主要参考http://www.3fwork.com/b211/000091MYM021616/ Step 1 : sudo gedit /etc/apt/sources.list 添加到末尾 deb http://mirrors.xmu.edu.cn/CRAN/bin/linux/ubuntu xenial/ 保存退出 Step 2: 下载公钥并更新 sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys 51716619E08…

上周20161021-20161028的任务还没有搞完,所以今天来填坑(微笑脸) ××××××××××××××××××××我是萌萌哒分割线××××××××××××××××××××××××××××××× 本文参考:https://bitbucket.org/biobakery/biobakery/wiki/metaphlan2 MetaPhlAn2是使用宏基因组鸟枪法测序数据描绘微生物群落组成的工具. ps: 与系统发育相关的图的表示 安装: 1. 下载并解压 2. 修改/etc/profile,…

好吧,这是本周(2016.10.21-28)的学习任务之一:安装bowtie2并学习其使用方法&参数设置 所以,啃文档咯,官方文档Version 2.2.9 http://bowtie-bio.sourceforge.net/bowtie2/manual.shtml 以下是我的整理.我不生产文档,我只是文档的搬运工么么哒- Bowtie2适合将长度50-1000bp的reads比对到长的参考序列上.Bowtie 2 indexes the genome with an FM Index (bas…

先挖坑 因为这个软件需要memory>16G,所以应该要安装在服务器上…

装完Bowtie2,官方文档给出的栗子说可以玩一玩samtools,所以我入个坑 参考这篇http://m.010lm.com/roll/2016/0620/2343389.html Step 1: 安装libncurses5库(貌似和字符多色显示有关?生信人会玩=.=) sudo apt-get install libncurses5 libncurses5-dev Step 2: 安装zlib(压缩与解压,有教程说不装会报错=.=) sudo apt-get install zlib1g-d…

其实好多东西装过好多次,然而每次都要翻文档,经常掉进前面掉进过的坑...所以这里重新写一份指南,以防下次再装又忘了(魂淡我并不想再装了啊不要立flag) 1. 安装biopython 1.1 因为biopython目前支持的是python2,所以我先把python调到2 1.2 安装numpy (http://www.numpy.org/) NumPy is the fundamental package for scientific computing with Python. It cont…

环境:RHEL 6.4 + Oracle 11.2.0.4 需求:单机静默安装GI软件并创建ASM实例和ASM磁盘组,为后续迁移数据库文件到ASM做准备 1. 安装配置GI软件 2. 创建ASM实例 3. 创建ASM磁盘组DATA1 1. 安装配置GI软件 1.1 创建grid用户和相关组,创建目录,确认ASM磁盘权限,配置环境变量 -- 创建grid用户和相关组 groupadd asmadmin groupadd asmdba groupadd asmoper useradd -g oins…

安装MySQL软件(绿色版) ① 解压软件包 ② 更改文件夹名称为mysql并复制到/usr/local文件夹下 ③ 使用cd指令进入/usr/local/mysql文件夹,使用ls –l查看 查看后发现,文件中的文件拥有者与文件的所属组都显示8972,为什么呢? 答:因为开发者在打包mysql时,系统会自动保存文件的拥有者与所属组,如果这个拥有者和所属组在当前Linux操作系统中找不到,则自动显示8972. ④ mysql安装详细步骤 第一步:groupadd mysql ,添加mysql组…

Objectives: •Describe your role as a database administrator (DBA) and explain typical tasks and tools The approach for designing, implementing, and maintaining an Oracle database involves the following tasks:1. Evaluating the database server hardware…

CentOS5.6下安装Oracle10G ******************************************************************************** *目标:在Centos系统下,安装Oracle10g软件 *步骤: *                1.安装包 *                2.域名解析设置及网络配置 *                3.创建用户.组 *                4.配置内核參数.改动环境变量…

自动化安装jdk软件部署脚本 准备工作: 1.在执行脚本的服务器上生成免密码公钥: 安装expect命令 yum install -y expect ssh-keygen 三次回车 2.将jdk-7u80-linux-x64.gz软件包放到http服务器中,供下载 3.运行脚本 boot.sh cat boot.sh #!/bin/bash # 需要安装软件的服务器列表 SERVERS="192.168.3.13 192.168.3.12 192.168.3.16" # 登陆服务器的r…

1.安装.deb文件 以安装Chrome为例: (1)到官方网站下载Chrome浏览器相应版本,比如google-chrome-stable_current_i386.deb: (2)Ctrl+Alt+T打开终端,进入deb文件所在目录(默认“Downloads”,中文操作系统的话就是“下载”): cd -/Downloads (2.5)安装之前,一般都会更新/升级 sudo apt-get update sudo apt-get upgrade (3)Deb包安装命令: sudo dpkg -…

在上一篇我们在本地的虚拟服务器上安装好CentOS7后,我们的python web服务.自定义的python service或python脚本需要在服务器上运行,还需要在服务器安装各种相关的软件才行,一般来说,想要实现自动化部署需求,还需要安装nginx.svn.uwsgi.python3.0(系统自带python2.7.5).supervisor.postgresql.pgbouncer.redis(nosql缓存根据自己代码的需要而定). PS:本人不是专业的运维,只能根据自己的研究弄弄单机…

用途:Cloning an Oracle Home , 可以免去多台机器重复安装oracle软件 1.停止相关进程[root@node1 bin]# ./crsctl stop cluster -all 2.打包 dbhome_1 目录[root@node1 11.2.0]# cd /u01/app/oracle/product/11.2.0/[root@node1 11.2.0]# tar -zcvpf db_1.bak db_1/[root@node1 11.2.0]# lsdb_1 db_…

windows8以后的版本安装msi软件(比如nodejs.msi.Git.msi.python.msi.T ortoiseSVN.msi)的时候老师出现2503.2502的错误,究其原因还是系统权限的问题.   工具/原料   msi文件 windows8以及windows8.1 壹:命令安装方法   1 按住win+x,在菜单中选择”命令提示符(管理员)(A)“: 或者在走下角的win的logo上右键,在菜单中选择”命令提示符(管理员)(A)“: 2 在命令提示符窗口中输入: msiexec…

如果ubuntu要安装新软件,已有deb安装包(例如:iptux.deb),但是无法登录到桌面环境.那该怎么安装?答案是:使用dpkg命令.dpkg命令常用格式如下:sudo dpkg -I iptux.deb#查看iptux.deb软件包的详细信息,包括软件名称.版本以及大小等(其中-I等价于--info)sudo dpkg -c iptux.deb#查看iptux.deb软件包中包含的文件结构(其中-c等价于--contents)sudo dpkg -i iptux.deb#安装iptux.…

1.查询安装路径 dpkg -L 软件名 例如:dpkg -L gedit dpkg -L gedit /. /usr /usr/bin /usr/bin/gedit /usr/share /usr/share/applications /usr/share/applications/gedit.desktop /usr/share/dbus- /usr/share/dbus-/services /usr/share/dbus-/services/org.gnome.gedit.service…

R官网更新说明 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/bin/linux/ubuntu/README.html 本文主要讲解在ubuntu下如何安装和更新R语言.将分别介绍什么是R语言,简单方法安装R语言,通过更新源来安装或更新R语言,和安装R语言集成开发环境. 0.什么是R语言 R语言是主要用于统计分析.绘图的语言和操作环境.R本来是由来自新西兰奥克兰大学的RossIhaka和RobertGentleman开发.(也因此称为R)现在由“R开发核心团…

安装准备 (1)确认系统版本号.内核版本号 # oslevel –r   //查看操作系统版本号 //-08能够安装10g,-09能够安装11g watermark/2/text/aHR0cDovL2Jsb2cuY3Nkbi5uZXQvaHVhbmd5YW5sb25n/font/5a6L5L2T/fontsize/400/fill/I0JBQkFCMA==/dissolve/70/gravity/SouthEast" alt=""> # prtconf |more  …

Ubuntu提示功能很强大,一般如果你想安装什么软件,可以直接输入名字,然后会有提示,安装格式一般为: sudo apt install 名字 Ubuntu14.04/16.04命令行快速安装Ruby和Rails运行环境(步骤二下的第二行命令有错,命令应为 rvm install 2.3.1) 详细步骤参考网址 https://www.linuxidc.com/Linux/2017-07/145554.htm 在ubuntu16.04中安装virtualbox 5 sudo sh -c 'ech…

[替换国内源] https://developer.aliyun.com/mirror/ubuntu 我提供一个下载,方便第一次安装懒得敲命令: https://jfz.me/16.04/sources.list sudo apt-get update sudo apt-get install openssh-server nano /etc/ssh/sshd_config PermitRootLogin yes 之后就可以愉快玩耍了~ [开启root账号] 设置root密码 sudo pass…

                                                                      linux安装常用软件和查询基本信息 1. 安装常用软件 [root@localhost ~]# yum provides ip       #provides搜索命令的安装包 yum -y install iproute-3.10.0-87.el7.x86_64 [root@localhost ~]# yum provides vim yum -y ins…

CentOS7.9静默安装Oracle19C软件 Oracle发布了支持的版本.可以看到了Oracle11gR2和Oracle12C.一直到2022年就不支持patch和服务.(感慨Oracle 11gR2的终结) 未来5年,主推Oracle19c.因此玩转一下Oracle19c,just for fun. 1.先决条件 1.0 一些前置条件 操作系统准备升级到7.9最新版本.命令如下: 硬盘u01:500GB,内存:16GB,CPU逻辑核数:16C [root@localhost ~]# yu…

说明 Lefse软件是宏组学物种研究常用软件,一般大家用在线版本即可.但要搭建在Linux集群环境中有点烦,记录一下折腾过程. 安装 这个软件是python2写的,因此假设我已经安装好了较高版本的python2以及pip等工具,在此基础上来安装lefse. lefse下载地址:https://bitbucket.org/nsegata/lefse/src/default/.这个网站有丰富的学习内容和教程,包括MetaPhIAn等流程,有时间去好好看看. lefse放在了bitbucket上,克隆…

安装IDEA软件之前需要做哪些准备? 在安装IDEA软件之前,需要先确定电脑中有没有JDK,如果没有需要先安装JDK. JDK是整个JAVA的核心,包括了Java运行环境,Java工具(javac/java/jdb等)和Java基础的类库. 如何检查有没有安装jdk? win + R键输入cmd进入命令行,在命令行中输入java -version ,如果出现类似于下面截图的,说明已经安装好了JDK,就可以跳过下面的步骤直接安装IDEA了. 如果是类似于下面的截图,说明没有安装jdk,需要安装JD…

我们都知道安装软件最简单的方法是apt-get install,但是卸载就不常用了,如何卸载呢?1.sudo apt-get remove xxxxxsudo apt-get autoremove2.对于用命令sudo aptitude install xxx安装的软件可以用sudo aptitude remove xxx卸载即可. 补充一点使用方法:一是从命令行启动 kchmviewer 二是让chm文件自动关联,这个在chm文件右键里选择一下就可以了.选择的名字是 kchmviewer.其实…

        Linux 中如何卸载已安装的软件. Linux软件的安装和卸载一直是困扰许多新用户的难题.在Windows中,我们可以使用软件自带的安装卸载程序或在控制面板中的“添加/删除程序”来实现.与其相类似,在Linux下有一个功能强大的软件安装卸载工具,名为RPM.它可以用来建立.安装.查询.更新.卸载软件.该工具是在命令行下使用的.在Shell的提示符后输入rpm,就可获得该命令的帮助信息. 软件的安装 Linux下软件的安装主要有两种不同的形式.第一种安装文件名为xxx.tar.g…

安装ubuntu 老毛桃进入win pe修复启动项 在win pe下面制作ubuntu的安装盘,只用的软件是ultraISO 参考博客下面的分区的那篇文章  http://jingyan.baidu.com/article/60ccbceb18624464cab197ea.html 此时win pe的启动盘成为了ubuntu的启动盘 在安装ubuntu的时候,原来装有win7的硬盘的格式是ntfs,就不要动那些盘了 其他的参考分区下面安装ubuntu的那个链接 安装ubuntu后要安装的软件,解…

1.sudo apt-get remove xxxxx  sudo apt-get autoremove2.对于用命令sudo aptitude install xxx安装的软件可以用sudo aptitude remove xxx卸载即可…

Linux 中如何卸载已安装的软件. Linux软件的安装和卸载一直是困扰许多新用户的难题.在Windows中,我们可以使用软件自带的安装卸载程序或在控制面板中的“添加/删除程序”来实现.与其相类似,在Linux下有一个功能强大的软件安装卸载工具,名为RPM.它可以用来建立.安装.查询.更新.卸载软件.该工具是在命令行下使用的.在Shell的提示符后输入rpm,就可获得该命令的帮助信息. 软件的安装 Linux下软件的安装主要有两种不同的形式.第一种安装文件名为xxx.tar.gz:另一种安装文…