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扩增子分析QIIME2. 1简介和安装
】的更多相关文章
扩增子分析QIIME2. 1简介和安装
原网站:https://blog.csdn.net/woodcorpse/article/details/75103929 声明:本文为QIIME2官方帮助文档的中文版,由中科院遗传发育所刘永鑫博士翻译并亲测有效,文档翻译己获QIIME2团队官方授权.由于QIIME2更新频繁,如使用中遇到问题请访问QIIME2官方论坛阅读最新版中文帮助. https://forum.qiime2.org/t/qiime2-1-chinese-manual/838 如中文翻译没有急时更新,新阅读英文原版 http…
Nutch搜索引擎(第2期)_ Solr简介及安装
1.Solr简介 Solr是一个高性能,采用Java5开发,基于Lucene的全文搜索服务器.同时对其进行了扩展,提供了比Lucene更为丰富的查询语言,同时实现了可配置.可扩展并对查询性能进行了优化,并且提供了一个完善的功能管理界面,是一款非常优秀的全文搜索引擎. Solr最初由CNET Networks开发,2006 年初,Apache Software Foundation 在Lucene顶级项目的支持下得到了Solr.Solr于2007年1月酝酿成熟,在整个项目孵化期间,Solr稳步地积…
Nutch之简介与安装
初学Nutch之简介与安装 初学Nutch之简介与安装 1.Nutch简介 Nutch是一个由Java实 现的,开放源代码(open-source)的web搜索引擎.主要用于收集网页数据,然后对其进行分析,建立索引,以提供相应的接口来对其网页数据进行 查询的一套工具.其底层使用了Hadoop来做分布式计算与存储,索引使用了Solr分布式索引框架来做,Solr是一个开源的全文索引框架,从 Nutch 1.3开始,其集成了这个索引架构. 1.1 Nutch的目标 Nutch 致力于让每个人能很容…
Nutch搜索引擎Solr简介及安装
Nutch搜索引擎(第2期)_ Solr简介及安装 1.Solr简介 Solr是一个高性能,采用Java5开发,基于Lucene的全文搜索服务器.同时对其进行了扩展,提供了比Lucene更为丰富的查询语言,同时实现了可配置.可扩展并对查询性能进行了优化,并且提供了一个完善的功能管理界面,是一款非常优秀的全文搜索引擎. Solr最初由CNET Networks开发,2006 年初,Apache Software Foundation 在Lucene顶级项目的支持下得到了Solr.Solr于20…
Redis 小白指南(一)- 简介、安装、GUI 和 C# 驱动介绍
Redis 小白指南(一)- 简介.安装.GUI 和 C# 驱动介绍 目录 简介 安装 入门指令 GUI 工具 C# 驱动介绍 简介 ANSI C 编写,开源,基于内存,可持久化,一个键值对的数据库,用法简单. 支持的类型:字符串.散列.列表.集合和有序集合. 因为 Redis 默认将所有数据都存储到内存中,并且内存的读写速度远远高于硬盘,因此,比其他基于硬盘存储的数据库在性能上体现的优势非常明显.不过这样也引发了一个数据安全性的问题,程序异常或退出后数据会出现丢失的情形,现在新的版本已经提供了…
数据采集工具Telegraf:简介及安装
接着上一篇博客:InfluxDB简介及安装,这篇博客介绍下Linux环境下Telegraf安装以及其功能特点... 官网地址:influxdata 官方文档:telegraf文档 环境:CentOS7.4 64位 Telegraf版本:0.11.1-1 一.Telegraf介绍 1.基本介绍 Telegraf 是一个用 Go 编写的代理程序,可收集系统和服务的统计数据,并写入到 InfluxDB 数据库.内存占用小,通过插件系统可轻松添加支持其他服务的扩展. Influxdb 是一个开源的分布式…
nginx高性能WEB服务器系列之一简介及安装
nginx系列友情链接:nginx高性能WEB服务器系列之一简介及安装https://www.cnblogs.com/maxtgood/p/9597596.htmlnginx高性能WEB服务器系列之二命令管理https://www.cnblogs.com/maxtgood/p/9597990.htmlnginx高性能WEB服务器系列之三版本升级https://www.cnblogs.com/maxtgood/p/9598113.htmlnginx高性能WEB服务器系列之四配置文件详解https:…
扩增子分析解读5物种注释 OTU表操作
本节课程,需要先完成<扩增子分析解读>系列之前的操作 1质控 实验设计 双端序列合并 2提取barcode 质控及样品拆分 切除扩增引物 3格式转换 去冗余 聚类 4去嵌合体 非细菌序列 生成代表性序列和OTU表 分析前准备 # 进入工作目录 cd example_PE250 上一节回顾:我们学习了嵌合体的形成,以及基于参考数据库去嵌合体:也学习了基于数据库比对来筛选细菌或真菌:最后基于最确定的OTU,我们生成代表性序列和OTU表,这是每种高通量测序都有的结果,后续的结果将全部基于这两个文件.…
扩增子分析解读2提取barcode 质控及样品拆分 切除扩增引物
本节课程,需要完成扩增子分析解读1质控 实验设计 双端序列合并 先看一下扩增子分析的整体流程,从下向上逐层分析 分析前准备 # 进入工作目录 cd example_PE250 上一节回顾:我们拿到了双端数据,进行了质控.并对实验设计进行了填写和检查.最后将双端数据合并为单个文件进行下游分析. 接下来我们将序列末端的barcode标签切下来,因为它们是人为添加的,不属于实验对象:再根据标签序列与实验设计文件比对,对每条序列属于哪个样品进行分类:最后我们切除掉扩增使用的引物,因为它们是人工合成的…
Nginx网络架构实战学习笔记(一):Nginx简介、安装、信号控制、nginx虚拟主机配置、日志管理、location 语法、Rewrite语法详解
文章目录 nginx简介 nginx安装 nginx信号控制 nginx虚拟主机配置 日志管理 location 语法 精准匹配的一般匹配 正则匹配 总结 Rewrite语法详解 nginx简介 Nginx ("engine x") 是一个高性能的 HTTP 和 反向代理 服务器,也是一个 IMAP/POP3/SMTP 代理服务器. Nginx 是由 Igor Sysoev 为俄罗斯访问量第二的 Rambler.ru 站点开发的 国内用户:自学it网,新浪,赶集,酷6 - nginx安…