InterProScan 5.18-57.0 安装和使用,目前最新版的interproscan 引用自 每日一生信--interproscan安装及使用(终结版)原文官网:http://code.google.com/p/interproscan/wiki/Introduction 配置要求:至少2 cores and 4 GB of RAM, 这样才能同时分析5 - 10 sequences . 软件要求: Linux, 32 bit or 64 bit (64 bit recommended…
InterProScan 5.25-64.0 安装和使用,目前最新版的interproscan 引用自 每日一生信--interproscan安装及使用(终结版)原文官网:http://code.google.com/p/interproscan/wiki/Introduction 配置要求:至少2 cores and 4 GB of RAM, 这样才能同时分析5 - 10 sequences . 软件要求: Linux, 32 bit or 64 bit (64 bit recommended…
http://blog.sina.com.cn/s/blog_670445240102uxwy.html 一 COG简介 COG,即Clusters of Orthologous Groups of proteins.构成每个COG的蛋白都是被假定为来自于一个祖先蛋白,并且因此或者是orthologs或者是paralogs.Orthologs是指来自于不同物种的由垂直家系(物种形成)进化而来的蛋白,并且典型的保留与原始蛋白有相同的功能.Paralogs是那些在一定物种中的来源于基因复制的蛋白,可…
1. Java 程序的构成 对象(object):对象是类的一个实例,有状态和行为. 类(class):类是一个模板,它描述一类对象的行为和状态. 方法(method):方法就是行为,一个类可以有很多方法.逻辑运算.数据修改以及所有动作都是在方法中完成的. 实例变量:每个对象都有独特的实例变量,对象的状态由这些实例变量的值决定. 举例 Hello World public class HelloWorld{ public static void main(String[] args){ Syst…
序列图(时序图) 序列图是一种交互图,它显示了进程如何相互操作以及按什么顺序操作. sequenceDiagram participant l as 大灰狼 participant y as 小羊 l->>y:小坏蛋,弄脏我喝的水 y->>l:狼先生,你在上游,我在下游 l->>y:听说去年你说我的坏话 y->>l:去年我还没出生呢 l->>y:不是你也是你爸爸,说着就扑上去 %% left or right note left of l:对于坏…
1)知识简介--------------------------------------------------------1.1)测序质量值 首先在了解fastq,fasta之前,了解一下什么是质量值.phred软件在对reads进行base calling的时候会给出每一个碱基的质量值,这个质量值的计算与测序预期错误率相关(estimated probability of error): Phred Quality Score Probability of incorrect bas…