31、SAM文件中flag含义解释工具--转载

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31、SAM文件中flag含义解释工具--转载

转载:http://www.cnblogs.com/nkwy2012/p/6362996.html SAM是Sequence Alignment/Map 的缩写.像bwa等软件序列比对结果都会输出这样的文件.samtools网站上有专门的文档介绍SAM文件.具体地址:http://samtools.sourceforge.net/SAM1.pdf 很多人困惑SAM文件中的第二列FLAG值是什么意思.根据文档介绍我们可以计算,但是为了方便大家,下面给大家提供一个脚本工具,大家直接输入flag值就…

Python工程文件中的名词解释---Module与Package的区别

当我们在已有的Python工程文件中创建新的内容是,通常会有两种类型文件供你选择---Module和Package,对于初学者来说会搞不清楚这两种文件直接的关系.这里就来解释一下这两者之间的关系. Module简介: 中文翻译成“模块”,所谓的模块其实就是能够独立的完成一组任务的代码集.在Python里面Module一般就是一个独立的.py文件(有时候也可能是多个). Package简介: 中文翻译成“包”,在Python中,Package就相当于多个Module组成的集合,一般我们在工程中…

BD面试题1-两个大文件中找出公共记录[转载]

转自:https://blog.csdn.net/tiankong_/article/details/77234726#commentBox 1.题目给定a.b两个文件,各存放50亿个url,每个url各占64字节,内存限制是4G,让你找出a.b文件共同的url? 2.思考过程 //我看见这个题就啥也没想到,想不到哈希啊... 可以使用哈希,对a文件中的所有进行遍历,再对b进行遍历,但是由于文件过大,并且还要给哈希表分配空间,所以一次性建立哈希表希望不大. 3.解决办法 50亿*64B=320…

Andoid java文件中的Log检查工具

AndroidLogChecker 由于发布软件版本的时候我们需要把Log注释掉,此工具可以检查java类中的Log所在行以及是否已经注释. Github: https://github.com/cumtkangyi/AndroidLogChecker package com.leo.kang.tools; import java.io.BufferedReader; import java.io.File; import java.io.FileNotFoundException; impor…

linux中shell变量$#,$@,$0,$1,$2的含义解释（转载）

变量说明: $$Shell本身的PID(ProcessID)$!Shell最后运行的后台Process的PID$?最后运行的命令的结束代码(返回值)$-使用Set命令设定的Flag一览$*所有参数列表.如"$*"用「"」括起来的情况.以"$1 $2 … $n"的形式输出所有参数.$@所有参数列表.如"$@"用「"」括起来的情况.以"$1" "$2" … "$n" 的形…

bat脚本中%~dp0含义解释

在Windows脚本中,%i类似于shell脚本中的$i,%0表示脚本本身,%1表示脚本的第一个参数,以此类推到%9,在%和i之间可以有"修饰符"(完整列表可通过"for /?"指令查看),表示对%i进行各种处理,其中d表示盘符,p表示除盘符外的路径,n表示文件名,x表示扩展名,f表示全路径(路径+文件名),s表示8.3格式的全路径,修饰符可以组合,所以%~dp0的意思是:脚本本身(%0)的路径(盘符d+路径p).下面是实例演示,在F:\ghost\tmpFiles…

块结构在文件中的表示IOB【转载】

转自:http://www.coderjie.com/blog/43b3601e0a2411e7841d00163e0c0e36 1.块在内存中以树的形式存储,分好块的文本在文件中用IOB标记存储: I(inside,内部),O(outside,外部),B(begn,开始). 如果一个单词被标记为B,则表示一个块的开始,块内的单词被标记为I,其他单词被标记为O.B和I标记后需要加块类型的后缀,如B-NP,I-NP.如下图所示: 文本方式的IOB格式存储如下: We PRP B-NP saw VB…

在Android.mk文件中输出打印消息（转载）

转自:http://blog.csdn.net/xiaibiancheng/article/details/8479694 在进行Android NDK的开发当中有时想看看Android.mk文件当中某个变量的值,可以再Android.mk文件当中用warnin语句实现该功能假如有个Android.mk文件的内容如下: LOCAL_PATH := $(call my-dir) include $(CLEAR_VARS) LOCAL_MODULE := hello-jni LOCAL_SRC_FI…