推荐关注微信公众号:AIPuFuBio,和使用免费生物信息学资源和工具AIPuFu:http://www.aipufu.com. [Circular RNA的产生机制] Circular RNA,缩写为circRNA,中文名为环状RNA,属于非编码RNA,是近年的一个重要研究热点. CircRNA主要是通过backsplicing的方式产生,明显不同于线性RNA(linear RNA)经典的5′–3′的模式.因此,circRNA不含有线性RNA的经典结构,如5′端加帽,3′端有poly A尾巴等

CIRI 根据circRNA 连接点处的reads来识别circRNA, 在连接点处的reads 其比对情况非常特殊: CIRI 根据3种模型来识别circRNA, 连接点处的read 叫做junction read A) circRNA 由3个外显子环化形成, 由于测序读长的限制,junction read 只覆盖了起始外显子和终止外显子的部分序列,这两部分reads的比对位置在基因组上的位置是相反的, B) circRNA 由3个外显子环化形成, 由于连接点处的一个外显子其长度太短,junc

find_circ 通过识别junction reads 来预测circRNA 和参考基因组比对完之后,首先剔除和基因组完全比对的reads,保留没比对上的reads, 这部分reads 直接比是比对不上基因组的,因为其来自不同的外显子区域,直接比对的话不允许这么大片段的缺失,那么如何区分剪切的spliced read 和 来自环状RNA的junction read呢,从上面的示意图我们可以直接看出,spliced read 的两部分比对在基因组上的前后位置和转录本中的位置保持一致,而来自cir

生物医学大数据 重点:蛋白质定量 新蛋白可以是全新的蛋白质,也可以是知结构但未知功能的蛋白质,也可以是知道结构有新功能的蛋白质. 新蛋白鉴定可以使用以下方法. 基于基因组,可以基因组中的coding区数据库变成理论上的蛋白质数据库,利用密码子翻译出氨基酸,为准确可以有三种版本,可以敲除1个碱基,2个碱基,3个碱基等,同时考虑正反链因素,就有3*2=6种可能性.基于转录组翻译情况,采用搜索已知蛋白质信息数据库,准确率高.denovo方法,即从头测序的综合比较方法,可信度基于打分值或p-value等

Yii框架中集成分层的 RBAC,代码位于vendor\yiisoft\yii2\rbac中,rbac工作原理分为两部分,建立授权数据和进行权限检查. 如上,一个角色拥有某个权限,如果希望用户拥有这个权限,那么就将拥有该权限的角色赋予给用户,特别是当系统中用户数量非常大的时候,如果需要修改权限只需要修改角色就可以了. 角色和权限都可以按层次组织.特定情况下,一个角色可能由其他角色或权限构成, 而权限又由其他的权限构成. 一个角色可以包含一个权限,反之则不行. 特定的权限,可以用一个规则 rule

1.1 What is Kerberos 1.1.1 简单介绍 Kerberos是一个用于鉴定身份(authentication)的协议, 它采取对称密钥加密(symmetric-key cryptography),这意味着密钥不会在网络上传输.在Kerberos中,未加密的密码(unencrypted password)不会在网络上传输,因此攻击者无法通过嗅探网络来偷取用户的密码. Kerberos利用对称加密和受信任的第三方(即KDC, key distribution center)来鉴别

SSL 通信原理及Tomcat SSL 双向配置 目录1 参考资料 .................................................................................................................................. 12 SSL(Server Socket Layer)简介 .......................................................

敌情篇 ——DDoS攻击原理 DDoS攻击基础 DDoS(Distributed Denial of Service,分布式拒绝服务)攻击的主要目的是让指定目标无法提供正常服务,甚至从互联网上消失,是目前最强大.最难防御的攻击之一. 按照发起的方式,DDoS可以简单分为三类. 第一类以力取胜,海量数据包从互联网的各个角落蜂拥而来,堵塞IDC入口,让各种强大的硬件防御系统.快速高效的应急流程无用武之地.这种类型的攻击典型代表是ICMP Flood和UDP Flood,现在已不常见. 第二类以巧取胜

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前几天在给人解释Windows是如何通过Kerberos进行Authentication的时候,讲了半天也别把那位老兄讲明白,还差点把自己给绕进去.后来想想原因有以下两点:对于一个没有完全不了解Kerberos的人来说,Kerberos的整个Authentication过程确实不好理解--一会儿以这个Key进行加密.一会儿又要以另一个Key进行加密,确实很容易把人给弄晕:另一方面是我讲解方式有问题,一开始就从Kerberos的3个Sub-protocol全面讲述整个Authentication

1.前言 一个安全的信息系统,合法身份检查是必须环节.尤其IM这种以“人”为中心的社交体系,身份认证更是必不可少. 一些PC时代小型IM系统中,身份认证可能直接做到长连接中(也就是整个IM系统都是以长连接为中心:身份鉴权.数据收发.文件传送等等).但当前主流的IM(尤其新一代的移动端IM)中,都是“长”(指TCP或UDP长连接).“短”(是指Http短连接)相结合的方式. 一个现代的移动端IM“长”.“短”连接配合内容大致如下: 1)短连接用途1:前置HTTP的SSO单点接口来实现身份认证: 2

一.实验内容 1.1 正确使用msf编码器(0.5分),msfvenom生成如jar之类的其他文件(0.5分),veil-evasion(0.5分),加壳工具(0.5分),使用shellcode编程(1分) 1.2 通过组合应用各种技术实现恶意代码免杀(0.5分)(如果成功实现了免杀的,简单语言描述原理,不要截图.与杀软共生的结果验证要截图.) 1.3 用另一电脑实测,在杀软开启的情况下,可运行并回连成功,注明电脑的杀软名称与版本(加分0.5) 二.基础问题回答 (1)杀软是如何检测出恶意代码的

参考: http://www.barretlee.com/blog/2015/10/05/how-to-build-a-https-server/ 今天摸索了下 HTTPS 的证书生成,以及它在 Nginx 上的部署.由于博客托管在 github 上,没办法部署证书,先记录下,后续有需要方便快捷操作.本文的阐述不一定完善,但是可以让一个初学者了解大致的原理,同时跟着操作可以为自己的博客/网站部署一个 HTTPS 证书. 网站部署 HTTPS 的重要性 看看下面,部分电信用户访问京东首页的时候,会

circRNA 最初研究的很少,只有很小一部分基因有检测到circRNA, 当时都认为是剪切错误形成的,对于其功能也没人去研究:学者对人类的成纤维细胞进行转录组测序,构建去核糖体文库, 同时采用了RNase酶消化线性RNA 和 不消化线性RNA的两种文库,同时检测circRNA , 最终检测到了25000 多种circRNA ,这些circRNA 来源于exon 区, 叫做 ecircRNA, 保守估计,有14%的基因都产生了circRNA. 利用同样的方法,在小鼠睾丸组织中,鉴定到了69种和人

摘 要: 多位点序列分型(MLST)是一种基于核酸序列测定的细菌分型方法,通过PCR扩增多个管家基因内部片段,测定其序列,分析菌株的变异,从而进行分型.MLST被广泛应用于病原菌.环境菌和真核生物中.与传统分子生物学分型方法相比,MLST操作简单,具有更高的分辨力,能将同种细菌分为更多的亚型,并确定不同ST型之间的系统发育关系以及与疾病的联系. 关键词: 多位点序列分型   多位点序列分型(Multilocus sequence typing,MLST)是一种基于核酸序列测定的细菌分型方法,通过

众所周知,JavaScript是一门弱类型的语言,但是这并不代表JavaScript中没有数据类型.JavaScript中常见的数据类型有string.number.object等等,通常我们使用typeof操作符来判断一个变量值的数据类型:但是由于许多问题的存在,往往出现一些出人意料的坑,或者我们无法得到具体的令人满意的答案,所以我们需要自己实现一些函数,用于鉴定各种数据类型,并且得到的结果要符合我们的常识,underscore就实现了一系列这样的函数. 1.数组(Array)的鉴定 如果我们

http://blog.csdn.net/ronintao/article/details/51649664 参考 1.Common Techniques to Improve Shadow Depth Maps 2.Tutorial 16 : Shadow mapping 3.Shadow Mapping 4.Shadow Mapping Algorithms 5.Shadow Map阴影贴图技术之探 6.Cascaded Shadow Maps 写在前面 之前已经很久没有再更新博客,上一篇已

Exp3 免杀原理与实践 目录 一.实验内容 二.基础问题回答 (1)杀软是如何检测出恶意代码的? (2)免杀是做什么? (3)免杀的基本方法有哪些? 三.实践过程记录 正确使用msf编码器,msfvenom生成如jar之类的其他文件,veil-evasion,自己利用shellcode编程等免杀工具或技巧: 通过组合应用各种技术实现恶意代码免杀 用另一电脑实测,在杀软开启的情况下,可运行并回连成功,注明电脑的杀软名称与版本 四.实验总结与体会 五.开启杀软能绝对防止电脑中恶意代码吗? 一.实验

转载:http://www.oebiotech.com/Article/mirnabjyyc.html http://www.ebiotrade.com/newsf/2014-9/201492594150379.htm miRNA自从被发现以来,一直备受关注,俨然已成为非编码RNA家庭中永不凋零的“玫瑰”.关于miRNA,主要有两个研究方向,其一是作为biomarker,这方面研究仅需足够庞大的临床样本支撑即可:miRNA的另一研究方向为功能机制研究,此时必须有miRNA靶基因的参与,可是如何确

前几天在给人解释Windows是如何通过Kerberos进行Authentication的时候,讲了半天也别把那位老兄讲明白,还差点把自己给绕进去.后来想想原因有以下两点:对于一个没有完全不了解Kerberos的人来说,Kerberos的整个Authentication过程确实不好理解——一会儿以这个Key进行加密.一会儿又要以另一个Key进行加密,确实很容易把人给弄晕:另一方面是我讲解方式有问题,一开始就从Kerberos的3个Sub-protocol全面讲述整个Authentication