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哈代-温伯格平衡定律(Hardy-Weinberg equilibrium),即HW平衡,是指对于一个大且随机交配的种群,基因频率和基因型频率在没有迁移.突变和选择的条件下会保持不变. 它是建立在一个理想的群体模式上的,有四个假设前提:1.群体无限大:2.随机婚配:3.没有突变:4.没有大规模迁移和选择因素的影响.其结论是群体中的基因频率和基因型频率在逐代传递中保持不变. 实际上这种理想群体的条件不可能完全满足,但经过数学推导,在一个群体中,基因频率和基因型频率在每一代都是恒定的,即使未达到平衡…
I.9 Linkage INDEPENDENCE OF GENOTYPES AT TWO LOCI:若A,B是两个独立位点:PA是基因A的概率,PB是基因B的概率.因为基因A与基因B是相互独立的位点,所以基因型AABB的概率为PAABB=(PA)^2*(PB)^2 A RETROSPECTIVE DERIVATION.: 前提一:假设存在两个种群,这两个种群中:A的基因频率PA=1/2.B的基因频率PB=1/2.其中种群1:配子AB和ab各占1/2:种群2:配子Ab,AB,aB,ab各占1/4.…
I.7 Different Gene Frequencies in the Two Sexes 假设存在一种基因仅在第一代亲代的不同性别之间的概率有区别,比如,A 在male中频率是Pm,a是(1-Pm):A 在female中频率是Pf,a是(1-Pf) (第一代亲代,配子,第一代子代)情况如下: 因为从第二代开始,该基因不会在两性中有所区别,所以满足哈代公式,所以第一代中基因m的频率和基因f的频率一致(为什么会一样?其实Pf即代表来自母亲的基因,而Pm代表来自父亲的基因,由于二倍体配子结合时是…
I.6 Overlapping generations 世代被分离开,世代不重复一定满足哈代公式的条件,但是现实情况远没有这么简单(因为会世代重叠,即亲代死去同时一个亲代在不同时间都有可能产生子代,因为而哈代公式需要世代不重叠,即亲代只产生一次子代),所以,我们需要构造另一种模型来分析世代重叠.   因为我们可以构造出近似于哈代比例的前提,帮助我们判断一些参数的值(因为在极端情况下该模型与哈代平衡一致,即利用一些点去构造一个连续的曲线).   前提一:该种群情况是Deaths and birth…
hardy-weinberg平衡:标准定义————如果一个种群符合下列条件:1.种群是极大的:2.种群个体间的交配是随机的,也就是说种群中每一个个体与种群中其他个体的交配机会是相等的:3.没有突变产生:4.种群之间不存在个体的迁移或基因交流:5.没有自然选择,那么,这个种群的基因频率(包括基因型频率)就可以一代代稳定不变,保持平衡.这就是遗传平衡定律,也称哈代c温伯格平衡. 实际应用中——做多态性等遗传分析首先要对数据结果进行hardy-weinberg平衡分析,当然——如果是病例对照研究的话,…
http://wenku.baidu.com/link?url=Fr_C7J5F4KusZTpZJUfuVfh4Bpyb9BAY7IQhWAOYirQJW0Oz-X3fI5r41aPHiQR8ENn9k6P1V9v1we6U2fe4IJIEci7Twg1Pma6n5ZC03k7 在某一群体中,不同座位上某两个等位基因同时遗传的频率明显高于预期的随机频率的现象,称连锁不平衡 (linkage disequilibrium) .由于 HLA 不同基因座位的某些等位基因经常连锁在一起遗传,而连锁的基因…
在腾讯的暑期训练营结识过不少鹅厂的前辈,他们对我的成长提供了很大的帮助,可以说有着知遇之恩,大部分现在还保持着联系,请教问题时会不吝赐教,以至于就在前两天11号企鹅18岁的成年礼,朋友圈刷满了领腾讯总办红包的消息,几乎一半的朋友圈成为了鹅厂的股东……(不可描述,上图.) 图1.小马哥的红包 因为腾讯内部都会起英文名,我也经常用英文名称呼前辈们, 所以一直想给自己也起个英文名字,这样注册微博等重名时我也好给自己打个英文标签,不过酝酿了很久一直没有好的想法,之前看“鹅厂卧谈会”说英文名一定要好好起,…
若向平衡二叉树中插入一个新结点后破坏了平衡二叉树的平衡性.首先要找出插入新结点后失去平衡的最小子树根结点的指针.然后再调整这个子树中有关结点之间的链接关系,使之成为新的平衡子树.当失去平衡的最小子树被调整为平衡子树后,原有其他所有不平衡子树无需调整,整个二叉排序树就又成为一棵平衡二叉树. 失去平衡的最小子树是指以离插入结点最近,且平衡因子绝对值大于 1 的结点作为根的子树.假设用 A 表示失去平衡的最小子树的根结点,则调整该子树的操作可归纳为下列四种情况. ( 1 ) LL 型平衡旋转法 由于在…
  1.概念: AVL树本质上还是一个二叉搜索树,不过比二叉搜索树多了一个平衡条件:每个节点的左右子树的高度差不大于1. 二叉树的应用是为了弥补链表的查询效率问题,但是极端情况下,二叉搜索树会无限接近于链表,这种时候就无法体现二叉搜索树在查询时的高效率,而最初出现的解决方式就是AVL树.如下图: 2.旋转 说到AVL树就不得不提到树的旋转,旋转是AVL维持平衡的方式,主要有以下四种类型. 2.1.左左旋转 如图2-1所示,此时A节点的左树与右树的高度差为2,不符合AVL的定义,此时以B节点为轴心…
前面讲解了平衡查找树中的2-3树以及其实现红黑树.2-3树种,一个节点最多有2个key,而红黑树则使用染色的方式来标识这两个key. 维基百科对B树的定义为“在计算机科学中,B树(B-tree)是一种树状数据结构,它能够存储数据.对其进行排序并允许以O(log n)的时间复杂度运行进行查找.顺序读取.插入和删除的数据结构.B树,概括来说是一个节点可以拥有多于2个子节点的二叉查找树.与自平衡二叉查找树不同,B-树为系统最优化大块数据的读和写操作.B-tree算法减少定位记录时所经历的中间过程,从而…