已知 genomic_dna.txt TCGATCGTACCGTCGACGATGCTACGATCGTCGATCGTAGTCGATCATCGATCGATCGACTGATCGATCGATCGATCGATCGATATCGATCGATATCATCGATGCATCGATCATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCATATGTCAGTCGATGCATCGTAGCATCGTATAGTAGCTACGTAGCTACGATCGATCGATCGATCGTAGCTAGCTAGCTAGATCGATCATCAT…

概念 双核苷酸由任意2个碱基组成 测试1 dna = "AATGATGAACGAC" #一一列举 dinucleotides = ['AA','AT','AG','AC', 'TA','TT','TG','TC', 'GA','GT','GG','GC', 'CA','CT','CG','CT'] all_counts = {} for dinucleotide in dinucleotides: count = dna.count(dinucleotide) if count >…

最近在上生物信息学原理,打算记录一些课上的作业.第一次作业:如题. 基本思路: 1.从GFF中读取CDS的起始终止位置以及正负链信息.GFF格式见http://blog.sina.com.cn/s/blog_8a4f556e0102yd3l.html. 2.利用起始/终止位置等信息从FNA文件中提取CDS序列.FNA格式见 http://boyun.sh.cn/bio/?p=1192. 3.利用CDS序列及密码子表得到FAA文件并输出. 注意:最需要注意的一点是:当GFF中CDS位于负链时,需要…

目录 目录 序列 序列的标准操作符 切片操作符 一个例子 字符串的连接 序列的功能函数 enumerate 枚举出序列对象的元素 len 获取序列对象的长度 min 取出sequence中的最小值 max 取出sequence中的最大值 reversed 返回一个逆序访问的迭代器 sorted 序列的排序 sum 计算序列中的各项元素和 zip 混合两个序列对象 all 检测sequence中各项元素是否均为True any 检测序列中的任意元素是否为True 序列 序列是一类基本数据类型(字符…

一. 需求 公司要做一个H5手机端适配页面,因技术问题所以H5是外包的,每次前端给我们源码,我们把源码传到服务器让其他人访问看是否存在bug,这个不是很麻烦吗?有人说,可以让前端在他们的服务器上先托管,等我们验收了后在给源码不结了嘛,是的呀!所有的人都愿意这样,but…… 要是能在本地搭建环境直接访问是不是更好的.问题是我们这边程序此刻没时间与H5前端对接,既浪费我们时间又浪费他们时间.所以开发一个service服务器让测试人员直接参与,这样就可以把我们完美分工了. 二.Python搭建web服…

python的random模块(生成验证码) random模块常用方法 random.random() #生成0到1之间的随机数,没有参数,float类型 random.randint(1, 3) #生成参数1到参数2之间的随机数,输出为int类型,[1,3] random.randrange(1, 3) #生成参数1到参数2之间的随机数,输出为int类型,[1,3),这个方法还有一种用法,就是下面介绍的这种 random.randrange(0,100,2) #从指定范围内,按指定基数递增的集…

python执行py文件的流程 当我们执行一个py文件的时候,直接python xx.py即可,那么这个流程是怎么样的呢.先说明一下,python执行代码实际上是先打开文件然后执行里面的代码,所以文件的扩展名不一定是py的形式,txt形式也是依旧可以成功执行,只要文件里面的代码是符合python规范的.下面我们来看看python是怎么执行py文件的. 先将文件里面的内容读取出来,scanner对其进行扫描,切分成一个个的token parser对token进行解析,建立抽象语法树(AST,abs…

一.介绍 内容 使用 RNN 进行序列预测 今天我们就从一个基本的使用 RNN 生成简单序列的例子中,来窥探神经网络生成符号序列的秘密. 我们首先让神经网络模型学习形如 0^n 1^n 形式的上下文无关语法.然后再让模型尝试去生成这样的字符串.在流程中将演示 RNN 及 LSTM 相关函数的使用方法. 实验知识点 什么是上下文无关文法 使用 RNN 或 LSTM 模型生成简单序列的方法 探究 RNN 记忆功能的内部原理 二.什么是上下文无关语法 上下文无关语法 首先让我们观察以下序列: 01 0…

Python 写了一个批量生成文件夹和批量重命名的工具 目录 Python 写了一个批量生成文件夹和批量重命名的工具 演示 功能 1. 可以读取excel内容,使用excel单元格内容进行新建文件夹,和文件夹重命名 2. 可以自定义重命名 3. 等 代码 下载 演示 功能 1. 可以读取excel内容,使用excel单元格内容进行新建文件夹,和文件夹重命名 2. 可以自定义重命名 3. 等 代码 import os from pathlib import Path import xlwings…

伪随机编码中较常用的是m序列,它是线性反馈移位寄存器序列的一种,其特点是在相同寄存器级数的情况下输出序列周期最长.线性反馈移位寄存器的工作原理是,给定所有寄存器一个初始值,当移位脉冲到来时,将最后一级寄存器的值输出,同时将第 i级的寄存器内容存储到第 i+1 级中,此外将每一级的寄存器输出按照一定的线性运算规则计算出一个值,并将该值存入第一级寄存器中.随着移位脉冲的累加,线性反馈移位寄存器的输出可以组成一个序列,称之为移位寄存器序列[71]. 图3.5 线性反馈移位寄存器 MATLAB生成M序列…