可视化工具之 IGV 使用方法】的更多相关文章

整合基因组浏览器(IGV)是一种高性能的可视化工具,用来交互式地探索大型综合基因组数据.它支持各种数据类型,包括array-based的和下一代测序的数据和基因注释. IGV这个工具很牛,发了NB: James T. Robinson, Helga Thorvaldsdóttir, Wendy Winckler, Mitchell Guttman, Eric S. Lander, Gad Getz, Jill P. Mesirov. Integrative Genomics Viewer. Na…
http://blog.csdn.net/qq_28859405/article/details/52562131…
https://zhuanlan.zhihu.com/p/269134063  番茄番茄我是西瓜 那是我日夜思念深深爱着的人啊~ 已关注   6 人赞同了该文章 前言 本篇是java内存区域管理系列教程之实战篇 --通过可视化工具和日志窥探内存分配策略 全系列内容可在本文专栏-jvm大局观中查阅 jvm全局观​www.zhihu.com 今天是实战篇,我们将通过一些常用的代码,依据可视化工具,来窥探这些代码背后,jvm内存分配的策略,其中会有颠覆全网80%的关于jvm方法区的认知(静态变量的存储…
伴随着前期的基础积累,翻过API,读过一些Demo,总觉得自己已经摸透了Prefuse,小打小闹似乎已经无法满足内心膨胀的自己.还记得儿时看的<武状元苏乞儿>中降龙十八掌最后一张居然是空白页,在千钧一发之际以为自己要嗝屁了,一阵东风让苏乞儿明白了,最后一章要做的原来是——整合.没错,今天我们就来好好谈谈整合! 看懂API不代表你会灵活运用某个类,会用一些类不代表能实现小功能,耍的了小功能不一定会做可视化工具整合,整合之道,奥妙无穷! 前篇回顾:上篇<漫谈可视化Prefuse(四)---被…
在上篇<可视化工具gephi源码探秘(一)>中主要介绍了如何将gephi的源码导入myeclipse中遇到的一些问题,此篇接着上篇而来,主要讲解当下通过myeclipse导入gephi源码的可行性不高以及熟悉netbeans,并把原本基于netbeans平台开发的gephi源码导入进netbeans后启动正常运行的过程,其中有遇到的不少问题和相应的解决方法.   前日工作梗概(还是沿着想把源码导入myeclipse的思路): 经过从各大子模块的pom.xml中筛选出符合条件的jar包写入项目下…
首先:关于  能支持MongoDB新版本的可视化工具,争议不断,各人都有各人的支持. 因此之前选择安装的时候就安装了MongoDB  3.0.14版本的. 最终,确定使用Robomongo作为我第一个使用的MongoDB的GUI使用. 第一步:下载Rongomongo  进行安装. 下载路径:https://robomongo.org/download 第二步: 将Robomongo这个GUI依旧放置在MongoDB的原本安装目录下 第三步:先不用启动GUI 第四步: 在启动之前,首先将Mong…
MongoDB: 1.下载地址:http://www.mongodb.org/downloads(32位还是64位自行选择).我下载的是:mongodb-win32-x86_64-3.2.4-signed.msi 源码地址:https://fastdl.mongodb.org/src/mongodb-src-r3.2.4.zip?_ga=1.146191420.943055734.1460080387 2.安装 一直点下去可以更换目录. 3. 安装准备MongoDB默认的数据目录为:C:\dat…
大家都知道MYSQL是开源的数据库,现在MYSQL在企业中的使用也越来越多,本人之前用过SQL SERVER数据库,因业务需要和自己的兴趣想要学习MYSQL,对于MYSQL,本人还是新手,请大家多多指正. 1.安装mysql 本人安装的版本是mysql5.6 Mysql 5.6的安装包下载地址:http://pan.baidu.com/s/1o6qHG5G 安装过程比较简单,基本上是下一步下一步,安装过程中需要设置mysql的登录密码.本人安装的时候附带安装了mysql的可视化工具MySQL W…
navicat是mysql数据库的客户端查询管理工具,本文详细的介绍了该软件的基本使用方法 本文转自 http://hejiawangjava.iteye.com/blog/2245758 sql是操作数据库中数据的语句,在不同的数据库中会略有不同,如mysql,postgreSQL,oracle,sqlserver,sqlite等等,但是sql的基础select.insert.update.delete语句都是相同的,本文只是介绍如何在mysql中,利用navicat可视化工具学习sql语句的…
Matplotlib是Python中最常用的可视化工具之一,可以非常方便地创建海量类型的2D图表和一些基本的3D图表.本文主要介绍了在学习Matplotlib时面临的一些挑战,为什么要使用Matplotlib,并推荐了一个学习使用Matplotlib的步骤. 简介 对于新手来说,进入Python可视化领域有时可能会令人感到沮丧.Python有很多不同的可视化工具,选择一个正确的工具有时是一种挑战. 例如,即使两年过去了,这篇<Overview of Python Visualization To…
最近想自己搭建一个个人博客,所以学了下mongodb,mongodb是用命令行输入的,有些人可能不太习惯,我自己找了下mongodb的一些可视化工具,一开始安装的是mongoVUE,mongoVUE页面挺友好的,还不错,但是最新版本的mongodb,mongoVUE已经不支持了,打开后看不到数据,而且是还是收费的.后来发现了一款adminmongo很好用,这里介绍给你们用一下. github地址:https://github.com/mrvautin/adminMongo 安装方法: 1.把gi…
欢迎大家前往腾讯云+社区,获取更多腾讯海量技术实践干货哦~. 作者:赵坤|腾讯魔王工作室后台开发工程师 在项目开发中,经常会遇到程序启动时间过长.CPU使用率过高等问题,这个时候需要依靠性能分析工具来定位性能的消耗点.本文介绍三个常用的工具的入门级使用及图形化方法,供大家参考. 本文介绍Perf.gprof和Valgrind三个性能分析工具,及其分析结果图形化的方法,旨在让大家更快的上手使用工具.出于篇幅的限制,本文不会对每种工具的使用参数及结果分析做详细的介绍,只做入门级的使用说明,更多详细的…
1. 数据分析基本流程 作为非专业的数据分析人员,在平时的工作中也会遇到一些任务:需要对大量进行分析,然后得出结果,解决问题. 所以了解基本的数据分析流程,数据分析手段对于提高工作效率还是非常有帮助的. 首先都是存在一个要解决的问题,主要问题和预期分析目标,简单来讲就是对问题进行定义. 然后才是开始收集数据.数据清洗.数据建模.数据展现.优化和重复,最后是报告撰写. 1. 明确分析目的和思路:在进行数据分析之前,首先考虑的应该是"为什么要展开数据分析?我要解决什么问题?从哪些角度分析数据才系统?…
英文出处:Chris Moffitt. Matplotlib是Python中最常用的可视化工具之一,可以非常方便地创建海量类型的2D图表和一些基本的3D图表.本文主要介绍了在学习Matplotlib时面临的一些挑战,为什么要使用Matplotlib,并推荐了一个学习使用Matplotlib的步骤. 简介 对于新手来说,进入Python可视化领域有时可能会令人感到沮丧.Python有很多不同的可视化工具,选择一个正确的工具有时是一种挑战. 例如,即使两年过去了,这篇<Overview of Pyt…
随着业务的越发复杂,对软件系统的要求越来越高,这意味着我们需要随时掌控系统的运行情况.因此,对系统的实时监控以及可视化展示,就成了基础架构的必须能力. 这篇博客,介绍下开源的可视化套件grafana的安装及其功能特点... 官网地址:Grafana 官方文档:Grafana文档 环境:CentOS7.4 64位 Grafana版本:5.3.2 一.Grafana介绍 Grafana是一个跨平台的开源的度量分析和可视化工具,可以通过将采集的数据查询然后可视化的展示,并及时通知.它主要有以下六大特点…
最近想自己搭建一个个人博客,所以学了下mongodb,mongodb是用命令行输入的,有些人可能不太习惯,我自己找了下mongodb的一些可视化工具,一开始安装的是mongoVUE,mongoVUE页面挺友好的,还不错,但是最新版本的mongodb,mongoVUE已经不支持了,打开后看不到数据,而且是还是收费的.后来发现了一款adminmongo很好用,这里介绍给你们用一下. github地址:https://github.com/mrvautin/adminMongo 安装方法: 1.把gi…
使用教程,参考: https://github.com/facebookresearch/visdom https://www.pytorchtutorial.com/using-visdom-for-visualization-in-pytorch/ https://www.pytorchtutorial.com/pytorch-visdom/ ⚠️中间发现visdom安装的版本过低,导致发生了一些问题,后面更改了版本为最新版本0.1.8.8,所以可能会发现截图有些不同,但是功能不会有太多影响…
MongoDB可视化工具--Robo 3T 使用教程 1. 到官网下载Robo 3T,网址如: https://robomongo.org/download. 2. 下载安装成功后,打开后点击左上角的 create创建一个连接,给该连接起个名字,如:localhost, 使用默认地址 localhost 和 端口27017 即可,点击save保存.如下图所示: 3. 点击保存后,就会在界面看到如下图所示 4. 双击 localhost 连接到 MongoDB 并进入交互界面; 我们可以看到我们本…
昨日内容回顾 外键的变种三种关系: 多对一: 左表的多 对右表一 成立 左边的一 对右表多 不成立 foreign key(从表的id) refreences 主表的(id) 多对多 建立第三张表(foreign key) 一对一 foreign key+unique 单表查询: (1) where group by: 分组,通过某个字段 select age,count(1) from user group by age having avg(age)>25; having order by…
2018-12-04 14:05:49 Visdom是Facebook专门为PyTorch开发的一款可视化工具,其开源于2017年3月.Visdom十分轻量级,但却支持非常丰富的功能,能胜任大多数的科学运算可视化任务.其可视化界面如图所示. Visdom可以创造.组织和共享多种数据的可视化,包括数值.图像.文本,甚至是视频,其支持PyTorch.Torch及Numpy.用户可通过编程组织可视化空间,或通过用户接口为生动数据打造仪表板,检查实验结果或调试代码. Visdom中有两个重要概念: en…
也是无意中接触到zk,搞得有点头大,之前都是通过crt连通服务后,在服务上通过命令去查看节点下的数据的,十分的不方便,后来发现了可视化工具这玩意儿还真的是好用,看节啊点下的数据啥的一目了然,我用过的有两种吧,一直zktools和zkui,zktoos看着界面比较粗糙吧,zkui看着还是不错的,而且更方便: 先看zktools吧:下载地址: https://github.com/zywxxd117/zktools.git 打开zktools有三种方法: 1.点击zktools.exe:2.双击 b…
在上篇<可视化工具gephi源码探秘(一)>中主要介绍了如何将gephi的源码导入myeclipse中遇到的一些问题,此篇接着上篇而来,主要讲解当下通过myeclipse导入gephi源码的可行性不高以及熟悉netbeans,并把原本基于netbeans平台开发的gephi源码导入进netbeans后启动正常运行的过程,其中有遇到的不少问题和相应的解决方法. 前日工作梗概(还是沿着想把源码导入myeclipse的思路): 经过从各大子模块的pom.xml中筛选出符合条件的jar包写入项目下的p…
 一.问题导出 在刚刚开始学习MySQL数据库应用与开发这门课程的时候,老师建议我们使用可视化工具MySQL Workbeach进行数据库的相关管理,但是小编在mysql命令框使用insert命令向表中插入中文数据的时候发现出现了warnings警告,并且打开MySQL Workbeach查看输入数据的时候发现,输入的数据为空或者是?????几个问号,于是便想到了字符格式的问题. 二.问题测试 (1)小编新建了一个test数据库,并在里面建了一个test数据表,里面只有一个属性(字符集都默认)…
方式一: 下载地址:http://redis.io/download,下载最新文档版本. 本教程使用的最新文档版本为 2.8.17,下载并安装: $ wget http://download.redis.io/releases/redis-2.8.17.tar.gz $ tar xzf redis-2.8.17.tar.gz $ cd redis-2.8.17 $ make make 完后 redis-2.8.17 目录下会出现编译后的 redis 服务程序 redis-server, 还有用于…
1. 概述 robot framework 的安装 可视化工具 ride 的安装 2. 准备 安装缘由 来自一本书 书名: Robot Framework自动化测试修炼宝典 豆瓣上有好评不少, 坏评也不多, 而且是 为数不多 的 robot framework 的中文书籍 如果一定要用 robot framework, 可以简单入门 看到后面, 就会知道这本书有多么的 垃圾, 跟 真香 二字, 完全不沾边 环境 虚拟机 win10 8G 内存 30G 硬盘 python python 2.7.1…
Visual GC是一个Java 内存使用分析与GC收集的可视化工具插件 <插件下载> 一:整个区域分为三部分:spaces.graphs.histogram 1 spaces区域:代表虚拟机内存分布情况.从图中可以看出,虚拟机被分为Perm.Old.Eden.S0.S1    注意:如果对每个区域基本概念不是很熟悉的可以先了解下java虚拟机运行时数据区这篇文字. 相关原理可以参考这篇博文<[转]Java内存与垃圾回收调优> 1.1 perm:英文叫做Permanent Gene…
一,MongoDB的安置及配置 1,从MongoDB官网下载安装 https://www.mongodb.com/download-center#community 根据的电脑选择合适的版本安装: 根据你的系统下载 32 位或 64 位的 .msi 文件,下载后双击该文件,按操作提示安装即可. 安装过程中,你可以通过点击 "Custom(自定义)" 按钮来设置你的安装目录. 当完成后,执行第2步骤,创建数据目录及配置 2,创建数据目录及配置 MongoDB将数据目录存储在 db 目录下…
一.可视化工具Navicat的使用 1.官网下载:http://www.navicat.com/en/products/navicat-for-mysql 2.网盘下载:http://pan.baidu.com/s/1bpo5maj 3.需要掌握的基本操作:   PS:在生产环境中操作MySQL数据库还是推荐使用命令工具mysql,但我们自己开发测试时,可以使用可视化工具Navicat,以图形界面的形式操作MySQL数据库 二.pymysql模块的使用 1.pymysql的下载和使用 之前我们都…
2018/9/18更新  感觉tensorboardX插件更好用,已转用https://github.com/lanpa/tensorboardX 更新:新版visdom0.1.7安装方式为:conda install -c srivasv visdom pytorch下可采用visidom作为可视化工具 1. 安装 pip install visdomconda install visdom 启动 python -m visdom.server 在浏览器输入:http://localhost:…
随着业务的越发复杂,对软件系统的要求越来越高,这意味着我们需要随时掌控系统的运行情况.因此,对系统的实时监控以及可视化展示,就成了基础架构的必须能力. Grafana官方网站 https://grafana.com/ Grafana介绍 Grafana是一个跨平台的开源的度量分析和可视化工具,可以通过将采集的数据查询然后可视化的展示,并及时通知.它主要有以下六大特点:1.展示方式:快速灵活的客户端图表,面板插件有许多不同方式的可视化指标和日志,官方库中具有丰富的仪表盘插件,比如热图.折线图.图表…