GO是一个同源蛋白的数据库,按照三大类别BP(生物学过程), MF(分子功能), CC(细胞组分) 对基因的产物-蛋白质进行了分类: 在GO数据库中,本质上是一个有向无环图的数据结构,在三大类别之下,又有小的分类层级,一层一层的分类下去: 对于某个具体的GO号来说,代表了一组同源蛋白,拥有相似的结构和功能,在数据库中,有上层分类的GO,也可能在这个GO下面,还有其他的GO 为了直观的展示某个GO号的分类,利用数据库提供的go-basic.obo 文件得到不同GO之间的层级关系,然后用Graphv

1.>c-Bioportal: www.cbioportal.org 整合和简化了包括TCGA,ICGC以及GEO等多个癌症基因组数据库的内容,提供友好可视化的界面,可供下载. 主要展示基因的somatic 突变谱,拷贝数变化,mRNA&miRNA表达量变化,DNA甲基化以及蛋白质表达的情况,并结合患者的临床资料,展示了KM生存曲线. 2.>OncoLnc: www.oncolnc.org 这是一个整合了TCGA的各种RNA数据和患者临床数据,提供生存分析的网站,灰常简单好用. 3.&

利用书籍进行系统学习,凭借博客/新闻等资料开阔眼界,辅之以代码及项目实战,并勤加以总结,方可进步. 常用网站: 找英文电子书网站:gen.lib.rus.ec 和 www.jiumodiary.com/ Leetcode刷题:https://leetcode.com/ ,练习数据结构和算法必备 九章算法网站:http://www.jiuzhang.com/solution/,该网站有Leetcode题目的配套答案,而且代码质量很高 数据结构可视化网站:https://www.cs.usfca.e

羡辙在bilibili开课啦 就在这个月,不知道是不是受了 @Jannchie见齐 的影响,羡辙竟然在bilibili开授Echarts课程,目前已开课两节. [滚城一团]的 ECharts 训练营 - 第〇课时:课程大纲 https://www.bilibili.com/video/av31172702 一个图表是如何渲染出来的? https://www.bilibili.com/video/av31545036 天!你还不知道羡辙是谁?羡辙真名:张雯莉, 百度Echarts核心开发者之一,

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Robert J. Hijmans37 开发了 raster 包用于网格空间数据的读.写.操作.分析和建模,同时维护了空间数据分析的网站 https://www.rspatial.org Edzer Pebesma38 和 Roger Bivand 等创建了 sp 包定义了空间数据类型和方法,提供了大量的空间数据操作方法,同时维护了空间数据对象 sp 的绘图网站 https://edzer.github.io/sp/,他们也一起合作写了新书 Spatial Data Science,提供了在线 

如何使用django去构建数据可视化的 web,可视化的结果可以呈现在web上. 使用django的MTV模型搭建网站 基础铺垫-MTV模型 Created with Raphaël 2.1.0Request服务器(Djangoweb)Response 首先,要搞清楚我们去访问服务器,服务器返回信息的行为. 1)Request向服务器(Djangoweb)发起请求 点击页面,或查看网页信息,都是这个过程 2)服务器回应-Response 服务器抛出的可能是某个页面,也可能是图片,或是一组动态的数

之前已经完成zookeeper集群.Hadoop集群.HBase集群.Flume.Kafka集群.Spark集群的搭建:使用Docker搭建Spark集群(用于实现网站流量实时分析模块),且离线分析模块已经在之前的模块中实现(网站日志流量分析系统之数据清洗处理(离线分析)),这次基于Docker搭建的spark集群,本地编写Scala代码实现网站日志流量实时分析模块,最终提交于spark集群. 一.本机环境 系统:win10 64位 Scala版本:2.13 JDK版本:1.8 IDE工具:ID

一.html 1.web流程中的HTML HTML---->赤裸裸的人 CSS  ---->穿华丽的衣服 JS    ---->让人动起来 浏览器和server端之间的通信本质上是字符串;浏览器将字符串处理为可视化的东西; web框架的祖宗是socket: #!/usr/bin/env python # _*_ coding:utf- _*_ import socket def handle_request(client): buf = client.recv() client.send

在上一篇文章<我是如何来做网站优化(Seo)的?(一)>讲述了网站优化几个注意项目. 在我们日常网站维护中,难免会使用到各种工具,文章的第二节我们就来讲讲这些工具. 网站提交通道 百度站长平台:百度站长工具,提供了用户提交Sitemap的功能,Ping服务,并给出了一些URL优化建议.网站安全检测工具. Google Tools:谷歌网站管理员工具,可以获取到谷歌抓取.编入索引和搜索流量的数据,同时接收关于用户网站上所存在的问题的通知. Bing Tools :微软必应网站管理员工具,获取到必

长夜漫漫无心睡眠,来一篇嘿嘿.我相信如果已经用Shell脚本完成IOS和Android打包的朋友一定需要Jenkins 怎么才能让策划打包ipa和apk?怎么才能彻底省去程序的时间,只要在同一局域网内不需要unity的开发环境,只要它有浏览器,它就能打包Jenkins无疑是最佳选择. Unity3D研究院之IOS全自动编辑framework.plist.oc代码(六十七) Unity3D研究院之IOS全自动打包生成ipa(六十八) Unity3D研究院之Android全自动打包生成apk(六十九

Selector 模块是对 Zepto 选择器的扩展,使得 Zepto 选择器也可以支持部分 CSS3 选择器和 eq 等 Zepto 定义的选择器. 在阅读本篇文章之前,最好先阅读<读Zepto源码之神奇的$>. 读 Zepto 源码系列文章已经放到了github上,欢迎star: reading-zepto 源码版本 本文阅读的源码为 zepto1.2.0 GitBook <reading-zepto> 辅助方法 visible function visible(elem){

前言 这几天复习图论算法,觉得BFS和DFS挺重要的,而且应用比较多,故记录一下. 广度优先搜索 有一个有向图如图a 图a 广度优先搜索的策略是: 从起始点开始遍历其邻接的节点,由此向外不断扩散. 1.假设我们以顶点0为原点进行搜索,首先确定邻接0的顶点集合S0 = {1,2}. 2.然后确定顶点1的集合S1 = {3},顶点2没有邻接点,所以集合为空. 3.然后确定3的邻接点集合S3,因为2已经被遍历过,所以不考虑,所以由顶点3知道的邻接点集合S3 = {4}. 4.然后再确定顶点4的邻接点集

谷歌重磅开源强化学习框架Dopamine吊打OpenAI 近日OpenAI在Dota 2上的表现,让强化学习又火了一把,但是 OpenAI 的强化学习训练环境 OpenAI Gym 却屡遭抱怨,比如不太稳定.更新不够及时等.今日,谷歌推出了一款全新的开源强化学习框架 Dopamine,该框架基于 TensorFlow,主打灵活性.稳定性.复现性,能够提供快速的基准测试. 配套开源的还包括一个专用于视频游戏训练结果的平台,以及四种不同的机器学习模型:DQN.C51.简化版的 Rainbow 智能体

Java数据结构和算法(四)赫夫曼树 数据结构与算法目录(https://www.cnblogs.com/binarylei/p/10115867.html) 赫夫曼树又称为最优二叉树,赫夫曼树的一个最主要的应用就是赫夫曼编码. 一.赫夫曼编码 can you can a can as a can canner can a can. 1.1 定长编码 99 97 110 32 121 111 117 32 99 97 110 32 97 32 99 97 110 32 97 115 32 97

本文基于OpenDaylight二层转发机制实验 而成 在SDN网络中,处于末端的主机并不知道其连接的网络是SDN,某台主机要发送数据包到另一台主机,仍然需要进行IP到MAC地址的ARP解析.SDN网络中由于引入了控制器的角色,其二层数据转发的机制与普通二层以太交换机洪泛+MAC地址学习机制存在很大的差异.当源IP要与目的IP通信时,会将ARP请求转发到控制器,由控制器帮助询问目的主机的MAC并将结果返回给源主机. 本实验在SDN环境中配置相同网段的两台主机,通过测试二者之间的数据转发来理解和掌

Caffe入门随笔   分享一下自己入门机器学习的一些资料:(1)课程,最推荐Coursera上的Andrew NG的Machine Learning,最好注册课程,然后跟下来.其次是华盛顿大学的Machine Learning系列课程,一共有6门,包括毕业设计(2)书籍: 机器学习(周志华西瓜书).机器学习实战.统计学习方法(李航).集体智慧编程.数学之美(吴军)(3)微博@余凯_西二旗民工:@老师木:@梁斌penny:@张栋_机器学习:@邓侃:@大数据皮东:@djvu9:@陈天奇怪(4)知乎

目录 慕课笔记-JavaScript正则表达式笔记 概述 RegExp对象 修饰符 元字符 字符类 范围类 预定义类 预定义字符 边界 量词 贪婪模式 分组 或(使用竖线表示) 反向引用 忽略分组 前瞻 对象属性 test和exec方法 非全局调用 可以使用正则的函数 String.prototyp.search(reg) String.prototype.match(reg) String.prototype.split(reg) String.prototype.replace 慕课笔记-J

官网:https://www.consul.io 官网文档:https://www.consul.io/docs简介 consul是一个服务发现的组件,在docker世界中他比较流行,主要是consul不仅具有服务发现功能,还实现了DNS功能(centos默认的是dnsmaqs),监控检查以及事件处理等功能. consul的节点有两种角色:bootstrap,leader以及follower:bootstrap是在重启之后都向该节点报道,理论上来bootstrap和选组无关,但是总是要有一个点,

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