fold change(ratio)
英文简称 : FC
中文全称 : 倍性变化
所属分类 : 生物科学
词条简介 : 一种用于描述两个用于相比的对象数量差异的方法。例如,第一个样本和第二个样本的量是50/10,那么FC(Ratio)就是5,反之就是0.2。
用这种方法分析微阵列的数据可以说明:
1)从基因表达的绝对值而来的表达变化是有意义的;
2)这种方法可以说明基因表达变化是否显著;
3)可以利用这种模型用于有效数据的筛选。
fold change(ratio)的更多相关文章
- 差异基因分析:fold change(差异倍数), P-value(差异的显著性)
在做基因表达分析时必然会要做差异分析(DE) DE的方法主要有两种: Fold change t-test fold change的意思是样本质检表达量的差异倍数,log2 fold change的意 ...
- Fold Change和t分布
基因表达谱数据 基因表达谱可以用一个矩阵来表示,每一行代表一个基因,每一列代表一个样本(如图1).所有基因的表达谱数据在“gene_exp.txt”文件中存储,第一列为基因的entrez geneid ...
- fold change的意义[转载]
转自:https://zhidao.baidu.com/question/2052933434631672387.html 1.解释 解释:表达值倍数变化 ,分析,消除可能的混杂因素,必要时可以用读段 ...
- cuffdiff 和 edgeR 对差异表达基因的描述
ASE又走到了关键的一步 要生成能决定是否有差异表达的table. 准备借鉴一下cuffdiff和edgeR 的结果 cuffdiff对差异表达基因的描述: 一共十四列: 第一列, test_id ...
- DEXSeq
1)Introduction DEXSeq是一种在多个比较RNA-seq实验中,检验差异外显子使用情况的方法. 通过差异外显子使用(DEU),我们指的是由实验条件引起的外显子相对使用的变化. 外显子的 ...
- Analyzing Microarray Data with R
1) 熟悉CEL file 从 NCBI GEO (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE24460)下载GSE24460. 将得到 ...
- airway之workflow
1)airway简介 在该workflow中,所用的数据集来自RNA-seq,气道平滑肌细胞(airway smooth muscle cells )用氟美松(糖皮质激素,抗炎药)处理.例如,哮喘患 ...
- DESeq2包
1)简介: DESeq2-package: for differential analysis of count data(对count data 做差异分析) 2)安装 if("DESeq ...
- TCGA系列--GDCRNATools
https://github.com/Jialab-UCR/GDCRNATools GDCRNATools - An R package for downloading, organizing, an ...
随机推荐
- java thread park
http://agapple.iteye.com/blog/970055 apidoc中说,park/unpark用来阻塞/激活线程,但是没有弃用方法suspend/resume的缺点,suspend ...
- UITextField和UIViewConteoller
UITextField控件 UITextFiled常用属性和方法 UITextField是常用的文本输入控件,比如我们用的QQ的登录界面,词典输入要查询的单词都使用了文本框控件,如下图所示.之前介 ...
- hibernate--一对多单向关联 (重点!!!)
多对一是在多的类上存在一的对象 一对多是在一的类上存在多的集合. 多的类 user.java: package com.bjsxt.hibernate; import javax.persistenc ...
- iOS开发——实时监控网速(仅作参考,发现一点问题)
开发中用到获取网速的地方,应该就两种: 1.下载速度,这种可以直接在接受数据的地方统计计算.这个就不讲了. 2.获取手机网卡的数据,可以监控网卡的进出流量,下面就是. #import "Vi ...
- Ubuntu Apache2 配置简单介绍
debian系列的(如Ubuntu,本人是Ubuntu 12.04的)Apache 通过 apt-get 方式安装的是 Apache2 的,是 httpd 的 2.x 版本,名字直接叫 apache2 ...
- HUST 1376 Random intersection
神题.同学指教.1秒AC...http://blog.csdn.net/jtjy568805874/article/details/50724656 #include<cstdio> #i ...
- enum的java例子
Grade.java package com.zhiyuan.myenum; /** * <p>Title: 枚举类 * <p>Company: * @description ...
- ios 设置屏幕方向的两种方法
第一种:通过人为的办法改变view.transform的属性. 具体办法: view.transform一般是View的旋转,拉伸移动等属性,类似view.layer.transform,区别在于Vi ...
- IFrame跨域访问自定义高度
由于JS禁止跨域访问,如何实现不同域的子页面将高度返回给父页面本身,是解决自定义高度的难点. JS跨域访问问题描述:应用A访问应用B的资源,由于A,B应用分别部署在不同应用服务器(tomcat)上,属 ...
- brew udpate出现错误“/usr/local is not writable.”的问题解决
如图所示: 在命令行输入: sudo chown -R 当前登录的用户名 /usr/local 再次输入: brew update 问题解决.