miRNA分析--数据过滤(一) 在比对之前为了减少比对时间,将每一个样本中的reads进行合并,得到fasta格式,其命名规则如下: 样本_r数子_x数字 r 中的数字表示reads序号: x 中的数字表示该条reads重复次数 比对分为两条策略 1.根据本物种已有的miRNA序列进行比对, 已知当miRNA序列从 miRBase或者 sRNAanno得到 (应该将clean reads比对到所研究物种到tRNA, rRNA, snoRNA,mRNA等数据,允许一个错配,将比对上等reads过…

miRNA分析--数据过滤(一) miRNA分析--比对(二) 根据miRNA Target Prediction in Plants, miRNA并非所有区域都要求严格匹配,其中第1位碱基和第14位以后的碱基是允许错配(以miRNA 5'为始). miRNA 文件提交不管是U或者T都是可以的 miRNA 靶基因预测我采用了3个工具 1.psRNATarget: A plant Samll RNA Target Analysis Server 进去以后,提交自己miRNA文件,fasta格式,并…

iOS Crash 分析(文二)-崩溃日志组成 现在我们看一个淘宝iOS主客崩溃的例子: ### 1.进程信息 ### Incident Identifier: E4201F10-6F5F-40F9-B938-BB3DA8ED7D50 CrashReporter Key: TODO Hardware Model: iPhone4,1 Process: Taobao4iPhone [3538] Path: /var/mobile/Applications/E3B51E77-D44D-4B3E-87…

手机自动化测试:appium源码分析之bootstrap二   在bootstrap项目中的io.appium.android.bootstrap.handler包中的类都是对应的指令类, private static HashMap<String, CommandHandler> map = new HashMap<String, CommandHandler>(); static {map.put("waitForIdle", new WaitForIdle…

用Schedulers(调度器)实现多任务(并发,Concurrency)的例子 废话不多说我们看一下有关于RxJava的代码: 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 private Subscription _subscription; @OnClick(R.id.btn_start_operation) // public void startLongOperation()…

前言:写 分析轮子(一)-ArrayList.java 的时候看到源码中有 int newCapacity = oldCapacity + (oldCapacity >> 1); 这样的代码,以前也学习过左移.右移,无符号右移三类移位运算符,不过忘记了具体的变化规则,于是就实验了一把,便有了本篇博文. 注:玩的是JDK1.7版本 一:先看结论 1)<< 左移 将左操作数向左移动,无论做操作数是正还是负,都在低位补“0” 2)>> 带符号的右移 将左操作数右移,如果左操作…

上篇文章中我们对Netty中NioEventLoop创建流程与源码进行了跟踪分析.本篇文章中我们接着分析NioEventLoop的启动流程: Netty中会在服务端启动和新连接接入时通过chooser选择器,分别为NioServerSocketChannel与NioSocketChannel选择绑定一个NioEventLoop,接下来我们就分别从这两个方面梳理NioEventLoop的启动源码 一.服务端启动 首先我们结合下图看下Netty服务启动过程中,NioServerSocketChann…

一.URL分析 通过对“Python机器学习”结果抓包分析,有两个无规律的参数:_ksTS和callback.通过构建如下URL可以获得目标关键词的检索结果,如下所示: https://s.taobao.com/search?data-key=s&data-value=44&ajax=true&_ksTS=1482325509866_2527&callback=jsonp2528&q=Python机器学习&imgfile=&js=1&stat…

一.前言 损失函数计算主要分析两部分一部分是yolo_head函数的分析另一部分为ignore_mask的生成的分析. 二.重要细节分析 2.1损失函数计算具体代码及部分分析 def yolo_loss(args, anchors, num_classes, ignore_thresh=.5, print_loss=False): #args前三个元素为yolov3输出的预测值,后三个维度为保存的label 值 '''Return yolo_loss tensor Parameters ----…

在spark 源码分析之五 -- Spark内置RPC机制剖析之一创建NettyRpcEnv中,剖析了NettyRpcEnv的创建过程. Dispatcher.NettyStreamManager.TransportContext.TransportClientFactory.TransportServer.Outbox.Inbox等等基础的知识都已经在前面剖析过了. 可以参照如下文章做进一步了解. p.p1 { margin: 0.0px 0.0px 0.0px 0.0px; font: 12…