编程_二次封装

    1.二次封装: 二次封装其实就是对一个类或者一个方法进行二次的改造增加新的功能. 2.一个类的二次封装: 我们以一个进程为例,我们把Process这个库进行二次封装,增加一些功能,在调用. thoma ...

  8. 201412-2 Z字形扫描 Java

    思路: 观察输出可以发现,可以不用定义 "方向" ,看斜线,如果是第偶数条(0也是偶数),从左下到右上输出.如果是第奇数条,从右上到左下输出. import java.util.S ...

  9. 对于centos的运用ssh远程连接

    1,首先安装ssh服务器 $yum install openssh-server 2,记录你当前centos的ip地址 $ifconfig 3,再在windows里面安装putty 4安装完成后, 在 ...

  10. MVC的异步模式

    [小家Spring]高性能关键技术之---体验Spring MVC的异步模式(Callable.WebAsyncTask.DeferredResult) 基础使用篇 https://blog.csdn ...