转载:http://www.bio1000.com/experiment/fenzi/237846.html 标签: NCBI Blast LASTP 摘要 : NCBI BLAST比对结果报告分析:BLAST是NCBI开发的一款序列相似搜索程,常用在线的BLAST比对工具进行序列比对分析和引物设计.   ncbi blast比对结果报告分析:BLAST是NCBI开发的一款序列相似搜索程,常用在线的BLAST比对工具进行序列比对分析和引物设计. 写在解读报告之前的,首先就使用Blast最终的目的…

Peptide Sequence Databases蛋白序列的数据库 nrAll non-redundant GenBank CDS translations + RefSeq Proteins + PDB + SwissProt + PIR + PRF所有非冗余的的GenBank CDS区的翻译序列 + 参考序列的蛋白 + PDB数据库 + SwissProt蛋白数据库 + PRF蛋白数据库 refseqRefSeq protein sequences from NCBI’s Referenc…

Biopython项目是旨在减少计算生物学中代码重复的开源项目之一,由国际开发人员协会创建. 它包含表示生物序列和序列注释的类,并且能够读取和写入各种文件格式(FASTA,FASTQ,GenBank和Clustal等), 支持以程序化方式访问生物信息的在线数据库(例如,NCBI). 独立的模块扩展了Biopython的序列比对,蛋白质结构,群体遗传学,系统发育,序列基序和机器学习等功能. 序列操作 >>> # This script creates a DNA sequence and…

简介 NCBI除了提供在线的Web BLAST序列比对服务外,还提供FTP方式下载序列比对工具.这允许在本地平台上针对从NCBI下载或本地创建的数据库执行BLAST搜索.这些实用程序没有图形用户界面,通过类似DOS的命令窗口运行,并通过基于文本的命令行开关接受输入. 以下内容介绍了在运行Windows 7操作系统的PC上安装BLAST+和示例NCBI数据库所需的步骤. 下载 BLAST+软件包ncbi-blast-#.#.#+-win64.exe,适用于运行64位Windows操作系统的PC上.…

2015年9月,一个叫Livecoding.tv的网站在互联网上引起了编程界的注意.缘于Pingwest品玩的一位编辑在上网时无意中发现了这个网站,并写了一篇文章<一个比直播睡觉更奇怪的网站:直播程序员写代码> 来介绍它. Livecoding.tv是在2015年2月在美国正式上线的.公司的总部位于旧金山,创办人也是一位程序员. 网上直播已经不是新鲜事了,但正儿八经地直播程序员写代码确实少见.难怪品玩的编辑在他的文章中这样写道:"这么逗的一个东西,你跟我说它是一个教育平台?呃,然而好…

关于Scrapy如何安装部署的文章已经相当多了,但是网上实战的例子还不是很多,近来正好在学习该爬虫框架,就简单写了个Spider Demo来实践.作为硬件数码控,我选择了经常光顾的中关村在线的手机页面进行爬取,大体思路如下图所示. # coding:utf-8 import scrapy import re import os import sqlite3 from myspider.items import SpiderItem class ZolSpider(scrapy.Spider):…

基于本地存储的kvm虚拟机在线迁移 kvm虚拟机迁移分为4种(1)热迁移基于共享存储(2)热迁移基于本地存储(3)冷迁移基于共享存储(4)冷迁移基于本地存储 这里介绍的是基于本地存储的热迁移 动态块迁移版本要求qemu版本要求  大于或等于0.12.1(centos6.7或以上都没问题)rpm -qa|grep qemuqemu-kvm-0.12.1.2-2.491.el6_8.1.x86_64qemu-kvm-tools-0.12.1.2-2.491.el6_8.1.x86_64 目标宿主机:…

年前在线公开课程通知: 近期在开启VIP课程,隔天讲一次,年前其它时间插空讲公开课,主题:设计模式系列 1:培训 - 大概不会讲的内容: 1:不讲系列. 2:不讲入门. 3:不讲我不懂的! 2:培训 - 大概会讲的内容: 1:.NET 技术栈方向. 2:框架的源码解析. 3:编码及框架的思维. 4:性能的优化. 5:编码的习惯. 6:并发的处理方式. 7:.NET技术套路. 8:心理学基础教程. 9:虾为什么能扯到蛋的原因. 3:培训 - 讲课的节奏: 1:每次课为1到1个半小时间. 2:讲课的…

在ASP.NET Core中使用百度在线编辑器UEditor 0x00 起因 最近需要一个在线编辑器,之前听人说过百度的UEditor不错,去官网下了一个.不过服务端只有ASP.NET版的,如果是为了能尽快使用,只要把ASP.NET版的服务端作为应用部署在IIS上就可以立即使用了.不过我的需求并不急,所以把ASP.NET移植到了ASP.NET Core上.整个过程很简单,只是重新引用了一些包,修改了几处代码,另外就是把Controller中比较长的一个switch语句块重构为了字典,根据url中…

平台之大势何人能挡? 带着你的Net飞奔吧!:http://www.cnblogs.com/dunitian/p/4822808.html#skill 下载地址:http://mozilla.github.io/pdf.js/getting_started/#download 解压打开,这两个文件夹是精华 你可以自己看看目录 我们的目标是:web/viewer.html 先打开看看: 噢,shit 了(PDF.js默认情况下不可以打开本地PDF文件(发布后可以打开服务器文件),也不可以跨域浏览P…