基因组所三代单分子测序PacBio完成技术升级—超长读长助力基因组学研究 2015-09-23 | 作者:所级中心基因组平台 张兵 [关闭] 近日,基因组所所级中心基因组平台三代单分子实时测序PacBio完成技术升级优化,实现了数据产量和读长的双重提升,一个SMRT Cell芯片可产出高达1Gb数据, reads平均长度达到14kb,N50超过19kb,为基因组学相关研究提供了有力支撑. PacBio 测序read和subread长度分布 利用三代单分子实时测序仪PacBio系统,平台提供的技术…

针对PacBio单分子测序——第三代测序技术的测序原理和读长     DNA基因测序技术从上世纪70年代起,历经三代技术后,目前已发展成为一项相对成熟的生物产业.测序技术的应用也扩展到了生物.医学.制药.健康.农林.园艺.花卉.环保.法医等许多领域,并成为一项与我们衣食住行密切相关的高技术产业.据最新统计,2012年全球基因测序市场的产值已超过百亿,按最近几年增长速度,预计2017年市场产值将加倍.因此可以说,基因测序在我国生物科技领域具有非常重要的战略意义.        “第三代测序技术”的…

升级技术架构,先要革新观念,最后才是技术问题 升级技术架构,不仅仅是技术升级 说到升级架构,大家第一个都会想到,是不是对技术升级一下就可以了? 我认为不是,技术架构升级要求的是整个公司的升级. 技术架构的变化,直接映射的就是成本投入的变化.如何让其他合伙人明白你的投入是值得的?比如业务合伙人可能质疑你只花钱没有结果.所以做技术架构变化时,先给公司高管说明白,我们的目标是什么?为什么我们要做?是因为业务规模达到一定量要继续升级,还是要支持原来的产品投入?它将来的投入可能是什么样?我们现在如果不升级…

Django视图是用来处理请求和响应的,Django默认是按Form和Template来设计的,如果要处理以JSON格式为主的RESTful API,那么就需要对Django请求和响应的处理代码进行优化改造,本文就来介绍DRF在这一部分的技术升级. Request DRF把Django的HttpRequest扩展成了Request: 其中最核心的属性是request.data,它和request.POST的区别如下: request.POST # 只处理表单(Form)数据,只支持POST方法…

Assembling large genomes with single-molecule sequencing and locality-sensitive hashing 好好读读,算法系列的好文章! Assembling large genomes with single-molecule sequencing and locality-sensitive hashing - NATURE BIOTECHNOLOGY marbl/MHAP  - Github MinHash Alignme…

科学技术,从哪里学习?        杨问了我几个最近:"如何学习技术?".说实话,其实,我自己只是一个资深兄弟.对于这个答案.这是更难以在本身回答. 可是.既然比师弟们多吃了几年饭.还是有一定的个人见解. 以下说说我自己如今是怎样看待这个问题的吧.        1明白自己的定位.        非常多人,也许和大一的我一样,压根不明确自己的定位指的是啥.在学校,老师们讲了N+1次,说本上这个词出现过M+1次,实际上多少人可以明确呢?如今的90后,据我观察都是相当乐观和自信的,压根就…

1 早期的web服务 2 CGI程序的出现.发展.凋零到MVC的兴起 CGI:通用网关接口技术. 随着CGI技术的出现,web服务端可以通过不同的用户请求产生动态页面内容. web服务器将请求数据交给CGI程序,CGI程序进行运算处理,生成HTML输出,通过web服务器返回给浏览器.早期的CGI编程语言是perl,高效便捷的开发特性使其成为当时许多网站开发的首选开发语言. CGI程序的缺点:web服务器通过启动独立进程的方式调用CGI程序,消耗许多不必要的系统资源.而目前流行的java Serv…

本文转载自公众号 DBAplus社群 , 作者:谢麟炯 谢麟炯,唯品会大数据平台高级技术架构经理,主要负责大数据自助多维分析平台,离线数据开发平台及分析引擎团队的开发和管理工作,加入唯品会以来还曾负责流量基础数据的采集和数据仓库建设以及移动流量分析等数据产品的工作. 海量数据实时OLAP场景的困境 大数据 首先来看一下我们在最初几年遇到的问题.第一就是大数据,听起来好像蛮无聊的,但大数据到底是指什么呢?最主要的问题就是数据大,唯品会在这几年快速发展,用户流量数据从刚开始的几百万.几千万发展到现在…

点击下载<不一样的 双11 技术:阿里巴巴经济体云原生实践> 本文节选自<不一样的 双11 技术:阿里巴巴经济体云原生实践>一书,点击上方图片即可下载! 作者 | 陈星宇(宇慕)阿里云基础技术中台技术专家 导读:etcd 是阿里巴巴内部容器云平台用于存储关键元信息的组件.阿里巴巴使用 etcd 已经有 3 年的历史, 在今年 双11 过程中它又一次承担了关键角色,接受了 双11 大压力的检验.为了让更多同学了解到 etcd 的最佳实践和阿里巴巴内部的使用经验,本文作者将和大家分享阿…

转自 http://www.cnblogs.com/rollenholt/p/4112833.html Scala 允许你指明函数的最后一个参数可以是重复的.这可以允许客户向函数传入可变长度参数列表.想要标注一个重复参数,在参数的类型之后放一个星号.例如: scala> def echo(args: String*) = for (arg <- args) println(arg) echo: (String*)Unit 这样定义, echo 可以被零个至多个 String 参数调用: sca…