by Umer Zeeshan Ijaz The purpose of this tutorial is to introduce students to the frequently used tools for NGS analysis as well as giving experience in writing one-liners. Copy the required files to your current directory, change directory (cd) to t…

http://highlyscalable.wordpress.com/2013/08/20/in-stream-big-data-processing/   Overview In recent years, this idea got a lot of traction and a whole bunch of solutions like Twitter's Storm, Yahoo's S4, Cloudera's Impala, Apache Spark, and Apache Tez…

目录 Chapter 4. Introducing streams Chapter 5. Working with streams Chapter 6. Collecting data with streams Chapter 7. Parallel data processing and performance Chapter 4. Introducing streams 4.1 流是什么 1.声明性,可复合,可并行 List<String> lowCaloricDishesName = m…

​ 现在的主流的互联网应用越来越依赖streaming data来提供用户一些interesting statistics insights.以linkedin为例,最近90天有多少人看过你的linkedin profile.看过你profile的人都是什么job title,他们都在那些公司工作.如下图,你应该如何实现这个功能呢? 相信大家都听说过page view event,就是用户每次打开网站上的某个页面发出来的tracking event,各个大公司一般用这些event来做一些统计分析…

MapReduce: Simplified Data Processing on Large Clusters MapReduce:面向大型集群的简化数据处理 摘要 MapReduce既是一种编程模型,也是一种与之关联的.用于处理和产生大数据集的实现.用户要特化一个map程序去处理key/value对,并产生中间key/value对的集合,以及一个reduce程序去合并有着相同key的所有中间key/value对.本文指出,许多实际的任务都可以用这种模型来表示. 用这种函数式风格写出的程序自动就…

最近在做SSRS项目时,遇到这么一个情形:该项目有多个数据库,每个数据库都在不同的服务器,但每个数据库所拥有的数据库对象(table/view/SPs/functions)都是一模一样的,后来结合网络上众多的资源找到了解决方案,即Data Processing Extensio(DPE).所谓DPE,直白地说就是开发自己的DLL去扩展SSRS的数据源,具体的操作如下所示: 1. 新建类库项目,并引入以下两个DLL: C:\Program Files\Microsoft SQL Server\MS…

Lifetime-Based Memory Management for Distributed Data Processing Systems (Deca:Decompose and Analyze)   一.分布式数据处理系统像Spark.FLink中的优缺点: 1.优点: in-memory中可以通过缓存中间数据以及在shuffle buffer中组合和聚合数据最小化重复 计算和I/O花销来提升多阶段和迭代计算性能. 2.缺点: (1)会在堆中产生大量的长期生存的对象,因而产生很多GC,尤…

最近在做SSRS项目时,遇到这么一个情形:该项目有多个数据库,每个数据库都在不同的服务器,但每个数据库所拥有的数据库对象(table/view/SPs/functions)都是一模一样的,后来结合网络上众多的资源找到了解决方案,即Data Processing Extensio(DPE).所谓DPE,直白地说就是开发自己的DLL去扩展SSRS的数据源,具体的操作如下所示: 1. 新建类库项目,并引入以下两个DLL: C:\Program Files\Microsoft SQL Server\MS…

第二讲_图像数据处理Image Data Processing 深度模型出现后被弱化,但是思想的影子在深度模型中可以看到的 图片存储原理 RGB颜色空间:三通道(b,g,r),加法混色 CMY(K):减法混色,用到印刷中:四个通道(c,m,y,k) HSI/HSV颜色空间:基于人类视觉: CIE-XYZ颜色空间:国际照明协会,人类视觉系统-视锥细胞:主要有短,中,长波段 CIE-Lab对色空间 单通道灰度图:Gray=R0.3+G0.59+B*0.11,转换公式灰度化 空域分析和变换 滤波和卷积…

MapReduce 论文研读 说明:本文为论文 <MapReduce: Simplified Data Processing on Large Clusters> 的个人理解,难免有理解不到位之处,欢迎交流与指正 . 论文地址:MapReduce Paper 1. MapReduce 编程模型 MapReduce 是 Google 提出的一种用于处理和生成大数据集的 编程模型 ,具象地可以理解成一个 框架 . 该框架含有两个由用户来实现的接口:map 和 reduce ,map 函数接收一个键…

目录 概 主要内容 实验的指标 Dan Hendrycks, Norman Mu,, et. al, AUGMIX : A SIMPLE DATA PROCESSING METHOD TO IMPROVE ROBUSTNESS AND UNCERTAINTY. 概 本文介绍AUGMIX算法--对现有的的一些augmentation方法进行混用, 并构建了一个新的损失函数. 主要内容 其中\(\mathrm{Dirichlet}\)为狄利克雷分布. 通过实验指出, Augmentation的混用(…

MapReduce: Simplified Data Processing on Large Clusters 概述 MapReduce 是一种编程模型,用于处理和生成大型数据集的相应实现.用户定义一个map函数以处理 key-value 键值对,生成中间态的 key-value 键值对.还要定义一个reduce函数来合并所有有相同中间态 key 的所有中间态 value.许多现实世界的工作都可以用这个模型实现. 以此风格编写的程序可以自动并行化地在大型商用机器集群上运行,运行时系统负责以下任务…

本文是阅读 LinkedIn 公司2020年发表的论文 Magnet: Push-based Shuffle Service for Large-scale Data Processing 一点笔记. 什么是Shuffle 以上图为例,在一个DAG的执行图中,节点与节点之间的数据交换就是Shuffle的过程.虽然Shuffle的过程很简单,但是不同的引擎有不同的实现. 以shuffle数据传输的介质来看 有基于磁盘的shuffle,例如Map/Reduce ,Spark,Flink Batch中…

相当长一段时间以来,大数据社区已经普遍认识到了批量数据处理的不足.很多应用都对实时查询和流式处理产生了迫切需求.最近几年,在这个理念的推动下,催生出了一系列解决方案,Twitter Storm,Yahoo S4,Cloudera Impala,Apache Spark和Apache Tez纷纷加入大数据和NoSQL阵营.本文尝试探讨流式处理系统用到的技术,分析它们与大规模批量处理和OLTP/OLAP数据库的关系,并探索一个统一的查询引擎如何才能同时支持流式.批量和OLAP处理. 在Grid Dy…

概要 这篇论文发表于2016年,主要是介绍Facebook内部的流式计算平台的设计与思考,对于流式计算的关键特性的实现选型上进行深度对比分析. 流式计算系统5个衡量指标 文中提到有5个重要的考量部分 易用性.用户使用什么语言来开发,例如SQL,C++,Java,用户开发,测试,发布一个应用需要花费多久? 性能.时延需要达到什么级别?例如毫秒级,秒级,分钟级?吞吐量需要达到多少?在这一点上Facebook设计的流处理系统基本是为了应对秒级的延迟,这是一个大的前提 容错处理.什么样的故障能够自动容错…

Abstract MapReduce是一种编程模型和一种用来处理和产生大数据集的相关实现.用户定义map函数来处理key/value键值对来产生一系列的中间的key/value键值对.还要定义一个reduce函数用来合并有着相同中间key值的中间value.许多现实世界中的任务都可以用这种模型来表达,就像下文所展示的那样. 用这个风格编写的程序可以自动并行地在集群上工作.运行时系统会自动处理例如切割输入数据,在机器之间调度程序的执行,处理机器故障以及管理必要的机器间通信等细节问题.这可以让那些对…

再有两天就进入2018了,想想还是要准备一下明年的工作方向.回想当初开始学习函数式编程时的主要目的是想设计一套标准API給那些习惯了OOP方式开发商业应用软件的程序员们,使他们能用一种接近传统数据库软件编程的方式来实现多线程,并行运算,分布式的数据处理应用程序,前提是这种编程方式不需要对函数式编程语言.多线程软件编程以及集群环境下的分布式软件编程方式有很高的经验要求.前面试着发布了一个基于scalaz-stream-fs2的数据处理工具开源项目.该项目基本实现了多线程的数据库数据并行处理,能充分…

FunDA最重要的设计目标之一就是能够实现数据库操作的并行运算.我们先重温一下fs2是如何实现并行运算的.我们用interleave.merge.either这几种方式来同时处理两个Stream里的元素.interleave保留了固定的交叉排列顺序,而merge和either则会产生不特定顺序,这个现象可以从下面的例子里看到: ) ) //当前元素跟踪显示 def log[A](pre: String): Pipe[Task,A,A] = _.evalMap { row => Task.dela…

题意:N(N<=40000)个数n1, n2, ..., nN (ni<=N),求(2 ^ n1 + 2 ^ n2 + ... + 2 ^nN) / N % 1000003. 题目链接:http://acm.hdu.edu.cn/showproblem.php?pid=3049 -->>RJ白书上说"因为'乘法逆'太重要了--",上一年南京区赛同学也碰到了求逆元--如今,学习了.. 什么是乘法逆?ab % m = 1 (这里的 a, b 分别都是模 m 的同余等…

我是在差分隐私下看到的,新解决方案的可用性肯定小于原有解决方案的可用性,也就是说信息的后续处理只会降低所拥有的信息量. 那么如果这么说的话为什么还要做特征工程呢,这是因为该不等式有一个巨大的前提就是数据处理方法无比的强大,比如很多的样本要分类,我们做特征提取后,SVM效果很好 ,但是如果用DNN之类的CNN.AuToEncoder,那么效果反而不如原来特征.这样就能理解了,DNN提取能力更强,那么原始就要有更多的信息,在新特征下无论怎么提取,信息就那么多. 信息量越多越好么?肯定不是,否则为什么…

记录过程. Lucene分词:http://blog.csdn.net/cyxlzzs/article/details/7999212 Lucene自定义词典:http://lilongbao.blog.163.com/blog/static/2128760512013689194583/ 注意点:.dic文件要以utf-8保存 不过这里有一个疑惑: .doc文件如果改为GBK保存,IKAnalyzer.cfg.xml文件的开头:<?xml version="1.0" encod…

http://spark.apache.org/docs/latest/sql-programming-guide.html…

https://databricks.com/blog/2014/08/14/mining-graph-data-with-spark-at-alibaba-taobao.html…

Introduction This chapter will present an implementation recipe for an enterprise log storage and a search and analysis solution based on the Storm processor. Log data processing isn't necessarily a problem that needs solving again; it is, however, a…

Week 4 Big Data Precessing Pipeline 上图可以generalize 成下图,也就是Big data pipeline some high level processing operations in big data pipeline 在一个pipeline里 有哪些data transformation 方法?课程上讲了一个类比data transformation的例子,把原木加工成家具. 基本的data transformation 操作有 : Map 是…

转自:https://blog.minio.io/stream-processing-with-apache-flink-and-minio-10da85590787 Modern technology trends like Machine Learning, Deep Learning, Artificial intelligence, and IoT have pushed the need for a reliable, scaleable storage platform that i…

转自: http://www.confluent.io/blog/stream-data-platform-1/ These days you hear a lot about "stream processing", "event data", and "real-time", often related to technologies like Kafka, Storm, Samza, or Spark's Streaming module.…

不多说,直接上干货! 一切来源于官网 http://kafka.apache.org/documentation/ Stream Processing 流处理 Many users of Kafka process data in processing pipelines consisting of multiple stages, where raw input data is consumed from Kafka topics and then aggregated, enriched,…

ABSTRACT Recent technological advancement have led to a deluge of data from distinctive domains (e.g., health care and scientific sensors, user-generated data, Internet and financial companies, and supply chain systems) over the past two decades. The…

https://cloud.google.com/dataflow/blog/dataflow-beam-and-spark-comparison https://github.com/apache/incubator-beam https://www.oreilly.com/ideas/the-world-beyond-batch-streaming-101 https://www.oreilly.com/ideas/the-world-beyond-batch-streaming-102 h…