1.综述 越来越多的R包正在由世界上不同的人所创建,其中一部分原因是devtools包使得开发R包1变得更加简单.devtools包不仅让开发R包变得简单,而且用于分发R包. 当开发者发布一个R包的时候,CRAN2一般是最常用的.使用install.packages()函数可以安装发布在CRAN上的R包.例如,如下方法可以安装dplyr包: install.packages('dplyr') devtools包的install_github()函数用于从Github上安装R包. library(

转自 http://bnuzhutao.cn/archives/901 一般 R 语言的书籍上,介绍安装 R 包的方法都是这样的: install.packages("packagename"); 一般而言这不会成功,因为它默认会安装到系统目录下面,而普通用户在这个目录里并没有写入的权限. 因此,需要在 install.packages 这个函数里面指定安装的路径,例如想安装到 /home/myname/R 这个目录,就这么写: install.packages("packa

MacOS 上安装 R 包 install.packages("data.table") 后面提示是否安装需要编译的版本: Do you want to install from sources the package which needs compilation?y/n 选择了 y 之后,报错 clang: error: unsupported option '-fopenmp' 网上找到的解决方法是: 安装 clang-omp brew install clang-omp 但是提

安装R包("RcppArmadillo")失败,导致依赖该包的DESeq2 无法使用: 首先对gcc,g++升级至4.7, 但依然报错,还是安装不了RcppArmadillo: 报错如下: $ R > source("https://bioconductor.org/biocLite.R") > biocLite("DESeq2") BioC_mirror: https://bioconductor.org Using Biocond

Windows设置国内源阿里云镜像加速1.先在 windows “文件资源管理器” 地址栏 输入 %APPDATA% 按回车,打开程序自定义设置文件夹然后,创建名为 pip 的文件夹,用于存放 pip 配置文件2.新建 pip 配置文件在刚才创建好的 pip 文件夹中,新建名为 pip.ini 的配置文件在 pip.ini 文件中输入以下内容,然后保存[global]index-url=https://mirrors.aliyun.com/pypi/simple/ [install]truste

https://www.cnblogs.com/jessepeng/p/10984983.html Linux 的R环境,可以通过anaconda jupyter notbook很容易的配置,见我之前的博客  https://www.cnblogs.com/shanyr/p/11276755.html 安装R包 Linux下安装R包一般有2种方式: 1. R CMD INSTALL 下载源码 R CMD INSTALL /.../mypackage.tar.gz 也可指定安装库路径: R CMD

背景介绍: 1CDH开发平台在搭建的过程中,会遇到各种各样的问题,其中的各种依赖就是一个很让人头痛的问题.如果安装脚本文件出现了这种问题,那么就可以把以下的这种方法加入shell中,但是不要用yum来安装,因为yum安装需要网络,有的应用场景是离线的,所以我们采用离线安装,下一个Yum包所需要的离线包以及依赖. 2CDH开发平台如果遇到网卡不能重启,就重启整个机器 3重启整个云主机完后启动CDH前,不要忘了先启动Ntp和Mysql服务,不然你连CDH怎么挂的都不知道 注:本文也是参考了其他大牛,

R version: 3.5.3, 3.6.3 更新日期: 2020-9-10 大家测试后多提建议哈, 有问题我会持续更新的 在工作中,我们使用的服务器通常是不能联外网的,这在安装R包的时候产生了巨大的不便.网上有很多帖子使用tools::package_dependencies这个工具下载依赖,但是这个工具是有坑的,相信尝试过的同学依然会发现有些依赖包在下载时被漏掉了,查了很多帖子,这个问题一直没有很好的解决. 今天,我就来解决这个问题,一来,方便自己,二来,服务他人. 我们就用R自己来解决自

https://cosx.org/2013/11/building-r-packages-easily/ 最近想试一下捣腾一个 R 包出来,故参考了一些教程.现在看到的最好的就是谢益辉大大之前写过的开发 R 程序包之忍者篇,以及 Hadley 大神(ggplot2 devtools 等一系列包的作者)的 教程.但是前者有一些过时,后者是全英文的,所以我这里记录一下比较简单的过程,给读者们一个参考思路.如果你有一些 R 程序,想塞到去一个自创的 R 包中,那么这篇文章就可能是你想要的.为了方便说明

1.前提条件 1). 确保已经安装需要的Python版本 2). 确保已经将Python的目录加入到环境变量中 2. Python安装包的几种常用方式 1). pip安装方式(正常在线安装) 2). whl安装方式(离线安装),一般是.whl格式的包 3). 源码安装方式(离线安装),tar.gz/egg格式 4). easy_install安装方式(用的比较少) 3.不同安装方式具体安装步骤 1). pip是一个通用的 Python 包管理工具:提供了对 Python 包的查找.下载.安装.卸

Python中第三方的库(library).模块(module),包(package)的安装方法以及ImportError: No module named 1.pip install .... 一般的pycharm都自带有pip,如果没有,就去下一个pip的安装包,将安装包解压在Python的根目录,搭建好Python的环境,然后用Python来安装pip,基本上就可以在pycharm 的Terminal界面或者命令提示界面直接安装想要的扩展包了 可以用pip install 来安装,用pip

最近安装github上的R包,经常显示Error in utils::download.file(url, path, method = method, quiet = quiet, : 无法打开URL'https://api.github.com/repos/之类的错误.起初以为是网络的问题,换了网不行,登梯子不行,关闭重启也不行. 在网上查了下,说是R默认是通过IE浏览器来下载包的,所以需要设置IE的安全选项. but,我已经很多年没用过IE了(但很多政府官方网站的操作都是默认IE,而且是要

1.在虚拟机光盘选项中设置连接路径为centos安装光盘. 2.将光盘挂载到本地目录. #新建一个文件夹 mkdir cdrom #把光盘挂载到cdrom目录下 mount /dev/cdrom cdrom 3.进入目录rpm包的目录 cd cdrom cd Packages 4.查询是否安装过git包 [root@yum-server Packages]# rpm -qa gitgit-1.7.1-3.el6_4.1.x86_64    #已经安装,不需要再装,如果查不到结果,表示没有安装.

1,先将R包下载到本地 2,getwd() setwd("F:\\CNV\\Paper\\Case-control\\mHMM") 3, install.packages("mHMM_1.0.zip",repos=NULL) 4, library(mHMM)

先 pip list 看看包的具体名字是什么,然后 pip uninstall **包名** ===== 打印出有新版本的包: pip list --outdated --format=freeze 如果一次升级所有过期的包: $ pip install pip-review $ pip-review --local --interactive 单独升级某个包: pip install *** --upgrade ================ 查看包的版本的方法: pip freeze |

当我们项目中的R文件丢失的时候会令我们痛苦不已,怎样找回呢?总不能删了吧,那样心血会毁于一旦的,我们肯定不会那样做,那要怎么办呢?我这里提供三种方法: ​一,一般情况下这样: ​    ​方法一:选中项目clean一下: ​    ​方法二:选中项目然后右击找到Android Tool再Fix一下: ​二,第二种情况下: ​    ​1,找到你的xxx.xml文件,首先找到报错的,把错误改正过来,这样应该就可以了. ​    ​2,如果第一种方法不行,就把自己的xxx.xml文件都改动改动,然后

Installing pystan manually fixed the issue (otherwise it would just hang forever). ~/GitHub $ git clone https://github.com/facebookincubator/prophet Cloning into 'prophet'... remote: Counting objects: 358, done. remote: Compressing objects: 100% (109

包(package)是多个函数的集合,常作为分享代码的基本单元,代码封装成包可以方便其他用户使用.越来越多的R包正在由世界上不同的人所创建并分发,这些分发的R包,可以从CRAN 或 github 上获取,由于向 CRAN 提交包审核非常严格,有些开发者并没有将自己开发的R包提至CRAN的意向,通过 devtools 可以轻松从 github上下载安装.包的生命周期一般会经历 source.bundled.binary.installed和in-memory五个阶段.参考资料 (http://r-

前言 R对windows使用很友好,对Linux来说充满了敌意.小数据可以在windows下交互操作,效果很好很棒.可是当我们要处理大数据,或者要在集群上搭建pipeline时,不得不面对在Linux上装R及想要的R包这个难题,尤其是对非root用户而言更是艰难重重. 准备依赖库 依次安装:zlib/bzip/liblzma/pcre/curl,注意顺序和版本.目前3.4以上3.6以下R版本相对较为稳定和不过时,我自己安装的是3.5.2. cd zlib-1.2.11 ./configure -

自动安装(在线安装) 在R的控制台,输入 install.packages("gridExtra") # 安装 gridExtra install.packages("stepNorm", contriburl="http://www.your.url", dependencies = TRUE) # 安装 stepNorm 若要指定安装目录 `mydir`,则输入 install.packages("stepNorm", c