转自:http://blog.sina.com.cn/s/blog_40d4ae110101fjzy.html 1 二代测序与基因芯片的区别与优缺点. 生物芯片相对第二代测序而言,优势在于价格便宜,便于分析.缺点则在于必须有参考序列(因为生物芯片的探针设计就是根据参考序列设计的). 相同点: 高通量和一些应用领域上的重合(比如表达谱,SNP) SNP:Single Nucleotide Polymorphisms 单核苷酸多态性 不同点: 1.本质不同: 基因芯片的本质是核酸杂交.只不过是同时进

NGS又称为下一代测序技术,高通量测序技术 以高输出量和高解析度为主要特色,能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列读取,在提供丰富的遗传学信息的同时,还可大大降低测序费用.缩短测序时间的测序技术. Sanger法测序(一代测序):是一种利用DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物的测序技术.每一次序列测定由一套四个单独的反应构成,每个反应含有所有四种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP),并混入限量的一种不同的双脱氧核苷三磷酸(ddNTP).由于ddNTP缺乏延伸所需要的3-OH基团,使延长的

1.建立数组 2.创建散点图. 3.添加趋势线. 4.设立为线性函数,勾选显示公式.显示R^2值,R即为相关系数. 5. 备注:此外也可以使用=CORREL()函数对相关系数进行求值.其结果是一致的.

               本博客所有文章分类的总目录:[总目录]本博客博文总目录-实时更新  开源Math.NET基础数学类库使用总目录:[目录]开源Math.NET基础数学类库使用总目录 前言 数据集的基本统计计算是应用数学,以及统计应用中最常用的功能.如计算数据集的均值,方差,标准差,最大值,最小值,熵等等.Math.NET中的MathNet.Numerics.Statistics命名空间就包括了大量的这些统计计算的函数.今天就为大家介绍的是使用Math.NET计算相关系数的类:Corr

1.Pearson皮尔森相关系数 皮尔森相关系数也叫皮尔森积差相关系数,用来反映两个变量之间相似程度的统计量.或者说用来表示两个向量的相似度. 皮尔森相关系数计算公式如下:

基音周期提取2-基于线性相关系数的Matlab实现 基音周期提取结果 图1 基音提取结果 算法说明 线性相关系数 也称"皮尔逊积矩相关系数"(Pearson product-moment correlation coefficient) 通常用γ或ρ表示,是用来度量两个变量之间的相互关系(线性相关),取值范围在[-1,+1]之间. γ>0为正相关,γ<0为负相关,γ＝0表示不相关.γ的绝对值越大,相关程度越高. r=1时为完全正相关:如两者呈负相关则r为负值,而r=-1时为

转自:http://blog.csdn.net/wsywl/article/details/5727327 由于使用的统计相关系数比较频繁,所以这里就利用几篇文章简单介绍一下这些系数. 相关系数:考察两个事物(在数据里我们称之为变量)之间的相关程度. 如果有两个变量:X.Y,最终计算出的相关系数的含义可以有如下理解: (1).当相关系数为0时,X和Y两变量无关系. (2).当X的值增大(减小),Y值增大(减小),两个变量为正相关,相关系数在0.00与1.00之间. (3).当X的值增大(减小),

转自:http://blog.csdn.net/wsywl/article/details/5859751 Spearman Rank(斯皮尔曼等级)相关系数 1.简介 在统计学中,斯皮尔曼等级相关系数以Charles Spearman命名,并经常用希腊字母ρ(rho)表示其值.斯皮尔曼等级相关系数用来估计两个变量X.Y之间的相关性,其中变量间的相关性可以使用单调函数来描述.如果两个变量取值的两个集合中均不存在相同的两个元素,那么,当其中一个变量可以表示为另一个变量的很好的单调函数时(即两个变量

最近收到一项新任务,要求两个矩阵的相关系数,说白了就是转换成向量两两计算.本来这个工作我是想自己写个小程序搞定的,但是大家纷纷反映matlab自带了此项功能,本着活到老学到老的心态,我开始查找这个函数,目测貌似有两个函数可以直接调用,首先我们先来介绍下我们这里的相关系数. 皮尔逊积矩相关系数(Pearson product-moment correlation coefficient) 通常用γ或ρ表示,是用来度量两个变量之间的相互关系(线性相关)的,取值范围在[-1,+1]之间. 下面再说下可

转载自:http://www.pinzhi.org/thread-7762-1-1.html Minitab中相关系数R-Sq和修正的相关系数R-Sq(adj)的意思,计算公式和区别 在Minitab做回归方程,或类似的运算中,经常会碰到多元相关系数R-Sq和修正的多元相关系数R-Sq(adj),那么,这2个是什么意思?具体的计算公式和区别是什么? 拟合的总效果多元全相关系数(Multiple correlation coefficient) R²(即R=Sq)和修正的多元相关系数(Adjust

例如,“三国人物是否智力越高,政治就越高”,或是“是否武力越高,统率也越高:准备数据分析环境: SELECT * FROM FactSanguo11 WHERE 姓名 IN ( N'荀彧', N'荀攸', N'贾诩', N'程昱', N'郭嘉' ) 曹魏五谋臣,指荀彧.荀攸.贾诩.程昱.郭嘉五人.因为这五个人对曹魏势力的成立与巩固有巨大贡献,所以,把他们叫做曹魏五谋臣.“智力”和“政治”的散布图 做成图表后,我们就可以知道它们是否与双变量相关联.但是!关联性究竟有多高呢?很可惜!我们无法确切得知

http://cucmakeit.github.io/2014/11/13/%E4%BF%AE%E6%AD%A3%E4%BD%99%E5%BC%A6%E7%9B%B8%E4%BC%BC%E5%BA%A6%E4%B8%8E%E7%9A%AE%E5%B0%94%E6%A3%AE%E7%9B%B8%E5%85%B3%E7%B3%BB%E6%95%B0/ 最后一段总结精辟: 需要注意的一点是修正的余弦相似度与皮尔森相关系数之间的细微差别.我之前也一直以为两个公式一样,只是意义上不同,但是仔细观察可以看到

先说独立与相关的关系:对于两个随机变量,独立一定不相关,不相关不一定独立.有这么一种直观的解释(不一定非常准确):独立代表两个随机变量之间没有任何关系,而相关仅仅是指二者之间没有线性关系,所以不难推出以上结论. 衡量随机变量相关性的方法主要有三种:pearson相关系数,spearman相关系数,kendall相关系数: 1.连续数据,正态分布,线性关系,用pearson相关系数是最恰当,当然用spearman相关系数也可以,   就是效率没有pearson相关系数高. 2.上述任一条件不满足,

阅读目录 前言 1.Math.NET计算相关系数的类 2.Correlation的实现 3.使用案例 4.资源                本博客所有文章分类的总目录:[总目录]本博客博文总目录-实时更新  开源Math.NET基础数学类库使用总目录:[目录]开源Math.NET基础数学类库使用总目录 回到目录 前言 数据集的基本统计计算是应用数学,以及统计应用中最常用的功能.如计算数据集的均值,方差,标准差,最大值,最小值,熵等等.Math.NET中的MathNet.Numerics.Sta

%相位角与相关系数曲线 close all; clear all; Samp1=200;  %设置信号的采样精度 Samp2=200;  %设置相位角p分割精度 A=10;%信号幅值 w=1;%信号角频率 na=5;%噪声放大系数 g=zeros(Samp2,Samp1);%产生Samp2 x Samp1的二维零矩阵,每一行对应一个p值时的函数 t = linspace(0,6*pi/w,Samp1); %创建函数向量 p= linspace(0,pi/3,Samp2);%创建相位角向量 f=A

之前我们介绍过,协方差能够一定程度上描述两个变量之间的相关性,但是有时候它并没有那么准确,例如下面这个例子: 本质一样的两个随机变量,独立性是不变的,但是通过这个等式我看到,如果在随机变量的前面添加了常数,协方差的结果是有比较大的差距的,因此这很不利于我们去度量两个随机变量之间的独立性,因此这里我们将描述相关性的变量进行标准化定义,这就引入了相关系数: 我们能够推导出相关系数的一条重要性:

理解皮尔逊相关的两个角度 其一, 按照高中数学水平来理解, 皮尔逊相关(Pearson Correlation Coefficient)很简单, 可以看做将两组数据首先做Z分数处理之后, 然后两组数据的乘积和除以样本数 Z分数一般代表正态分布中, 数据偏离中心点的距离.等于变量减掉平均数再除以标准差.(就是高考的标准分类似的处理) 标准差则等于变量减掉平均数的平方和,再除以样本数,最后再开方. 所以, 根据这个最朴素的理解,我们可以将公式依次精简为: 其二, 按照大学的线性数学水平来理解, 它比

****************************************************** 如有谬误,请联系指正.转载请注明出处. 联系方式: e-mail: heyi9069@gmail.com QQ: 3309198330 ****************************************************** 统计相关系数简介 由于使用的统计相关系数比较频繁,所以这里就利用几篇文章简单介绍一下这些系数. 相关系数:考察两个事物(在数据里我们称之为变量)

统计相关系数简介 由于使用的统计相关系数比较频繁,所以这里就利用几篇文章简单介绍一下这些系数. 相关系数:考察两个事物(在数据里我们称之为变量)之间的相关程度. 如果有两个变量:X.Y,最终计算出的相关系数的含义可以有如下理解: (1).当相关系数为0时,X和Y两变量无关系. (2).当X的值增大(减小),Y值增大(减小),两个变量为正相关,相关系数在0.00与1.00之间. (3).当X的值增大(减小),Y值减小(增大),两个变量为负相关,相关系数在-1.00与0.00之间. 相关系数的绝对值

一.np.var 数学上学过方差:$$ D(X)=\sum_{i\in [0,n)} ({x-\bar{x}})^2 $$ np.var()实际上是均方差,均方差的意义就是将方差进行了平均化,从而使得此值不会随着数据的增多而发生变化. np.std()是标准差,np.std()的平方等于np.var(),标准差在高斯分布中用$\sigma$表示. 不论是方差还是标准差,它们衡量的都是二阶中心矩.为什么是二阶而不是一阶?这是一个问题. 函数原型:numpy.var(a, axis=None, dt