【Alterations of brain quantitative proteomics profiling revealed the molecular mechanisms of diosgenin against cerebral ischemia reperfusion effects（大脑的定量蛋白质组学揭示了薯蓣皂苷元对脑缺血再灌注效应的分子机制）】的更多相关文章

Alterations of brain quantitative proteomics profiling revealed the molecular mechanisms of diosgenin against cerebral ischemia reperfusion effects（大脑的定量蛋白质组学揭示了薯蓣皂苷元对脑缺血再灌注效应的分子机制）

文献名:Alterations of brain quantitative proteomics profiling revealed the molecular mechanisms of diosgenin against cerebral ischemia reperfusion effects(大脑的定量蛋白质组学揭示了薯蓣皂苷元对脑缺血再灌注效应的分子机制) 期刊名:J. Proteome Res 发表时间:(2020年3月) IF:3.78 (2018) 单位: 西安交通大学 中科院…

Quantitative proteomics of Uukuniemi virus-host cell interactions reveals GBF1 as proviral host factor for phleboviruses（乌库涅米病毒-宿主细胞互作的定量蛋白质组学揭示了GBF1是个白蛉病毒的前病毒宿主因子）-解读人：谭亦凡

期刊名:Molecular & Cellular Proteomics 发表时间:(2019年12月) IF:4.828 单位:1德国海德堡大学附属医院2德国汉诺威医科大学3德国亥姆霍茲感染研究中心4德国马克斯·普朗克生化研究所5瑞典于默奥大学6葡萄牙波尔图大学7德国&柏林健康研究所 8法国里昂大学 物种:人 技术:非标定量蛋白质组学,免疫共沉淀,病毒化验 一. 概述: 该研究使用免疫共沉淀-非标定量蛋白质组学的方法发现了高尔基转运相关蛋白GBF1与乌库涅米病毒(UUKV)的感染有关.通过…

Quantitative Proteomics of Enriched Esophageal and Gut Tissues from the Human Blood Fluke Schistosoma mansoni Pinpoints Secreted Proteins for Vaccine Development （解读人：张聪敏）

文献名:Quantitative Proteomics of Enriched Esophageal and Gut Tissues from the Human Blood Fluke Schistosoma mansoni Pinpoints Secreted Proteins for Vaccine Development(从人类血吸虫曼氏血吸虫中富集的食道和肠道组织的定量蛋白质组学确定了用于疫苗开发的分泌蛋白) 期刊名:Journal of Proteome Research 发表时间:…

预测氨基酸替换的致病性及分子机制：MutPred工具的使用

MutPred的功能是预测氨基酸替换后的致病性及其分子机制,旧版本见链接:http://mutpred1.mutdb.org/ 新版本更新为MutPred2,见网站链接:http://mutpred2.mutdb.org/index.html,如下图所示,点击predict here 操作步骤见下图: 输入邮件地址.输入想要查询的蛋白质序列.最后submit等结果. 重点讲中间输入的蛋白质序列怎么来的: 首先,进入网站https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/ 假…

密码子演化假说|凝固事件假说|立体化学假说|共进化假说|代谢途径相关性假说|四重兼并|假四重兼并|最小损伤原则|AU-rich|GC-rich|逐步进化假说|分子机制进化假说

生命组学 将密码子表重排后发现,嘌呤嘧啶含量不同,密码子的氨基酸种类由第一二位决定,同时第三位变化大却没有蛋白质层面上实质性的改变,这说明第三位氨基酸是用于维持氨基酸组成不发生变化同时保证蛋白质稳定性. 基于最小损伤原则,AU-rich半区为多样性半区,这里的氨基酸是必须的氨基酸且种类繁多.GC-rich半区是鲁棒性半区,通过可替代的氨基酸可以帮助稳定氨基酸组成,因此氨基酸变化对蛋白质影响小,这是对对多样性半区的补充.比如,四重兼并和假四重兼并(变为同类或相同氨基酸). 密码子演化假说 凝固事件…

Mol Cell Proteomics. | Identification of salivary biomarkers for oral cancer detection with untargeted and targeted quantitative proteomics approaches (解读人：卜繁宇)

文献名:Identification of salivary biomarkers for oral cancer detection with untargeted and targeted quantitative proteomics approaches 期刊名:Molecular & Cellular Proteomics 发表时间:2019年9月 IF:4.828 单位: 台湾桃园长庚大学医学院 台湾桃园林口长庚纪念医院 台湾台中国立中兴大学 物种:人唾液 技术:非靶向和靶向组学组学…

Cancer Cell | 肿瘤微环境渐进式调控AML治疗抵抗的分子机制

急性髓系白血病 ( acute myeloid leukemia, AML ) 是成年人常见的血液系统恶性肿瘤之一,主要表现为髓系原始细胞克隆性恶性增殖及正常造血细胞功能抑制.在AML基因突变图谱中,fms样酪氨酸激酶3 ( fms-like receptor tyrosine kinase 3, FLT3 ) 基因突变最为常见,存在于约1/3初诊AML患者.FLT3突变形式主要包括跨膜区内部的串联重复突变 ( ITD ) 和累及活化环中的点突变( TKD ) 两种形式.虽然这些突变影响细胞功能…

Nature | 多层次蛋白质组学综合分析冠状病毒侵染宿主细胞的分子机制

冠状病毒是一种自然界普遍存在的单股正链RNA病毒,电镜下呈日冕状或皇冠状,故命名为冠状病毒.在本世纪初短短20年中,共爆发了三次冠状病毒疫情,即2003年SARS-CoV.2012年MERS-CoV和2019年SARS-CoV-2,极易引起呼吸道系统感染并在人与人间传播,严重威胁人类生命.其中,SARS-CoV-2如今更是造成了全球300多万人死亡,1.4亿人感染,再次刷新了人们对于冠状病毒危害性的认识.因此,准确.深入地研究冠状病毒及其感染宿主细胞过程的生物学特征,并开发高效地防治药物及疫苗,…

单细胞文献分析 Quantitative single-cell rna-seq with unique molecular identifers

Quantitative single-cell rna-seq with unique molecular identifers 这篇文章论证了 scRNA-seq 使用UMI来计算基因表达量的合理性和优势. 这里主要研究如何分析 scRNA-seq 的数据,如何处理ERCC和UMI. 背景: however, losses in cdna synthesis and bias in cdna amplifcation lead to severe quantitative errors. 单…

Javascript：再论Javascript的单线程机制 之 DOM渲染时机

Javascript:再论Javascript的单线程机制 之 DOM渲染时机 背景 Javascript是单线程事件驱动的,所有能看到的Javascript代码都是在一个线程执行,定时器回调和AJAX回调会在适当的时刻插入队列等待Javascript线程调度执行,今天想测试一下DOM渲染的线程与时机,具体的问题是: 修改DOM会立即显示在UI中吗? 一个小测试 测试代码 1 <!DOCTYPE html> 2 <html xmlns="http://www.w3.org/19…

沉淀再出发：再谈java的多线程机制

沉淀再出发:再谈java的多线程机制 一.前言 自从我们学习了操作系统之后,对于其中的线程和进程就有了非常深刻的理解,但是,我们可能在C,C++语言之中尝试过这些机制,并且做过相应的实验,但是对于java的多线程机制以及其中延伸出来的很多概念和相应的实现方式一直都是模棱两可的,虽然后来在面试的时候可能恶补了一些这方面的知识,但是也只是当时记住了,或者了解了一些,等到以后就会变得越来越淡忘了,比如线程的实现方式有两三种,线程池的概念,线程的基本生命周期等等,以及关于线程之间的多并发引起的资源的抢占…

再理解HDFS的存储机制

再理解HDFS的存储机制 1. HDFS开创性地设计出一套文件存储方式.即对文件切割后分别存放: 2. HDFS将要存储的大文件进行切割,切割后存放在既定的存储块(Block)中,并通过预先设定的优化处理,模式对存储的数据进行预处理,从而攻克了大文件储存与计算的需求. 3. 一个HDFS集群包含两大部分.即NameNode与DataNode. 一般来说,一个集群中会有一个NameNode和多个DataNode共同工作: 4. NameNode是集群的主server,主要是用于对HDFS中全部的文…

Journal of Proteome Research | Quantitative Subcellular Proteomics of the Orbitofrontal Cortex of Schizophrenia Patients （精神分裂症病人眶额叶皮层亚细胞结构的定量蛋白质组学研究）（解读人：王聚）

期刊名:Journal of Proteome Research 发表时间:(2019年10月) IF:3.78 单位: 里约热内卢联邦大学 坎皮纳斯州立大学 坎皮纳斯州立大学神经生物学中心 卡拉博大学 慕尼黑大学 物种:人类脑部眶额叶皮层组织 技术:iTRAQ标记非靶相对定量,SRM靶向相对定量   一. 概述: 该研究选取了12例精神分裂病人和8例对照健康人群的眶额叶皮层(OFC)组织,通过iTRAQ标记非靶相对定量以及SRM靶向相对定量,进行了组织细胞中线粒体,粗提细胞核以及细胞质三大类亚…

Dysregulation of Exosome Cargo by Mutant Tau Expressed in Human-induced Pluripotent Stem Cell (iPSC) Neurons Revealed by Proteomics Analyses（蛋白质组学揭示了人诱导的多能干细胞（iPSC）神经元中表达的突变Tau对外泌体的失调） 解读人：梁玉婷

期刊名:MCP 发表时间:(2020年4月) IF:4.828 单位:Skaggs School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences, University of California San Diego 物种:人 技术:LC-MS/MS Tandem Mass Spectrometry; label free quantitation 一. 概述:(用精炼的语言描述文章的整体思路及结果) 本研究以人iPSC神经元合成的外泌体为实验材料,进行LC-MS…

解读人：刘杰，Targeted Quantitative Kinome Analysis Identifies PRPS2 as a Promoter for Colorectal Cancer Metastasis（PRM-磷酸化激酶定量发现结肠癌转移促进因子-PRPS2）

关键词:PRM,kinase,colorectal cancer, metastasis, PRPS2 来自加州大学河滨分校的Yinsheng Wang教授应用PRM技术筛选出介导结肠癌细胞转移促进因子-PRPS2激酶.这项研究于2019年3月25日发表于蛋白组学主流期刊Journal of Proteome Research(原文链接:https://pubs.acs.org.ccindex.cn/doi/10.1021/acs.jproteome.9b00119). 背景 结肠癌(CRC)是…

Mol Cell Proteomics. | Mapping Spatio-temporal Microproteomics Landscape in Experimental Model of Traumatic Brain Injury Unveils a link to Parkinson’s Disease

期刊:Molecular & Cellular Proteomics 发表时间:June 16, 2019 通讯作者:Michel Salzet,Isabelle Fournier 一.  概述 作者在大鼠不同脑区域构建中度受控皮质损伤模型(CCI),并在受损后不同时间段使用 空间分辨的蛋白质组学检测技术来观测创伤性脑损伤(TBI)中蛋白的量和质的改变.发现了已知与帕金森病(PD)有关的主要蛋白质家族的过度表达,(例如同侧黑质中的GPR158,HGMB1,突触结合蛋白和谷氨酸脱羧酶),因此揭示了…

China Brain Project: Basic Neuroscience, Brain Diseases, and Brain-Inspired Computing

日前,中国科学院神经科学研究所.中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心.香港科技大学生命科学部和分子神经科学国家重点实验室.中国科技大学自动化研究所在 Cell 上联合发表了一篇概述论文<China Brain Project: Basic Neuroscience, Brain Diseases, and Brain-Inspired Computing>,介绍了「中国脑计划」在基础神经科学.脑疾病和脑启发计算上的研究进展.机器之心对这篇论文进行了完整的编译,读者也可通过以下链接查看原论文.…

Advances in Single Cell Genomics to Study Brain Cell Types | 会议概览

单细胞在脑科学方面的应用 Session 1: Deciphering the Cellular Landscape of the Brain Using Single Cell Transcriptomics Single cell/nucleus transcriptomics has emerged as a powerful approach to classify cell types and dynamic cell states in any multicellular organ…

Mol. Cell. Proteomics | 癌细胞衍生的小细胞外囊体通过促进HGF-Met途径促进受体细胞转移

题目:Cancer cell derived small extracellular vesicles contribute to recipient cell metastasis through promoting HGF/c-Met pathway 期刊:MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS 发表时间:June 13, 2019 DOI:10.1074/mcp.RA119.001502 分享人:廖文丽 内容与观点: 一.概述 本研究旨在揭示小细胞外囊泡蛋白(sEV…

Mol Cell Proteomics. | Proteomics Analysis of Extracellular Matrix Remodeling During Zebrafish Heart Regeneration (解读人：徐宁)

文献名:Proteomics Analysis of Extracellular Matrix Remodeling During Zebrafish Heart Regeneration(斑马鱼心脏再生过程中胞外基质重塑的蛋白质组学分析) 期刊名:MCP 发表时间:(2019年9月) IF:4.828 单位: 西班牙巴塞罗那再生医学中心 巴塞罗那生物材料和纳米医学网络生物医学研究中心 物种:斑马鱼 技术:非靶向蛋白组学   一. 概述: 本研究选取斑马鱼心脏不同再生时期的心室样本,通过所建立一…

Hadoop_HDFS架构和HA机制

Hadoop学习笔记总结 01.HDFS架构 1. NameNode和ResourceManager NameNode负责HDFS,从节点是DataNode:ResourceManager负责MapReduce,从节点上是NodeManager. 2. NameNode工作原理 元数据内容 名字,几个副本,几个块_Id,每一个块在哪些主机上. 实际是真实文件和系统block块的映射. NameNode职责 维护元数据信息 维护hdfs目录树 响应客户端请求 NameNode元数据管理机制 (1)…

solr 打分和排序机制(转载)

以下来自solr in action. 包含: 词项频次.查询词项出现在当前查询文档中的次数. 反向文档频次.查询词项出现在所有文档总的次数. 此项权重. 标准化因子: 字段规范: 文档权重. 字段权重. 长度归一化.消除长文档的优势.因为长文档的词项频次一般会比较大. 协调因子.避免一个文档中出现某一个词项的次数太多导致总分值太大.目的是让结果中包含更多的是出现所有词项的文档. 具体说明见下文. 以下转载自网络.原文地址: http://tec.5lulu.com/detail/110d8n2…

解读人：李琼，Metabolic profiling of tumors, sera and skeletal muscles from an orthotopic murine model of gastric cancer associated-cachexia（胃癌相关恶病质的原位小鼠模型中肿瘤，血清和骨骼肌的代谢谱分析）

发表时间:(2019年4月) IF:3.950 单位: 厦门大学 厦门理工大学 物种:小鼠的肿瘤,血清和骨骼肌 技术:核磁共振代谢组学分析 一. 概述:(用精炼的语言描述文章的整体思路及结果) 本研究通过原位植入BGC823细胞系建立了GCC鼠模型,并对胃组织,血清和腓肠肌进行基于核磁共振的代谢组学分析.在肿瘤中鉴定出20种差异代谢物,在血清中鉴定出13种,在腓肠肌中鉴定出14种.提供与GCC诱导的肌肉萎缩相关的代谢改变信息. 二. 研究背景:(简要介绍研究进展动态.研究目的和意义) 恶病质是一…

解读人：范徉，Methylome and Metabolome Analyses Reveal Adaptive Mechanisms in Geobacter sulfurreducens Grown on Different Terminal Electron Acceptors（甲基化组学和代谢组学分析发现Geobacter sulfurreducens生长在不同电子终受体中的适应机制）

发表时间: (2019年4月) IF:3.950 单位: Fujian Provincial Key Laboratory of Soil Environmental Health and Regulation, College of Resources and Environment, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou, Fujian 350002, China 物种:Geobacter sulfurreducens 技术:三…

Mol Cell Proteomics. |王欣然| 基于微粒的蛋白聚合物捕获技术让能满足多种不同需求的蛋白质组学样品制备方法成为可能

大家好,本周分享的是发表在Molecular & Cellular Proteomics. 上的一篇关于蛋白质组学样本质谱分析前处理方法改进的文章,题目是Protein aggregation capture on microparticles enables multi- purpose proteomics sample preparation,通讯作者是丹麦哥本哈根大学的Jesper V. Olsen. 对于蛋白质组学研究人员来说,在进行质谱分析之前,一个良好的蛋白样本制备方法可以有效降低…

Quantitative proteomic analysis of small and large extracellular vesicles (EVs) reveals enrichment of adhesion proteins in small EVs (文献分享一组-柯酩)

文献名:Quantitative proteomic analysis of small and large extracellular vesicles (EVs) reveals enrichment of adhesion proteins in small EVs(小型和大型胞外囊泡的定量蛋白质组学分析揭示小型胞外囊泡中粘附蛋白的富集) 期刊名:Journal of proteome research 发表时间:2019年1月 单位: 范德比尔特大学医学院 新墨西哥大学 莎拉坎农研究所…

ComplexBrowser: a tool for identification and quantification of protein complexes in large-scale proteomics datasets（大规模蛋白组学数据集中鉴定和定量蛋白复合物）

文献名:ComplexBrowser: a tool for identification and quantification of protein complexes in large-scale proteomics datasets(大规模蛋白组学数据集中鉴定和定量蛋白复合物) 期刊名:Mol Cell Proteomics 发表时间:(2019年11月) IF:4.828 单位:南丹麦大学生物化学与分子生物学系和VILLUM生物分析科学中心 物种:人和小鼠 技术:ComplexBrow…

Journal of Proteomics Research | Th-MYCN转基因小鼠的定量蛋白质学分析揭示了Aurora Kinase抑制剂改变代谢途径和增强ACADM以抑制神经母细胞瘤的进展

题目:Quantitative Proteomics of Th-MYCN Transgenic Mice Reveals Aurora Kinase Inhibitor Altered Metabolic Pathways and Enhanced ACADM To Suppress Neuroblastoma Progression 期刊:Journal of Proteome Research 发表时间:September 27, 2019 DOI:10.1021/acs.jproteom…

Mol Cell Proteomics. | Elevated Hexokinase II Expression Confers Acquired Resistance to 4-Hydroxytamoxifen in Breast Cancer Cells（升高的己糖激酶II表达使得乳腺癌细胞获得对他莫昔芬的抗性）(解读人：黄旭蕾)

文献名:Elevated Hexokinase II Expression Confers Acquired Resistance to 4-Hydroxytamoxifen in Breast Cancer Cells(升高的己糖激酶II表达使得乳腺癌细胞获得对他莫昔芬的抗性) 期刊名:Mol Cell Proteomics 发表时间:(2019年9月) IF:4.828 单位: 加州大学河滨分校 研究对象:乳腺癌细胞 技术:靶向蛋白组学   一. 概述: 本文应用了基于并行反应监测(PRM)…

AS3事件机制概述

事件机制是AS3的核心功能之一,没有充分掌握事件机制的方方面面,就不能算是精通AS3语言. 1. AS3事件机制的主要成员 IEventDispatcher:事件派发对象接口,定义了添加.派发.移除.是否监听指定事件.是否触发指定事件接口 EventDispatcher:事件派发对象接口的实现者,用户无法撇开EventDispatcher而自行实现IEventDispatcher接口,无法直接继承EventDispatcher时,必须把EventDispatcher作为实例变量. Event:事…