16S数据质控流程,一次下机lane包括很多的项目,每个项目有独立的合同号,一个项目可能包含16S或者ITS两种,通过一个完整的pipeline,将上游拆分好的数据全部整理成可以直接分析的数据.原本这个工作是通过并行的sge实现,是运行层面的并行,现在在程序层面实现并行处理,可以脱离sge系统工作. import os import sys import re import time import collections from multiprocessing import Process,J…

https://mlnote.wordpress.com/2015/12/16/python%E6%9C%BA%E5%99%A8%E5%AD%A6%E4%B9%A0%E5%AE%9E%E8%B7%B5%E4%B8%8Ekaggle%E5%AE%9E%E6%88%98-machine-learning-for-kaggle-competition-in-python/ Author: Miao Fan (范淼), Ph.D. candidate on Computer Science. Affil…

进程与线程 在多任务处理中,每一个任务都有自己的进程,一个任务会有很多子任务,这些在进程中开启线程来执行这些子任务.一般来说,可以将独立调度.分配的基本单元作为线程运行,而进程是资源拥有的基本单位. python支持多进程multiprocessing,以及多线程threading. 多进程 os.fork()函数可以开启一个进程.该函数会返回两次值,分别在父进程中返回子进程的ID,而在子进程中永远返回0. os.getpid()函数可以返回进程的ID.os.getppid()则可以返回父进程的…

转载于: https://my.oschina.net/leejun2005/blog/398826 在批评Python的讨论中,常常说起Python多线程是多么的难用.还有人对 global interpreter lock(也被亲切的称为"GIL")指指点点,说它阻碍了Python的多线程程序同时运行.因此,如果你是从其他语言(比如C++或Java)转过来的话,Python线程模块并不会像你想象的那样去运行.必须要说明的是,我们还是可以用Python写出能并发或并行的代码,并且能带…

前言 在上篇Golang高效实践之并发实践channel篇中我给大家介绍了Golang并发模型,详细的介绍了channel的用法,和用select管理channel.比如说我们可以用channel来控制几个goroutine的同步和退出时机,但是我们需要close channel通知其他接受者,当通知和通信的内容混在一起时往往比较复杂,需要把握好channel的读写时机,以及不能往已经关闭的channel中再写入数据.如果有没有一种更好的上下文控制机制呢?答案就是文章今天要介绍的context,…

简介 接着上一篇继续看一下如何并发测试以及并发测试的过程中,可能遇到的问题,在这里宏哥把宏哥遇到的和小伙伴或者童鞋们,一起分享一下. Appium端口检测 问题思考 经过前面学习,我们已经能够使用python启动appium服务,但是启动Appium服务之前必须保证对应的端口没有被占用,否则会出现如下报错: error: Couldn't start Appium REST http interface listener. Requested port is already in use. Pl…

python之socketserver实现并发 服务端 import socketserver #socketserver模块是用来实现并发 # 我们自己的类里一定要继承socketserver.BaseRequestHandler方法 # 里面需要一个handle方法 # 每当客户端来连接时,就会创建一个实例,实例与实例之间独立 # 实例包含 # self.request:conn 作用:服务端收发信息的对象 # self.client_address:addr 作用:客户端的ip地址 cla…

为什么需要并发编程? 如果程序中包含I/O操作,程序会有很高的延迟,CPU会处于等待状态,这样会浪费系统资源,浪费时间 1.Python的并发编程分为多进程并发和多线程并发 多进程并发:运行多个独立的程序,优势在于并发处理的任务都有操作系统管理,不足的是程序和各个进程间通信和数据共享不方便 多线程并发:有程序员管理并发处理人物,这种并发的可以方便的在线程间共享数据,前提是不能被锁住 对于计算密集型程序:多进程并发优于多线程并发,计算密集型指的是:程序运行的时间大部分都消耗在cpu的运算处理过程中…

import time import os import multiprocessing from multiprocessing import Queue, pool """ 一.Python 使用多进程实现并发编程: 因为cpython解释器中有GIL存在的原因(每个进程都会维护一个GIL,jpython解释器没有这个问题),所以在一个进程内, 即使服务器是多核cpu,同一时刻只能有一个线程在执行任务(一个进程内).如果存在较多IO,使用多线程是可以提高处理速度的, 但是…

Scala多线程-并发实践 scala extends Thread_百度搜索 scala多线程 - 且穷且独立 - 博客园 Scala和并发编程 - Andy Tech Talk - ITeye博客 scala中java并发编程 - 厚积!! - 博客园 Spark记录-Scala多线程 - 信方 - 博客园 scala 多线程 - - CSDN博客…