转自:https://zhidao.baidu.com/question/2052933434631672387.html 1.解释 解释:表达值倍数变化 ,分析,消除可能的混杂因素,必要时可以用读段 的绝对表达值倍数变化(fold-change)来作为补充. Fold change 用于描述一个初始值到一个最终值的变化程度. 1.例如,若初始值为30,最终值为60,则相应的fold change为2,或者可以描述为一个2折的增长.fold change仅仅靠最终值与初始值的比率计算即可得到.

基因表达谱数据 基因表达谱可以用一个矩阵来表示,每一行代表一个基因,每一列代表一个样本(如图1).所有基因的表达谱数据在“gene_exp.txt”文件中存储,第一列为基因的entrez geneid,第2~61列是疾病样本的表达,第62~76列是正常样本的表达. 图1 基因表达谱的矩阵表示 寻找差异表达的基因: 原理介绍: 差异表达分析是目前比较常用的识别疾病相关miRNA以及基因的方法,目前也有很多差异表达分析的方法,但比较简单也比较常用的是Fold change方法.它的优点是计算简单直观

在做基因表达分析时必然会要做差异分析(DE) DE的方法主要有两种: Fold change t-test fold change的意思是样本质检表达量的差异倍数,log2 fold change的意思是取log2,这样可以可以让差异特别大的和差异比较小的数值缩小之间的差距. Let's say there are 50 read counts in control and 100 read counts in treatment for gene A. This means gene A is

fold change 英文简称 : FC 中文全称 : 倍性变化 所属分类 : 生物科学 词条简介 : 一种用于描述两个用于相比的对象数量差异的方法.例如,第一个样本和第二个样本的量是50/10,那么FC(Ratio)就是5,反之就是0.2. 用这种方法分析微阵列的数据可以说明: 1)从基因表达的绝对值而来的表达变化是有意义的: 2)这种方法可以说明基因表达变化是否显著: 3)可以利用这种模型用于有效数据的筛选.

4.(2021.6.24)Briefings-生物信息学中的图表示学习:趋势.方法和应用 论文标题: Graph representation learning in bioinformatics: trends, methods and applications 论文期刊: Briefings in Bioinformatics 2021 论文地址: https://www.researchgate.net/profile/Haicheng-Yi/publication/354327323_G

需求说明 有多个switch组件 需要知道switch的状态 表格中当前行(scope.row)的数据 问题描述 官方文档中对switch中change的描述: 目前能得到switch的状态值,但是无法得到change回调中第二个形参的值 解决方法: change回调函数默认形参的实参是$event,其它的实参传自己需要的数据就ok

change buffer是一种特殊的数据结构,当要修改的辅助索引页不在buffer pool中时,用来cache对辅助索引页的修改.对辅助索引页的操作可能是insert.update和delete操作.等到相关的索引页被读入buffer pool中后,才会使用change buffer中的内容对辅助索引页进行修改(即merge操作). 和聚集索引不同,辅助索引通常是不唯一的,插入辅助索引通常也是随机的.同样,对辅助索引的删除.更新也通常是不连续的. 等到相关的索引页被读入buffer pool

注:从进入生信领域到现在,已经过去快8年了.生物信息学包含了我最喜欢的三门学科:生物学.计算机科学和数学.但是如果突然问起,什么是生物信息学,我还是无法给出一个让自己满意的答案.于是便有了这篇博客. 起源 据说在1970年,荷兰科学家Paulien Hogeweg和Ben Hesper最早在荷兰语中创造了"bioinformatica"一词,英语中的"bioinformatics" 在1978年首次被使用.这两位科学家当时使用该词来表示: The study of

大家好,本周分享的是发表在MCP上的一篇关于鸟枪蛋白质组学中的错误率的文章,题目是Integrated identification and quantification error probabilities for shotgun proteomics,作者是瑞典皇家理工学院的Matthew The 和Lukas Kall. 鸟枪法蛋白质组学中蛋白的无标定量存在诸多误差.蛋白的鉴定就是其中的一个来源.然而人们经常忽略某些错误源,且在后续步骤中认为过滤得到的列表是完全正确的,这两个错误的累加很

枚举 将一组有限集合创建为一种新的类型,集合里面的值可以作为程序组件使用: 枚举基本特性 以下代码是枚举的简单使用: 使用values方法返回enum实例的数组 使用ordinal方法返回每个enum实例的次序,从0开始 使用compareTo方法比较两个enum实例 使用==来比较enum实例 使用getDeclaringClass方法返回enum实例所属的enum类 使用valueOf方法根据指定的名字返回enum实例 package enumerated; enum Shrubbery {

今天在浏览博文时,看到这篇文章:C#中的ref 传进出的到底是什么 ? 在传对象时使用ref的疑问 另附言: 本文写于早上,就在想发布的那瞬间,靠,公司断网了,原来修改的部分丢失了. 网一断就是一天了,现在回到家才把之发布. 一直我们都知道,引用类型就传的就是地址,值类型传的就是值,可是还仍有那么多人迷惑,网上虽然流传着很多ref 的相关文章,似乎都没为大伙解下惑. 最近有人在看我 CYQ.Data 框架 的时候说起,既然class是引用地址,本身传的就是地址,你代码中还要写ref传递来干什么;

jquery中的attr和prop有什么区别? To retrieve and change DOM properties such as the checked, selected, or disabled state of form elements, use the .prop() method. 根据官方的建议:具有 true 和 false 两个属性的属性,如 checked, selected 或者 disabled 使用prop(),其他的使用 attr(). 设置check等属性

最近开始使用vue做项目 在这个过程中,碰到了大多数做前端肯定经历的一个问题,就是文件上传预览 花了点时间解决,因此分享一下预览功能的解决方案 页面: <div class="select"> <input type="file" id="filed" hidden="" @change="filePreview"> //@change是vue中的用法,相当于原生的onchange

原文地址:http://blog.csdn.net/whmii/article/details/3363667 变量赋值和参数传递是java中两个容易让人迷惑的问题.对于原始类型(primitives type),java采用值传递,这很明显.然而,当传递的参数类型是对象时,或者两个对象的变量进行赋值时,问题就有些复杂,很多初学者对此感到迷惑.实际上,当赋值或者传递参数的时候,Java采取的都是一种值传递.在下面的代码中, class A{ int i=2; } class B{ static 

1.取得控件值 using System.Collections.Generic; //取得当前控件值的集合 直接寻找控件的ID List<object> keyValues = this.GridViewmethod.GetSelectedFieldValues("F_XXX");//控件的ID foreach (object key in keyValues)//循环遍历出来 { } 2.在AspGridView取得某一行 List<object> keyV

LoadRunner中常用的字符串操作函数有:                strcpy(destination_string, source_string);               strcat(string_that_gets_appended, string_that_is_appended);51Testing软件测试网:J3~c:c[(wR%A2l               atoi(string_to_convert_to_int); //returns the integ

虽然已经使用MySQL5.6版本有一段时间了,但由于没有和之前的版本作过详细比较,所以对于哪些重要的或者不太重要的特性是在新版本中引入的,还有哪些特性已经或者将要从旧版本中移除的并没有一个十分全面的了解.最近有一个将某数据库实例由5.5升级为5.6的需求,所以对于MySQL5.6和5.5版本之间的差异做了一个简单梳理.   新增     Security improvements.           可使用mysql_config_editor将登陆认证信息以加密方式保存在.mylogin.c

项目中有发送消息功能,需要能通过搜索,多选用户,来指定发送人.使用 select2 插件来完成. select2 的 html 代码如下: <div class="form-group" id="member_group"> <label class="col-lg-3 control-label required">选择用户 <span class="required">*</spa

这里总结了一些在 Dart 中常用的数组操作方法,以便查阅. 首先,我们准备两组数据,以方便后面使用: List<Map> students = [ { 'name': 'tom', 'age': 16 }, { 'name': 'jack', 'age': 18 }, { 'name': 'lucy', 'age': 20 } ]; List numbers = [2, 8, 5, 1, 7, 3]; 本文中用到的 students 及 numbers 均指的是这里已经定义好的,后面不再重复

今天在浏览博文时,看到这篇文章:C#中的ref 传进出的到底是什么 ? 在传对象时使用ref的疑问 引用类型就传的就是地址,值类型传的就是值,可是还仍有那么多人迷惑,网上虽然流传着很多ref 的相关文章,似乎都没为大伙解下惑. 最近有人在看我 CYQ.Data 框架 的时候说起,既然class是引用地址,本身传的就是地址,你代码中还要写ref传递来干什么; 贴出来做示例:   /// <summary>     /// by 路过秋天 http://cyq1162.cnblogs.com