remove duplicated gene pair using awk

cat input.txt TRINITY_DN106621_c0_g1_i1 TRINITY_DN129833_c0_g1_i2 TRINITY_DN106621_c0_g1_i1 TRINITY_DN140628_c4_g2_i2 TRINITY_DN106621_c0_g1_i1 TRINITY_DN135041_c0_g1_i1 TRINITY_DN135041_c0_g1_i1 TRINITY_DN106621_c0_g1_i1 TRINITY_DN140628_c4_g2_i2 TR…

openmesh - impl - Remove Duplicated Vertices

openmesh - impl - Remove Duplicated Vertices 关于openmesh元素删除实现的介绍参见:openmesh - src - trimesh delete and add elements - grassofsky - 博客园 (cnblogs.com) 重复点删除的主要步骤如下: 找到所有的重复顶点,并设定每组重复顶点中需要保留的顶点: 记录这些重复顶点对应的三角形:(因为下一步在顶点删除的时候,会将顶点周围关联的三角形都删除,并将顶点的状态设置为de…

leetcode 283 Move Zeros; 27 Remove Elements; 26 Remove Duplicated from Sorted Array;

,,,,}; //把数组的值赋给vector vector<int> vec(arr, arr+sizeof(arr)/sizeof(int)); 解法一: 时间复杂度O(n) 空间复杂度O(1) class Solution { public: void moveZeroes(vector<int>& nums) { ; //nums中,[0,...k)的元素均为非0元素 //遍历到第i个元素后,保证[0,...i)中所有非0元素 //都按照顺序排列在[0,...k)中…

OpenCV feature2d

/*M/////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////// // // IMPORTANT: READ BEFORE DOWNLOADING, COPYING, INSTALLING OR USING. // // By downloading, copying, installing or using the software you agree to this licen…

python查找并删除相同文件-UNIQ File-wxPython-v6

相比第一版,新增:菜单,对话框,文件过滤器,操作结果保存,配置功能(自己写了一个读写配置文件的功能),提示语优化,模块分化更合理. 截图: 源代码: UniqFile-wxPython-v6.py: # -*- coding: gbk -*- ''' Author:@DoNotSpyOnMe Blog: http://www.cnblogs.com/aaronhoo ''' import wx,os from Dialogs import DialogSetFilters,DialogAbout…

python查找并删除相同文件-UNIQ File-wxPython版本

今天用wxPython做了一个GUI程序,我称之为UNIQ File,实现查找指定目录内的相同文件,主要原理是计算文件的md5值(计算前先找出文件大小相同的文件,然后计算这些文件的md5值,而不是所有文件都计算,大大减少了md5的计算量),加入了多线程功能. 运行该程序需要安装wxPython. 界面图源代码: UNIQFile-wxPython.py # -*- coding: gbk -*- ''' Author:@DoNotSpyOnMe Blog: http://www.cnblogs…

SPARQL1.1 101 Language and Jena support

1 introduction definition cited from SPARQL 1.1 Overview: SPARQL 1.1 is a set of specifications that provide languages and protocols to query and manipulate RDF graph content on the Web or in an RDF store. I roughly divide W3C's SPARQL 1.1 Specificat…

Command-line tools can be 235x faster than your Hadoop cluster

原文链接:http://aadrake.com/command-line-tools-can-be-235x-faster-than-your-hadoop-cluster.html Introduction As I was browsing the web and catching up on some sites I visit periodically, I found a cool article from Tom Haydenabout using Amazon Elastic Ma…

bullet HashMap 内存紧密的哈希表

last modified time:2014-11-9 14:07:00 bullet 是一款开源物理引擎,它提供了碰撞检測.重力模拟等功能,非常多3D游戏.3D设计软件(如3D Mark)使用它作为物理引擎. 作为物理引擎,对性能的要求是非常苛刻的:bullet项目之所以可以发展到今天,非常大程度取决于它在性能上优异的表现. 翻阅bullet的源代码就能看到非常多源代码级别的优化.本文将介绍的HashMap就是一个典例. bullet项目首页:http://bulletphysics.org…

C# - List操作- 去掉重复

ChangeList里面会有重复的数据,这时可以这样去掉重复的item // Remove duplicated info var dup = ChangeList.Where(item => item.Stream.id == item.NewId).ToList(); dup.ForEach(item =>ChangeList.Remove(item)); 删除掉符合某种条件的 var selected = list.Where(item => item.Used == true).…

C/C++中char* 与char []定义的区别

转载请注明来自souldak,微博:@evagle Question: 给你一个字符串例如abb输出它包含的字符的所有可能排列. 例如abb输出3个:abb,bab,bba Answer: 假设我们自己来做,那做法如下: 1. 有n个字符相当于n个格子. 2. 先放第一个格子,从n个字符中任选一个,放到这个格子即可,放完就剩下n-1个格子和n-1个字符 3. 放第二个格子,从n-1个字符中任选一个 ... n. 最后一个格子,只剩下一个字符,不用选,输出放好的结果第二步到第n步其实问题本质是一…

44个JAVA代码质量管理工具（转）

1. CodePro AnalytixIt’s a great tool (Eclipse plugin) for improving software quality. It has the next key features: Code Analysis, JUnit Test Generation, JUnit Test Editor, Similar Code Analysis, Metrics, Code Coverage and Dependency Analysis.2. PMDI…

vim php代码规范

vim 代码规范工具php-cs-fixer.phar (參考https://github.com/FriendsOfPHP/PHP-CS-Fixer) INSTALL curl http://get.sensiolabs.org/php-cs-fixer.phar -o php-cs-fixer sudo chmod a+x php-cs-fixer sudo mv php-cs-fixer /usr/local/bin/php-cs-fixer 至此,你能够直接用php-cs-fixer格式…

Mysql的主从配置

前言:这次学习分布式的思想要配置mysql的主从复制和读写分离,我在主从配置上踩到很多坑,在此演示一遍配置过程,并附上问题的说明和自己的一些见解 Mysql主从复制的原理附上原理图: mysql的主从复制原理其实挺简单,主要由两种类型3个线程完成:I/O 和 sql thread 主服务器上有一个I/O thread用来生成二进制日志,每当有事务产生便写入二进制文件,所有主服务器上需要配置mysql 打开日志服务,新的日志内容会通过从服务器的I/O thread 更新到从服务器上的日志从服务…

ubuntu下安装mysql和配置远程访问

ubuntu下安装mysql和配置远程访问下载安装mysql sudo apt-get install mysql-client mysql-server 安装的时候会提示要设置root密码,如果你没有在卸载的时候去清理残留数据是不会提示你去设置root密码的. 卸载mysql sudo apt-get remove mysql-* dpkg -l |grep ^rc|awk '{print $2}' |sudo xargs dpkg -P 清除残余数据检查mysql是否在运行 sudo…

Scala字符串与容器

String 前文已经说明了字符串的声明方式: var s = "Hello World"; var s: String = "Hello World"; 在 Scala 中,字符串的类型实际上是 Java String(java.lang.String),它本身没有 String 类.我们可以在Scala中使用Java String的所有方法. String对象是不可变对象, 更改String内容的操作实际上是创建了一个新的字符串. scala> var s…

Redis 5.0.0 releases notes

Redis 5.0 release notes ======================= -------------------------------------------------------------------------------- Upgrade urgency levels: LOW: No need to upgrade unless there are new features you want to use. MODERATE: Program an upgra…

editcap的使用

editcap.exe -h Editcap (Wireshark) (v2.-gf42a0d2b6c) Edit and/or translate the format of capture files. See https://www.wireshark.org for more information. Usage: editcap [options] ... <infile> <outfile> [ <packet#>[-<packet#>] ...…

卸载 mysql

sudo apt-get remove mysql-* dpkg -l |grep ^rc|awk '{print $2}' |sudo xargs dpkg -P 之后会跳出一个弹框点击“是”就行了…

ceilometer 源码分析（polling）（O版）

一.简单介绍ceilometer 这里长话短说, ceilometer是用来采集openstack下面各种资源的在某一时刻的资源值,比如云硬盘的大小等.下面是官网现在的架构图这里除了ceilometer的架构图,还有另外三个组件: Panko 用来存储事件的, 后面用来实现cloudkitty事件秒级计费也是我的工作之一,目前实现来一部分,有时间单独在写一篇博文. gnocchi是用来存储ceilometer的计量数据,之前的版本是存在mongo中, 不过随着计量数据的不断累计, 查询性能变得…

lncRNA芯片重注释

.caret,.dropup>.btn>.caret{border-top-color:#000!important}.label{border:1px solid #000}.table{border-collapse:collapse!important}.table td,.table th{background-color:#fff!important}.table-bordered td,.table-bordered th{border:1px solid #ddd!importa…

ubuntu16.04彻底卸载mysql并且重新安装mysql

首先删除mysql: sudo apt-get remove mysql-* dpkg -l |grep ^rc|awk '{print $2}' |sudo xargs dpkg -P 清理完毕: dpkg: error: --purge needs at least one package name argument Type dpkg --help for help about installing and deinstalling packages [*]; Use 'apt' or '…

07-THREE.JS 各种形状的几何图形

<!DOCTYPE html> <html> <head> <title>Example 02.04 - Geometries</title> <script src="https://cdn.bootcss.com/three.js/r67/three.js"></script> <script type="text/javascript" src="../libs…

mysql Access denied for user 'root'@'localhost'问题解决

问题描述: 系统安装mysql的过程中,没有提示配置用户名和密码相关的信息,安装完毕后,登录报错. 表现现象为: mysql -u root -p [输入root密码] 界面提示: ERROR 1698 (28000): Access denied for user 'root'@'localhost' 问题解决过程: 1. 首先尝试了通过绕开数据库权限校验的流程,直接进入数据库后再重新配置用户名和密码 sudo /etc/init.d/mysql stop sudo mysqld_safe -…

数据结构设计 Stack Queue

之前在简书上初步总结过几个有关栈和队列的数据结构设计的题目.http://www.jianshu.com/p/d43f93661631 1.线性数据结构 Array Stack Queue Hash 2.非线性数据结构 Tree HashMap Heap/PriorityQueue 3.HashSet HashMap HashTable的区别: hashMap的键就组成一个HashSet HashTble实现是基于Dictionary类,而HashMap是基于Map接口 HashTable是线程…