http://wenku.baidu.com/link?url=Fr_C7J5F4KusZTpZJUfuVfh4Bpyb9BAY7IQhWAOYirQJW0Oz-X3fI5r41aPHiQR8ENn9k6P1V9v1we6U2fe4IJIEci7Twg1Pma6n5ZC03k7 在某一群体中,不同座位上某两个等位基因同时遗传的频率明显高于预期的随机频率的现象,称连锁不平衡 (linkage disequilibrium) .由于 HLA 不同基因座位的某些等位基因经常连锁在一起遗传,而连锁的基因…

1.Hard and soft selective sweeps 长期以来,快速适应主要与选择作用于高度多基因的数量性状有关,例如在育种试验期间.这些性状可以通过对大量已经存在的多态性的群体频率的微小调整,对选择压力的变化作出快速反应.在这个所谓的“无穷小模型”下,适应性预计会在群体基因组数据中留下微妙的特征,因为潜在的多态性可能在群体中存在了足够长的时间,从而与其周围的遗传变异脱钩.然而,最近的研究表明,快速适应往往只涉及少数几个具有巨大个体效应的等位基因,而这些等位基因以前在种群中很少见,甚…

现在GWAS已经属于比较古老的技术了,主要是碰到严重的瓶颈了,单纯的snp与表现的关联已经不够,需要具体的生物学解释,这些snp是如何具体导致疾病的发生的. 而且,大多数病找到的都不是个别显著的snp,大多数都找到了很多的snp,而且snp都落在非编码区了,这就导致对这些snp的解读非常的困难. 目前,已经有非常傻瓜式的GWAS pipeline了,比如:A tutorial on conducting genome‐wide association studies: Quality contr…

本文首发于“生信补给站”,https://mp.weixin.qq.com/s/Gl6BChxSYbSHMo9oMpufPg 连锁不平衡图,用来可视化不同SNP之间的连锁程度,前同事间俗称“倒三角”图. 本文使用自己的数据,因为安装R包后使用内置数据集运行出结果较容易,但是自己的数据就可能会有一些不大不小的“坑”,我替你们趟了... 一 载入R包 数据 数据为内置CEUData保存后,进行了“细微”的处理(去掉SNP碱基之间的“/”),这种基因型文件很常见: library("LDheatmap…

PLINK提供了“--ld”的参数计算两个SNP位点的连锁不平衡值. 命令如下: plink --file file --ld rs123 rs134 --out rs123_rs134 生成如下数据: --ld rs123 rs134: R-sq = 0.0313386       D' = 1 Haplotype Frequency Expectation under LE --------- --------- -------------------- TG 0 0.022549 CG 0…

哈代-温伯格平衡定律(Hardy-Weinberg equilibrium),即HW平衡,是指对于一个大且随机交配的种群,基因频率和基因型频率在没有迁移.突变和选择的条件下会保持不变. 它是建立在一个理想的群体模式上的,有四个假设前提:1.群体无限大:2.随机婚配:3.没有突变:4.没有大规模迁移和选择因素的影响.其结论是群体中的基因频率和基因型频率在逐代传递中保持不变. 实际上这种理想群体的条件不可能完全满足,但经过数学推导,在一个群体中,基因频率和基因型频率在每一代都是恒定的,即使未达到平衡…

/usr/bin/ld.bfd.real: cannot find -lGL /usr/bin/ld.bfd.real: cannot find -lX11 根据网上大多数的说法,以及官网的介绍.截至5月底,android对ubuntu12.04的编译平台的支持不是很推荐,有些库的兼容方面会有一些问题 这两个错误报的错其实就是说没有在库路径中找到libGL.so libX11.so 但是打开etc/ld.so.conf.d中查看64位的库路径下x86_64-linux-gnu.conf配置文件…

一个如何识别相似语句的问题,于是上网找了找,一个叫Levenshtein Distance的算法比较简单,就写了段代码实现了一下,效果还不错. 这个算法是一个俄国人Lvenshtein提出的,用于计算两个字符串之间,由一个转换成另一个所需的最少编辑操作次数.次数越少,表示两个字符串相似度越高. 用实例来讲解算法最直观,我们假设有两个字符串:test和est,需要经过以下几个步骤来获取LD值. 1.初始化一个矩阵 ┌──┬───────────┐ │ │test t e s t │ ├──┼───…

Undefined symbols for architecture x86_64: "_OBJC_CLASS_$_The49DayPersonalFullscreenGiftModel", referenced from: objc-class-ref in The49DayPersonalRoomGiftModel.o ld: symbol(s) not found for architecture x86_64 clang: error: linker command faile…

我猜想错误引起的原因可能是因为我复制target的时候原来的工程中的的link binary with libraries中原来的libpods-xxx.a没有删除.我将多余的libPods删除后解决. 关于问题ld:library not found for -lXXX ld:library not found for -lXXX 的问题有可能是你的某个库的连接引用有问题,解决的办法就是在项目的target里,选中Link Binary With Libraries 里的.a或framewor…

编译时出现错误/usr/bin/ld: cannot find -lz,安装zlib和zlib-devel yum install zlib yum install zlib-devel…

1. 查看执行文件的链接库 ldd 例子: # ldd /sbin/sln not a dynamic executable “not a dynamic executable”是 ldd 说明 sln 是静态链接的一种方式. # ldd /bin/ln libc.so.6 => /lib/libc.so.6 (0x40021000) /lib/ld-linux.so.2 => /lib/ld-linux.so.2 (0x40000000) 如您所见,ln 依赖外部共享库 libc.so.6…

问题:Undefined symbols for architecture x86_64:   ld: symbol(s) not found for architecture x86_64 问题原因:所用的库不支持 X86_64架构 解决方法:在Target —> BuildSetting —> Architectures中修改为$(ARCHS_STANDARD_32_BIT)如下图:  …

最近有个jar改了名字后,有个依赖它的工程死活引用的是老名字,导致打包的时候出错,如下所示: [INFO] ------------------------------------------------------------------------[INFO] Building com.ld.base.runtime 1.0.0-SNAPSHOT[INFO] -------------------------------------------------------------------…

Assembly on x86_64 Linux Some instructions in Intel assembly set are invalid in x86_64 env. e.g. aaa push eax ... Solutions Use 64-bit instructions instead.(You can refer to Intel developer manual) Add 32-bit options: For nasm: nasm -f elf32 xxx.asm…

目录 . 动态链接的意义 . 地址无关代码: PIC . 延迟版定(PLT Procedure Linkage Table) . 动态链接相关结构 . 动态链接的步骤和实现 . Linux动态链接器实现 . 显式运行时链接 . 共享库系统路径 && 默认加载顺序 1. 动态链接的意义 . 静态链接对内存和磁盘的浪费很严重,在静态链接中,C语言静态库是很典型的占用空间的例子 . 静态链接对程序的更新.部署.发布会造成严重的麻烦 为了解决这些问题,最好的思路就是把程序的模块相互分割开来,形成独…

问题: 在linux环境编译应用程式或lib的source code时常常会出现如下的错误讯息: /usr/bin/ld: cannot find -lxxx 这些讯息会随着编译不同类型的source code 而有不同的结果出来如: /usr/bin/ld: cannot find -lc /usr/bin/ld: cannot find -lltdl /usr/bin/ld: cannot find -lXtst 其中xxx即表示函式库文件名称,如上例的:libc.so.libltdl.so…

在Linux下创建线程时,编译时会出现下面的错误,[root@linuxserver 807]# gcc -o 22 22.c/tmp/cc21HcoW.o(.text+0x4c): In function `main':: undefined reference to `pthread_create'collect2: ld returned 1 exit status程序为: #include <unistd.h>#include <pthread.h>#include <…

ld: framework  not found AGCommon clang:error:linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation) 当集成一些三方库时,会添加到工程很多静态库.a的framwork等,例如sharesdk,友盟等!上述问题是报错framework找不到,但是检查你的项目agcommon.framework也在,并没有报红(即为丢失文件) 但是还是报错文件丢失! 解决方案:可能路径设置的不对…

一,经历 1> 出现了以下错误,感觉像是GiftAnimationView文件的问题 /Users/liuzhu/Library/Developer/Xcode/DerivedData/testTimerShowScrollView-gwbgymjoyrylqjerhpxxcxbmbcdm/Build/Intermediates/testTimerShowScrollView.build/Debug-iphonesimulator/testTimerShowScrollView.build/Ob…

工程老是提示ld: warning: directory not found for option:xxxxxx 这种提示,通常是由于添加了第三方SDK,但是后来改了个名字或者去掉了SDK,但是在 Build Settings----->Search Paths----->Library Search Paths 中仍然没有删除掉对应的路径, 所以需要到Library Search Paths和Framework Search Paths中删除掉警告的路径,就OK了…

Linux系统中“动态库”和“静态库”那点事儿 /etc/ld.so.conf  动态库的后缀为*.so  静态库的后缀为 libxxx.a   ldconfig   目录名 转载自:http://blog.chinaunix.net/uid-23069658-id-3142046.html 今天我们主要来说说Linux系统下基于动态库(.so)和静态(.a)的程序那些猫腻.在这之前,我们需要了解一下源代码到可执行程序之间到底发生了什么神奇而美妙的事情. 在Linux操作系统中,普遍使用ELF格…

额,被调用函数的名称与调用函数的名称写的不一致啊: 所以会出现 ld returned 1 exist status 好了, 问题解决了.…

在linux环境编译应用程式或lib的source code时出现如下错误:/usr/bin/ld: cannot find -lxxx 这些讯息会随着编译不同类型的source code 而有不同的结果出来如:/usr/bin/ld: cannot find -lc/usr/bin/ld: cannot find -lltdl/usr/bin/ld: cannot find -lXtst 其中xxx即表示函式库文件名称,如上例的:libc.so.libltdl.so.libXtst.so.其命…

工程新添加了 AFNetworking  使用pod ,pod install 完成后,编译报错 ld: library not found for -lPods-AFNetworkingclang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation) 搜索结果都是 添加加库的引用路径...  都不好使... 最终解决:跟新下pod 的编译设置 http://blog.kingiol.com/blog/…

可以把当前路径加入 /etc/ld.so.conf中然后运行ldconfig,或者以当前路径为参数运行ldconfig 2.把当前路径加入环境变量LD_LIBRARY_PATH中3. 如果你觉得不会引起混乱的话,可以直接把该库拷入/lib,/usr/lib/等位置(需要权限),这样链接器和加载器就都可以准确的找到该库了. 简单方法是当前目录加入到LD_LIBRARY_PATH:export LD_LIBRARY_PATH=.:$LD_LIBRARY_PATH 再执行 hello 就能执行了,gc…

在新的SDK环境中调试百度地图的应用程序时,app总是意外退出,找了半天发现错误的原因是unrecognized selector xx的错误,另外还有报了一个Unknown class XXX in Interface Builder file的错误,找了一下百度官方的资料,官方建议是app的Build Settings中的Other Linker Flags中增加-all_oad选项,但是我的app中还连接了其他静态库,加了这个选项之后,编译的时候报了 ld duplicate symbol…

Windows服务器Azure云编译安装MariaDB教程 www.111cn.net 编辑:future 来源:转载 安装MariaDB数据库最多用于linux系统中了,下文给各位介绍在Windows服务器Azure云编译安装MariaDB教程,希望本文能帮助到各位.   试用1元Windows Azure,带宽都是杠杠的.下面演示下Windows Azure下编译安装LNMP环境,系统环境是Ubuntu 14.04 TLS版 软件版本: 数据库:mariadb-10.0.13 Stable…

/etc/ld.so.conf 这个文件记录了编译时使用的动态链接库的路径,告诉链接器去哪个路径下寻找链接时需要用到的库,如果找不到,就会提示链接错误. 如果我们安装了第三方的库,而没有将它放在链接器可以找到的目录,则运行使用这些第三方库的程序时,会提示找不到库. 这时,我们有两种方案可以解决: 1.在链接器的默认目录中创建指向真正库的软链接. 2.将第三方库所在目录添加到链接器的目录中,即在/etc/ld.so.conf中添加库的路径即可.然后需要执行ldconfig,新添加的路径才会生效.…

在iPhone 6 Plus上跑的时候遇到了这么一个错误:ld can't link with a main executable file for architecture armv7,然后就各种改啊改啊,因为我明明已经把arm64加入了豪华午餐阵容了呀,为啥还提示我不允许在64位处理器上跑啊?这不科学! 然后就是各种Google呗,唔,搜到了两个解决方案: 一. http://stackoverflow.com/questions/26031932/cant-link-with-a-main…