hmmer 使用 » 转载文章请注明,转载自:博耘生物 » <hmmer的安装与使用> » 原文链接:http://boyun.sh.cn/bio/?p=1753   从功能基因研究的角度来讲,相关的搜索,比如从序列数据库中,找同源的序列,或者对一个对一个新的基因功能进行鉴定,使用hmmer比使用blast有着更高的灵敏度已经更高的搜索速度,但其应用还远没有blast普及,这里是一篇入门级的介绍文章. hmmer下载与安装 对于Mac OS/X, Linux, UNIX系统,用源代码编译安装:

<CMake实践>笔记一:PROJECT/MESSAGE/ADD_EXECUTABLE <CMake实践>笔记二:INSTALL/CMAKE_INSTALL_PREFIX <CMake实践>笔记三:构建静态库与动态库 及 如何使用外部共享库和头文件 五.静态库与动态库构建 读者云,太能罗唆了,一个Hello World就折腾了两个大节.OK,从本节开始,我们不再折腾Hello World了,我们来折腾Hello World的共享库. 本节的任务: 1.建立一个静态库和动

mac下使用clion构建boost库 使用brew install boost 完成后发现boost被安装在在/usr/local/Cellar/boost下 jetbrain给出的指导意见 https://www.jetbrains.com/help/clion/quick-cmake-tutorial.html ================== ============= http://blog.csdn.net/to_be_better/article/details/5396719

前言 在前文中,我说过本系列文章的受众是在现代前端体系下能够熟练编写业务代码的同学,因此本文在介绍 webpack 配置时,仅提及构建一个库所特有的配置,其余配置请参考 webpack 官方文档. 输出产物 构建一个库与构建一个一般应用最大的不同点在于构建完成后输出的产物. 一般应用构建完成后会输出: 一个 html 文件 一个 js 入口 chunk .若干子 chunk 若干 css 文件 若干其它资源,如图片.字体文件等 虽然输出的资源非常多,但实际上所有的依赖.加载关系都已经从 html

目录 R语言构建蛋白质网络并实现GN算法 1.蛋白质网络的构建 2.生物网络的模块发现方法 3.模块发现方法实现和图形展示 4.附录:igraph中常用函数 参考链接 R语言构建蛋白质网络并实现GN算法 1.蛋白质网络的构建 我们使用与人类HIV相关的蛋白质互作数据hunam-HIV PPI.csv来构建这个蛋白质互作网络. 在R中,我们可以从存储在R环境外部的文件读取数据.还可以将数据写入由操作系统存储和访问的文件. R可以读取和写入各种文件格式,如:csv,excel,xml等. 想要读取c

继续完善Hello World,建立它的共享库, 包括静态库和动态库. 本节的任务: 1,建立一个静态库和动态库,提供HelloFunc函数供其他程序编程使用,HelloFunc 向终端输出Hello World字符串. 2,安装头文件与共享库. 3, 编写一个程序使用创建的共享库(静态库和动态库). cd /home/ccj/CMakeDemo mkdir t3   cd /backup/cmake/t3 mkdir lib   在t3目录下建立CMakeLists.txt,内容如下: PRO

如何使用scons构建工程,请参考快速构建C++项目工具Scons,结合Editplus搭建开发环境. 编译SharedLibrary项目的时候,生产的so文件时自动加上lib, 例如: env = Environment() env.SharedLibrary('hello', sources=['hello.c']) 将以上保存成build.py, 执行编译命令 scons -f build.py 生成动态库so的文件名 libhello.so.这样做的好处,自然不用多说.这种lib前缀并不

1.下载源码包 下载地址 http://download.osgeo.org/geos/geos-3.6.1.tar.bz2 下载之后解压即可. 2.编译 geos源码包中自带了makefile.vc,所以可以直接使用nmake进行构建. 打开VS的命令行工具(我的是VS2015 x64 Native Build Tools Command Prompt) 进入源码目录,使用下面命令进行构建(构建前请先运行一下autogen.bat,也可手动将include目录下的version.h.vc和pl

一.构建步骤 创建一个动态库 MyDynamicFramework 创建一个测试类 在 MyDynamicFramework.h(默认生成,可统一暴露头文件) 中 #import "Person.h" #import <UIKit/UIKit.h> //! Project version number for MyDynamicFramework. FOUNDATION_EXPORT double MyDynamicFrameworkVersionNumber; //! P

目录 1. 文件目录结构 2. 库文件源代码 3. 编译生成库文件 1. 文件目录结构 首先创建如下目录结构: └── lib ├── build # ├── CMakeLists.txt └── src # ├── add.c └── add.h 从上面的结构,可以看出博主想实现一个具备简单加法的库. build:存放cmake生成的makefile文件,make编译生成的中间文件. CMakeLists.txt:使用cmake语法编写相关指令,用于生成makefile src:库文件的源代码

一..a 文件静态库打包 打开 Xcode 创建一个新的 Static Library 工程,取名 MyStaticLibrary. 创建工程完毕后,系统自动创建了一个同名类,添加一个方法用于测试. #import <Foundation/Foundation.h> @interface MyStaticLibrary : NSObject + (void)test; @end @implementation MyStaticLibrary + (void)test { NSLog(@&quo

Meteor:JavaScript App Platform braintree:在线支付 jquery datetimepicker:日期控件 Hotjar Tracking Code:网站追踪 Zopim Live Chat:实时通讯 addthis:社交分享

例子如下: mystdio.h #ifndef __MYSTDIO_H__ #define __MYSTDIO_H__ #include <sys/types.h> #define MYEOF -1 enum mode{READ, WRITE, APPEND}; typedef struct { int _fd; char *_buff; char *_nextc; int _mode; off_t _left; }MYFILE; extern MYFILE * myfopen(const c

目标任务:使用requests抓取电影网站信息和下载链接保存到数据库中,然后使用flask做数据展示. 爬取的网站在这里 最终效果如下: 主页: 可以进行搜索:输入水形物语 点击标题进入详情页: 爬虫程序 # -*- coding: utf-8 -*- import requests from urllib import parse import pymysql from lxml import etree headers = {'User-Agent':'Mozilla/5.0 (Window

[时间:2017-09] [状态:Open] [关键词:Android,Android Studio,gradle,native,c,c++,cmake,原生开发,ndk-build] 0 引言 最近在工作中遇到了升级Android Studio 2.3.3稳定版之后,无法编译jar包的问题.之后寻找AS文档-探索 Android Studio发现.可以通过AS创建和编译jar包,顺便看到支持原生开发,可以直接在AS中调试c/c++代码,这是非常不错的功能.终于可以摆脱纯打日志的开发环境了. 本

现在公认的JavaScript典型项目需要运行单元测试,合并压缩.有些还会使用代码生成器,代码样式检查或其他构建工具. Grunt.js是一个开源工具,可以帮助你完成上面的所有步骤.它非常容易扩展,并使用JavaScript书写,所以任何为JavaScript库或项目工作的人都可以按自己的需要扩展它. 本文解释如何使用Grunt.js构建JavaScript库.Grunt.js依赖Node.js和npm,所以第一节解释其是什么,如何安装和使用.如果你对npm有了解,那你可以跳过这一节.第四和第五

在前端开发中可能会遇到将相同的功能模板集合成一个组件,供他人调用,这样可以减少重复造轮子,也可以节约人力.财力,更能够提高代码的可维护度:下面将通过详细的步骤教你如何构建一个Vue前端组件. 1.在本机上安装好NodeJs,并配置好环境变量 (1)NodeJs的下载地址:点击进入下载页面 我这里是下载64位Windows安装包(.msi),大家可以根据自己电脑系统选择相应的版本即可. (2)下载NodeJs后双击它,采用默认设置,一直点击下一步,直到Finish为止.需要说明的是,在安装Node

一.背景 web前端开发人员经常会用到一些现成的js库(框架).框架的使用增加了代码的模块化和可复用性,最主要的是屏蔽了浏览器之间差异性的实现,使得代码更加简洁,框架使用者只需要将注意力放在业务的实现上而不必为底层繁琐的实现感到头疼. 目前主流的js框架有很多,各有侧重,我们通常只会用到其中一小部分子功能.如果为了局部功能而引入一个庞大的框架,显然有点大材小用而且会增加浏览器的加载负担,浪费网络带宽,影响用户体验.因此,很多时候定义我们自己的js库非常的有必要,我们只需要根据项目需求构建出个性化

构建一个自己的库供其它人使用是不是一件很酷(苦)的事情,通过CocoaPods 可以快捷的构建自己库,并向全世界分享你的成果 一.创建 Podspec 有两种方式: 使用命令 pod lib create mylib 创建一套完整的 Pod 库模版 使用命令 pod spec create mylib 创建 Podspec 的配置文件 二.配置 Podspec 官网说明:https://guides.cocoapods.org/syntax/podspec.html#specification

linux下编译安装boost库 linux下编译安装boost库 1.下载并解压boost 1.58 源代码 下载 解压 2.运行bootstrap.sh 3.使用b2进行构建 构建成功的提示 4.安装boost库到指定目录 5.测试一下 代码 编译运行 先看一下系统环境 Linux o-pc 3.19.0-22-generic #22-Ubuntu SMP Tue Jun 16 17:15:15 UTC 2015 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux 本文由乌合之众

如何构建一个库 静态库(.a) 静态库的建立和使用是非常简单的: 1. 编译源文件:gcc -Wall -c test1.c test2.c 2. 生成库文件:ar -cvq libtest.a 3. 链接库文件:gcc -o exename source.c  libtest.a   或者 gcc -o exename source.c  -L/path/to/lib-directory -ltest 动态库(.so) 动态库的建立步骤.链接方法和静态库基本一致,如下: gcc -Wall -