先写一些需要用到的知识点,比如包.函数 dplyr 很好用的包 经常与ggplot2连用 mutate:用于对数据框的列进行重新处理,或者用处理的结果添加新列 数据清洗: 1.na.omit()               #去除数组当中的空值 newdata<-na.omit(olddata) ggplot: 1.在ggplot的里面添加直线: geom_hline()添加水平线 geom_viline()添加垂直线        #geom_hline(yintercept=1.3,type…
一.注意‘\t’是‘\t’     不是‘/t’  写'/t'就错了   就不是换行符了 二.程序报错先检查有没有这个包…
一.函数参数: pheatmap参数: treeheight_row #横有多长 treeheight_col #竖有多长 cluster_cols=FLASE #单一方向聚类,也就是只有一边有树状结构,默认是TRUE color=colorRampPalette(c("green","black","red"))(1000)) #更改颜色,具体怎么设置,还不知道 fontsize=15,fontsize_row=15,fontsize_col=…
写在前面:本博客为本人原创,严禁任何形式的转载!本博客只允许放在博客园(.cnblogs.com),如果您在其他网站看到这篇博文,请通过下面这个唯一的合法链接转到原文! 本博客全网唯一合法URL:https://www.cnblogs.com/acm-icpcer/p/11203182.html 这几天参加了学院组织的生物信息培训活动,有一个部分讲R语言入门,个人觉得受益良多,特将一些听课心得记录在此. Introduction R语言本质上和python.matlab一样是解释型语言,与编译型…
第一篇——用几分钟了解R语言入门知识 第二篇——用几分钟了解R语言入门知识(续) 关于数据分析学习笔记的计划(以及目录)…
R语言入门1:安装R和RStudio 曹务强 中科院遗传学博士研究生 9 人赞同了该文章 1. Windows安装R 在Windows系统上,安装R语言比较简单,直接从R的官方网站下载,按照正常的软件安装流程点下一步即可. 2. Windows安装RStudio R语言自带的工作窗口界面非常不美观,用起来也非常不方便.于是有人发明了RStudio: RStudio是R语言的一种集成开发环境,它是免费自由软件.RStudio同时有桌面版和服务器版.RStudio基于C++开发,它的图形用户界面基于…
R语言基础画图/绘图/作图 R语言基础画图 R语言免费且开源,其强大和自由的画图功能,深受广大学生和可视化工作人员喜爱,这篇文章对如何使用R语言作基本的图形,如直方图,点图,饼状图以及箱线图进行简单介绍. 0 结构 每种图形构成一个section,每个部分大致三部分构成,分别是R语言标准画图代码,R语言画图实例,和画图结果. R语言标准画图代码帮助你可以直接使用:help(funciton)查找,实例数据基本都来自内置包的数据,好了,直接切入主图,从最简单的点图开始吧. 1 点图 点图,简单的讲…
最近有好多r语言的爱好者问我r语言的事情,在百度上简单的收一收,感觉都在扯淡,真正适合初学者入门的资料几乎没有,比如最开始用什么编辑器比较好,在哪下载,最开始学习的例子有什么?  在日本网站上反倒是找到了不少的好资料,现在吧连接给出. 統計解析 & R言語 超初心者入門資料まとめ 基本统计知识和r语言下载安装到基本语法ppt http://morizyun.github.io/blog/statistics-analysis-bigginer-r/ 各种函数用法 http://cse.naro.…
简单介绍 watermark/2/text/aHR0cDovL2Jsb2cuY3Nkbi5uZXQv/font/5a6L5L2T/fontsize/400/fill/I0JBQkFCMA==/dissolve/70/gravity/Center" alt="" />语言是主要用于统计分析.画图的语言和操作环境. R本来是由来自新西兰奥克兰大学的Ross Ihaka和Robert Gentleman 开发. (也因此称为R)如今由"R开发核心团队"负责…
这节教程简单描述了R语言中常用的数据类型, 向量,字符串,矩阵,列表,数据框,以及附带了一个小例子 对于这节课所附带的例子需要做下列补充: 1.这个例子面向于对整列的数据进行预测 2.如果你需要求单行单列的预测值,你可以这样做 我们求第1行中的预测值 lma <- lm(sale_sum[1,1]~sale_sum[1,2]) 3.这个例子中没有用到第三列的数据,在这里第三列只是作为参考 相信这份教程可以帮助你学习R语言 此虽为免费教程,但请不要在未经允许的情况下转发在其他的任何地方,谢谢! 下…
1.help可以提供帮助,如help(nchar), help("[["),或者用?nchar也能获取帮助.example(nchar)可以获取到某个主题的使用方法. 2.nchar获取字符串的长度,nchar(x)返回x中每个字符串的长度,length获取向量的长度,区别如下: > nchar("hello") [1] 5 > nchar(3) [1] 1 > nchar(3000) [1] 4 > help(nchar) > nch…
数据挖掘常用的语言有R语言,python,SQL等,其中R语言最受欢迎.(注:SQL Server包含微软研究院开发的两种数据挖掘算法:Microsoft决策树和Microsoft聚集,此外还支持第三方开发的算法.) R语言是由统计学家开发的,一款开源免费的统计绘图语言,可以提供数学统计分析,允许用户开发的包进行扩展,同时可以进行数据可视化,兼容多种格式的输入输出. 在CRAN(Comprehensive R Archive Network,里面收藏了R的安装包,文档及大量的软件扩展包)base…
数据对象 创建向量相关的方法 R语言的向量用法非常像python, 就比如这个seq(0,10,2), 从0到10, 步长为2, 涉及到的元素作为向量里的内容进行创建. 这里的用法非常像Matlab, 可以直接对向量进行科学计算. (我记得在python里类似这样的乘法是"重复"的作用, 也就是(1,2,3)会变成(1,2,3,1,2,3,1,2,3)) rep方法, 例子如下, 创建一个向量, 连续5个100, 然后是连续2个200, 然后是连续3个300 runif方法会取n个随机…
设置R语言环境为英文环境 其实不设置也行...就是报错提示的内容是中文的话, 会不太好理解.. 1. 首先在用户根目录下cat查看一下, 发现没有.Renviron文件, 这个是R语言的环境配置文件. 2. 那么就用echo语句追加一句"LANGUAGE=en" 到 .Renviron文件, 如果没有这个文件, echo语句会自动创建. 3. 然后再cat查看一下, 确认一下. R语言运行方式 1. 在 R 的 console中 , 以一行一行用户交互的方式来进行 2. 在R 的con…
前言 本章介绍了 R 语言的基础知识 界面: 使用命令 “ R “进行命令行的实时编译 对象 定义: 用于储存数据的,设定一个名称 格式: a <- 1:6 命名规则: 规则1:不能以数字开头规则2:不能使用!,-,*,/等符号 查看对象 命令:ls() 运算 运算方式 R语言以 element-wise execution (按元素)的方式进行计算.举例: 对一个数字集进行运算,对其中每一个元素进行运算 对两个向量的运算,将其排成列进行各自的运算(若为整数倍,则进行循环的补足,然后再进行运算)…
1.向量 向量是R语言中最基本的数据类型,在R语言中没有单独的变量. (1)  创建向量 R语言中可以用 = 或者 <- 来赋值. 向量名 <- 向量 或  向量名 = 向量 向量的创建方式有c()函数,seq()函数等. 注:R中的向量默认为列向量,如果要得到行向量需要对其进行转置. (2)  引用 待引用向量为:test = c(6,7,8,9,10). a.用下标引用 向量名[下标值] 或  向量名[下标值1:下标值2] (下标值1至下标值2的所有数值) 注:R语言下标值从1开始. 另外…
向量之间的加减乘除运算: > x <- 1 > x [1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 > x=x+1 > x [1] 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 > x = 1:10 > x [1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 > y = seq(1,100, length.out = 10) > y [1] 1 12 23 34 45 56 67 78 89 100 > x*y [1] 1 24 69 136 22…
这节的内容是建立在之前我们对R语言最基本向量赋值的基础之上的,笔者本人学完R当中向量的索引感觉异常舒适,因为这个比Python的索引爽多了,是什么值开始索引就从哪里开始索引,到哪里结束就在哪里结束,而不会像Python一样有的时候输入0实际上是从1开始计数,有的时候到99为止实际上你要索引到100,给人一种难以弄清的感觉.学了简洁的R心里大为开朗. 一.得到向量当中某个数值的值 首先我们先生成一个从1到100数值的向量: > x <- c(1:100) > x [1] 1 2 3 4 5…
R语言主要用于统计,因此引入了向量这个概念将更好地进行统计计算,在其他无法引入向量的语言当中则会使用循环来计算一些大规模的数据,在R语言当中则不需要,下面我们来看看R语言当中向量的具体用法吧! 首先,如果我们把x作为一个向量,将其赋值为拥有五个元素的向量,代码如下: > x <- c(1,2,3,4,5) > x [1] 1 2 3 4 5 > 我们可以看到x的值已经变成了1,2,3,4,5,其中进行向量赋值的时候,我们使用的是C()函数进行的向量化.当然,向量里面并不会像数学一样…
R语言在人工智能,统计学,机器学习,量化投资,以及生物信息学方面有着十分广泛的运用.也是我大学的必修课,因此这里梳理一些有关R语言的知识点,做做记录. 首先我们需要知道R语言的工作区域,R语言默认的工作区域是在“C:/Users/lenovo/Documents”目录下,然而一般这样就会导致电脑的运行速度减慢,尤其是之后我们在使用R语言进行大数据的处理时,C盘因为大小不够,就会使计算机崩溃,因此我们可以调整R语言的输出目录,查看R语言工作目录的命令是: getwd() 得到: "C:/Users…
慢慢才意识到概率统计的重要性,当时学的时候只知道很重要,是机器学习基础啥的,但是却没有真正意识到( ╯□╰ ).我现在的理解是,统计学习可以从大数据中挖掘出规律(其实和数据挖掘还是很相关的),在科研工作和生活中都可以帮助和指导我们.生活中,我们可以通过分析数据,“透过现象看本质” (learning from data),参考大概率发生的事件,帮助我们少走一些弯路,做出正确的决策. 最开始的概率思维来自大一的近现代史老师,老师说 “为什么公司要区分985,211等学位?”,其实我当时也不是很理解…
一.R语言应知常用函数 1.getwd() 函数:获取工作目录(同eclipse设置workspace类似),直接在R软件中使用,如下图: 2.setwd(dir=”工作目录”) 函数:设置R软件RStudio的工作目录,如下图(注意目录写法): 3.list.files()函数(同dir()函数):查看R软件当前工作目录下的文件,如下图: 4.一般赋值符号:<- 或-> ,如x<-3 或3->x,表示x等于3 5.ls()函数:查看工作空间中的所有变量:ls.str()函数:查看…
一.数据分析相关概念 数据:是指对事物或对象各方面进行描述的符号,包括事物的基本属性.特征.性质.状态.相互关系等:比如描述人的数据有:身高.年龄.性别.兴趣.性格.婚姻状态等等. 分析:是指把事物或现象的各方面数据组合在一起,从这些事物的基本属性.特征.性质.状态等中找出其中彼此关系,寻找解决问题的方法,从而得出结论或指导决策. 数据分析:是指用一定的方法(包括数学.统计学等方法)对收集的数据,提取数据中有用的信息(属性.特征.性质.状态)详细研究,找出其中规律,概括总结分析结果,提供决策依据…
环境是windows R语言安装包 install.packages("magrittr")…
说明 在前一篇中,我们介绍了 R 语言和 R Studio 的安装,并简单的介绍了一个示例,接下来让我们由浅入深的学习 R 语言的相关知识. 本篇将主要介绍 R 语言的基本操作.变量和几种基本数据类型,好对 R 语言的使用方法有一个基本的概念.通过本篇的学习,你将了解到: R 语言有哪些基本操作 什么是变量,以及如何给变量赋值 R 语言有哪些基本数据类型,如何确定变量的数据类型 R 语言的基本操作 R 语言的默认提示符是 > ,它表示正在等待输入命令,每次输入命令后敲击回车即可执行当前命令. R…
1 R的下载.安转   (转)R有很多的版本,支持目前主流的操作系统MAC.Linux和WINDOWS系列.因为我个人是在WINDOWS下用R的,所以在这里将只介绍WINDOWS下R的下载&安装. 下载R: 你可以从世界各地很多网站上下载到R,官方的中国下载点是: http://www.lmbe.seu.edu.cn/CRAN/bin/windows/base/ 在我写这篇文章的时候,最新的版本是R-2.2.1版. 在网络上有一篇被翻译过来的R入门教材,可以在这里找到 :R 導論(入門) 安装R…
1 R的下载.安转 R有很多的版本,支持目前主流的操作系统MAC.Linux和WINDOWS系列.因为我个人是在WINDOWS下用R的,所以在这里将只介绍WINDOWS下R的下载&安装. 下载R: 你可以从世界各地很多网站上下载到R,官方的中国下载点是: http://www.lmbe.seu.edu.cn/CRAN/bin/windows/base/ 在我写这篇文章的时候,最新的版本是R-2.2.1版. 在网络上有一篇被翻译过来的R入门教材,可以在这里找到 :R 導論(入門) 安装R: 1,双…
nanana,作为一个不合格的数学专业学生,脑袋不好使,又穷逼,只好学点儿实用的东西,希望能养活自己~~~ 不瞎哔哔,想做数据方面工作的时候在犹豫是学R还是学python,一点儿python基础都没有强行用了一个python爬虫,发现python还是比较的麻烦(但是还是后来还是花了一些时间学了一些python基础的语法,发现python真的很棒,但是总感觉R更加的合适,R真的是比较美妙的东西~~~)所以现在在R的路上飘渺着~~~请多指教啦! 1. R向量 我很喜欢这东西,做大物实验的时候太方便了…
要求:模拟产生统计专业同学的名单(学号区分),记录数学,线代,英语三科成绩 > num <- seq(1513032001, 15130320100)                 #模拟100位同学 > math <- round( runif(100, min = 80, max = 100) )    #round()---产生随机数, runif()--均匀分布在min = 80 到 max = 100之间的数(100个) > linger <- round(…
前言 这一章讲了程序设计的相关知识,经过了: 算法分析 编码 得到最后的程序. if 语句 格式:if (this) {that} else if { another} else { another another} 双运算符 && .|| && 和 || 与 & 和 | 的不同之处在于:&& 和 || 存在短路现象,因此能够提高代码的运行效率局限性是:两侧只能是单个的逻辑测试 逻辑测试语句实例 判断三个值是否相等 方法一:symbols[1] ==…