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对称归一化的拉普拉斯矩阵
2024-08-28
拉普拉斯矩阵(Laplacian Matrix) 及半正定性证明
摘自 https://blog.csdn.net/beiyangdashu/article/details/49300479 和 https://en.wikipedia.org/wiki/Laplacian_matrix 定义 给定一个由n个顶点的简单图G,它的拉普拉斯矩阵定义为: L = D - A,其中,D是该图G度的矩阵,A为图G的邻接矩阵. 因为G是一个简单图,A只包含0,1,并且它的对角元素均为0. L中的元素给定为: 其中deg(vi) 表示顶点 i 的度. 对称归一化的拉普拉斯
SC3聚类 | 拉普拉斯矩阵 | Laplacian matrix | 图论 | R代码
Laplacian和PCA貌似是同一种性质的方法,坐标系变换.只是拉普拉斯属于图论的范畴,术语更加专业了. 要看就把一篇文章看完整,再看其中有什么值得借鉴的,总结归纳理解后的东西才是属于你的. 问题: 1. 这篇文章有哪些亮点决定他能发NM?单细胞,consensus,较好的表现,包装了一些专业的术语,显得自己很专业,其实真正做的东西很少: 2. consensus方法的本质是什么? 3. 工具的评估准则?ARI,silhouette index 4. SC3的最大缺点是什么?速度太慢,超过10
拉普拉斯矩阵(Laplacian matrix)
原文地址:https://www.jianshu.com/p/f864bac6cb7a 拉普拉斯矩阵是图论中用到的一种重要矩阵,给定一个有n个顶点的图 G=(V,E),其拉普拉斯矩阵被定义为 L = D-A,D其中为图的度矩阵,A为图的邻接矩阵.例如,给定一个简单的图,如下(例子来自wiki百科): 把此“图”转换为邻接矩阵的形式,记为A: 把W的每一列元素加起来得到N个数,然后把它们放在对角线上(其它地方都是零),组成一个N×N的对角矩阵,记为度矩阵D,如下图所示.其实度矩阵(
Laplacian matrix 从拉普拉斯矩阵到谱聚类
谱聚类步骤 第一步:数据准备,生成图的邻接矩阵: 第二步:归一化普拉斯矩阵: 第三步:生成最小的k个特征值和对应的特征向量: 第四步:将特征向量kmeans聚类(少量的特征向量):
拉普拉斯矩阵(Laplace Matrix)与瑞利熵(Rayleigh quotient)
作者:桂. 时间:2017-04-13 07:43:03 链接:http://www.cnblogs.com/xingshansi/p/6702188.html 声明:欢迎被转载,不过记得注明出处哦~ 前言 前面分析了非负矩阵分解(NMF)的应用,总觉得NMF与谱聚类(Spectral clustering)的思想很相似,打算分析对比一下.谱聚类更像是基于图(Graph)的思想,其中涉及到一个重要概念就是拉普拉斯矩阵(Laplace matrix),想着先梳理一下这个矩阵: 1)拉普拉斯矩阵基
graph Laplacian 拉普拉斯矩阵
转自:https://www.kechuang.org/t/84022?page=0&highlight=859356,感谢分享! 在机器学习.多维信号处理等领域,凡涉及到图论的地方,相信小伙伴们总能遇到和拉普拉斯矩阵和其特征值有关的大怪兽.哪怕过了这一关,回想起来也常常一脸懵逼,拉普拉斯矩阵为啥被定义成 ?这玩意为什么冠以拉普拉斯之名?为什么和图论有关的算法如此喜欢用拉普拉斯矩阵和它的特征值? 最近读论文的时候,刚好趁机温习了一下相应的内容,寻本朔源一番,记录下来,希望大家阅读之后,也能够有
《SEMI-SUPERVISED CLASSIFICATION WITH GRAPH CONVOLUTIONAL NETWORKS》论文阅读
背景简介 GCN的提出是为了处理非结构化数据(相对于image像素点而言).CNN处理规则矩形的网格像素点已经十分成熟,其最大的特点就是利用卷积进行①参数共享②局部连接,如下图: 那么类比到非结构数据图(graph),CNN能直接对非结构数据进行同样类似的操作吗?如果不能,我们又该采用其他什么方式呢? 首先思考能不能,答案是不能.至少我们无法将graph结构的数据规整到如上图所示的矩形方格中,否则结点之间的边无法很好表示.还可以考虑卷积核这一点,我们知道不管我的图(image)如何变化(图片变大
最全面的图卷积网络GCN的理解和详细推导,都在这里了!
目录 目录 1. 为什么会出现图卷积神经网络? 2. 图卷积网络的两种理解方式 2.1 vertex domain(spatial domain):顶点域(空间域) 2.2 spectral domain:频域方法(谱方法) 3. 什么是拉普拉斯矩阵? 3.1 常用的几种拉普拉斯矩阵 普通形式的拉普拉斯矩阵 对称归一化的拉普拉斯矩阵(Symmetric normalized Laplacian) 随机游走归一化拉普拉斯矩阵(Random walk normalized Laplacian) 泛化
论文解读GCN 1st《 Deep Embedding for CUnsupervisedlustering Analysis》
论文信息 Tittle:<Spectral Networks and Locally Connected Networks on Graphs> Authors:Joan Bruna.Wojciech Zaremba.Arthur Szlam.Yann LeCun Source:2014, ICLR Paper:Download Code:Download Abstract Convolutional Neural Networks are extremely efficient archi
论文解读(AGE)《Adaptive Graph Encoder for Attributed Graph Embedding》
论文信息 论文标题:Adaptive Graph Encoder for Attributed Graph Embedding论文作者:Gayan K. Kulatilleke, Marius Portmann, Shekhar S. Chandra论文来源:2020, KDD论文地址:download论文代码:download 1 Introduction 基于 GCN 的方法有三个主要缺点: 图卷积滤波器和权值矩阵的纠缠会损害其性能和鲁棒性: 图卷积滤波器是广义拉普拉斯平滑滤波器的特殊情况,
图谱论(Spectral Graph Theory)基础
拉普拉斯矩阵(Laplacian matrix),也称为导纳矩阵(Admittance matrix)或者基尔霍夫矩阵(Kirchohoff matrix) 归一化的拉普拉斯矩阵定义为 例子: 拉普拉斯矩阵性质: (1)对称半正定矩阵 (2)最小特征值为0 证明:* = (- ) * = 0 = 0 * (3)任何一个属于实向量,有以下式子成立 证明: 谱聚类: 矩阵的谱半径就是指矩阵的特征值中绝对值最大的那个.ρ(A)=max{|λi|,i=1,2,……n} 为A的谱半径. ρ(A)≤║A║
译:Local Spectral Graph Convolution for Point Set Feature Learning-用于点集特征学习的局部谱图卷积
标题:Local Spectral Graph Convolution for Point Set Feature Learning 作者:Chu Wang, Babak Samari, Kaleem Siddiqi 译者:Elliott Zheng 来源:ECCV 2018 Abstract 点云的特征学习已经显示出巨大的希望,引入了有效且可推广的深度学习框架,例如pointnet ++. 然而,到目前为止,点特征已经以独立和孤立的方式被抽象,忽略了相邻点的相对布局及其特征.在本文中,我们建议
【GNN】图神经网络小结
图神经网络小结 图神经网络小结 图神经网络分类 GCN: 由谱方法到空域方法 GCN概述 GCN的输出机制 GCN的不同方法 基于谱方法的GCN 初始 切比雪夫K阶截断: ChebNet 一阶ChebNet 自适应图卷积网络AGCN 谱方法小结 基于空域方法GCN 基于递归的空间GCN(Recurrent-based Spatial GCNs) 图神经网络GNN(特指早期的一种结构) 门控图神经网络(GGNN) 随机稳态嵌入SSE 基于合成的空间GCN(Composition Based Spa
论文解读(AGC)《Attributed Graph Clustering via Adaptive Graph Convolution》
论文信息 论文标题:Attributed Graph Clustering via Adaptive Graph Convolution论文作者:Xiaotong Zhang, Han Liu, Qimai Li, Xiao-Ming Wu论文来源:2019, IJCAI论文地址:download 论文代码:download 1 Introduction 关于GNN 是低通滤波器的好文. 2 Method 2.1 Graph Convolution 2.1.1 Basic idea 为正式定义图
【聚类算法】谱聚类(Spectral Clustering)
目录: 1.问题描述 2.问题转化 3.划分准则 4.总结 1.问题描述 谱聚类(Spectral Clustering, SC)是一种基于图论的聚类方法——将带权无向图划分为两个或两个以上的最优子图(sub-Graph),使子图内部尽量相似,而子图间距离尽量距离较远,以达到常见的聚类的目的. 对于图的相关定义如下: 对于无向图G = (V,E),V表示顶点集合,即样本集合,即一个顶点为一个样本:E表示边集合. 设样本数为n,即顶点数为n. 权重矩阵:W,为n*n的矩阵,其值wi,j为各边的权值
Clustering[Spectral Clustering]
0. 背景 谱聚类在2007年前后十分流行,因为它可以快速的通过标准的线性代数库来实现,且十分优于传统的聚类算法,如k-mean等. 至于在任何介绍谱聚类的算法原理上,随便翻开一个博客,都会有较为详细的介绍,如这里.当然这些都来自<A Tutorial on Spectral Clustering>一文.为了上下文一致性和便于理解,我就直接截图别人基于这篇论文中翻译好的部分(偷懒): 1 - 无向权重图:谱聚类是基于图论结构,也是数据结构的毗邻矩阵来实现的,即将所有的点的看成是一个相互连接的图
生成树的计数 Matrix-Tree(矩阵树)定理
信息学竞赛中,有关生成树的最优化问题如最小生成树等是我们经常遇到的,而对生成树的计数及其相关问题则少有涉及.事实上,生成树的计数是十分有意义的,在许多方面都有着广泛的应用.本文从一道信息学竞赛中出现的例题谈起,首先介绍了一种指数级的动态规划算法,然后介绍了行列式的基本概念.性质,并在此基础上引入Matrix-Tree定理,同时通过与一道数学问题的对比,揭示了该定理所包含的数学思想.最后通过几道例题介绍了生成树的计数在信息学竞赛中的应用,并进行总结. 生成树的计数 Matrix-Tree定理 问题
【BZOJ】1002:轮状病毒(基尔霍夫矩阵【附公式推导】或打表)
Description 轮状病毒有很多变种,所有轮状病毒的变种都是从一个轮状基产生的.一个N轮状基由圆环上N个不同的基原子和圆心处一个核原子构成的,2个原子之间的边表示这2个原子之间的信息通道.如下图所示: N轮状病毒的产生规律是在一个N轮状基中删去若干条边,使得各原子之间有唯一的信息通道,例如共有16个不同的3轮状病毒,如下图所示: 现给定n(N<=100),编程计算有多少个不同的n轮状病毒. Input 第一行有1个正整数n. Output 计算出的不同的n轮状病毒数输出. Sample I
MapReduce实现大矩阵乘法
来自:http://blog.csdn.net/xyilu/article/details/9066973 引言 何 为大矩阵?Excel.SPSS,甚至SAS处理不了或者处理起来非常困难,需要设计巧妙的分布式方法才能高效解决基本运算(如转置.加法.乘法.求逆) 的矩阵,我们认为其可被称为大矩阵.这意味着此种矩阵的维度至少是百万级的.经常是千万级的.有时是亿万级的.举个形象的栗子.至2012年12月底,新 浪微博注册用户数超5亿,日活跃用户4629万[1],如果我们要探索这4000多万用户可以分
机器学习-kNN-数据归一化
一.为什么需要数据归一化 不同数据之间因为单位不同,导致数值差距十分大,容易导致预测结果被某项数据主导,所以需要进行数据的归一化. 解决方案:将所有数据映射到同一尺度 二.最值归一化 normalization 最值归一化:把所有数据映射到0-1之间 适用于分布有明显边界的情况:受outlier影响较大 import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt x = np.random.randint(0,100,100) # 一维矩阵的最值归一化
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