HumanNet v2:用于疾病研究的人类基因网络人类基因网络已被证明在疾病研究的许多方面都很有用,已经开发了许多基于网络的策略来产生关于基因 - 疾病 - 药物关联的假设.预测和组织与特定疾病最相关的基因的能力已被证明是特别重要的.我们之前通过使用贝叶斯统计框架整合各种类型的组学数据,开发了人类功能基因网络HumanNet,并展示了其检索疾病基因的能力.在这里,我们介绍HumanNet v2(http://www.inetbio.org/humannet),这是一个人类基因网络数据库,通过整合…

Nature Biotechnology:人类基因研究走近平民 数据是基础解读更重要 5万美元可以做什么?最近,美国斯坦福大学教授斯蒂芬·夸克在国际著名学术期刊<自然·生物技术>发表论文宣布,只用3个人.4周.1台已经上市的仪器,花费不到5万美元,就绘制出了自己的全基因组图谱.虽然价格还有些高,但比起去年的25万美金,显然离走近平民,又近了一大步. 5万美元可以做什么?最近,美国斯坦福大学教授斯蒂芬·夸克在国际著名学术期刊<自然·生物技术>发表论文宣布,只用3个人.4周.1台已经上…

题目描述 上了大学之后,小W和小Z一起报了一门三宝课,在实践课上遇到了一些问题. 一条染色体上有nn对基因,每种基因都可以用一个数ai来表示,作为标号. 现在,在其中一条染色单体上某基因发生了突变. 此时染色体上有n−1对相同的基因和一对不同的基因. 他们通过某种方法获得了这条染色体上的全部基因. 现在他们想知道发生突变的基因的标号是什么. 输入 第一行一个数n 第二行2×n个数表示. 输出 两个数,代表发生突变的基因的标号. 样例输入 5 1 2 3 4 7 8 4 3 2 1 样例输出 7…

http://www.oschina.net/news/59287/apache-nutch-2-3 Apache Nutch v2.3已经发布了,建议所有使用2.X系列的用户和开发人员升级到这个版本. 这个版本提供了一个基于Apache Wicket的Web管理界面,解决了143个问题,提供了Maven依赖,升级到Gora v0.5,支持的底层存储为: Apache Hadoop 1.0.1 & 2.4.0 Apache Cassandra 2.0.2 Apache HBase 0.94.14…

前言 我们知道在APP开发过程中.监听手机当前的网络状态还是一个非经常常使用的方法,这里我来为大家接受一种使用AFNetWorking来监听当前的网络状态的方法:网络监听对程序开发的帮助有非常多:比方下载时在不同的网络状态下使用不同下载策略.缓存策略.或者就是一个单纯的提示 使用控件 在这里我使用的是AFNetWorking 3.0之前的版本号.我并没有測试过最新的3.0.4版本号能否够正常使用,可是我觉得是不影响的,假设各位在測试过程中,有什么问题的话请直接私信我. 代码实现 首先我们新建一个…

相关命令详细介绍参见 http://www.cnblogs.com/Dream-Chaser/p/7077105.html .问题: 两个网络名称空间中的两个接口veth0和veth1,如何配置netns0和netns1中的路由使得两者可以联通?即在netns0中 ping 10.0.1.2 正常. .答案: 在netns0中 $ ip netns exec netns0 ip route add dev veth0 #command () 在netns1中 $ ip netns exec ne…

HapMap五周年回顾 2011-01-12 | 作者: [关闭] 作者简介:曾长青,中国科学院北京基因组所研究员,博士生导师.CUSBEA奖学金.百人计划.杰出青年基金.首批新世纪百千万人才工程国家级人选获得者.作为“十五”重大攻关项目课题组长.国际HapMap计划Steering Committee Member和 “中华单体型图协作组”召集人,负责HapMap“中国卷”的实施.主要从事疾病相关基因定位.群体遗传学和基因组多态研究,部分成果在Nature,Nature Genetics, P…

1.人类基因组的HapMap和国际HapMap计划 (1)何谓HapMap HapMap是Haplotype Map 的简称,Haplo意为单一,在基因组中专指来自父母的一对染色体中的一条.Haplotype就是单条染色体中的一段,译作单体型(有人译作单倍型),是描述遗传差异的一种主要方式.DNA作为遗传物质,不但编码了物种间的差异,物种内不同个体之间的差异也含在其中,均表现为基因组之间的DNA序列差异,也就是基因组的多态性上. DNA由四种核苷酸单个连接而成,基因组最常见的多态就是单核苷酸多态…

完美人类假设:一类人,具有最完美的基因组,享受最健康的环境和饮食,同时拥有最健康的思想情绪,最终以最长的寿命,自然死亡. 自然死亡是自然生命最终的归宿,这是写在目前基因组里的铁律! 不管科技如何发展,人最终都会追求生命的拓展和延续,所以医学总体是不可能败落的,只是医学的部分低价值的工作会被淘汰. 疾病的研究似乎永远没有尽头,疾病本质就是健康的异常,鉴于健康的生命活动的复杂性,任何一个局部发生异常都会导致疾病. 所以,生命系统有多复杂,疾病研究就能有多复杂! 有趣的是,必须通过疾病模型,我们才能更…

题目背景 大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列.它包含了4种核苷酸,简记作A,C,G,T.生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物. 在一个人类基因工作组的任务中,生物学家研究的是:两个基因的相似程度.因为这个研究对疾病的治疗有着非同寻常的作用. 题目描述 两个基因的相似度的计算方法如下: 对于两个已知基因,例如AGTGATG和GTTAG,将它们的碱基互相对应.当然,中间可以加入一些空碱基-,例如: 这样,两个基因之间的相似度就可以用碱基之间相似度的总和来描述,碱基之间的…