参考  设置环境变量R_LIBS将R包安装到自定义路径   实际上是可以解决问题的, #环境变量完成以后,启动(重启)R,运行 .libPaths() 加载R包时,发现路径仍然未变成自定义的. 那么参考  quantreg软件包加载失败.是要改路径么?新手求帮忙 开启R的时候用管理者身份打开[鼠标右键RStudio→以管理者身份运行],再运行,就会发现路径自定义成功. .libPaths()…

前言 R对windows使用很友好,对Linux来说充满了敌意.小数据可以在windows下交互操作,效果很好很棒.可是当我们要处理大数据,或者要在集群上搭建pipeline时,不得不面对在Linux上装R及想要的R包这个难题,尤其是对非root用户而言更是艰难重重. 准备依赖库 依次安装:zlib/bzip/liblzma/pcre/curl,注意顺序和版本.目前3.4以上3.6以下R版本相对较为稳定和不过时,我自己安装的是3.5.2. cd zlib-1.2.11 ./configure -…

生物上的一些包可以这样安装 source("https://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("affy") 一般的包: install.package("包名") 使用library()可以查看已经安装的包的列表,会打开一个新窗口显示信息. 使用installed.packages()可以看到各个包安装的路径,版本号等信息. 也可以使用 .packages(all.available=T) 就在控制台…

R 查看包的版本 version> packageVersion("snow") 卸载包remove.packages 从源码安装包install.packages(path_to_file, repos = NULL, type="source")http://stackoverflow.com/questions/1474081/how-do-i-install-an-r-package-from-source 生成随机数 正太分布For uniforml…

options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) if(! require("devtools")) install.packages("devtools") if(! require("reshape2")) install.packages("reshape2") if(! require(…

在R console中使用install.packages()来安装第三方包时,会出现这样的错误: 即使我们选择的是China的镜像也解决不了问题. 这时候,可以先试试用IE打开上图中黑底部分的URL.因为据说R是使用IE来打开页面进行下载的,所以如果自己电脑上的IE打不开相应的链接,那么在R里面也是无法完成下载的. 如果用IE打不开,网友们的说法是修复IE.我的做法是直接翻了墙.然后用IE就能正常打开页面了,然后也能在R里面进行各种包的安装了. 在安装的过程中,有时会出现无法把下载好的包移动到…

https://www.cnblogs.com/jessepeng/p/10984983.html Linux 的R环境,可以通过anaconda jupyter notbook很容易的配置,见我之前的博客  https://www.cnblogs.com/shanyr/p/11276755.html 安装R包 Linux下安装R包一般有2种方式: 1. R CMD INSTALL 下载源码 R CMD INSTALL /.../mypackage.tar.gz 也可指定安装库路径: R CMD…

通常我们都是直接使用library(pkg_name)  的形式加载R包,在同一台机器上面,对于我们而言,这个包所在的路径一定是在.libPaths() 路面的,但是对于其他用户而言,这个路径可能不存在.libPaths() 里面,此时,就无法正确的加载该R包,为了解决这一问题,可以通过添加 lib.loc 参数,指定查找该包的路径. 用法示例: library(gplots, lib.loc="/usr/lib64/R/library/gplots") 通过lib.loc 参数可以解…

目的 走一遍R包开发过程,并发布到Github上使用. 步骤 1. 创建R包框架 Rsutdio --> File--> New Project--> New Directory --> R Package 创建完成后,在R包文件夹下有如下文件(夹): man: 存放*.Rd文件 R: 存放R脚本 DESCRIPTION: R包描述信息 NAMESPACE: 命令空间 rmytools.Rproj: R工程文件 2. 自定义R包 上面是Rstudio为开发者创建的一个框架,接下来是…

转自 http://bnuzhutao.cn/archives/901 一般 R 语言的书籍上,介绍安装 R 包的方法都是这样的: install.packages("packagename"); 一般而言这不会成功,因为它默认会安装到系统目录下面,而普通用户在这个目录里并没有写入的权限. 因此,需要在 install.packages 这个函数里面指定安装的路径,例如想安装到 /home/myname/R 这个目录,就这么写: install.packages("packa…