利用Graphviz 可视化GO 数据库】的更多相关文章

GO是一个同源蛋白的数据库,按照三大类别BP(生物学过程), MF(分子功能), CC(细胞组分) 对基因的产物-蛋白质进行了分类: 在GO数据库中,本质上是一个有向无环图的数据结构,在三大类别之下,又有小的分类层级,一层一层的分类下去: 对于某个具体的GO号来说,代表了一组同源蛋白,拥有相似的结构和功能,在数据库中,有上层分类的GO,也可能在这个GO下面,还有其他的GO 为了直观的展示某个GO号的分类,利用数据库提供的go-basic.obo 文件得到不同GO之间的层级关系,然后用Graphv…
Navicat可视化MySQL数据库 Navicat内部封装了所有的操作数据库的命令,用户只需要点击操作即可,无需书写sql语句. navicat能够充当多个数据库的客户端. 具体操作参考百度. pymysql模块 连接数据库以及sql语句的使用 import pymysql # 连接数据库 conn = pymysql.connect( host = '127.0.0.1', port = 3306, user = 'root', password = '123456', database =…
实验系统:CentOS 6.6_x86_64 实验前提:防火墙和selinux都关闭 实验说明:本实验共有4台主机,IP分配如拓扑 实验软件:mariadb-10.0.20 oneproxy-rhel5-linux64-v5.6-ga 下载地址:http://pan.baidu.com/s/1jGpL2o2 实验拓扑: 注意:本实验是之前mysql-proxy实验的拓展,因此大部分环境及设定是相同的,其中一.二步这里不再重复,具体请参考:利用mysql-proxy进行mysql数据库的读写分离…
利用xtrabackup备份mysql数据库 一.安装1.直接下载二进制文件wget http://www.percona.com/downloads/XtraBackup/XtraBackup-2.1.9/binary/Linux/x86_64/percona-xtrabackup-2.1.9-744-Linux-x86_64.tar.gz 解压后放入对应目录 2.将该文件的bin目录加入环境变量,或将执行文件拷贝到/usr/bin目录下,否则将报sh: xtrabackup_55: comm…
经常性忘了给数据库备份,结果当数据库发生问题的时候,才发现备份是1个月以前的,那个后悔与懊恼还加惭愧啊,别提有对难受了.要认为的记住去备份比较难,每天事情又那么多,所以有了这个自动备份就不用愁了.先拷过来,再慢慢研究. /*******************完整备份作业*******************/--完整备份,每周一次USE MasterGOdeclare @str varchar(100)set @str='D:\DBtext\jgj\DBABak\FullBak'+replac…
在Delphi中利用MSDASC来配置数据库链接 在运行期进行数据库的连接是一个问题,自己写一个窗体配置吧,数据库不一样,所用的参数也不一样,还有那讨厌的连接字符串,有时真不知该写什么好.那天无意中发现一个UDL文件,打开时自动弹出标准的数据库链接属性配置窗体,用过ADOConnection的一定知道.可惜的是UDL文件是明码,而且要放在一个目录下,要是能放在注册表中多好,还可以加密存放,我们如何调用这个窗体呢?通过查找注册表,发现打开UDL文件的是MSDASC,再查MSDASC,OK,在OLE…
接下来我们通过项目案例来介绍:这个利用谷歌API对数据库增删改查 1.首先项目图: 2.这里的布局文件activity_main.xml: <LinearLayout xmlns:android="http://schemas.android.com/apk/res/android" xmlns:tools="http://schemas.android.com/tools" android:layout_width="match_parent&qu…
转自:http://www.cnblogs.com/sld666666/archive/2010/06/25/1765510.html 利用Graphviz 画结构图   1. Graphviz介绍 Graphviz是大名鼎鼎的贝尔实验室的几位牛人开发的一个画图工具. 它的理念和一般的“所见即所得”的画图工具不一样,是“所想即所得”. Graphviz提供了dot语言来编写绘图脚本.什么?!画个图也需要一个语言!! 不要急,dot语言是非常简单地,只要看了下面几个列子,就能使用了. 2. Gra…
使用spring的动态路由实现数据库负载均衡 系统中存在的多台服务器是"地位相当"的,不过,同一时间他们都处于活动(Active)状态,处于负载均衡等因素考虑,数据访问请求需要在这几台数据库服务器之间进行合理分配, 这个时候,通过统一的一个DataSource来屏蔽这种请求分配的需求,从而屏蔽数据访问类与具体DataSource的耦合: 系统中存在的多台数据库服务器现在地位可能相当也可能不相当,但数据访问类在系统启动时间无法明确到底应该使用哪一个数据源进行数据访问,而必须在系统运行期间…
原文 利用EntityFramework获得双色球数据库 双色球想必大家都很熟悉了,尽管屡买屡不中,但还是会买.以前就想过利用双色球的走势图得到双色球的数据库,至于得到数据库干什么倒没想过,不过对以往号码有没有重复出现还是挺好奇的.最近写Entity Framework的博客,所以这篇文章的标题里就出现了Entity Framework的身影,其实Entity Framework在下面的程序里只占据了很少的一部分. 下面开始介绍我获取数据库的方法. 双色球的走势图网址:http://zx.cai…
利用RMAN恢复整个数据库案例一 适合场合:恢复的目录一致,同时备份的过程中有归档日志 恢复的数据库目录和down机的数据库一致,还有一个就是RMAN备份的时候已经备份了归档日志. 备份脚本: run{ allocalte channel ch1 type disk; sql ‘alter system archive log current’; backup as compressed backupset database format ‘/u02/rman/testdb_%T_%U’; sq…
Qt 学习之路 2(57):可视化显示数据库数据(skip) 豆子 2013年6月26日 Qt 学习之路 2 26条评论 前面我们用了两个章节介绍了 Qt 提供的两种操作数据库的方法.显然,使用QSqlQuery的方式更灵活,功能更强大,而使用QSqlTableModel则更简单,更方便与 model/view 结合使用(数据库应用很大一部分就是以表格形式显示出来,这正是 model/view 的强项).本章我们简单介绍使用QSqlTableModel显示数据的方法.当然,我们也可以选择使用QS…
graphviz官网:http://www.graphviz.org/ 背景:有画图需要,之前见到别人用graphviz画,画出来的图漂亮,且自动帮你排版安排布局,所以自己想尝试用它画. 其中遇到的几个问题 win系统下载msi安装包后进行安装,安装不成功,报错信息是win电脑却少什么包,最后转向Mac画图. 找到两个graphviz online的网站(http://www.webgraphviz.com/  和),都不太好用,不是对中文支持不好,就是稍微复杂一些的图他就画不出来了. Mac…
接下来我们通过项目案例来介绍:这个利用谷歌API对数据库增删改查 1. 首先项目图: 2. 这里的布局文件activity_main.xml: <LinearLayout xmlns:android="http://schemas.android.com/apk/res/android" xmlns:tools="http://schemas.android.com/tools" android:layout_width="match_parent&…
利用innobackupex进行简单数据库的备份yum install perl-DBIyum install perl-DBD-MySQLyum install perl-Time-HiResyum install perl-IO-Socket-SSL http://www.cnblogs.com/zhoujinyi/p/4088866.html http://www.2cto.com/database/201306/218521.html http://www.linuxidc.com/Li…
数据集下载地址: 链接:https://pan.baidu.com/s/1l1AnBgkAAEhh0vI5_loWKw提取码:2xq4 创建数据集:https://www.cnblogs.com/xiximayou/p/12398285.html 读取数据集:https://www.cnblogs.com/xiximayou/p/12422827.html 进行训练:https://www.cnblogs.com/xiximayou/p/12448300.html 保存模型并继续进行训练:htt…
[决策树]西瓜数据graphviz可视化实现 一.问题描述: 使用西瓜数据集构建决策树,并将构建的决策树进行可视化操作. 二.问题简析: 首先我们简单的介绍一下什么是决策树.决策树是广泛用于分类和回归任务的模型.本质上,它从一层层的if/else问题中进行学习,并得出结论. 三.代码实现: 说明:本实例运行在linux环境下,通过jupyter notebook运行. 依赖项:graphviz 下载GraphViz's executables的网址:http://www.graphviz.org…
SQL Server 事件探查器 是一个界面,用于创建和管理跟踪并分析和重播跟踪结果. 这些事件保存在一个跟踪文件中,稍后试图诊断问题时,可以对该文件进行分析或用它来重播一系列特定的步骤. SQL Server 事件探查器 Microsoft SQL Server 事件探查器 是 SQL 跟踪的图形用户界面,用于监视 数据库引擎 或 Analysis Services 的实例. 您可以捕获有关每个事件的数据并将其保存到文件或表中供以后分析. 例如,可以对生产环境进行监视,了解哪些存储过程由于执行…
CloneDB是Oracle 11.2.0.3推出的一项新特性,它利用的了11g新引入的Direct NFS.它直接利用目标数据库的备份,无需将备份COPY到克隆环境下,使得一个备份可以克隆多个不同用途的数据库.它同时采用了copy-on-write技术,使得备份中只有被修改了的block才会被应用到克隆数据库中,极大的节省了克隆数据库的空间,并提升了数据库克隆的速度. 下面对该项特性进行了测试,共涉及三台服务器,采用的均是32位RHEL 6.3操作系统,数据库版本11.2.0.4. NFS服务…
对备份的基础理解: --完整备份:完整备份会备份所有数据的区和少量的日志(日志文件用于恢复数据保持数据一致性).由于差异备份需要依据最后一次完整备份,因此完整备份会清楚一些分配位图数据. --差异备份:差异备份是针对完全备份:备份上一次的完全备份后发生变化的所有修改过的数据区(注意不是数据页),差异备份不是增量进行,不会修改分配位图数据. --事务日志备份:在完整恢复模式或大容量日志恢复模式下,如果事务日志自日志链建立后没有进行过日志备份,则备份最最后一次完整备份或差异备份后的所有日志,否则备份…
利用Java来进行Mysql数据库的导入和导出的总体思想是通过Java来调用命令窗口执行相应的命令. MySql导出数据库的命令如下: mysqldump -uusername -ppassword -hhost -Pport exportDatabaseName > exportPath 利用Java调用命令窗口执行命令来进行MySql导入数据库一般分三步走: 第一步:登录Mysql数据库,在登录数据库的时候也可以指定登录到哪个数据库,如果指定了则可以跳过第二步: 第二步:切换数据库到需要导入…
/* 将数据库的增删改查单独放进一个包 */ package com.itheima28.sqlitedemo.dao; import java.util.ArrayList; import java.util.List; import android.content.ContentValues; import android.content.Context; import android.database.Cursor; import android.database.sqlite.SQLit…
Oracle: SELECT * FROM ALL_TABLES;系统里有权限的表 SELECT * FROM DBA_TABLES; 系统表 SELECT * FROM USER_TABLES; 当前用户下的表     Sql Server 1,利用sysobjects系统表 在这个表中,在数据库中创建的每个对象(例如约束.默认值.日志.规则以及存储过程)都有对应一行,我们在该表中筛选出xtype等于U的所有记录,就为数据库中的表了. 示例语句如下:: select * from sysobj…
测试: 每1分钟执行1次,利用crontab */1 * * * * /opt/nginx/db_bak.sh 每天的0点0分把数据库备份为日期格式 0 0 * * * /opt/nginx/db_bak.sh 脚本如下: #!/bin/bash logs_path="/opt/nginx/sql_bak/" mkdir -p ${logs_path}$(date -d "yesterday" +"%Y")/$(date -d "yes…
1.这里是在mysql主从复制实现的基础上,利用mycat做读写分离,架构图如下: 2.Demo 2.1 在mysql master上创建数据库创建db1 2.2 在数据库db1创建表student 同时,因为配置好了mysql主从复制,在mysql slave上也有一样数据库和表 2.3 编辑 mycat的配置文件server.xml <!--表示mycat的登录用户名--> <user name="test"> <!--表示mycat的登录密码--&g…
JDBC是Sun公司制定的一个可以用Java语言连接数据库的技术. 一.JDBC基础知识 JDBC(Java Data Base Connectivity,java 数据库连接)是一种用于执行SQL语句的Java API,可以为多种关系数据库提供统一访问,它由一组用Java语言编写的类和接口组成.JDBC为数 据库开发人员提供了一个标准的API,据此可以构建更高级的工具和接口,使数据库开发人员能够用纯 Java API 编写数据库应用程序,并且可跨平台 运行,并且不受数据库供应商的限制. 1.跨…
在生产环境中,我们总会因为这样或那样的原因导致主从不同步,亦或者是测试环境要和生产环境进行同步,利用Navicat结构同步工具,不但能找出库结构差异,还可以针对create.modify.drop等进行选择性比对,非常的人性化,那么一起来看下是如何操作的. 首先在Navicat的主界面选择工具,结构同步,这时会看到如下画面: 选择源和目标服务器,选择需要同步的数据库,选择所需的运行选项,勾选遇到错误继续. 点击比对后,就会出现同步过程,此时仅仅是比对,还未真正进行同步.点击右下角的运行同步按钮,…
一.前言 巨杉数据库(SequoiaDB)是国内第一款新一代文档型分布式数据库,巨杉数据库由巨杉软件完全自主研发,拥有完全自主知识产权,不基于任何其它的开源项目.SequoiaDB数据库是为分布式存储.并行计算模型.云计算资源条件下搭建和运行应用程序而设计的. 作为一款操作性数据库,巨杉数据库在海量数据实时读写场景具有得天独厚的优势,拥有较高的读写性能. 为便于跟其他同类数据库进行比较,在本篇文章中,我们介绍一个专门用于对NoSQL数据库产品进行性能测试的工具--YCSB. 二.YCSB介绍 Y…
随着传统的数据库.计算机网络和数字通信技术的飞速发展,以数据分布存储和分布处理为主要特征的分布式数据库系统的研究和开发越来越受到人们的关注.但由于其开发较为复杂,在一定程度上制约了它的发展.基于此,本文提出了在.Net环境下使用一种新的开发语言C#结合ADO.Net数据访问模型来开发分布式数据库系统,大大简化了开发过程. 1 分布式数据库系统 就其本质而言,分布式数据库系统的数据在逻辑上是统一的,而在物理上却是分散的.与集中式数据库相比它有如下主要优点: · 解决组织机构分散而数据需要相互联系的…
项目背景: 项目需要对两个服务器上的表进行同步,表的结构可能不一样.比如服务器A上的表i同步数据到服务器B上的表j,i和j的结构可能不一样,当然大部分字段是一样的.项目看起来很简单,网上一搜也是很多,什么利用Oracle的同步工具,利用mybatis拦截器拦截sql语句等等.不好意思,由于种种原因,我们项目都没有办法使用.我们最后讨论的方案就是最传统的暴力解决,一条一条插入或者更新,当然这有一个很重要的前提,就是我们的数据不多,最多也就是几万条,如果数据量很多,比如上千万的这种级别,这种方案估计…