fold change(ratio)
英文简称 : FC
中文全称 : 倍性变化
所属分类 : 生物科学
词条简介 : 一种用于描述两个用于相比的对象数量差异的方法。例如,第一个样本和第二个样本的量是50/10,那么FC(Ratio)就是5,反之就是0.2。
用这种方法分析微阵列的数据可以说明:
1)从基因表达的绝对值而来的表达变化是有意义的;
2)这种方法可以说明基因表达变化是否显著;
3)可以利用这种模型用于有效数据的筛选。
fold change(ratio)的更多相关文章
- 差异基因分析:fold change(差异倍数), P-value(差异的显著性)
在做基因表达分析时必然会要做差异分析(DE) DE的方法主要有两种: Fold change t-test fold change的意思是样本质检表达量的差异倍数,log2 fold change的意 ...
- Fold Change和t分布
基因表达谱数据 基因表达谱可以用一个矩阵来表示,每一行代表一个基因,每一列代表一个样本(如图1).所有基因的表达谱数据在“gene_exp.txt”文件中存储,第一列为基因的entrez geneid ...
- fold change的意义[转载]
转自:https://zhidao.baidu.com/question/2052933434631672387.html 1.解释 解释:表达值倍数变化 ,分析,消除可能的混杂因素,必要时可以用读段 ...
- cuffdiff 和 edgeR 对差异表达基因的描述
ASE又走到了关键的一步 要生成能决定是否有差异表达的table. 准备借鉴一下cuffdiff和edgeR 的结果 cuffdiff对差异表达基因的描述: 一共十四列: 第一列, test_id ...
- DEXSeq
1)Introduction DEXSeq是一种在多个比较RNA-seq实验中,检验差异外显子使用情况的方法. 通过差异外显子使用(DEU),我们指的是由实验条件引起的外显子相对使用的变化. 外显子的 ...
- Analyzing Microarray Data with R
1) 熟悉CEL file 从 NCBI GEO (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE24460)下载GSE24460. 将得到 ...
- airway之workflow
1)airway简介 在该workflow中,所用的数据集来自RNA-seq,气道平滑肌细胞(airway smooth muscle cells )用氟美松(糖皮质激素,抗炎药)处理.例如,哮喘患 ...
- DESeq2包
1)简介: DESeq2-package: for differential analysis of count data(对count data 做差异分析) 2)安装 if("DESeq ...
- TCGA系列--GDCRNATools
https://github.com/Jialab-UCR/GDCRNATools GDCRNATools - An R package for downloading, organizing, an ...
随机推荐
- 使用JQuery结合HIghcharts实现从后台获取JSON实时刷新图表
项目做了一个报表,可以实时的观察呼叫中心的电话访问量,之前的版本是使用JFreechart做的,使用一段时间后出现内存溢出,服务器的内存使用量会变得很大,所以改用Ajax前台加载数据的方式实现实时报表 ...
- Mercurial hg web server的配置
在windows下安装tortoisehg-1.0.3-hg-1.5.3-x64.exe的版本控制工具后,克隆建立中心库后,启动web server,其他分库可以连接中心库进行pull但无法push. ...
- 把自己的电脑做服务器发布tomcat的项目外网访问
1.首先你要确定你有一个外网ip地址.如果你分配到的是一个局域网IP地址需要经过一系列的转换为外网ip地址,然后继续下面操作. 2.拿到外网IP地址,进行tomcat的server.xml文件的配置. ...
- IE6 7 父级元素的overflow:hidden 是包不住子级的relative
<!DOCTYPE html> <html> <head> <meta charset="utf-8"> <title> ...
- this.button1.Click += new System.EventHandler(this.button1_Click);
在这个程序里,这里的修改是为了更好理解,当然这种写法是语法错误的. 下面我们对其进行分析: 首先,观察“=”右面的表达式. new System.EventHandler(this.button1_C ...
- openssl windows编译 32位&64位
openssl版本:openssl-1.0.0k 64位编译 1.编译环境: openssl-1.0.0a必须用vs2008编译(Open Visual Studio 2008 x64 Cross T ...
- ds18b20再硬件设计部分的注意事项
1.DS18B20的供电方式: ps:寄生电源不是实际的电源器件,而是一种供电方式,即通过数据线供电. 如下面的两张图片所示,分别为外部供电模式下单只和多只DS18B20测温系统的典型电路连接图. ( ...
- LB 高可扩展性集群(负载均衡集群)
一.什么是负载均衡 首先我们先介绍一下什么是负载均衡: 负载平衡(Load balancing)是一种计算机网络技术,用来在多个计算机(计算机集群).网络连接.CPU.磁盘驱动器或其他资源中分配负载, ...
- IT人常用的网站
一.网页设计类 蓝色理想 http://www.blueidea.com 网页设计师联盟 http://www.68design.net 网页设计大本营 http://www.code-123.com ...
- UIScroll和UIPickView
.h #import <UIKit/UIKit.h> #define WIDTH self.view.frame.size.width #define HEIGHT self.view.f ...