3D-DNA是一款简单,方便的处理Hi-C软件,可将contig提升到染色体水平.其githup网址:https://github.com/theaidenlab/3d-dna 3D-DNA流程简介 将Hi-C数据比对到draft.genome.fa.(利用Juicer分析Hi-C数据) 利用自动化流程进行纠错(misjoin),排序(order),确定正确方向(orient),最后scaffolding,得到染色体水平的组装结果(3D-DNA分析) Juicebox 进行人工纠错 所需软件及安

对生物有一定了解的朋友都知道DNA是染色体的重要组成部分,DNA结构中包含重要的遗传物质,孩子的DNA来自父母DNA的组合,这就是为什么“一家人相像”的奥秘所在.ChemDraw虽然号称是化学结构绘制工具但是它并不仅仅只能够用于化学领域,生物领域也是可以使用的.使用其他图形编辑器绘制DNA结构并不是一件特别简单的事情,但是使用ChemDraw的话就会变得异常简单,本ChemDraw教程将指导使用ChemDraw绘制DNA结构的技巧. 一.使用非ChemDraw绘制DNA结构 DNA分子是以4种脱

1. 纪录片:非自然选择 1.1 CRISPR-Cas9的出现 1.2 故事1:先天性基因缺陷而失明的小孩 1.3 故事2:基因变异的蚊子 1.4 基因技术应用的现状 1.5 担忧 2. CRISPR基因编辑 2.1 Cas9 2.2 Cas12a(以前称为Cpf1) 2.3 Cas9与Cpf1 2.4 Anti-CRISPR 2.5 CRISPR/Cas工具 3. 基因敲除 4. DNA,RNA,染色体,基因,蛋白质 4.1 概念 4.2 DNA和RNA 4.3 物质关系: 4.4 功能关系:

OMIM数据库:大神私藏的数据库,99.9%的人都不知道! 2019-03-04 11:00乳腺癌/医生/肺癌 “ GEO.NCDB.TCGA.SEER数据库这些我都知道,但OMIM是什么鬼? OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man)数据库,中文称在线人类孟德尔遗传数据库.OMIM包括了现在所有已知的遗传病和超过15000个基因的信息.OMIM侧重于疾病表型与其致病基因之间的关联. ” 也就是说当你知道某个病的时候,但不知道它受什么基因影响 ——选OMI

之前我有过一篇16s基本概念和数据分析的文章.16S 基础知识.分析工具和分析流程详解 可以分成两部分,生物层面和技术层面. 生物层面: 1. 肠道微生物里面包含了哪些微生物?显然包含了所有层面的微生物:细菌.古细菌和真菌. 2. 肠道微生物是如何从母体遗传向下一代的?成熟的肠道微生物群体是如何逐步形成的?环境因素占比多少? 3. 肠道微生物是通过什么来影响疾病的? 4. 目前常见的肠道微生物层面的治疗方案有哪些?疗效如何?哪些病是纯粹由肠道微生物引起的? 技术层面: 1. 什么是16s测序.宏

视频  https://www.bilibili.com/video/av7973580?from=search&seid=16993146754254492690 教材 Molecular biology of the gene 7th edition  J.D. Watson et. al DNA的复制,染色体组装 一.Replication Enzymes 复制酶 1.酶结构: 手状结构.thumb不动,而finger动. 手掌:①聚合作用. β折叠片层 2个二价金属离子(Mg2+orMn

生物信息资源更新越来越快,使用可视化的方法来分析DNA序列已成为生物信息学的一个研究热点,用图形表示DNA序列的方法也越来越成熟.2011年,著名杂志<Science>发表一篇引起轰动的文章:<Presenting the Human Genome:Now is 3D!>,这篇文章全然给我们描写叙述了人类基因组測序未来的蓝图,可见3D技术在非常多领域都是发展方向. 使用mono能够高速的创建DNA分子结构立体模型,效果例如以下: 当然简单的呈现DNA分子结构,不过一部分功能,假设将

目录 1. 主要纠错类型 misjoins translocations inversions chromosome boundaries 2. 其他有用操作 撤销与反撤销 移到边角料 1. 主要纠错类型 上篇HiC挂载软件以及如何用Juice_box手工纠错?我吐槽了Juicebox操作麻烦,且没有详细文档.今天在3d-dna流程3D de novo assembly (3D-DNA) pipeline中,终于找到Juicebox的官方文档了:http://aidenlab.org/assem

我们都知道,图表在ASP.NET技术中是一种特别受欢迎而又很重要的工具.图表是表示数据的图形,一般含有X和Y两个坐标轴.我们可以用折线,柱状,块状来表示数据.通过图表控件,我们即能表示数据又能比较各种图表的数据,例如比较去年和今年的收入.图表的类型也有很多,如柱状图.折线图.条形图.组合图等等. 这篇文章将阐述如何在ASP.NET中如何制作3D图表.首先,我将展示如何绘制出一个简单的图表. 简单图表的步骤 步骤1 新建一个"ASP.NET Empty Web Site". 步骤2 在S

参考资料: [cfDNA专题]cell-free DNA在非肿瘤疾病中的临床价值(好) ctDNA, cfDNA和CTCs有什么区别吗? cfDNA你懂多少? 新发现 | 基因是否表达,做个cfDNA全基因组测序就可揭晓 游离DNA Cell-Free DNA (cfDNA) Isolation 游离DNA (circulating cell free DNA,cfDNA),是一种在细胞外呈现游离状态且无细胞状态的的DNA,广泛存在于动植物及人类的血清.血浆.脑脊液.尿液.痰液或粪便当中.过去,

http://www.unity蛮牛.com/thread-22018-1-1.html ngui作为unity界面插件之一中,无疑是最好用,使用最多的了从自学unity到现在界面一直使用它 由于它的持续更新,我在此不得不说,确实很为开发者作想,为什么这么讲呢?大概在去年吧  当时用的那个版本已经不记得了,反正就是有个需求,要实现“无限循环”拖动,使用过以前ngui的人就知道当时是没有这个功能的,后来被自己弄出来没几天,就发现新版本中就自带了这样的东西,也就是如今ngui列子中的 Endless

一.写在前面的秋裤 早在去年的去年,我就大肆介绍了2D transform相关内容.看过海贼王的都知道,带D的家伙都不是好惹的,2D我辈尚可以应付,3D的话,呵呵,估计我等早就在千里之外被其霸气震晕了~~ 看看下图女帝的动作以及神情,就可以知道名字带D的家伙的厉害! 最近折腾iPad的一些东西,有一些3D效果的交互.有些事情,总以为是遥远的未来,谁知真正发生的时候说来就来,比如说一颗想结婚的心,又比方说在实际项目中折腾3D transform效果. 然而,虽然以前折腾过3D变换效果(webkit

http://shop.souvr.com/thread-123416-1-1.html 随着3D立体视像.全息影像等技术不断取得突破性进展,国内外越来越多的公司投身3D显示领域,产品层出不穷.3D技术将革命性地影响和改变人们的沟通.工作与生活方式.3D显示技术不仅广泛应用于工业领域.建筑领域.军事领域.医疗.教学.娱乐和公共展示等领域,推动传统信息化的升级,而且其正悄悄地融入个人娱乐与数字家庭的诸多领域,如电影.电视.动画.游戏.通讯.摄影.摄像.购物.互联网等.将带动显示器.电视等行业向3D

以下网页3D案例均为TWaver原创出品,推荐使用Chrome, FireFox, Safari等对WebGL支持良好的浏览器运行.案例排名不分先后,如需Demo,可直接申请试用.   1. 化学元素周期表 六种排列方式,炫酷动画效果,TWaver 3D轻松实现. 演示地址:http://demo.servasoft.com/chemical-table/ 2.DNA螺旋图 DNA3D模型,包含几千个球体(几十万个面),高性能渲染,搭配丰富色彩和光照效果,可用于医疗三维可视化. 演示地址:htt

DNA Sequence Time Limit: 1000MS   Memory Limit: 65536K Total Submissions: 9899   Accepted: 3717 Description It's well known that DNA Sequence is a sequence only contains A, C, T and G, and it's very useful to analyze a segment of DNA Sequence,For exa

transform-style: preserve-3d,translate3d(x,y,z),perspective() 让其倾斜的核心:加perspective(600px)让其动的核心:ransition:all 2.5s ease 0 .section { position: relative; overflow: hidden;    -webkit-transform:perspective(600px) rotateX(180deg);    transform: perspect

最近遇到一些类似3D FPS的game play.针对这里面Player摄像机的运动的问题,随便总结一些东西以备参考.首先,对问题做一些的假设: Player摄像机在多数情况下在场景中的位置是固定的,只在某些时候因为动画而发生平动(当然也会发生转动),多数时候只需要转动. Player摄像机不需要照射到Player的任何部分,也就是Player的角色根本不显示在场景中. 如果Player摄像机拍摄的方向是其自身坐标系的z方向,那么其转动只限于绕自身的x和y轴,且只在一定范围内(比如正负45度).

前几天在项目开发中碰到一个这样的需求,RPG游戏中,特效和动画播放不同步的.假如主角在攻击NPC时,先实例化特效,后播放动画.动画毕竟是有一个时间长度的.等到动画播放攻击挥刀的那一瞬间时,特效可能早就播放完了.于是就想着在动画播放到某一帧的时刻才实例化特效,这样就解决了动画与特效不同步的问题.首先我们要做的是如何给动画添加事件? 1,建立一个空白的Unity工程,导入一个带有动画的模型.

听到过很多用Unity 3D开发游戏的程序员抱怨引擎效率太低,资源占用太高,包括我自己在以往项目的开发中也头疼过.最近终于有了空闲,可以仔细的研究一下该如何优化Unity 3D下的游戏性能.其实国外有不少有关U3D优化的资料,Unity官方的文档中也有简略的章节涉及这方面的内容,不过大多都是以优化美术资源为主,比如贴图的尺寸,模型静态及动态的batch以减少draw call,用lightmap替代动态光影,不同渲染模式在不同环境下的性能等等.鉴于此,加上美术资源方面的东西本人不是特别了解,所以

根据最新需求需要动态的给kvm下的windows虚拟机挂载硬盘,网上查看了很多资料终于试通了,在这里记录下方便自己回忆,同事可以给大家做做参考,如果有问题欢迎吐槽 环境:先说说我使用的环境,环境是使用virsh 依托xml文件创建虚拟机,在xml文件之用配置静态ide硬盘可以识别,但是虚拟机运行时动态attach-device时就无法实时现实出来,下面简单说说的步骤 操作前请参考这篇文章那个内容http://www.cnblogs.com/davygeek/p/4607467.html 系统:w