1)简介: DESeq2-package: for differential analysis of count data(对count data 做差异分析) 2)安装 if("DESeq2" %in% rownames(installed.packages()) == FALSE) {source("http://bioconductor.org/biocLite.R");biocLite("DESeq2")} suppressMessage

Error in read.dcf(file.path(pkgname, "DESCRIPTION"), c("Package", "Type")) : 无法打开链结 此外: Warning messages: : In download.file(url, destfile, method, mode = "wb", ...) : downloaded length != reported length : In unzip

> library('ggplot2')Error in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]) : 不存在叫'colorspace'这个名字的程辑包 在安装了某个包的时候,解决依赖关系时更新了其他一些包,结果导致ggplot2无法载入,找不到'colorsoace'这个包,出现上诉问题. 解决方法:重新安装'colorspace' install.packages('colorspace') 再重新安装

> library(xlsx) 载入需要的程辑包:rJava Error : loadNamespace()里算'rJava'时.onLoad失败了,详细内容: 调用: inDL(x, as.logical(local), as.logical(now), ...) 错误: unable to load shared object 'C:/Program Files/R/R-3.1.3/library/rJava/libs/x64/rJava.dll': LoadLibrary failure:

R > -------------------------------------------------[解决方案]1.使用命令单独安装caret,安装的时间很长.install.packages("caret", dependencies = c("Depends", "Suggests")) 需要安装依赖的包全部安装之后,就可以了.依赖包如下:dependencies ‘doMC’, ‘rpvm’, ‘Rcompression’, ‘

问题描述: 安装包xlsx包后,运行library("xlsx")后弹出错误窗口: RGui (64-bit): Rgui.exe - 系统错误 无法启动此程序,因为计算机中丢失 jvm.dll.尝试重新安装该程序以解决此问题. 在R语言环境中的错误是: 载入需要的程辑包:rJava Error : loadNamespace()里算'rJava'时.onLoad失败了,详细内容: 调用: inDL(x, as.logical(local), as.logical(now), ...)

关于R的分词器jiebaR 关于R的分词器jiebaR "结巴"中文分词的R语言版本,支持最大概率法(Maximum Probability),隐式马尔科夫模型(Hidden Markov Model),索引模型(QuerySegment),混合模型(MixSegment),共四种分词模式,同时有词性标注,关键词提取,文本Simhash相似度比较等功能.项目使用了Rcpp和CppJieba进行开发. 0. 安装 > library(devtools)> install_gi

关于ggplot包(二) 关于ggplot包(二) 标尺(Scale) 从前面可以看到,画图其实就是在做映射,不管是映射到不同的几何对象上,还是映射各种图形属性.在对图形属性进行映射之后,使用标尺可以控制这些属性的显示方式,如坐标刻度,如颜色属性. > ggplot(small)+geom_point(aes(x=carat,y=price,shape=cut,colour=color))+scale_y_log10()+scale_colour_manual(values=rainbow(7)

在大数据如火如荼的时候,机器学习无疑成为了炙手可热的工具,机器学习是计算机科学和统计学的交叉学科, 旨在通过收集和分析数据的基础上,建立一系列的算法,模型对实际问题进行预测或分类. R语言无疑为我们提供了很好的工具,它正是计算机科学和统计科学结合的产物,开源免费, 相对于Python.Orange Canvas.Weka.Kinme这些免费的数据挖掘软件来说,更容易上手,统计图形也更加美观. 今天在这里和大家介绍一下Caret机器学习包的一些基本用法.   一.数据收集       下载kern

每每以为攀得众山小,可.每每又切实来到起点,大牛们,缓缓脚步来俺笔记葩分享一下吧,please~ --------------------------- R语言·文本挖掘︱Rwordseg/rJava两包的安装 笔者:文本挖掘中这两个包可谓是"老顽固",做文本挖掘必须要过的关卡,今天倒腾了一天,桌面下了一堆东西,终于弄出来了.故此,赶紧记录下来,以后可用: 关于这两个包的安装问题,有很多很多教程,很多方法,我就不一一介绍,如果我介绍的方法你安装不了,那你就得去下面的参考链接找找其他的方

install.packages(c("matrixStats", "Hmisc", "splines", "foreach", "doParallel", "fastcluster", "dynamicTreeCut", "survival")) source("http://bioconductor.org/biocLite.R&qu

rJava 包的安装与载入 一般文本分词的教程都会贴出: install.packages("rJava") library(rJava) 来引导我们装载rJava包,运行install.packages("rJava") 一般可以顺利下载该package,但是运行library(rJava)时,经常有新手同学会遇到加载失败的情况,报错如下: Error : loadNamespace()里算'rJava'时.onLoad失败了,详细内容: 调用: fun(libn

我使用Rtudio环境,安装sqldb几次出错.网上没有好的教程. 经过自己试验之后,这样处理.我写出来以后,供大家参考. > install.packages("sqldf") also installing the dependencies ‘BH’, ‘plogr’, ‘gsubfn’, ‘proto’, ‘RSQLite’, ‘DBI’, ‘chron’ trying URL 'https://cran.rstudio.com/bin/windows/contrib/3.

一.playwith包简介 playwith包提供了一个GTK+图形用户界面(GUI),使得用户可以编辑R图形并与其交互.playwith()函数允许用户识别和标注点.查看一个观测所有的变量值.缩放和旋转图形.添加标注(文本.箭头.线条.矩形.标题和标签).修改视觉元素(颜色.文本大小等).应用先前存储的图形风格,以及以多种格式输出图形结果.依赖于GTK+ GUI,用户可以使用鼠标编辑图形.与identify()函数不同,playwith()既对R基础图形有效,也对lattice和ggplot2

 1. Rstudio安装xlsx报错 xlsx包加载依赖Java环境,我之前就安装过Java,但安装xlsx成功后,加载xlsx时一直报错: Error : loadNamespace()里算'rJava'时.onLoad失败了,详细内容: 调用: inDL(x, as.logical(local), as.logical(now), -) 错误: unable to load shared object 'D:/software/myR/R-3.1.2/library/rJava/libs/

最近在做股票的高频交易数据分析,需要用到数据库,而我只对MySQL比较熟悉,于是就安装了MySQL.当我安装好了MySQL后,正兴冲冲地准备安装RMySQL包时,问题来了:RMySQL包不支持windows操作系统!!!晴天霹雳啊!真的不支持吗?在花了n个小时,查阅了大量的英文资料后得出一个结论:在windows操作系统下,RMySQL包可以安装成功. 现将安装方法分享一下,让纠结此问题的童鞋们不再为此苦恼. 说明: 1.我用的R语言是64位的2.15.2版,安装路径是:D:\R\R-2.15.

加载 rJava 包报错: > library(rJava) Error : loadNamespace()里算'rJava'时.onLoad失败了,详细内容: 调用: fun(libname, pkgname) 错误: No CurrentVersion entry in Software/JavaSoft registry! Try re-installing Java and make sure R and Java have matching architectures. 此外: War

1.  需要先在Mac OS中安装好R,Rstudio中,这个比较简单,掠过 2. 下载编译好的spark(spark-2.0.0-bin-hadoop2.6.tgz)可以在Spark官网下载到你所需要的版本 解压spark到指定目录 $ tar -zxvf spark-2.0.0-bin-hadoop2.6.tgz -C ~/ 我这里解压后spark的目录为(/Users/hduser/spark-2.0.0-bin-hadoop2.6) 3.  打开Rstudio,安装相关包 > insta

> library(maps) > library(geosphere) 载入需要的程辑包:sp > map("state")#画美国地图 > map("world")#画世界地图 > xlim<-c(-171.738281,-56.601563) > ylim<-c(12.039321,71.856229) > map("world",col="#f2f2f2",fill

题目:模拟产生统计专业同学的名单(学号区分),记录数学分析.线性代数.概率统计三科成绩,然后进行一些统计分析 > num=seq(10378001,10378100) > num [1] 10378001 10378002 10378003 10378004 10378005 10378006 10378007 10378008 [9] 10378009 10378010 10378011 10378012 10378013 10378014 10378015 10378016 [17] 10

Part4文本分类 Part3文本聚类提到过.与聚类分类的简单差异. 那么,我们需要理清训练集的分类,有明白分类的文本:測试集,能够就用训练集来替代.预測集,就是未分类的文本.是分类方法最后的应用实现. 1.       数据准备 训练集准备是一个非常繁琐的功能,临时没发现什么省力的办法,依据文本内容去手动整理.这里还是使用的某品牌的官微数据,依据微博内容.我将它微博的主要内容分为了:促销资讯(promotion).产品推介(product).公益信息(publicWelfare).生活鸡汤(l