HDF5, 大量(海量?)数据存储的一种解决方案. HDF的全称是Hiearchical Data Format, 5是版本号(未考证过TODO). 一个HDF5文件操作起来就像一个独立的文件系统. (TODO, I/O特性, 是事件驱动的吗?) import h5py import numpy as np 创建一个HDF5文件 f = h5py.File("/home/dengdan/temp/no-use/hdftest.hdf5", "w") 它可以存储两类数…

一.简介 HDF5(Hierarchical Data Formal)是用于存储大规模数值数据的较为理想的存储格式,文件后缀名为h5,存储读取速度非常快,且可在文件内部按照明确的层次存储数据,同一个HDF5可以看做一个高度整合的文件夹,其内部可存放不同类型的数据.在Python中操纵HDF5文件的方式主要有两种,一是利用pandas中内建的一系列HDF5文件操作相关的方法来将pandas中的数据结构保存在HDF5文件中,二是利用h5py模块来完成从Python原生数据结构向HDF5格式的保存,本…

从头到尾都是手码的,文中的所有示例也都是在Pycharm中运行过的,自己整理笔记的最大好处在于可以按照自己的思路来构建矿建,等到将来在需要的时候能够以最快的速度看懂并应用=_= 注:为方便表述,本章设s为pandas.core.series.Series的一个实例化对象,设df为pandas.core.frame.DataFrame的一个实例化对象 1. Pandas简介 Pandas是基于NumPy的python数据分析库,最初被作为金融数据分析工具而开发出来,因此Pandas为时间序列分析提…

JAVA学习总结    2 第一天    2 1:计算机概述(了解)    2 (1)计算机    2 (2)计算机硬件    2 (3)计算机软件    2 (4)软件开发(理解)    2 (5)语言    2 (6)人机交换    2 2:键盘功能键的认识和快捷键(掌握)    2 (1)功能键的认识    2 (2)快捷键    3 3:常见的DOS命令(掌握)    3 (1)常见的如下    3 (2)其他的几个(了解)    3 4:Java语言概述(了解)    4 (1)Jav…

問題一: Installing Caffe without CUDA: fatal error: cublas_v2.h No such file: 在Makefile.config中修改,將CPU_ONLY := 1打開. 問題二:“fatal error: hdf5.h: 没有那个文件或目录”解决方法 参考自http://blog.csdn.net/hongye000000/article/details/51043913 Step 1 在Makefile.config文件的第85行,添加/…

最近用caffe做了一下regression问题,先用data layer中的data,float_data试了一下,data用来存放图片,float_data存放regression的values,label存放标签,发现不行,因为float_data和label这俩是指向同一块内存,两者不能共存,除非改caffe源码.我又仔细看了一下caffe的源码,发现我这个地方说的不对,具体来讲,caffe读取image和label是这样一个流程: 1.编写程序将image和label转换成Datum格…

问题描述: 在拿到一个hdf5文件,想用c++去读取文件中的字符串,但是会报错:read failed ps: c++读取hdf5的字符串方法见:https://support.hdfgroup.org/ftp/HDF5/examples/misc-examples/stratt.cpp 具体错误信息如下: HDF5-DIAG: Error detected in HDF5 (1.8.16) thread 140492203562816: #000: ../../../src/H5Dio.c l…

最近Pixar的开源USD软件很火,官方在Introduce中明确讲到这个软件的设计开发目标是增强艺术家协作,减少不确定因素,最大化资产版本迭代效率,追求更大的承载能力. 当今行业中传统的线性的制作方式来已经很难满足日益复杂的流程需求了,采用Alemibc是一个好办法,但Alembic只能作为中间文件在Pipeline中传递,并没有提供有力的组装工具,要将多个abc资产组装起来,给予材质,打上灯光,还需要在maya或其他软件中进行.当整个场景非常庞大的时候,maya就会陷入性能的挣扎,在这里需要…

HDF(Hierarchical Data Format)指一种为存储和处理大容量科学数据设计的文件格式及相应库文件.HDF 最早由美国国家超级计算应用中心 NCSA 开发,目前在非盈利组织 HDF 小组维护下继续发展.当前流行的版本是 HDF5.HDF5 拥有一系列的优异特性,使其特别适合进行大量科学数据的存储和操作,如它支持非常多的数据类型,灵活,通用,跨平台,可扩展,高效的 I/O 性能,支持几乎无限量(高达 EB)的单文件存储等. HDF5文件层次化的存储两类对象: dataset:数据…

Sequential 序贯模型 序贯模型是函数式模型的简略版,为最简单的线性.从头到尾的结构顺序,不分叉,是多个网络层的线性堆叠. Keras实现了很多层,包括core核心层,Convolution卷积层.Pooling池化层等非常丰富有趣的网络结构. 我们可以通过将层的列表传递给Sequential的构造函数,来创建一个Sequential模型. from keras.models import Sequential from keras.layers import Dense, Activa…

最近要用到HDF5来存储数据,想要安装尝试用一下.发现网上有两种安装方式,一种是obtain518.html:获取最新的HDF5-1.8软件;另一种是cmakebuild518.html:使用CMAKE构建HDF5-1.8. 我原本尝试后一种方法:Windows下HDF5静态库的封装与测试(已验证).发现文章讲的云里雾里的,没有搞明白. 后来尝试了前一种方法:VS2013配置HDF5,现摘录于下,并做一些批注. 一:HDF5下载.安装 链接:(https://support.hdfgroup.o…

今年的CCF A会又要开始投稿了,实验室的师弟还在玩命的加实验,虽然我属于特殊情况是该从靠边站被老板扶正但是实验室的事情我也尽力的去帮助大家,所以师弟在做实验的时候遇到了问题也会来问问我,这次遇到的一个问题就是torch7的安装,以及 hdf5模块,torch模块 , nn模块的安装 搞不上,于是乎我就再次出马了,于是就有了这次的博客. 首先,要说下这次的安装平台为  Linux 的  Ubuntu18.04 . torch7的安装 torch7 的官网 http://torch.ch/docs…

打包python脚本为exe的坎坷经历, by pyinstaller方法 又应验了那句歌词. 不经历风雨, 怎么见得了彩虹. 安装过程略去不提, 仅提示: pip install pyinstaller 打包指令 粗看包里的文档, 然后开始打包: 打开console 就用了这个命令: pyinstaller monitor_rt_quotes.py 结果就是比预期麻烦的多的多的: 干活, 硬盘不停地balabala叫, 漫长 这里记录一下控制台显示的提示信息: 官方文档对上述指令的解释为: |…

关于如何将数据集封装为 Bunch 可参考 关于 『AI 专属数据库的定制』的改进. PyTables 是 Python 与 HDF5 数据库/文件标准的结合.它专门为优化 I/O 操作的性能.最大限度地利用可用硬件而设计,并且它还支持压缩功能. 下面的代码均是在 Jupyter NoteBook 下完成的: import sys sys.path.append('E:/xinlib') from base.filez import DataBunch import tables as tb i…

Pytorch:EDSR 生成训练数据的方法 引言 Winter is coming 正文 pytorch提供的DataLoader 是用来包装你的数据的工具. 所以你要将自己的 (numpy array 或其他) 数据形式装换成 Tensor, 然后再放进这个包装器中. 使用 DataLoader 有什么好处呢? 就是他们帮你有效地迭代数据, 举例: import torch import torch.utils.data as Data #utils是torch中的一个模块,Data是进行小…

前情提要: 工作原因需要处理一批约30G左右的CSV数据,数据量级不需要hadoop的使用,同时由于办公的本本内存较低的缘故,需要解读取数据时内存不足的原因. 操作流程: 方法与方式:首先是读取数据,常见的csv格式读取时一次性全部读取进来, 面对数据量较大(本次3亿条实车数据)时,需要 分批 并且有 选择性 的读取后 提取有效信息 删除冗余信息并清理内存. 同时,为了使处理数据时效率更高,将整理好的数据实时读取进来以后,保存成快速且可读的数据形式另行存储.然后释放内存并读取下一批数据直到整个流…

使用HDF5 :HDF5_1.10.0 出现: fatal error C1083: 无法打开包括文件:"stdbool.h": No such file or directory fatal error C1083: 无法打开包括文件:"inttype.h": No such file or directory C++11的问题,MSVC10不能使用C++11,. 处理方法: 滚回 HDF5_1.8.11 版本…

HDF数据格式 Hierarchical Data Format,可以存储不同类型的图像和数码数据的文件格式,并且可以在不同类型的机器上传输,同时还有统一处理这种文件格式的函数库.大多数普通计算机都支持这种文件格式. 转自百度百科: 简介 HDF是用于存储和分发科学数据的一种自我描述.多对象文件格式.HDF是由美国国家超级计算应用中心(NCSA)创建的,以满足不同群体的科学家在不同工程项目领域之需要.HDF可以表示出科学数据存储和分布的许多必要条件.HDF被设计为: 自述性:对于一个HDF文件里…

年10月26日 星期六 mmdatasdk: module for downloading and procesing multimodal datasets using computational sequences. mmmodelsdk: tools to utilize complex neural models as well as layers for building new models. The fusion models in prior papers will be rel…

pandas-19 DataFrame读取写入文件的方法 DataFrame有非常丰富的IO方法,比如DataFrame读写csv文件excel文件等等,操作很简单.下面在代码中标记出来一些常用的读写操作方法,需要的时候查询一下该方法就可以了. df1.to_csv('df1.csv') # 默认会把 index 也当成一列写入到文件中 df1.to_csv('df2.csv', index=False) # 如果不想显示索引,可以添加第二个参数 index = False df1.to_jso…

1 SMAP(Soil Moisture Active and Passive)数据介绍 SMAP baseline science data products在下面的表格中展示,这些数据产品可以从两个NASA设计的数据中心下载, Alaska Satellite Facility (ASF) and National Snow and Ice Data Center (NSIDC). ASF专门提供SAR 数据,NISDC专门提供冰冻圈科学与陆地微波数据.同时也可以在Worldview浏览SM…

技术背景 VMD是分子动力学模拟领域常用的一款可视化软件,可以非常直观方便的展示分子的运动过程.而VMD本身对展现的格式有一定的要求,如果不是常见的rst等类型的坐标文件的话,就需要自己手动去实现一个可视化的插件.这里我们介绍的是通过VMD来可视化hdf5格式的坐标文件--hdf5是量子化学领域非常常用的一个数据格式,对于规模较大的数据集有很好的性能支持. 安装hdf5插件 这里本地使用的是Ubuntu20.04的系统,如果是其他系统,有可能需要针对性的修改下.首先我们将这个hdf5插件的源码下…

HDF Hierarchical Data Format,又称HDF5 在深度学习中,通常会使用巨量的数据或图片来训练网络.对于如此大的数据集,如果对于每张图片都单独从硬盘读取.预处理.之后再送入网络进行训练.验证或是测试,这样效率太低.如果将这些图片都放入一个文件中再进行处理效率会更高.有多种数据模型和库可完成这种操作,如HDF5和TFRecord. 一个HDF5文件是一种存放两类对象的容器:dataset和group. Dataset是类似于数组的数据集,而group是类似文件夹一样的容器,…

技术背景 在处理分子动力学模拟的数据时,不可避免的会遇到众多的大轨迹文件.因此以什么样的格式来存储这些庞大的轨迹数据,也是一个在分子动力学模拟软件设计初期就应该妥善考虑的问题.现有的比较常见的方式,大致可以分为存成明文的和存成二进制的两种方式.这两种方式各有优劣,明文存储可读性较好,二进制文件压缩率较好,不会占用太大的空间.又因为我们也不会经常性的去打开轨迹文件一个一个的检索,因此二进制文件是一个更好的存储格式选项.如果不仅仅限于分子动力学模拟的领域,在其他数据领域经常用的格式有npz等.而经过…

mapreduce多文件输出的两方法   package duogemap;   import java.io.IOException;   import org.apache.hadoop.conf.Configuration; import org.apache.hadoop.fs.Path; import org.apache.hadoop.io.LongWritable; import org.apache.hadoop.io.NullWritable; import org.apach…

本文老周就给大伙伴们介绍一下方法参数代码的生成. 在开始之前,先补充一下上一篇烂文的内容.在上一篇文章中,老周检讨了 MemberAttributes 枚举的用法,老周此前误以为该枚举不能进行按位操作,后来发现是可以的.不过啊,MemberAttributes 枚举有些情况下不那么好弄,最典型的就是要生成抽象类的时候,反正老周试了很久,用MemberAttributes枚举不能顺利生成抽象类. 这时候,老周想到了 TypeAttributes,然后就试了一下. CodeTypeDeclarati…

直接上图:原因:该div包含的内容是靠后台进行print操作,输出的.如果没有输出任何内容,浏览器会默认给该空白区域添加空白符.在IE6.7下,浏览器解析渲染时,会认为空白符也是占位置的,默认其具有字体的属性,所以也就出现“多余占位”的bug. 解决方法: 一.让html标签相接输出.例如:<div></div>. ——太过麻烦,代码也不规则,不好维护. 二.设置font-size:0; ——不能完美fix~ 二.使用注释符<!-- -->.例如:<div>…

前面的文章:多线程爬坑之路-学习多线程需要来了解哪些东西?(concurrent并发包的数据结构和线程池,Locks锁,Atomic原子类) 多线程爬坑之路-Thread和Runable源码解析 前面大致的了解了Thread的一些方法和属性下面对一些方法进行运用看看具体效果<下面可能还是会贴很多的源代码,其实我是拒绝的,我只想贴每个方法的代码,但是有时候看到一个方法里面有调用了方法,但是笔者有没有给出来,很蛋疼,有种爽到一半的感觉,所以我还是会把它贴出来,希望一次就能挖到底,不论有没有全懂,但至…

C# 基础回顾 - 匿名方法 目录 简介 匿名方法的参数使用范围 委托示例 简介 在 C# 2.0 之前的版本中,我们创建委托的唯一形式 -- 命名方法. 而 C# 2.0 -- 引进了匿名方法,在 ≥ C# 3.0 的版本中,我们会用 Lambda 表达式进行取代匿名方法,并且用 Lambda 表达式作为编写内联代码的首选方式,因为它更简洁. 匿名方法是,顾名思义,匿名方法就是没有名称的方法.匿名方法最明显的好处就是:可以降低额外另写一个方法的工作量:另外一个好处就是可以直接访问调用者的变量,…

首先介绍一下ArcGIS10.0的缓存机制: 切片方案 切片方案包括缓存的比例级别.切片尺寸和切片原点.这些属性定义缓存边界的存在位置,在某些客户端中叠加缓存时匹配这些属性十分重要.图像格式和抗锯齿等其他属性也会写入切片方案,但对于客户端应用程序能否成功叠加切片没有影响. 切片方案原点 切片方案原点是指切片方案格网的左上角,默认原点为地图文档定义的坐标参考的左上点.原点不一定代表创建切片的起始点:只有在达到地图全图范围时才是这样.进行缓存时使用公用切片方案原点可确保所创建的缓存能够在 Web 应…