fold change都很小,有意义吗

2024-11-04

fold change的意义[转载]

转自:https://zhidao.baidu.com/question/2052933434631672387.html 1.解释解释:表达值倍数变化 ,分析,消除可能的混杂因素,必要时可以用读段的绝对表达值倍数变化(fold-change)来作为补充. Fold change 用于描述一个初始值到一个最终值的变化程度. 1.例如,若初始值为30,最终值为60,则相应的fold change为2,或者可以描述为一个2折的增长.fold change仅仅靠最终值与初始值的比率计算即可得到.

差异基因分析：fold change(差异倍数), P-value(差异的显著性)

在做基因表达分析时必然会要做差异分析(DE) DE的方法主要有两种: Fold change t-test fold change的意思是样本质检表达量的差异倍数,log2 fold change的意思是取log2,这样可以可以让差异特别大的和差异比较小的数值缩小之间的差距. Let's say there are 50 read counts in control and 100 read counts in treatment for gene A. This means gene A is

Fold Change和t分布

基因表达谱数据基因表达谱可以用一个矩阵来表示,每一行代表一个基因,每一列代表一个样本(如图1).所有基因的表达谱数据在“gene_exp.txt”文件中存储,第一列为基因的entrez geneid,第2~61列是疾病样本的表达,第62~76列是正常样本的表达. 图1 基因表达谱的矩阵表示寻找差异表达的基因: 原理介绍: 差异表达分析是目前比较常用的识别疾病相关miRNA以及基因的方法,目前也有很多差异表达分析的方法,但比较简单也比较常用的是Fold change方法.它的优点是计算简单直观

RTTI、虚函数和虚基类的实现方式、开销分析及使用指导（虚函数的开销很小，就2次操作而已）

白杨 http://baiy.cn “在正确的场合使用恰当的特性” 对称职的C++程序员来说是一个基本标准.想要做到这点,首先要了解语言中每个特性的实现方式及其开销.本文主要讨论相对于传统 C 而言,对效率有影响的几个C++新特性: 编译时开销运行时开销相关文档: C++编码规范与指导 C++异常机制的实现方式和开销分析多处理器环境和线程同步的高级话题 C++0x(C++11)新特性点评相对于传统的 C 语言,C++ 引入的额外开销体现在以下两个方面: 编译时开销模板.类层次结构.强类

fold change(ratio)

fold change 英文简称 : FC 中文全称 : 倍性变化所属分类 : 生物科学词条简介 : 一种用于描述两个用于相比的对象数量差异的方法.例如,第一个样本和第二个样本的量是50/10,那么FC(Ratio)就是5,反之就是0.2. 用这种方法分析微阵列的数据可以说明: 1)从基因表达的绝对值而来的表达变化是有意义的: 2)这种方法可以说明基因表达变化是否显著: 3)可以利用这种模型用于有效数据的筛选.

【生产问题】记还原一个很小的BAK文件，但却花了很长时间，分析过程

[生产问题]还原一个很小的BAK文件,但却花了很长时间? 关键词:备份时事务日志太大会发生什么?还原时,事务日志太大会怎么办? 1.前提: [1.1]原库数据已经丢失,只有这个bak了 [1.2]bak文件只有1.8G大小 2.遇见问题 [2.1]排查为什么这么慢,1.8G的bak文件,还原了2个小时还没成功. (1)排查请求进度: 查看 sys.dm_exec_requests(查看进度与阻塞) select status,start_time,command,percent_complete

IT人都很忙(茫)

我发现,身边的盆友都很忙,要么在加班,要么加班刚回家:要么在出差,要么刚出差回来. 难道搞IT的人都很忙么?忙还是茫? 大学期间,不知道未来要干什么,很多人也不清楚应该学习哪些知识和技能,是否需要考证,是否要上培训班,有的人甚至在考虑是否要上课? 毕业了到毕业3年,找到了工作,经常加班,可能已经厌倦了这种生活,比如工作六天,晚上也经常加班,到家时已经很晚了.大城市,大多数人都住在比较偏远的位置,上下班还得挤地铁,不少盆友每天要在地铁上花2个小时,时间浪费在了路上.工作很忙是很多人生活的真实写照.

[日常] 用vim的时候发现的不是很小的bug...

前一天晚上的时候不知道搞啥了...第二天早上起来开 gnome-system-monitor 的时候发现CPU占用好像不太对头 (一直有个核是 \(100\%\)), 转到进程的时候发现使用最高的居然是个 vim... 顺手翻了翻这个进程其他的资源占用, 一翻不要紧, 居然一直在以 \(13.9\texttt{MB}\) 左右的稳定速度写磁盘...? 哦豁完蛋然后去考试了, 下午回来发现磁盘特么的马上就要被写满了... 找了找开了哪些 vim, 然后发现我所有终端都没开着 vim? 喵喵喵?

form表单中控件较多,加载完成后切换页面都很慢的解决方法

form表单中控件较多,加载完成后点击都很慢,为什么?我一页面中form表单里面上百个控件(如input.select.radio.checkbox等),还有一些js脚本,加载速度还可以,都能全部显示完毕,但是点击一些事件(如切换tab.关闭模拟框,点击radio等)都非常慢,不知道为什么? 当我采用inprivate模式浏览时,以上动作都很快,但老用inprivate也麻烦,有何办法解决. 按理说form都在客户端显示完全了,其他操作都是客户端的操作阿应该不慢才对阿/. ------解决思路-

HTML5做手机站页面字体显示很小的解决方法

HTML5做手机站需要加上一部分代码,不然字体会显示很小的,经历了很久的不解才发现的,希望给大家一些帮助 <!DOCTYPE html PUBLIC "-//WAPFORUM//DTD XHTML Mobile 1.0//EN" "http://www.wapforum.org/DTD/xhtml-mobile10.dtd"> <html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml"> <

解决eclipse中文字很小

新下载的eclipse4.2.1版本,显示中文字体很小,但是英文比较正常.网上查看要更改字体大小,但是更改后英文也变大了,不是想要的结果. window – preferences – general – appearance – colors and fonts – basic – text font – edit 把弹出页面中的“西欧语言”改成“中欧字符”,即可解决. 原文:http://coolheaded.cn/?p=14

这个PHP无解深坑，你能解出来吗？（听说能解出来的都很秀）

欢迎大家前往腾讯云+社区,获取更多腾讯海量技术实践干货哦~ 本文由horstxu发表于云+社区专栏 1. 问题背景 PHP Laravel框架中的db migration是比较常用的一个功能了.在每个版本迭代中,除了代码会变动之外,一般数据库的字段或者数据库表也会有些变动.因此在新版本上线时,除了发布新版代码,不可避免地要把数据库的变动也执行了.在没有db migration功能之前,我们的做法是把要变动库表的SQL语句写好(CREATE TABLE,ALTER TABLE等)存在一个sql文件

很小的一个函数执行时间调试器Timer

对于函数的执行性能(这里主要考虑执行时间,所耗内存暂不考虑),这里写了一个简单的类Timer,用于量化函数执行所耗时间. 整体思路很简单,就是new Date()的时间差值.我仅仅了做了一层简单的封装—— /** * 执行时间调试器 * * Timer类 */ (function(win) { var Timer = function() { return this; }; Timer.log = function(content) { if (typeof console == "undefi

【转载】Atom 是一款各方面体验都很像 Sublime Text 的编辑器

转载:http://www.appinn.com/atom-editor/ Atom 是一款各方面体验都很像 Sublime Text 的编辑器,它由 Github 出品,目前免费. Atom 功能的插件化程度非常高,甚至很多基本功能也做成了插件,所以安装之后自带十五个插件……包括设置也在其中. 插件.主题.命令,文本式配置文件,总让你感觉这简直就是 Sublime Text 的操作方式.但是他更简单和直观一些.当然我们还是很难因此就说他容易上手.因为这家伙纯英文,且我没有找到汉化.不过你要是用

重置了下系统好多关于mysql密码的文章都很渣拷分好的备用

方法1: 用SET PASSWORD命令 mysql -u root mysql> SET PASSWORD FOR 'root'@'localhost' = PASSWORD('newpass'); 方法2:用mysqladmin mysqladmin -u root password "newpass" 如果root已经设置过密码,采用如下方法 mysqladmin -u root password oldpass "newpass" 方法3: 用UPDA

实验吧—隐写术——WP之男神一般都很低调很低调的！！

首先我们打开解题连接~ 是直接给我们下载了一个压缩文件,解压后得到: 确实是很帅的小哥哥呢,呵呵...... 分析题目提示,“获取隐藏在图片中的flag”,嗯~这句很重要,他决定了我们要先用那种工具我用的是图片查看神器,将两张图片叠加具体操作如下图: 按左右键将两个图片进行交或并等尝试处理后,得到了一个好像是二维码的图片, 但我们都知道二维码都是黑白分明的,所以我们保存给图片继续进行处理通过不断地改变通道,我们可以得到三个不同的二维码但我们仔细观察后,发现和正常的二维码不同这就需要我们进

三年Android开发，月薪一万二，不敢跳槽，每天都很焦虑

在我们的身边,存在一个普遍现象:很多人从事Android开发工作多年,走过的弯和坎,不计其数,经历的心酸难与外人道也.可是技术确难以提升.止步不前,薪资也只能看着别人水涨船高,自己却没有什么起色. 虽然在公司里属于不可缺少的一员,但是同时又担心离开了这家公司就找不到更好的工作了. 有这种焦虑的朋友或许应该思考一下这个问题:如何提升自己在 Android 市场上的竞争力? 首先我们要解决一个问题:为什么很多人会一直停留在两三年的水平上,而后一直在重复以往的经验? 我认为最主要的一点就是主观能动性,

【问题&解决】手机网页Html代码实现（解决显示页面很小的问题）

工作需要,要做一个手机自适应的网页效果,终于搞定,先分享并记录! 其实主要就是改掉HTML页面声明: 在网页中加入以下代码,就可以正常显示了: <meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1.0, user-scalable=no, minimum-scale=1.0, maximum-scale=1.0"/> 解释: width - viewport的宽度height

6个炫酷又好用的 Python 工具，个个都很奔放呀

贝多芬写完<第九交响曲>后说:it's done:耶稣在被处死前说:it is done:<指环王>结尾摧毁魔戒后Frodo说:it's done! 我整理完这6个Python工具后,深吸一口气说:成了. 上一期入口:10个不到500行代码的超牛Python项目 6. Python Tutor 简介: 如果你不知道代码在内存中是如何运行的,不妨把它拷贝到Tutor里可视化执行一遍,加深理解. 5.Jupyter Notebook 简介:就像一个草稿本,能将文本注释.数学方程.代码和

Android调用系统相机拍照保存照片很小解决方案

保存图片小的一般操作步骤: 1. 调用系统相机 Intent intent = new Intent(MediaStore.ACTION_IMAGE_CAPTURE); startActivityForResult(intent, 1); 2. 保存照片 @Override protected void onActivityResult(int requestCode, int resultCode, Intent data) { // TODO Auto-generated method s

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