ChIP-seq数据分析整理 1.Alignment 2.Peak detection 3.Peak annotation 1. GO analysis 2. Pathway analysis 4.Differential analysis 5.Peak gene 6.Pathway analysis 7.Data visualization 1.Alignment base calling——Off-Line Basecaller software (OLB V1.8.0). Solexa C

工作中有个真理:如果你连自己所做的工作的来龙去脉都讲不清楚,那你是绝对不可能把这份工作做好的. 这适用于任何行业.如果你支支吾吾,讲不清楚,那么说难听点,你在混日子,没有静下心来工作. 检验标准:随时向别人解释你的工作,让别人提出尖锐的问题,看你是不是答不上来. 16S概念 什么是16S?S是什么意思? 16S分析是用来干嘛的?能分析什么? 16S大致的分析原理是什么? 有点生物学基础的会知道16S和核糖体有关,但大多数还是搞不清楚它们之间的关系. 先明确一些概念: 核糖体:Ribosome,由

LR性能测试分析流程 一.     判断测试结果的有效性 (1)在整个测试场景的执行过程中,测试环境是否正常. (2)测试场景的设置是否正确.合理. (3)测试结果是否直接暴露出系统的一些问题. (4)确定测试结果有效之后,就要对测试数据进行深入的分析. 二.     分析思路 (1)分析原则:由外到内,由表到里,层层深入.拆分问题,隔离问题: 具体的步骤为:先看summary汇总,再逐步看每个事物,最后在精确的去看网页细分图: (2)对于一个应用系统,性能开始出现了下降,最直观最直接的表象就是

Qiime安装 参考资料:http://blog.sina.com.cn/s/blog_83f77c940101h2rp.html Qiime script官方说明http://qiime.org/scripts/index.html 一般ITS数据简要分析过程 reference下载:https://github.com/downloads/qiime/its-reference-otus/its_12_11_otus.tar.gz 其中97_* 和99_*分别是相似度97和99的refere

前端无秘密 直播的逆向抓取说到底是前端的调试和逆向技术,加上部分的dpa(深入包分析,个人能力尚作不到深入,只能作简单分析)难度较低 目前互联网直播弹幕主要是两种技术实现. 1websocket消息通信,js拿到消息再处理到dom中,逆向验证流程,和服务端建立连接后即可,逆向难度较低,消息分明文和加密两种情况,前端无秘密,加密也能找到解密的js代码.如此实现可直接用nodejs,js相关代码通用,一个比较大的坑是服务端websocket版本不一样,所需依赖socker.io包的版本也不一样,要通

在看深入JVM虚拟机一书(p50,2.4 实战OutOfMemoryError),有一个Java堆溢出的例子,使用到了Eclipse Memory Analyzer插件,由于自己现在使用的是MyEclipse,所以就需要在MyEclipse上添加插件.具体步骤如下: 1.先安装MAT插件 Memory Analyzer 插件下载地址:http://www.eclipse.org/mat/downloads.php 点击进行下载 3.将下载的文件解压到MyEclipse的  dropins  文件

原文链接:http://click.aliyun.com/m/42521/ 摘要: 本文主要通过一个bug来记录一下如何分析一个MySQL bug的崩溃信息. 版本:Percona 5.7.17-11 一.数据库重启日志分析 terminate called after throwing an instance of 'std::out_of_range' what(): ... 本文主要通过一个bug来记录一下如何分析一个MySQL bug的崩溃信息. 版本:Percona 5.7.17-11

Step1:从分析Summary的事务执行情况入手Summary主要是判定事务的响应时间与执行情况是否合理.如果发现问题,则需要做进一步分析.通常情况下,如果事务执行情况失败或响应时间过长等,都需要做深入分析.下面是查看分析概要时的一些原则:(1):用户是否全部运行,最大运行并发用户数(Maximum Running Vusers)是否与场景设计的最大运行并发用户数一致.如果没有,则需要打开与虚拟用户相关的分析图,进一步分析虚拟用户不能正常运行的详细原因:(2):事务的平均响应时间.90%事务最

转自 http://www.cnblogs.com/nb44c/p/5218880.html 1.先安装MAT插件 Memory Analyzer 插件下载地址:http://www.eclipse.org/mat/downloads.php 点击进行下载 3.将下载的文件解压到MyEclipse的  dropins  文件夹下 4.创建和文件夹同名的.link文件,文件中的内容就写上对应的地址(地址使用\\ 或者 /) 5.重启MyEclipse,即可在window---->preferanc

原创: To_run_away 从零开始学linux 本节的开始之前,先看一下uboot的链接脚本. 一.链接脚本 /* * Copyright (c) 2004-2008 Texas Instruments * * (C) Copyright 2002 * Gary Jennejohn, DENX Software Engineering, <garyj@denx.de> * * SPDX-License-Identifier:  GPL-2.0+ */ #include <confi

前言: 之前写Java服务端处理POST请求时遇到了请求体转换成字符流所用编码来源的疑惑,在doPost方法里通过request.getReader()获取的BufferedReader对象内部的 Reader用的是什么编码将字节流转换成字符流的呢?又是在哪里设置呢和什么时候生效的呢?通过查找资料,我了解到通过HttpServletRequest对象获得请求体数据 有三种方法,其中两种是不管HTTP请求头设置Content-Type为何值都能够在不重复获取输入流的前提下获取到数据的,一个是req

1.DEBUG [2017-07-10 11:38:41,705][] org.springframework.web.servlet.DispatcherServlet:865 - DispatcherServlet with name 'dispatcherServlet' processing POST request for [/profit/queryProfitAccountList] 注:spring mvc的的DispatcherServlet dispatcherservlet

思来想去,还是觉得ENCODE的流程靠谱,所以又花了快一周来调试,终于排除万难,跑成功了.[2019年12月08日] 以下是ATAC生成的结果目录: call-align call-call_peak_pooled call-filter call-idr_ppr call-overlap call-pool_ta_pr2 call-spr call-align_mito call-call_peak_ppr1 call-frac_mito call-idr_pr call-overlap_pp

MyBatis 是支持定制化 SQL.存储过程以及高级映射的优秀的持久层框架.MyBatis 避免了几乎所有的 JDBC 代码和手动设置参数以及获取结果集.MyBatis 可以对配置和原生Map使用简单的 XML 或注解,将接口和 Java 的 POJOs(Plain Old Java Objects,普通的 Java对象)映射成数据库中的记录.如何新建MyBatis源码工程请点击MyBatis源码分析-IDEA新建MyBatis源码工程. MyBatis框架主要完成的是以下2件事情: 根据JD

全基因组关联分析流程: 一.准备plink文件 1.准备PED文件 PED文件有六列,六列内容如下: Family ID Individual ID Paternal ID Maternal ID Sex (1=male; 2=female; other=unknown) Phenotype PED文件是空格(空格或制表符)分隔的文件. PED文件长这个样: 2.准备MAP文件 MAP文件有四列,四列内容如下: chromosome (1-22, X, Y or 0 if unplaced) r

[gevent源码分析] 深度分析gevent运行流程 http://blog.csdn.net/yueguanghaidao/article/details/24281751 一直对gevent运行流程比较模糊,最近看源码略有所得,不敢独享,故分享之. gevent是一个高性能网络库,底层是libevent,1.0版本之后是libev,核心是greenlet.gevent和eventlet是亲近,唯一不同的是eventlet是自己实现的事件驱动,而gevent是使用libev.两者都有广泛的应

QQ空间说说抓取难度比较大,花了一个星期才研究清楚! 代码请移步到GitHub GitHub地址:https://github.com/20100507/Qzone [没有加入多线程,希望你可以参与进来加入多线程不过 单个QQ请求频率不可以太高  过多的线程就需要 更多的QQ小号轮流登录] 不要忘了点一个赞 哈哈哈~~ 1.1 截图看一看效果:       1.1抓取执行过程:          1.2 部分数据截图:   1.3 每一个说说的具体内容  1.4 70W说说数据文件大小:    

本文主要通过源码来了解SparkStreaming程序从任务生成到任务完成整个执行流程以及中间伴随的checkpoint操作 注:下面源码只贴出跟分析内容有关的代码,其他省略 1 分析流程 应用程序入口: val sparkConf = new SparkConf().setAppName("SparkStreaming") val sc = new SparkContext(sparkConf) val ssc = new StreamingContext(sc, Seconds(b

在U-boot目录下,有个比较重要的目录就是SPL的,SPL到底是什么呢?为什么要用它呢? SPL(Secondary programloader)是uboot第一阶段执行的代码.主要负责搬移uboot第二阶段的代码到 系统内存(System Ram,也叫片外内存)中运行.SPL是由固化在芯片内部的ROM引导的.我们知道很多芯 片厂商固化的ROM支持从nandflash.SDCARD等外部介质启动.所谓启动,就是从这些外部介质中搬移一段 固定大小(4K/8K/16K等)的代码到内部RAM中运行.