fold change(ratio)
英文简称 : FC
中文全称 : 倍性变化
所属分类 : 生物科学
词条简介 : 一种用于描述两个用于相比的对象数量差异的方法。例如,第一个样本和第二个样本的量是50/10,那么FC(Ratio)就是5,反之就是0.2。
用这种方法分析微阵列的数据可以说明:
1)从基因表达的绝对值而来的表达变化是有意义的;
2)这种方法可以说明基因表达变化是否显著;
3)可以利用这种模型用于有效数据的筛选。
fold change(ratio)的更多相关文章
- 差异基因分析:fold change(差异倍数), P-value(差异的显著性)
在做基因表达分析时必然会要做差异分析(DE) DE的方法主要有两种: Fold change t-test fold change的意思是样本质检表达量的差异倍数,log2 fold change的意 ...
- Fold Change和t分布
基因表达谱数据 基因表达谱可以用一个矩阵来表示,每一行代表一个基因,每一列代表一个样本(如图1).所有基因的表达谱数据在“gene_exp.txt”文件中存储,第一列为基因的entrez geneid ...
- fold change的意义[转载]
转自:https://zhidao.baidu.com/question/2052933434631672387.html 1.解释 解释:表达值倍数变化 ,分析,消除可能的混杂因素,必要时可以用读段 ...
- cuffdiff 和 edgeR 对差异表达基因的描述
ASE又走到了关键的一步 要生成能决定是否有差异表达的table. 准备借鉴一下cuffdiff和edgeR 的结果 cuffdiff对差异表达基因的描述: 一共十四列: 第一列, test_id ...
- DEXSeq
1)Introduction DEXSeq是一种在多个比较RNA-seq实验中,检验差异外显子使用情况的方法. 通过差异外显子使用(DEU),我们指的是由实验条件引起的外显子相对使用的变化. 外显子的 ...
- Analyzing Microarray Data with R
1) 熟悉CEL file 从 NCBI GEO (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE24460)下载GSE24460. 将得到 ...
- airway之workflow
1)airway简介 在该workflow中,所用的数据集来自RNA-seq,气道平滑肌细胞(airway smooth muscle cells )用氟美松(糖皮质激素,抗炎药)处理.例如,哮喘患 ...
- DESeq2包
1)简介: DESeq2-package: for differential analysis of count data(对count data 做差异分析) 2)安装 if("DESeq ...
- TCGA系列--GDCRNATools
https://github.com/Jialab-UCR/GDCRNATools GDCRNATools - An R package for downloading, organizing, an ...
随机推荐
- zf-关于被发牌人没有显示环节的那个被发牌人的解决办法
是存储过程里的字段没有插入进去,添加个presonName即可--修改的时候可以执行 dbo.dingshi_fapai 来进行存储 如果添加presonName 必须在临时表里加上这个字段,然后在进 ...
- URL 传+号到后台变空格问题解决方案
今天巧合遇到这个问题,下面是网上找的解决方案. 原文:http://blog.sina.com.cn/s/blog_a0949eec01010xta.html 今天在调试客户端向服务器传递参数时,参数 ...
- Scroll View 深入
转载自:http://mobile.51cto.com/hot-430409.htm 可能你很难相信,UIScrollView和一个标准的UIView差异并不大,scroll view确实会多一些方法 ...
- [转]android中解析后台返回的json字符串
普通形式的:服务器端返回的json数据格式如下: {"userbean":{"Uid":"100196","Showname&qu ...
- (转)C++中返回对象的情形及RVO
http://www.cnblogs.com/xkfz007/archive/2012/07/21/2602110.html 之前有文章介绍过临时对象和返回值优化RVO方面的问题.见此处. 在C++中 ...
- ERROR security.UserGroupInformation
[java] 15/11/14 12:58:19 WARN mapred.JobClient: Use GenericOptionsParser for parsing the arguments. ...
- 开发板S3C2440挂起NFS步骤
第一.安装.配置.启动FTP.SSH或NFS服务 参考韦东山的嵌入式linux应用开发完全手册 http://pan.baidu.com/s/1o79h3n0 第二.windows.linux以及开发 ...
- Android Studio的使用(四)--生成Get、Set方法
如何快速生成Get.Set方法,在我们编程中经常使用,下面将详细介绍. 1.右击代码编辑区域,并选择Generate. 2.在弹出框中选择Getter and Setter. 3.在弹出框中全选所有变 ...
- PAT 天梯赛 L1-009 N个数求和
模拟题 题目链接 题解 每次将两个分数进行相加,到最后再将结果化成带分数.主要考察的最大公约数与最小公倍数. 代码如下: #include<cstdio> #include<cstd ...
- 如何理解java的引用传递
1. 数组的引用传递 public class TestArray { public static void changeAry1(int[] ary){ int[] ary1 = {9,9,9}; ...