题意:有两个代表基因序列的字符串s1和s2,在两个基因序列中通过添加"-"来使得两个序列等长:其中每对基因匹配时会形成题中图片所示匹配值,求所能得到的总的最大匹配值. 题解:这题运用dp的解法是借用了求最长公共子序列的方法,,定义dp[i][j]代表s1以第i位结尾的串和s2以第j位结尾的串匹配时所能得到的最大匹配值:那么状态转移方程为:dp[i][j]=max( dp[i-1][j-1]+s1[i]和s2[j]的匹配值 , dp[i-1][j]+s1[i]和'-'的匹配值 , dp[…

传送门 题目大意: 将两个字符串对齐(只包含ACGT,可以用'-'占位),按照对齐分数表(参见题目)来计算最后的分数之和,输出最大的和. 例如:AGTGATG 和 GTTAG ,对齐后就是(为了表达对齐,这里我用m表示'-') AGTGATG mGTTAmG 题目分析: 首先看出这道题与LCS有关,下面来考虑转移: 当t1[i]==t2[j]时,和LCS一样,\(dp[i][j] = dp[i-1][j-1]+score[t1[i]][t2[j]]\) 当t1[i]!=t2[j]时,唯一不同的是…

最长公共子序列的变形 题目大意:给出两个基因序列,求这两个序列的最大相似度. 题目中的表格给出了两两脱氧核苷酸的相似度. 状态转移方程为: dp[i][j] = max(dp[i-1][j]+Similarity(s1[i], '-'),                     dp[i][j-1]+Similarity(s2[j], '-'),                     dp[i-1][j-1]+Similarity(s1[i], s2[j])); 注意边界的初始化. //#de…

题意: 人类基因由A.C.G.T组成. 有一张5*5的基因表.每格有一个值,叫相似度.例:A-C:-3.意思是如果A和C配对, 则它俩的相似度是-3[P.S.:-和-没有相似度,即-和-不能配对] 现在给两条基因片段.(长度不一定相等) 现在你要在两条基因片段中插入若干个-(空白基因),使得两个基因片段长度相等,且得到的整体相似度的值最大.[再次P.S.:-和-不能配对] 思路: 因为-和-不能匹配,所以插入的-的个数是有限的. str1的第一个基因可以与str1的第一个或-配对.然后,,,,很…

Human Gene Functions Time Limit: 1000MS   Memory Limit: 10000K Total Submissions: 17805   Accepted: 9917 Description It is well known that a human gene can be considered as a sequence, consisting of four nucleotides, which are simply denoted by four…

Human Gene Functions Time Limit: 1000MS   Memory Limit: 10000K Total Submissions: 19573   Accepted: 10919 Description It is well known that a human gene can be considered as a sequence, consisting of four nucleotides, which are simply denoted by four…

大概作了一周,终于A了 类似于求最长公共子序列,稍有变形 当前序列 ch1 中字符为 a,序列 ch2 中字符为 b 则有 3 种配对方式: 1. a 与 b 2. a 与 - 3. - 与 b 动态转移方程: dp[i][j] = max(dp[i - 1][j - 1] + g(ch1[i],ch2[j]) , dp[i - 1][j] + g(ch1[i],‘-') , dp[i][j-1] + g('-',ch2[j])) 代码如下: #include<stdio.h> #includ…

题意: 输入俩个字符串,怎样变换使其所有字符对和最大.(字符只有'A','C','G','T','-') 其中每对字符对应的值如下: 怎样配使和最大呢. 比如: A G T G A T G -  G T T A -  G 和为 (-3)+5+5+(-2)+5+(-1) +5=14. 题解: 最长公共子序列的变形. 设dp[i][j]为a的前i个和b的前j个字符能构成的最大和. score[][]为每对字符的值,比如score['A']['G']为'A','G'这对字符对应的值. string a…

题目链接:http://acm.hdu.edu.cn/showproblem.php?pid=1159 Common Subsequence Time Limit: 2000/1000 MS (Java/Others)    Memory Limit: 65536/32768 K (Java/Others)Total Submission(s): 37551    Accepted Submission(s): 17206 Problem Description A subsequence of…

Common Subsequence Time Limit: 2000/1000 MS (Java/Others)    Memory Limit: 65536/32768 K (Java/Others) Total Submission(s): 18387    Accepted Submission(s): 7769 Problem Description A subsequence of a given sequence is the given sequence with some el…