查找DICOM基础知识时,看到这篇文章里面写了一些关于使用深度学习进行医疗影像分析:文件格式篇.下文摘自:https://www.jiqizhixin.com/articles/2017-07-31 医疗数据组成: 医疗数据有四个关键的组成部分--像素深度.光度解释.元数据以及像素数据.这几部分决定了图像的大小和分辨率. 像素深度(Pixel Depth)或者位深度(Bit Depth)或者色深度(Color Depth)就是用来编码每一像素的信息所用的位数.例如,一个 8 位的栅格会拥有从 0

转自莫毕业 目前,脑成像数据主要有DTI.fmri.3D三种模态.这些数据在分析前都要进行格式转换,不同公司的扫描仪存储格式也不尽相同.脑成像处理软件也很多,不同软件使用的格式也不一样,所以数据转换是脑成像数据处理的第一步,必须非常清楚.这里主要以siemens的机器为准,介绍在windowx下的MRIcron的dcm2nii转换和MRIConvert转换. 从扫描中心下载的原始数据是以dicom数据格式存在的压缩文件,解压后,得到原始文件.来自siemens的扫描仪的原始文件以“IMA”下为后

医疗图像解析 Dicom 后缀: .dcm..DCM Dicom中规定的坐标系是以人坐标系为绝对坐标系的,规定X轴正向指向病人的左侧,Y轴正向指向病人的背部,Z轴正向指向病人的头部.但是,坐标点的位置,每个厂商都有自己的看法 下图展示了成像过程中对应的坐标系 成像坐标系 三视图 图片信息中的Tag说明 在DICOM中,是通过Image Position和Image Orientation来描述当前的图像和人体坐标系的相对位置的. 解析举例 import dicom import pylab im

在DICOM标准里,有三个TAG与成像的方向相关. 参考来源:Kitware关于DICOM方向的说明 http://public.kitware.com/IGSTKWIKI/index.php/DICOM_data_orientation 包括 1.Image Position (0020,0032): specifies the x, y, and z coordinates of the upper left hand corner of the image. In other words,

1.定位线概念:某个方位的影像在另一个方向的影像上的投影相交线,例如横断面(从头到脚的方向)在矢状面(从左手到右手)上的影像投影面交线. 举个例子:右边的是MR(核磁共振)的某一帧切片,这是从头开始扫描,扫描到眼睛这个位置, 而左边图像是从左手到右手的扫描切片,那么右边图像的位置就恰好在左边图像的眼睛的位置,用红线标出的位置则为定位线, 一般用于医生参考病灶在矢状面.冠状面和横断面的具体方位. 2.检查设备示意图 在笛卡尔空间直角坐标系中,Y 右肩膀到左肩膀,X 后背到前胸,Z 足到头 3.算法

前言 在我的另一篇博文 Canvas坐标系转换 中,我们知道了所有的平移缩放旋转操作都会影响到画布坐标系.那在我们对画布进行了一系列操作之后,怎么再知道当前矩阵数据状态呢. 具体代码 首先请看下面的一段代码(下文具体解释代码作用): window.TrackTransform = function () { var svg = document.createElementNS("http://www.w3.org/2000/svg", 'svg'); var xform = svg.c

默认坐标系与当前坐标系 canvas中的坐标是从左上角开始的,x轴沿着水平方向(按像素)向右延伸,y轴沿垂直方向向下延伸.左上角坐标为x=0,y=0的点称作原点.在默认坐标系中,每一个点的坐标都是直接映射到一个CSS像素上. 但是如果图像的每次绘制都参考一个固定点将缺少灵活性,于是在canvas中引入“当前坐标系”的概念,所谓“当前坐标系”即指图像在此时绘制的时候所参考的坐标系,它也会作为图像状态的一部分.比如rotate旋转操作,改变当前坐标系也就是改变了rotate的参考点,试想下如果没有当

接下来可以进行消息传递了 ,也就是dimse ,再来复习下 什么是dimse .n-set  n-create c-echo 这些都是dimse  他们都是属于一种结构的pdu 那就是tf-pdu(传输数据和命令的都称之为tf-pdu 或者transfer pdu ,协商连接的都称之为associcate pdu) .dimse 由 许多tag组成,就像文件解析那篇博文一样.tf-pdu数据结构分析如下: 如果你又要问此图是怎么来的 ,dicom标准第八章 33页.你可能又要问 dimse又是什

第二篇,前面都是闲扯 其实正文现在才开始,这次是把压箱底的东西都拿出来了. 首先我们今天要干的事是实现一个echo响应测试工具 也就是echo 的scu,不是实现打印作业管理么.同学我告诉你还早着呢.本来标题取的就是<dicomviewer 第二弹 之 实现打印管理>名字多霸气,最后我又改回来了. 首先你得把数据组织方式搞懂 那就是pdu  和dimse  元素  数据元素.然后基于这之上你得把协商连接这块搞懂 ,协商连接都没通过不用说后面的了.然后你得把实现一个功能 比如打印 ,scu跟sc

看标准 越看越糊,根本原因:dicom抽象得非常严重,是“专家”弄的.没办法. 又是什么服务类 又是什么sop,相信你把dicom标准看到头大 都不知如何下手. 不就是 socket么 这有何难. 首先你得理解神马叫pdu,从pdu入门 ,我只能这么说了.pdu就是pdu  protocol data unit   反正就是这么个概念  你把它理解为socket数据包就行了.他的结构是开始1字节是pdu类型 然后一字节始终是0 ,然后是4字节 表示数据长度 然后是指定长度的数据. 简图: 然后专

本文主要讲述dicom标准及dicom通讯的工作方式.dicom全称医学数字图像与通讯 其实嘛就两个方面 那就是“存储”跟“通讯”. 文件数据组织方式  网络数据组织方式.文件数据组织方式就是解析静态的dicom文件 在 <dicom格式文件解析器>一文中已经阐述过了 就不再说了.网络数据组织方式 简而言之就是各种协议 命令控制 数据序列化.那么这一章中我们将会讲他,但是进行实际操作将在后面几章. 又一篇详尽的Dicom协议介绍: http://blog.csdn.net/zssureqh/a

这三个坐标系统是当前国内较为常用的,它们均采用不同的椭球基准.其中北京54坐标系,属三心坐标系,大地原点在苏联的普而科沃,长轴6378245m,短轴6356863,扁率1/298.3:西安80坐标系,属三心坐标系:国家80坐标系,大地原点在陕西省径阳县永乐镇,长轴6378140m,短轴6356755,扁率1/298.25722101:WGS84坐标系为协议地球坐标参考系,长轴6378137.000m,短轴6356752.314,扁率1/298.257223563.由于采用不一样的椭球基准,所以转

在OpenGL中,存在着至少存在着三种矩阵,对应着函数glMatrixMode()的三个参数:GL_MODELVIEW,GL_PROJECTION,GL_TEXTURE. 以下主要描述GL_MODELVIEW(模型视图矩阵)的个人理解. 在OpenGL中空间中点的三维坐标是使用行向量表示的,虽然与列向量相比存储结构并没有发生变化,但在坐标变换(即矩阵乘法)中会有很大不同.大家都知道一个4X4的矩阵可以表示三维坐标的平移,旋转变换.例如一矩阵R表示一个旋转加平移变换,空间中一点P(x, y, z)

在遥感行业我们经常会用到各类的坐标系相互之间的转换,常见的度分秒转化为度很简单,直接上代码: //经纬度 ////118度48分54.152秒=118+(48/60)+(54.152/3600)=118.81504度 public static string GetLongLatByDMS(byte Deg, byte Mis, byte Sec) { decimal result = Convert.ToInt32(Deg) + (Convert.ToDecimal(Mis) / 60) +

将编译好的qgis库整理,屏蔽获取删除环境变量中的路径,测试qgis.exe程序功能 如出现如上提示: 原因:是未找到qgis.db文件,无法拷贝到系统默认的C:/Users/Administrator/.qgis2//gdal_pam中的.qgis2文件夹中: 解决:找到源码中的resource文件夹,拷贝到qgis.exe同级目录 这个问题会造成一系列与sqlite3.dll数据库有关的功能,例如:自定义坐标系设置无效,添加有坐标系的地图没有效果等,按上述方法可解决!

Proj.NET ( http://projnet.codeplex.com/)是一个.NET下开源的空间参照和投影引擎,遵循OGC相关标准.负责人(Coordinators )是D_Guidi 和SharpGIS,开发者(Developers)还有codekaizen.rstuven等,这些人也是.NET下其他的开源系统如GeoAPI.NET.SharpMap等主要贡献者.License: GNU Library General Public License (LGPL). Proj.NET支

config.xml文件的配置如下: <widget left="3" bottom="3" config="widgets/Coordinate/CoordinateWidget.xml" url="widgets/Coordinate/CoordinateWidget.swf" /> 源代码目录如下: 地图坐标系模块的源代码原理解析,详细的代码在下载的开源flexviewer自带的: (1)Coordinate

http://my.oschina.net/fankun2013/blog/338100 地图供应商比较多,产生了许多地图坐标.地图坐标正确转换是个问题.在之前开发地图应用的时候发现从WGS84坐标系(GPS)转换成某个地图坐标系都比较困难.然后只能使用地图供应商提供的webservice接口转换.百度也提供了免费的webservice接口(限制并发量).对于少数点的转换性能还可以,但是对于非常多点的转换压力比较大(使用多线程并行计算).个人感觉比较繁琐,而且很难保证转换的稳定性. 时间飞逝,百

 iOS开发中的火星坐标系及各种坐标系转换算法 源:https://my.oschina.net/u/2607703/blog/619183   其原理是这样的:保密局开发了一个系统,能将实际的坐标转换成虚拟的坐标.所有在中国销售的数字地图必须使用这个系统进行坐标转换之后方可上市.这是生产环节,这种电子地图被称为火星地图.在使用环节,GPS终端设备必须集成保密局提供的加密算法(集成工作由保密局完成),把从GPS卫星那里得到的坐标转换成虚拟坐标,然后再去火星地图上查找,这样就在火星坐标系上完成了地

[Unity3D的四种坐标系] 1.World Space(世界坐标):我们在场景中添加物体(如:Cube),他们都是以世界坐标显示在场景中的.transform.position可以获得该位置坐标. 2.Screen Space(屏幕坐标):以像素来定义的,以屏幕的左下角为(0,0)点,右上角为(Screen.width,Screen.height),Z的位置是以相机的世界单位来衡量的.注:鼠标位置坐标属于屏幕坐标,Input.mousePosition可以获得该位置坐标,手指触摸屏幕也为屏幕