今天在使用muscle 软件进行多序列比对时,发现输出的结果全部为gap, 而且还没有明显的报错信息 找了很久之后,终于发现了问题 muscle 为了追求速度,对输入序列的个数和长度进行了限制 下面是官方说明文档中的原话: 我的输入序列长度为5k 左右, 最终输出的结果全部为gap 经过测试,我发现序列数大于50 的时候,只要长度没有太长,结果也是正常的 所以,muscle 的缺陷就是对于太长的输入序列,没办法正常比对,这个时候推荐使用mafft 这个多序列比对工具

还原本来的二叉树并不是一个非常简单的事,虽然思想比较简单,但过程却是比较繁琐.下面我拿先序序列和中序序列来讲一下原理吧. 从先序序列中我们一下子就可以得到二叉树的根节点是第一个元素,然后再中序序列中我们也可以找到这个元素(假设二叉树中所有的元素的值不相同)这样我们就可以把中序序列分成两部分,前部分和先序序列可求得左子树,后部分与先序序列可求得右子树.下面以左部分为例,在除去根节点的前序序列中的第二个元素,就是我们左子树的的第一个节点,然后继续在中序序列的前部分中找到相同的元素,再次对中序序列进行

Kotlin系列之序列(Sequences)源码完全解析 2018年06月05日 22:04:50 mikyou 阅读数:179 标签: Kotlin序列(sequence)源码解析Androidjava 更多 个人分类: Kotlin   版权声明:本文为博主原创文章,未经博主允许不得转载. https://blog.csdn.net/u013064109/article/details/80588034 简述: 好久没有发布原创文章,一如既往,今天开始Kotlin浅谈系列的第十讲,一起来探索

只要实现了__len__和__getitem__两个方法即可将该类视为序列. 切片原理 动态存取属性 如果实现了__getattr__方法,也要定义__setattr__方法,以防对象行为不一致

题意:有一个模板串,有\(T\)个字符串,从字符串中找到某个子串,使得这个子串中的子序列包含模板串,求最短的子串的长度. 题解:找子序列,很容易想到序列自动机,根据序列自动机的原理,我们一定可以确保除了第一个字符,其他的字符的位置都是最优的,所以我们先对模板串的第一个字符\(p\)记录它的所有位置,然后再遍历它的位置,每次都跑一下序列自动机维护答案的最小值即可. 代码: const string p="puleyaknoi"; int t; string s; vector<in

SpriteSheet精灵动画引擎   本文介绍Flash中SpriteSheet精灵序列图与其它渲染方式的性能对比.SpriteSheet的原理及注意实现,最后实现了一个精灵序列图的渲染引擎.本文的SpriteSheet引擎及demo可以在github上下载:https://github.com/saylorzhu/SpriteSheet 动画渲染性能对比 Flash中动画制作方式有多种,如矢量动画.位图帧动画.精灵序列图等等.针对不同的制作方式,对同一个角色动画进行如下测试:一个角色在屏幕上

二分法,主要应用于有序序列中,原理是每次查找都将原序列折半,逐渐缩小查找范围的一种算法. 需求 要求在一个有序序列中,例如[0, 3, 6, 9, 12, 15, 18, 21, 24, 27, 30, 33, 36, 39, 42, 45, 48, 51, 54, 57, 60, 63, 66, 69, 72, 75, 78, 81, 84, 87, 90, 93, 96, 99],查找一个数字,如果找到则打印该数字,如果找不到,则输出“not found!” 递归方式 递归,是在函数中自身调

概念 全排列的生成算法有很多种,有递归遍例,也有循环移位法等等.C++/STL中定义的next_permutation和prev_permutation函数则是非常灵活且高效的一种方法,它被广泛的应用于为指定序列生成不同的排列.本文将详细的介绍prev_permutation函数的内部算法. 按照STL文档的描述,next_permutation函数将按字母表顺序生成给定序列的下一个较大的序列,直到整个序列为减序为止.prev_permutation函数与之相反,是生成给定序列的上一个较小的序列

引子:javascript实际使用的排序算法在标准中没有定义,可能是冒泡或快排.不用数组原生的 sort() 方法来实现冒泡和快排. Part 1:冒泡排序(Bubble Sort) 原理:临近的两数两两进行比较,按从小到大或从大到小顺序排列,进行多趟,每一趟过去后(外循环),最大或最小的数字被交换到最后一位(内循环). 代码:共进行6趟,每一趟比较5次 var a=[6,2,4,1,5,9],t; for(var i=0;i<a.length;i++){ for(var j=0;j<a.le

第一章:引子 STL包含的算法头文件有三个:<algorithm><numeric><functional>,其中最大最常用的是<algorithm>,今天学习的是<algorithm>包含的算法中的第一部分:非修改顺序操作算法. 接下来学习的算法基于C++11标准,较老的IDE会支持不全面或者部分算法不支持. 第二章:原型解析 如分类名称体现的信息,本节的所有函数都不会修改序列,并且原理上都是顺序遍历迭代器实现的. all_of 函数原型: t

1.序列是Python中最基本的数据结构.序列中的每个元素被分配一个序列号——元素的位置,也称索引,第1个索引是0,第2为1,以此类推.序列中的最后1个元素为-1,倒数第2个位-2. python中有6中内建的序列:列表.元组.字符串.Unicode字符串.buffer对象和xrange对象. 2.通用序列操作:索引(indexing).分片(sliceing).加(adding).乘(multiplying).检查某个元素是否属于序列成员.计算序列长度.找出最大元素和最小元素的内建函数. 两种

数据结构还是很重要的,就算不是那种很牛逼的,但起码得知道基础的东西,这一系列就算是复习一下以前学过的数据结构和填补自己在这一块的知识的空缺.加油.珍惜校园中自由学习的时光.按照链表.栈.队列.排序.数组.树这种顺序来学习数据结构这门课程把. -WH 一.单链表的概念 链表是最基本的数据结构,其存储的你原理图如下图所示 上面展示的是一个单链表的存储原理图,简单易懂,head为头节点,他不存放任何的数据,只是充当一个指向链表中真正存放数据的第一个节点的作用,而每个节点中都有一个next引用,指向下一

CF917D Stranger Trees 题目描述 给定一个树,对于每个\(k=0,1\cdots n-1\),问有多少个生成树与给定树有\(k\)条边重合. 矩阵树定理+高斯消元 我们答案为\(f_k\).假设我们呢将原树上的边权设为\(x\),其他的边权设为\(1\),那么我们做一次矩阵树定理求出来的东西就是\(\displaystyle \sum_{i=0}^{n-1}f_i x^i\).于是我们找\(n\)个不同的\(x\),然后高斯消元就行了. 代码: #include<bits/s

王二学习python的笔记以及记录,如有雷同,那也没事,欢迎交流,wx:wyb199594 学习内容 1.文件处理 1.打开文件 open(‘路径’,‘打开方式’) 打开方式 r w a r+ w+ a+ ps: r+ 打开文件直接写,和读完再写不一样,光标会变 1.操作文件 a.读 read 一次性 readline 一行一行, 不知道在哪里结束 #视频 图片 rb打开 按照字节读 readlines 一次性读 for 循环-----最好用 b.写 write c.光标 -----文件指针 s

翻译说明: 原标题: Kotlin : Slow List and Lazy Sequence 原文地址: https://medium.com/@elye.project/kotlin-slow-list-and-lazy-sequence-61691fc974c5 原文作者: Elye 自从Kotlin可以兼容Java7上后,很高兴的是我们可以轻松地在List上使用各种集合操作符并且可以链式调用它们.但是我们知道在某些情况下使用List的迭代器并不是最好的方式,那么还有另一种方式就是使用序列

[NOIP2016 DAY1 T2]天天爱跑步 题面: B[NOIP2016 DAY1]天天爱跑步 时间限制 : - MS 空间限制 : 565536 KB 评测说明 : 2s Description 小c同学认为跑步非常有趣,于是决定制作一款叫做<天天爱跑步>的游戏.<天天爱跑步>是一个养成类游戏,需要 玩家每天按时上线,完成打卡任务.这个游戏的地图可以看作一一棵包含 \(N\)个结点和\(N-1\) 条边的树, 每条边连接两个结点,且任意两个结点存在一条路径互相可达.树上结点编

一.集成学习法 在机器学习的有监督学习算法中,我们的目标是学习出一个稳定的且在各个方面表现都较好的模型,但实际情况往往不这么理想,有时我们只能得到多个有偏好的模型(弱监督模型,在某些方面表现的比较好).集成学习就是组合这里的多个弱监督模型以期得到一个更好更全面的强监督模型,集成学习潜在的思想是即便某一个弱分类器得到了错误的预测,其他的弱分类器也可以将错误纠正回来. 集成方法是将几种机器学习技术组合成一个预测模型的元算法,以达到减小方差(bagging).偏差(boosting)或改进预测(sta

目录 1.tips 2.事务(transaction) 3.索引(index) 4.数据库的导出和备份 5.函数 6.防SQL注入 7.使用Explain分析SQL语句 8.视图(view) 1.tips 1).数据库不区分大小写: 2).插入新数据时忽略重复数据,可在INSERT后加关键字IGNORE即可 3).通过UNION操作符来连接两个以上的SELECT语句结果组合到一个结果到同一个集合中: 格式: select... from... where... union distinct se

转载请注明出处:http://blog.csdn.net/u012860063 题目链接:http://acm.hdu.edu.cn/showproblem.php? pid=1027 Ignatius and the Princess II Problem Description Now our hero finds the door to the BEelzebub feng5166. He opens the door and finds feng5166 is about to kill

递归 及 面向对象初识及编程思想   一.递归 1.定义: 在函数内部,可以调用其他函数.如果一个函数在内部调用自身本身,这个函数就是递归函数. (1)递归就是在过程或函数里调用自身: (2)在使用递归策略时,必须有一个明确的递归结束条件,称为递归出口. 1 def age(n): 2 if n ==1: #条件判定 3 return 10 #返回一个结果 4 else: 5 return age(n-1)+2 #重复调用函数本身,系统会将运算的结果存放到栈,然后再依次的进行取值调用. 6 pr

一.递归 1.定义: 在函数内部,可以调用其他函数.如果一个函数在内部调用自身本身,这个函数就是递归函数. (1)递归就是在过程或函数里调用自身: (2)在使用递归策略时,必须有一个明确的递归结束条件,称为递归出口. def age(n): if n ==1: #条件判定 return 10 #返回一个结果 else: return age(n-1)+2 #重复调用函数本身,系统会将运算的结果存放到栈,然后再依次的进行取值调用. print(age(5)) #打印结果 执行结果:18 2.优缺点