目录 MPI学习笔记 MPI准备 概述 前置知识补充 环境部署 1.修改IP及主机名 2.关闭防火墙 3.实现免密码SSH登录 4.配置MPI运行环境 5.测试 程序的执行 编译语句 运行语句 MPI编程 4个基本函数 MPI点对点通信函数 非阻塞MPI_Send/MPI_Recv 阻塞MPI_Isend MPI集合通信函数 1-n/n-1 n-n 常用函数 测试案例 send MPI_Scatter 与 MPI_Gather MPI学习笔记 研究课题需要用到并行化,这里记录学习笔记 MPI准备…

基于都志辉老师<MPI并行程序设计模式>第14章内容. 前面接触到的MPI发送的数据类型都是连续型的数据.非连续类型的数据,MPI也可以发送,但是需要预先处理,大概有两类方法: (1)用户自定义新的数据类型,又称派生类型(类似定义结构体类型,但是比结构体复杂,需要考虑<类型,偏移量>两方面的内容) (2)数据的打包和解包(将不连续的数据给压缩打包到连续的区域,然后再发送:接受到打包数据后,先解包再使用) 这样做的好处,我猜一个是可以有效减少通信的次数,提高程序效率:另一方面可以减轻…

相关章节:第13章组通信MPI程序设计. MPI组通信与点到点通信的一个重要区别就是:组通信需要特定组内所有成员参与,而点对点通信只涉及到发送方和接收方. 由于需要组内所有成员参与,因此也是一种比较复杂的通信方式.程序员在设计组通信语句的时候,需要同时考虑两点: a. 程序运行起来之后,当前正在运行的进程的行为方式 b. 将组通信作为一个整体,考虑所有进程的行为方式 (1)概述 组通信从功能上实现了三个方面: a. 通信:完成组内数据传输(广播.收集.散发.组收集.全互换各种数据交换传输方式)…

这一章讲了MPI非阻塞通信的原理和一些函数接口,最后再用非阻塞通信方式实现Jacobi迭代,记录学习中的一些知识. (1)阻塞通信与非阻塞通信 阻塞通信调用时,整个程序只能执行通信相关的内容,而无法执行计算相关的内容: 非阻塞调用的初衷是尽量让通信和计算重叠进行,提高程序整体执行效率. 整体对比见下图: (2)非阻塞通信的要素 非阻塞通信调用返回意味着通信开始启动:而非阻塞通信完成则需要调用其他的接口来查询. 要素1:非阻塞通信的调用接口 要素2:非阻塞通信的完成查询接口 理想的非阻塞通信设计应…

学习了MPI四种通信模式 及其函数用法: (1)标准通信模式:MPI_SEND (2)缓存通信模式:MPI_BSEND (3)同步通信模式:MPI_SSEND (4)就绪通信模式:MPI_RSEND 四种通信模式的区别都在消息发送端,而消息接收端的操作都是MPI_RECV. 1.标准通信模式 原理图如下 标准通信模式由MPI决定是否用缓存. 如果MPI决定缓存将要发出的数据:发送操作不管接受操作是否执行,都可以进行:而且缓存结束后发送操作就可以返回,不需要等待接受操作收到数据 如果MPI决定不缓…

这里的内容主要是都志辉老师<高性能计算之并行编程技术——MPI并行程序设计> 书上有一些代码是FORTAN的,我在学习的过程中,将其都转换成C的代码,便于统一记录. 这章内容分为两个部分:MPI对等模式程序例子 & MPI主从模式程序例子 1. 对等模式MPI程序设计 1.1 问题背景 这部分以Jacobi迭代为具体问题,列举了三个求解Jacobi迭代问题的MPI对等模式程序. 这里需要阐明一下,书上的Jacobi迭代具体的背景可以参考这个内容:http://www.mcs.anl.g…

有了apue的基础,再看mpi程序多进程通信就稍微容易了一些,以下几个简单程序来自都志辉老师的那本MPI的书的第七章. 现在ubuntu上配置了一下mpich的环境: http://www.cnblogs.com/liyanwei/archive/2010/04/26/1721142.html 注意,为了编译运行方便,在~/.bashrc文件中添加mpi的两个环境变量 设置完之后注意执行source ~/.bashrc命令 程序1 计时功能 主要用到的MPI_Wtime()这个函数 #inclu…

基于都志辉老师MPI编程书中的第15章内容. 通信域是MPI的重要概念:MPI的通信在通信域的控制和维护下进行 → 所有MPI通信任务都直接或间接用到通信域这一参数 → 对通信域的重组和划分可以方便实现任务的划分 (1)通信域(communicator)是一个综合的通信概念.其包括上下文(context),进程组(group),虚拟处理器拓扑(topology).其中进程组是比较重要的概念,表示通信域中所有进程的集合.一个通信域对应一个进程组. (2)进程(process)与进程组(group)…

一.编译MPI mpic++ test.cc -o test 二.启动MPI mpiexec -np 10 ./test 三.几个例子 第一个进程向第二个发一个数,第二个进程向第三个进程发送一个数...依次传递 #include "mpi.h" #include <stdio.h> #include <stdlib.h> #include <time.h> #include <string.h> #include <iostream…

mpi矩阵乘法(C=αAB+βC) 最近领导让把之前安装的软件lapack.blas里的dgemm运算提取出来独立作为一套程序,然后把这段程序改为并行的,并测试一下进程规模扩展到128时的并行效率.        我发现这个是dgemm.f文件,里面主要是对C=αAB+βC的实现,因此在此总结一下MPI的矩阵乘法使用.        其主要思想:是把相乘的矩阵按行分解(任务分解),分别分给不同的进程,然后在汇总到一个进程上,在程序上实现则用到了主从模式,人为的把进程分为主进程和从进程,主进程负责…